DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG31792 and Abcc6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_724148.2 Gene:CG31792 / 35163 FlyBaseID:FBgn0051792 Length:1323 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_112275.1 Gene:Abcc6 / 81642 RGDID:620268 Length:1502 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1372 Identity:439/1372 - (31%)
Similarity:691/1372 - (50%) Gaps:145/1372 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 FKNEDLPEN--PRERSNIFSALSFWYTIPTFIKGQKVTLGAKDLYRALKEHRAESLGNKLCSSWA 66
            |..:..|.|  |...::..|...||:......||.:..||.|||:...:|:.:|.|.::|...|.
  Rat   199 FSEDSKPLNPCPEAEASFPSKAMFWWASGLLWKGYRKLLGPKDLWSLERENSSEELVSQLEREWR 263

  Fly    67 ---NELETNK-------------------KNASLLRVLFRVFGRYFVFLGLVLFCLEVILTVQPM 109
               :||..:|                   :...|||.::|||...|:...|.|...:......|.
  Rat   264 RNFSELPGHKGHSGMGTPETEAFLQPERSQRGPLLRAIWRVFRSTFLLGTLSLVISDAFRFAVPK 328

  Fly   110 FLMKLISSFSNPSPTSNGVAYAYAGGVILGSALKVILMNPYSFAVTHLGLKIRVGVSSMIYRKCL 174
             |:.|...|.....:|....:..|..:.|.:.|:.:....|.:.|..|.:::|..::.::|||.|
  Rat   329 -LLSLFLEFMGDLESSAWTGWLLAVLMFLSACLQTLFEQQYMYRVKVLQMRLRTAITGLVYRKVL 392

  Fly   175 RLTKTDLGEISTGHIINLISNDLGRMDTFIQFTHYLWLAPLQALMVTYLMYQEIGIAAVFGMTFI 239
            .|:.......:.|.::||:|.|:.|:...|...:.|||..|..::....::|.:|.:|:..:...
  Rat   393 VLSSGSRKSSAAGDVVNLVSVDVQRLVESILHLNGLWLLFLWIIVCFVYLWQLLGPSALTAVAVF 457

  Fly   240 LLFIPLQMYLGKKISGLRLKTAIRSDKRMRIMTEIIAGIQVIKMYAWELPFEKMVAHARHKEINS 304
            |..:||..::.||.|..:.:...:...|.|:.:.::..::.||.:.||..|.:.:.|.|.:|:.:
  Rat   458 LSLLPLNFFITKKRSFHQEEQMRQKASRARLTSSMLRTVRTIKSHGWECAFLERLLHIRGQELGA 522

  Fly   305 IRHVAYAKCLIWSFNRFLTPVSIFL-SLVGF-----VLMGRFLTAEVAFLITAYYNVVRTNMTAY 363
            ::..|:    ::|.:.....||.|| :||.|     |.....:.||.||:.....::: ....|:
  Rat   523 LKTSAF----LFSVSLVSFQVSTFLVALVVFAVHTLVAEDNAMDAEKAFVTLTVLSIL-NKAQAF 582

  Fly   364 FSVGVTQTAETLVSIKRVQKLLLSGEVVAKDENVVSNGAEEDLQEAREKLLVTPTPMRAPEKPPH 428
            ....|....:..||..|:...|..       |.|..||             :..:|.|.      
  Rat   583 LPFSVHCLVQARVSFDRLAAFLCL-------EEVDPNG-------------MVLSPSRC------ 621

  Fly   429 NSEDCVSISELKAKWTTNSPDYTLSGVNLQVHAGALVAIVGHTGSGKSSLIQAILGELRVESGEI 493
            :|:|.:||......|:..||. .|.|:||.|..|.|:|:||..|:|||||:.|:||||....|.:
  Rat   622 SSKDRISIHNGTFAWSQESPP-CLHGINLTVPQGCLLAVVGPVGAGKSSLLSALLGELLKVEGSV 685

  Fly   494 EVTGSMSYASQEPWLFSGTVRQNILFGQPMDRRRYDLVVRKCALERDFELLPLKDKTILGDRGAS 558
            .:.||::|..||.|:.:.:|.:|:.|.|.:|......|:..|||..|....|....|.:|::|.:
  Rat   686 SIEGSVAYVPQEAWVQNTSVVENVCFRQELDLPWLQEVLEACALGSDVASFPAGVHTPVGEQGMN 750

  Fly   559 LSGGQKARISLARSVYRDASIYLLDDPLSAVDSSVARRLFEECL--RGHLRDKIVILVTHQLQFL 621
            ||||||.|:||||:|||.|::||:||||:|:|:.|::.:|::.:  .|.|:....|||||.|..|
  Rat   751 LSGGQKQRLSLARAVYRRAAVYLMDDPLAALDAHVSQEVFKQVIGPSGLLQGTTRILVTHTLHVL 815

  Fly   622 QQADQIVIMEMGKVKAVGTYES-LHKSGLDFGIVLD---DPVNDNEAAEDRSRTSSI-------- 674
            .|||||:::..|.:..:|:|:. ||::|...|: ||   .|..:.|.....:.||..        
  Rat   816 PQADQILVLANGTIAEMGSYQDLLHRNGALVGL-LDGARQPAGEGEGEAHAAATSDDLGGFSGGG 879

  Fly   675 TDQRR---------SSVKSVLSHAESCP--EDV-------GEEQKINLQRQQLGRNGLGVYVDYF 721
            |..||         :.||...|.|:..|  :||       ||:.      .|.||.....|:.|.
  Rat   880 TPTRRPERPRPSDAAPVKGSTSEAQMEPSLDDVEVTGLTAGEDS------VQYGRVKSATYLSYL 938

  Fly   722 RAGGGFLSFSVVMTFFVCSQGLASLGDYFLSPWVSRNEKMVAHNYTTDAKDADFEMHAAYIYMLI 786
            ||.|..|. :..:..|:|.|..:....|:||.|        |.:...|.|    :||:|....:.
  Rat   939 RAVGTPLC-TYTLFLFLCQQVASFCQGYWLSLW--------ADDPVVDGK----QMHSALRGSIF 990

  Fly   787 TVLSIMVTIKRSFLFFNLA------MRASIQLHNSMFRGISRASMYFFNKNPAGSILNRFSKDMG 845
            .:|..:..|.   ||.::|      .|||..|..|:...::|:.:.||.:.|.|::||||||:..
  Rat   991 GLLGCLQAIG---LFASMAAVFLGGARASCLLFRSLLWDVARSPIGFFERTPVGNLLNRFSKETD 1052

  Fly   846 QVDEMLPTIIMTVIQDFLLFG----GNIIVIAIVNPLFLIPALAFGIVIYYLRSFYLKTSLDVKR 906
            .||..:|..:.|::.  ..||    |  :.:::..||.::..|...::....:|.|:.|...::|
  Rat  1053 IVDVDIPDKMRTLLT--YAFGLLEVG--LAVSMATPLAIVAILPLMLLYAGFQSLYVATCCQLRR 1113

  Fly   907 LEASTRSPVYSHFAASLNGLSTIRAFGAGSILEAEFDGYQDMHSSASYMFISTSRAFAYWMDIF- 970
            ||:::.|.|.||.|.:..|...:|||.|.....|:.|...|.:...|:..:...|..|..:::. 
  Rat  1114 LESASYSSVCSHLAETFQGSQVVRAFQAQGPFTAQHDALMDENQRISFPRLVADRWLAANLELLG 1178

  Fly   971 -CVLFIAMITLSFFIFPPSSAADVGLAITQAMGLTGTVQWTVRQSAELENTMISVERMIEYEEIE 1034
             .::|:| .|.:.......||...|.:::.|:.:|.|:||.||...:|||:|::|||:.:|....
  Rat  1179 NGLVFVA-ATCAVLSKAHLSAGLAGFSVSAALQVTQTLQWVVRSWTDLENSMVAVERVQDYVHTP 1242

  Fly  1035 PEGP--LEATADKKPHESWPEQGKIEFVELSLRYEPYLKSESVLKSLSFVIKPKEKVGIVGRTGA 1097
            .|.|  |.::|   ....||..|:|||.:..||:.|.|  ...::.:|..|...|||||||||||
  Rat  1243 KEAPWRLPSSA---AQPLWPCGGQIEFRDFGLRHRPEL--PMAVQGVSLKIHAGEKVGIVGRTGA 1302

  Fly  1098 GKSSLINALFRL-SYNDGSVRIDDKDTNDMGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTVRHNLDPFDEYSD 1161
            |||||...|.|| ...:|.:.||.....|||||.|||:|:||||:||||.|::|.|||...|.:|
  Rat  1303 GKSSLTWGLLRLQEATEGGIWIDGVPITDMGLHTLRSRITIIPQDPVLFPGSLRMNLDLLQENTD 1367

  Fly  1162 DRLWCALEEVELKDVVASVATGLETKITEGGSNFSVGQRQLVCLARAILRDNRILVMDEATANVD 1226
            :.:|.|||.|:||..|.|:...|:.:.:..|.:.||||:||:|||||:||..:||::|||||:||
  Rat  1368 EGIWAALETVQLKAFVTSLPGQLQYECSGQGDDLSVGQKQLLCLARALLRKTQILILDEATASVD 1432

  Fly  1227 PQTDALIQATIRNKFRECTVLTVAHRLHTIMDSDRVLVMDAGRVVEFGTPYELLTADDTNAFQDL 1291
            |.|:..:||.:...|.:||||.:||||.::|:..||||||.|:|.|.|:|.:||.  ....|..|
  Rat  1433 PGTEIQMQAALERWFAQCTVLLIAHRLRSVMNCARVLVMDEGQVAESGSPAQLLA--QKGLFYRL 1495

  Fly  1292 VKQTGQA 1298
            .:::|.|
  Rat  1496 AQESGLA 1502

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG31792NP_724148.2 PLN03130 7..1313 CDD:215595 438/1369 (32%)
Abcc6NP_112275.1 MRP_assoc_pro 36..1501 CDD:188098 437/1369 (32%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 854..909 12/54 (22%)

Return to query results.
Submit another query.