DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Lar and Lar

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001260594.1 Gene:Lar / 35259 FlyBaseID:FBgn0000464 Length:2032 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061516302.1 Gene:Lar / 1279520 VectorBaseID:AGAMI1_014585 Length:2049 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:2050 Identity:1642/2050 - (80%)
Similarity:1838/2050 - (89%) Gaps:23/2050 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MGL---QMTAARPIAALSLLVL-----SLLTWTHPTIVD-----AAHPPEIIRKPQNQGVRVGGV 52
            |||   ..|||..:|.::.|.|     .::..:|....|     ..||||||:||.|||||||||
Mosquito     1 MGLLVVNSTAALLLAIIATLFLLAEVPQIVVASHGNFSDFPFIYLTHPPEIIKKPVNQGVRVGGV 65

  Fly    53 ASFYCAARGDPPPSIVWRKNGKKVSGTQSRYTVLEQPGGISILRIEPVRAGRDDAPYECVAENGV 117
            |:|:|||||||.|:::||||.||:..|||||||.: ..|:|:|||||||||||||||||||||||
Mosquito    66 ATFFCAARGDPQPTVIWRKNSKKIMMTQSRYTVYD-ANGVSMLRIEPVRAGRDDAPYECVAENGV 129

  Fly   118 GDAVSADATLTIYEGDKTPAGFPVITQGPGTRVIEVGHTVLMTCKAIGNPTPNIYWIKNQTKVDM 182
            ||||||:||||:|||||||||||||.|.|..||||.|||.:|.|||.|:|.|.|||:|:..:|||
Mosquito   130 GDAVSAEATLTVYEGDKTPAGFPVIKQFPTIRVIETGHTAVMQCKATGSPPPKIYWLKDMKRVDM 194

  Fly   183 SNPRYSL-KDGFLQIENSREEDQGKYECVAENSMGTEHSKATNLYVKVRRVPPTFSRPPETISEV 246
            :|||||: .:|.|||:||.|.|.||||||||||:||||:|.|.|||||||||||||||||.:.||
Mosquito   195 TNPRYSINSEGSLQIDNSEESDMGKYECVAENSIGTEHTKPTPLYVKVRRVPPTFSRPPEPVYEV 259

  Fly   247 MLGSNLNLSCIAVGSPMPHVKWMKG-SEDLTPENEMPIGRNVLQLINIQESANYTCIAASTLGQI 310
            |||:||.|:|:|||||||.|||.|| .:||||||::|:|||||:|.:|:.|.||||||.|:||.|
Mosquito   260 MLGANLTLTCVAVGSPMPSVKWRKGVDQDLTPENDVPVGRNVLELTDIRVSTNYTCIAQSSLGVI 324

  Fly   311 DSVSVVKVQSLPTAPTDVQISEVTATSVRLEWSYKGPEDLQYYVIQYKPKNANQAFSEISGIITM 375
            ::.|:|||||||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   325 EATSLVKVQSLPAAPTDVTISEVTATQVRLEWSYKGPEDLQYYVIQYKPKNANQAFSEISGIITM 389

  Fly   376 YYVVRALSPYTEYEFYVIAVNNIGRGPPSAPATCT---TGDFSFGGTKMESAPRNVQVRTLSSST 437
            :||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|   |||.::||:||||||||::|:.|||||
Mosquito   390 FYVVRTLSPYTEYEFYVIAVNNIGRGPPSLPATTTTGETGDSAYGGSKMESAPRNIEVKPLSSST 454

  Fly   438 MVITWEPPETPNGQVTGYKVYYTTNSNQPEASWNSQMVDNSELTTVSELTPHAIYTVRVQAYTSM 502
            |:|||||||||||||||||||||||.|||||||:||| :.:::||:||||||||||:||||:|||
Mosquito   455 MLITWEPPETPNGQVTGYKVYYTTNPNQPEASWDSQM-ETNDMTTISELTPHAIYTIRVQAFTSM 518

  Fly   503 GAGPMSTPVQVKAQQGVPSQPSNFRATDIGETAVTLQWTKPTHSSENIVHYELYWNDTYANQAHH 567
            ||||:|.|||||||||||||||||||||:|||||||||::||||.||||||||||||||||:.||
Mosquito   519 GAGPLSNPVQVKAQQGVPSQPSNFRATDVGETAVTLQWSRPTHSGENIVHYELYWNDTYANEQHH 583

  Fly   568 KRISNSEAYTLDGLYPDTLYYIWLAARSQRGEGATTPPIPVRTKQY--GAPPRNITAIATSSTTI 630
            :||.|:|.|||..||||||||.||:|||||||||||||||||||||  ||||||:|..|||.|||
Mosquito   584 QRIPNTETYTLSSLYPDTLYYFWLSARSQRGEGATTPPIPVRTKQYVPGAPPRNVTVEATSPTTI 648

  Fly   631 SLSWLPPPVERSNGRIIYYKVFFVEVGREDDEATTMTLNMTSIVLDELKRWTEYKIWVLAGTSVG 695
            ::||||||||||||.|:|||||||||||.|.|||..|||.|||||||||||||||||||||||||
Mosquito   649 NVSWLPPPVERSNGAIVYYKVFFVEVGRSDSEATVTTLNSTSIVLDELKRWTEYKIWVLAGTSVG 713

  Fly   696 DGPRSHPIILRTQEDVPGDPQDVKATPLNSTSIHVSWKPPLEKDRNGIIRGYHIHAQELRDEGKG 760
            |||||:|..:||.||||||||||||:|:|||:|:|:||||.||:|||||||||||.||:::||||
Mosquito   714 DGPRSYPYTVRTHEDVPGDPQDVKASPVNSTTIYVTWKPPKEKNRNGIIRGYHIHVQEMKEEGKG 778

  Fly   761 FLNEPFKFDVVDTLEFNVTGLQPDTKYSIQVAALTRKGDGDRSAAIVVKTPGGVPVRPTVSLKIM 825
            .||||.||||||.||:||||||||||||:|||||||||||||||.|.||||||||:||||:|||:
Mosquito   779 LLNEPMKFDVVDGLEYNVTGLQPDTKYSVQVAALTRKGDGDRSAPISVKTPGGVPIRPTVTLKIL 843

  Fly   826 EREPIVSIELEWERPAQTYGELRGYRLRWGVKDQALKEEMLSGPQMTKKRFDNLERGVEYEFRVA 890
            ||:|.||||||||||.||||||||||:||||::|||.||:|.|.|:..||.::||||||||||||
Mosquito   844 ERDPTVSIELEWERPRQTYGELRGYRVRWGVREQALNEEILQGTQLNVKRINDLERGVEYEFRVA 908

  Fly   891 GSNHIGIGQETVKIFQTPEGTPGGPPSNITIRFQTPDVLCVTWDPPTREHRNGIITRYDVQFHKK 955
            |.||||||||.||..|||||:|.|||:.|.:|||||||:|:||:|||||||||.|||||||||||
Mosquito   909 GMNHIGIGQEAVKHLQTPEGSPTGPPTGIAVRFQTPDVVCITWEPPTREHRNGQITRYDVQFHKK 973

  Fly   956 IDHGLGSERNMTLRKAVFTNLEENTEYIFRVRAYTKQGAGPFSDKLIVETERDMGRAPMSLQAEA 1020
            ||||||:|||.|:||||||||:|:||||.||||||||||||||:|:::.|||||||||.|:||.|
Mosquito   974 IDHGLGTERNTTVRKAVFTNLDESTEYIVRVRAYTKQGAGPFSEKVVIATERDMGRAPFSVQAVA 1038

  Fly  1021 TSEQTAEIWWEPVTSRGKLLGYKIFYTMTAVEDLDDWQTKTVGLTESADLVNLEKFAQYAVAIAA 1085
            |||||.|:|||||.|||||:|||||||||||||||:||||.||:||||||:||||||||||||||
Mosquito  1039 TSEQTVEVWWEPVPSRGKLVGYKIFYTMTAVEDLDEWQTKVVGVTESADLINLEKFAQYAVAIAA 1103

  Fly  1086 RFKNGLGRLSEKVTVRIKPEDVPLNLRAHDVSTHSMTLSWSPPIRLTPVNYKISFDAMKVFVDSQ 1150
            .:|.|||:||||.||::|||||||||||||||||||||||:||||:.|:||||||||:|.|||||
Mosquito  1104 MYKTGLGKLSEKATVKVKPEDVPLNLRAHDVSTHSMTLSWAPPIRMNPINYKISFDAVKEFVDSQ 1168

  Fly  1151 GFSQTQIVPKREIILKHYVKTHTINELSPFTTYNVNVSAIPSDYSYRPPTKITVTTQMAAPQPMV 1215
            |.||.||:|::|||||.:||:|||:||||||||.|||||:|:||||:||.|||||||||||||||
Mosquito  1169 GISQKQILPRKEIILKSHVKSHTISELSPFTTYFVNVSAVPTDYSYKPPAKITVTTQMAAPQPMV 1233

  Fly  1216 KPDFYGVVNGEEILVILPQASEEYGPISHYYLVVVPEDKSNLHKIPDQFLTDDLLPGRNKPERPN 1280
            :||||||||||||.||||||||||||||||||:||||||:|||||||||||::|||.|.|.:|.|
Mosquito  1234 QPDFYGVVNGEEIQVILPQASEEYGPISHYYLIVVPEDKANLHKIPDQFLTEELLPSRPKLDRLN 1298

  Fly  1281 APYIAAKFPQRSIPFTFHLGSGDDYHNFTNRKLEREKRYRIFVRAVVDTPQKHLYTSSPFSEFLS 1345
            ||||||.|.||:||:|||||||:..|||||:||||.||||||||||||||||||||||||||||:
Mosquito  1299 APYIAAMFLQRNIPYTFHLGSGETNHNFTNKKLERGKRYRIFVRAVVDTPQKHLYTSSPFSEFLA 1363

  Fly  1346 LDMREAPPGERPHRPDPNWPAEPEVSVNRNKDEPEILWVVLPLMVSTFIVSTALIVLCVVKRRRQ 1410
            |||:|||.||.||||:||.|.:.|:.:....:||.:||||.|: ::..::|...:|:..|:||||
Mosquito  1364 LDMKEAPTGEPPHRPNPNVPQDTEIIIRGKNEEPGMLWVVGPI-IAALVLSVCFLVVYFVRRRRQ 1427

  Fly  1411 PCKTPDQAAVTRPLMAADLGAGPTPSDPVDMRRLNFQTPGMISHPPIPISEFANHIERLKSNDNQ 1475
            |||.|||||||||||||||||||.|:|||||||:|||||||||||||.|:|.|||:||||:|||.
Mosquito  1428 PCKAPDQAAVTRPLMAADLGAGPAPTDPVDMRRINFQTPGMISHPPISIAELANHVERLKANDNL 1492

  Fly  1476 KFSQEYESIEPGQQFTWDNSNLEHNKSKNRYANVTAYDHSRVQLPAVEGVVGSDYINANYCDGYR 1540
            ||||||||||||||||||:||:|.||.||||||||:||||||.||.:|||.||||||||||||||
Mosquito  1493 KFSQEYESIEPGQQFTWDHSNMEVNKPKNRYANVTSYDHSRVILPPIEGVPGSDYINANYCDGYR 1557

  Fly  1541 KHNAYVATQGPLQETFVDFWRMCWELKTATIVMMTRLEERTRIKCDQYWPTRGTETYGQIFVTIT 1605
            ||||||||||||||||.||||||||||::|||||||||||:|||||.|||.||||.||.:.||||
Mosquito  1558 KHNAYVATQGPLQETFGDFWRMCWELKSSTIVMMTRLEERSRIKCDMYWPARGTEVYGAMTVTIT 1622

  Fly  1606 ETQELATYSIRTFQLCRQGFNDRREIKQLQFTAWPDHGVPDHPAPFLQFLRRCRALTPPESGPVI 1670
            ||||||||||||||:.|.|.|:||||||||||||||||||||||||||||||.::|||.||||:|
Mosquito  1623 ETQELATYSIRTFQIYRNGSNERREIKQLQFTAWPDHGVPDHPAPFLQFLRRTKSLTPSESGPII 1687

  Fly  1671 VHCSAGVGRTGCYIVIDSMLERMKHEKIIDIYGHVTCLRAQRNYMVQTEDQYIFIHDAILEAIIC 1735
            ||||||||||||||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||:|||:||
Mosquito  1688 VHCSAGVGRTGCYIVIDSMLERMKYEKTIDIYGHVTCLRAQRNYMVQTEDQYIFIHDALLEAVIC 1752

  Fly  1736 GVTEVPARNLHTHLQKLLITEPGETISGMEVEFKKLSNVKMDSSKFVTANLPCNKHKNRLVHILP 1800
            |.||||||:||.|:|||:.|||.|.|:|||:|:|||||||.||::||||||||||||||||||||
Mosquito  1753 GSTEVPARSLHNHIQKLMQTEPHENITGMEMEYKKLSNVKADSTRFVTANLPCNKHKNRLVHILP 1817

  Fly  1801 YESSRVYLTPIHGIEGSDYVNASFIDGYRYRSAYIAAQGPVQDAAEDFWRMLWEHNSTIVVMLTK 1865
            ||||||.||||.|:|||||:|||.:||||||:||||||||:|:.|||||||||||||||||||||
Mosquito  1818 YESSRVCLTPIRGVEGSDYINASLVDGYRYRNAYIAAQGPLQETAEDFWRMLWEHNSTIVVMLTK 1882

  Fly  1866 LKEMGREKCFQYWPHERSVRYQYYVVDPIAEYNMPQYKLREFKVTDARDGSSRTVRQFQFIDWPE 1930
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1883 LKEMGREKCFQYWPHERSVRYQCYVVDPIAEYNMPQYKLREFKVTDARDGSSRTVRQFQFIDWPE 1947

  Fly  1931 QGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPITVHCSAGVGRSGVFITLSIVLERMQYEGVLDVFQT 1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1948 QGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPITVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMQYEGVLDVFQT 2012

  Fly  1996 VRILRSQRPAMVQTEDQYHFCYRAALEYLGSFDNY 2030
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||:|
Mosquito  2013 VRILRSQRPAMVQTEDQYQFCYRAALEYLGSFDHY 2047

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LarNP_001260594.1 I-set 36..129 CDD:400151 72/92 (78%)
Ig strand B 53..57 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand C 66..70 CDD:409353 0/3 (0%)
Ig strand E 93..97 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand F 108..113 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 122..125 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig 141..228 CDD:472250 56/87 (64%)
Ig strand B 157..161 CDD:409353 1/3 (33%)
Ig strand C 170..174 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand E 192..196 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand F 206..211 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 218..221 CDD:409353 2/2 (100%)
IgI_3_RPTP_IIa_LAR_like 237..319 CDD:409401 54/82 (66%)
Ig strand A 237..239 CDD:409401 1/1 (100%)
Ig strand A' 244..248 CDD:409401 2/3 (67%)
Ig strand B 251..259 CDD:409401 4/7 (57%)
Ig strand C 264..270 CDD:409401 4/5 (80%)
Ig strand C' 272..274 CDD:409401 0/1 (0%)
Ig strand D 277..281 CDD:409401 3/3 (100%)
Ig strand E 286..291 CDD:409401 3/4 (75%)
Ig strand F 298..305 CDD:409401 6/6 (100%)
Ig strand G 309..318 CDD:409401 3/8 (38%)
FN3 322..411 CDD:238020 82/91 (90%)
FN3 <382..747 CDD:442628 301/369 (82%)
FN3 712..810 CDD:238020 79/97 (81%)
FN3 832..898 CDD:214495 50/65 (77%)
FN3 <867..1269 CDD:442628 325/401 (81%)
fn3 914..998 CDD:394996 69/83 (83%)
R-PTPc-LAR-1 1498..1735 CDD:350401 205/236 (87%)
R-PTP-LAR-2 1784..2021 CDD:350402 223/236 (94%)
LarXP_061516302.1 None

Return to query results.
Submit another query.