DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Tep4 and Mug6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001260590.1 Gene:Tep4 / 35248 FlyBaseID:FBgn0041180 Length:1498 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038963368.1 Gene:Mug6 / 297572 RGDID:1566313 Length:1493 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1632 Identity:427/1632 - (26%)
Similarity:704/1632 - (43%) Gaps:326/1632 - (19%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 LC---VILALLQTMEPVKAEGKYTIVGPGTIHSHRDYNVAVAVHQTKEPVTLKVGITGPSYNKTE 72
            ||   |:||||.:........||.::.|..:::.....:.:.::...|.||:...:......:..
  Rat     9 LCLFSVLLALLPSASSFNGNSKYMVLVPSQLYTDTPEKICLHLYHLNETVTVTASLISQRGTRKL 73

  Fly    73 TVELATAGE-FKQITFKLPPLEAGE----YNLTAEGVKGLEFKNSTKLNWENFKPYIKIQTDKGK 132
            ..||....: |..::|.:|.|.:.|    .::..||.|. :|.....:..:|.:..:.:||||..
  Rat    74 FDELVVDKDLFHCLSFTIPRLPSSEEEESLDINIEGAKH-KFSKRRVVLVKNKESVVFVQTDKPV 137

  Fly   133 YKPGDTINYRVIFLDENLRPDTAKDEV--VVWFEDSKRNRIKQEKHIKTTGGVYTGKFELSEFAT 195
            ||||.::.:|::.:|:||.|   .:|:  :.:.||.|.|||.|.:.|||..|:....|.||....
  Rat   138 YKPGQSVKFRIVSMDKNLHP---LNELFPLAYIEDPKINRIMQWQDIKTENGLKQLSFSLSAEPI 199

  Fly   196 LGSWSLHV--QNG--DQHHDGGIYFGGRKQFGGFGHRWHRSDELVNFEVEKYVLPKYSVKMDATQ 256
            .|.:.:.:  |:|  ::|                           :|.|.::|||::.|.:....
  Rat   200 QGPYKIVILKQSGVKEEH---------------------------SFTVMEFVLPRFGVDVKVPN 237

  Fly   257 QVSVRDGEFNVVLKANYTYGKPVNGKVLVNV-------HLDSTSSWENVDGKTVQTDYPGHSVVG 314
            .:||.|...:|...|.|||||||.|:|.:::       ...:.|:.:..|.   :.|..|.|.  
  Rat   238 AISVYDEIISVTACATYTYGKPVPGRVKISLCHGNPSFRSQTKSACKEEDS---ELDNNGCST-- 297

  Fly   315 TADMVGGKAKLT-MDLKDFASYLPHKTSSSYAQITATVEEDFTGVKLNETGGVQLYPYRYEMSCT 378
                  .:..:| ..||:  :||  |...:: .:.|||.|:.||.:.:.:|.:::...|.:....
  Rat   298 ------QEVNITEFRLKE--NYL--KVRQAF-HVNATVTEEGTGSEFSGSGRIEVKRTRNKFLFL 351

  Fly   379 DYSSCFSFKPDKEHELNF----KITYVDGSLITDTKSVVKAK---FTEGIRRNYAFYAFGTDHQE 436
            ...|.|      .|.:.|    ::..:.|..|.:.:..:||:   ||.         |..||.. 
  Rat   352 KADSHF------RHGIPFFVKVRLVNIKGDPIPNQQVFIKAQGAGFTN---------ATTTDQH- 400

  Fly   437 PELPTIEKKTFVFESHLNASGVAPFKVVLPDLPDIANFTRY-YSIELEFVDEKRDLYT------- 493
                                |:|.|.:      |.:..:|| .:|::...:|...:::       
  Rat   401 --------------------GLAKFSI------DTSGISRYILNIKVYHKEENSCIHSSCTAERH 439

  Fly   494 ---------------TYPYREPKQIENPSSEEEKEWFRAEVQRPKDVWNLKIGQEYQVILNSSRP 543
                           :|.|.:.:....|.::..      .||..   :.|| ||...|:     |
  Rat   440 AEAHHTAYAVYSLSKSYIYLDTEAGVLPCNQSH------TVQAH---FILK-GQVLGVL-----P 489

  Fly   544 LKYFVYNIVGRGNILET-KRVDLAEP-----QTTVNVTIKPTFLTTPYGRVYFYYVDETGEFRYT 602
            ...|.|.::.:|:||:| ......||     |....:.|...|...|..::..|.:...||....
  Rat   490 QIVFHYLVMAQGSILQTGNHTHQVEPGESPVQGNFALEIPVEFSMVPMAKMLIYTILPDGEVIAD 554

  Fly   603 EETFSVEVELQNQIEIK-APAEVKPGADVALEIKTSPKSFVGLLAVDQSVLLLGSNNDLNKESFN 666
            ...|.||..|::::.:. :|::..|.:...:.:..||:|..||.|||||||||....:|: .|..
  Rat   555 SVKFQVEKCLRHEVHLSFSPSQSLPASQTHMRVTASPQSLCGLRAVDQSVLLLKPEAELS-PSLI 618

  Fly   667 WRLNGYDTST-------PWQ-------------GGYSY---YPGER--------TGVVTMTN--- 697
            :.|.|...|.       |::             |..:|   |..|:        ||:..:||   
  Rat   619 YDLPGMQESKFIPRSHYPFEDEDGCVIYRPRVIGKLTYSVPYGREKDVFRYMRDTGLTALTNLKL 683

  Fly   698 -AYFFYNRTAPDYNILTEGFGGSSFAMRKTTVAHDSHVFHSGAGGPTQAVGFSAESASASAAP-- 759
             .:.|      ||:::.          .....|..|.:|:|...|..::.  ..:|.....||  
  Rat   684 RTFCF------DYDMVP----------LAVPAARSSDLFNSDGYGSWRSA--RVKSLPPKKAPHK 730

  Fly   760 ----------VVRKNFAETWIFADIESTEEEVFKWVKTIPDTITNWVVTGFSLHPQKGLGVTNDQ 814
                      .:|..|.|||::..:........:...|:|||||.|......|....|||:::..
  Rat   731 DPPPKDPVIETIRNYFPETWVWDLVTVNSSGAAELEMTVPDTITEWKAGALCLSNDTGLGLSSVA 795

  Fly   815 TNIKTFQPFFVSVRLPYSVKRGEVINVPALVFNYLPKTLDVELTLDNEDQEYDFVDASNEVIGDQ 879
            | ::.||||||.:.:||||.|||...:.|.|.||||.:|.:.:.|: ...::..|...|    ||
  Rat   796 T-LQAFQPFFVELTMPYSVIRGEAFTLKATVMNYLPTSLPMAVQLE-ASPDFTAVPVGN----DQ 854

  Fly   880 KRTQNIRVGANEAAGASFLIRPKVIGNILLKFKAIS--------------PLAG--DAIHKPLKV 928
               .:..:|||....:|:|:.||.:||:.....|.:              |..|  |.:.|.|.|
  Rat   855 ---DSYCLGANGRHTSSWLVTPKSLGNVNFSVSAEAQQSPEPCGSEVATVPETGRKDTVVKVLIV 916

  Fly   929 VPEGITQYQNRAFFINLKDTGEFKNTFELEVPEDVVPDSERVEFGLVGDLLGPVVKNLENLLRLP 993
            .||||.:....:..:...| .|...|..|.:|..||.||.|..|.::||:|...:||.:||:::|
  Rat   917 EPEGIKREHTFSSLLCASD-AELSETLSLLLPPTVVKDSARAHFSVMGDILSSAIKNTQNLIQMP 980

  Fly   994 SGCGEQTMSKLVPNYLVRDYLKSIKKLTPALDTRIKRNLQDGYQHMLHYRHDDGSFSSFGPTKWR 1058
            .|||||.|....|:..|..||...::||..:.::....|:.|||..|:|:|.|||:|:||     
  Rat   981 YGCGEQNMVLFAPSIYVLKYLNETQQLTEKIKSKALGYLRAGYQRELNYKHKDGSYSAFG----- 1040

  Fly  1059 QEDPVRNGSTWLTAYVLRSFSKIKDIIDLDEQILAKGYEFLLTRQAENGSFTEHGEYFYSSQR-- 1121
            ..|....|:|||||:||:|||:.:..|.:||..:...:.:|..:|.::|.|...|..|.::.:  
  Rat  1041 DHDGKGQGNTWLTAFVLKSFSQAQAFIFIDESHITDAFTWLSHQQKDSGCFRSSGSLFNNAMKGG 1105

  Fly  1122 --SLLTLTANSLLALLEEEKPN--QAAIDKAVAYLSANTAESIE-------LLPKSIAIYALQKA 1175
              ..:||:|...:||||...|:  ...:.||::.|.::. |:||       :..|::..||...|
  Rat  1106 VDDEITLSAYITVALLESLPPDTEHPVVSKALSCLESSW-ENIEQGGNGSFVYTKALMAYAFALA 1169

  Fly  1176 KAPEAAKQVASLKSLAKH---EDDRTWW---------TEDLDKLRASKNCGRWWCWIWSQDVEIT 1228
            ...|...::  ||||.|.   ||:...|         ...|.|.:||           |.:||:.
  Rat  1170 GNQEKRNEI--LKSLDKEAIKEDNSIHWERPQKPMKSARSLYKPQAS-----------SAEVEMN 1221

  Fly  1229 SYALLSLLDSDQETADSV---------LNTVRWLIAQRNGFGGFASSQDTVVGLTALIKFAEKSG 1284
            :|.:|:.|     ||.|.         :.|::||..|:|..|||:|:|||||.|.||.|:...:.
  Rat  1222 AYVILARL-----TAQSAPSPKDLALSMGTIKWLTKQQNSRGGFSSTQDTVVALDALSKYGAATF 1281

  Fly  1285 YEAAKW-EVTVSNKGKREKTEKLNTSEENDLLLQTVEFPQGTKSLEFEAKGTGAAMVQISYQYNL 1348
            .::.|. .|||.:.|  ...:|......|.||||.|..|....:......|.|....|...:|||
  Rat  1282 SKSQKTPSVTVQSSG--SFFQKFQVDNSNRLLLQQVSLPDIPGNYTVSVSGEGCVYAQTMLRYNL 1344

  Fly  1349 VEKEPKPSF--KIQTTVLPESSPA---NLELSVCVDYVEEGESKESNMAILEVSLPSGYTADEDS 1408
            ..::.:|:|  |:||..|..::|.   :.::|:.:.|.  |....|||.|.:|.:.||:...:.:
  Rat  1345 PLEKQQPAFALKVQTVPLTCNNPKGQNSFQISLEISYT--GSRPASNMVIADVKMLSGFIPLKPT 1407

  Fly  1409 FADIRNIERVRLVETKNGDSVVVIYFENLAKNEEKCIRIEAYRTHAVANQKPSSVVLYDYYDTNK 1473
            ...:..:|.|...|....:  |::|.:.:. |:.........:...|.|.:|:.|.:||||:|::
  Rat  1408 VKKLERLEHVSRTEVTTNN--VLLYLDQVT-NQTLSFSFIIQQDIPVKNLQPAIVKVYDYYETDE 1469

  Fly  1474 KATEYYS 1480
            .|...||
  Rat  1470 VAFAEYS 1476

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Tep4NP_001260590.1 YfaS <76..1411 CDD:441940 395/1493 (26%)
A2M_2 982..1279 CDD:239227 108/330 (33%)
A2M_recep 1387..1480 CDD:462226 23/92 (25%)
Mug6XP_038963368.1 YfaS <129..1352 CDD:441940 367/1380 (27%)
A2M 749..839 CDD:459711 34/90 (38%)
A2M_2 969..1276 CDD:239227 108/330 (33%)
A2M_recep 1386..1476 CDD:462226 23/92 (25%)

Return to query results.
Submit another query.