DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(2)37Cb and l(2)37Cb

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609946.1 Gene:l(2)37Cb / 35192 FlyBaseID:FBgn0086444 Length:894 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_319843.5 Gene:l(2)37Cb / 1280046 VectorBaseID:AGAMI1_007561 Length:891 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:893 Identity:725/893 - (81%)
Similarity:809/893 - (90%) Gaps:12/893 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 KNRKRTASSSSSGEEPDSEEESRLKDLQERDEFASRLKKRDDDRTRNVVDSTGGRRAIEEATKRL 68
            ||..|..|.||.    ||.:|.|.:||:|||||:.|||:||:..||||..|:..|.|  :|.|||
Mosquito     3 KNTDRRKSYSSD----DSSDEERHRDLKERDEFSKRLKQRDESNTRNVAASSDKRGA--DAAKRL 61

  Fly    69 KLEHEDRDKIVPHLRLQSRRQYLEKRKDDKVAELEADILDDEYLFDESVLTKREKEEREYKKQLL 133
            :||..||:|::|.||.|||||||||||:||||||||||.||||||.|:.:|:||:.:||:||:||
Mosquito    62 RLETADREKLLPELRKQSRRQYLEKRKEDKVAELEADIRDDEYLFPEAEITERERRDREHKKRLL 126

  Fly   134 NIAKEHEKARELERIQRYNMPQDLKKGERSEYVEVDEFEKQPNSEQKKWEAEQLASARFHFGAKD 198
            .|||:|||||||||:|||.||:|:||||..|||||||.|:.|:||||||||||||||.:.||:||
Mosquito   127 QIAKDHEKARELERVQRYRMPKDVKKGEMEEYVEVDERERMPHSEQKKWEAEQLASAVYGFGSKD 191

  Fly   199 AK----AEEEYELLLDDQIDFIQALTLDGSREKSSSRQPELTEKERKRLTLDETRRSLPVYPFKE 259
            ||    .::|||||||:||||::||.:.|:::|..  :|||||.:||::|::||::|||:|||||
Mosquito   192 AKERAAQQQEYELLLDEQIDFVEALQMAGTKKKDD--KPELTEAQRKKMTIEETQKSLPIYPFKE 254

  Fly   260 DLIAAVKEHQVLIIEGETGSGKTTQVPQYLVEAGFTKDKKMIGCTQPRRVAAMSVAARVAEEMGV 324
            |||||::.|.:||||||||||||||:||||.|||||.:.|.||||||||||||||||||||||.|
Mosquito   255 DLIAAIQAHNILIIEGETGSGKTTQIPQYLYEAGFTNEGKKIGCTQPRRVAAMSVAARVAEEMAV 319

  Fly   325 KLGNEVGYSIRFEDCTSDRTILKYMTDGTLHREFLSEPDLASYSVMIIDEAHERTLHTDILFGLV 389
            |||||||||||||||||:||::|||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
Mosquito   320 KLGNEVGYSIRFEDCTSERTVIKYMTDGTLHREFLSEPDLASYAVMIIDEAHERTLHTDILFGLV 384

  Fly   390 KDIARFRPELKLLISSATLDAEKFSAFFDDAPIFRIPGRRYPVDIFYTKAPEADYIDACCVSVLQ 454
            |||||||.:||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Mosquito   385 KDIARFRKDLKLLISSATLDAEKFSDFFDKAPIFRIPGRRYPVDIFYTKAPEADYIDACVVSVLQ 449

  Fly   455 IHATQPLGDILVFLTGQDEIETCQEVLHDRVKRLGSKIRELIVIPVYANLPSDMQAKIFEPTPPN 519
            |||||||||||||||||:|||.|||:|.|||||||||::||:::|:|||||||||||||||||||
Mosquito   450 IHATQPLGDILVFLTGQEEIEACQEMLQDRVKRLGSKLKELLILPIYANLPSDMQAKIFEPTPPN 514

  Fly   520 ARKVILATNIAETSLTIDNIIYVIDPGFAKQNNFNSRTGMESLMVVPISKASANQRAGRAGRTAP 584
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:||||||||||||||||||.||
Mosquito   515 ARKVILATNIAETSLTIDNIIYVIDPGFAKQNNFNSRTGMETLLVVPISKASANQRAGRAGRVAP 579

  Fly   585 GKCFRLYTAWAYKHELEDNTVPEIQRINLGNAVLMLKALGINDLIHFDFLDPPPHETLVLALEQL 649
            ||||||||||||.:|||||||||||||||||||||||.|||:||:||||||||||:||:||||||
Mosquito   580 GKCFRLYTAWAYNNELEDNTVPEIQRINLGNAVLMLKTLGIHDLLHFDFLDPPPHQTLILALEQL 644

  Fly   650 YALGALNHHGELTKLGRRMAEFPVDPMMGKMLLASEKYKCSEEMVTIAAMLSVNSAIFYRPKDKI 714
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||:|:||||||||.||||||||||
Mosquito   645 YALGALNHHGELTKLGRRMAEFPVDPMMAKMLLASEKYKCSEEIVSIAAMLSVNGAIFYRPKDKI 709

  Fly   715 IHADTARKNFNHMHGDHLSLLQVYNQWAETDYSTQWCYENFIQYRSMKRARDVREQLVGLMQRVE 779
            ||||||||||||.|||||||:||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   710 IHADTARKNFNHRHGDHLSLMQVYNQWVESDYSTQWCYENFIQYRSMKRARDVREQLVGLMQRVE 774

  Fly   780 IDMVSCLPETVNVRKAATAGYFYHVARLSKGGHYKTIKHNQTVMIHPNSSLFEELPRWVLYHELV 844
            |:|||...:|.|||||.|||||||||||||.|:|||:||||.|||||||:|||:||||:||||||
Mosquito   775 IEMVSGESDTTNVRKAITAGYFYHVARLSKSGNYKTVKHNQDVMIHPNSALFEDLPRWLLYHELV 839

  Fly   845 FTSKEYMRQVIEIESKWLLEVAPHYYKAKELEDSTNKKMPKVAGRAEM 892
            ||:||:||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||..|||||
Mosquito   840 FTTKEFMRSVIEIESKWLLEVAPHYYKPKELEDPTNKKMPKTVGRAEM 887

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(2)37CbNP_609946.1 PTZ00121 <6..267 CDD:173412 165/264 (63%)
HrpA 251..>868 CDD:441249 549/616 (89%)
l(2)37CbXP_319843.5 None

Return to query results.
Submit another query.