DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ssp3 and ssp3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609917.2 Gene:ssp3 / 35149 FlyBaseID:FBgn0032723 Length:1732 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061512013.1 Gene:ssp3 / 1279627 VectorBaseID:AGAMI1_005850 Length:1627 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1818 Identity:819/1818 - (45%)
Similarity:1094/1818 - (60%) Gaps:294/1818 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MEMREVLSREGREAKNLLVYQFCDETTSSGATSGFGSTGGDVGGGSGGDGPAVGSGGVLLNGDCY 65
            |:.|:..::||:||||.  |...|:                     ||:                
Mosquito     1 MDNRKFFNQEGKEAKNF--YHLSDD---------------------GGE---------------- 26

  Fly    66 RKPPMVPPKSP--NGTPKNCQSPTSPRLKSSASVGCGGGSSGGPRVRSASTGRDKKSELQARYWA 128
              |...|||.|  ...|:..||..|.|.||.        |..|||||||||||||||||||||||
Mosquito    27 --PQRTPPKRPPIGVRPRCIQSHVSQRQKSL--------SKSGPRVRSASTGRDKKSELQARYWA 81

  Fly   129 LLFGNLQRAINEIYQTVECYENISSCQETILVLENYVRDFKALCEWFKVSWDYESRPLQQRPQSL 193
            .|||||:|::||||.|||||||:|||:|.|||||||:||||||.||||||||||:.||.|||.||
Mosquito    82 FLFGNLERSVNEIYLTVECYENLSSCKEAILVLENYIRDFKALAEWFKVSWDYEATPLPQRPHSL 146

  Fly   194 AWEVRKSNPTPRVRTRSLCSPNNSGKSSPALFPGTQSGETSPFC----DNGQI-SPRKLLRAYDQ 253
            |||||||||.|||| :.|.||..||||||:.     ||:.|| |    :.|:: ||:|...:.:.
Mosquito   147 AWEVRKSNPVPRVR-KQLSSPGMSGKSSPSF-----SGKNSP-CPVVEETGRVSSPKKTNSSTES 204

  Fly   254 VPKGAMRLNVRELFAASKRATQGSSQSDNMEGPLDLS---GDKS---NFVLRSTQYAQTDLEDPH 312
            :.|   |.|   |..||:..|..:|      .||:.|   .||:   ::||:..||.||:|||.:
Mosquito   205 LSK---RCN---LAKASRHETTETS------APLEQSLTLCDKASVESYVLKLDQYTQTNLEDEN 257

  Fly   313 LTLADVREKMRMEAEEREAQNRIENEALEEVTIPIDNEDATESLNKQEPSSLELPIHNVADLSKE 377
            ||||:..||.     :::..|.         ||.:|.:..:....:.:|:         .|:..|
Mosquito   258 LTLAEYLEKY-----DKQFCNG---------TITVDTDGESNQKVENKPN---------IDVGLE 299

  Fly   378 PELMEAASEATALEMTVASL----ESMENALLNQQANKEPTPPSTVIK------------PLAEI 426
            .:.:..||:..:.:|||.||    .|:..|.|  ::.|..|...||.|            |...:
Mosquito   300 EKKLPVASDTKSEQMTVKSLTKNVPSVNTASL--KSGKTQTKTLTVPKLVGSRGNVVRPGPNQAL 362

  Fly   427 LKKPQPLNPLSGNNVQ---NSPLKYSSVLNRPSKKMIPPPGGVAAQKTISTKPGLVKPNLTTTV- 487
            ::|......||..||:   :.|:|.::|.|..|                         |::||. 
Mosquito   363 VRKSATATGLSPMNVKMAASLPVKSATVSNMSS-------------------------NVSTTKH 402

  Fly   488 -NGLRST---KTATAPPAIKTTGRSGLQRHPRPSSKTECYGPPNNVASRLSARSRTMLEINGRN- 547
             ||::.|   |..:||             ..:|.:    |..| .||||||.||:||:|:..|: 
Mosquito   403 RNGIKQTHVLKPGSAP-------------RTQPGN----YNVP-GVASRLSVRSKTMIEVTSRSN 449

  Fly   548 -----TNSSARTLPKKTNPGSILSTATRTKMSSRLS-SREDITSSTSTLKASNEQLSNSRNTL-- 604
                 .|.....|.::       |||   |:||..: |:|||.|||||||||.::| .|||::  
Mosquito   450 RVYAPANGGRNDLQRR-------STA---KLSSAANHSKEDIYSSTSTLKASTDRL-GSRNSIVS 503

  Fly   605 ------------KAENQHSEPKQIQPPTDA--DDGWLTVKNRRRTSMHWANRFNQPTGYASLPTL 655
                        ||.::.||||.: |.:|.  :|||.|||.:||:|:.||.||||||||||||||
Mosquito   504 GSTGKPPHSLQSKAGDRRSEPKSM-PSSDQTNNDGWYTVKTKRRSSLLWATRFNQPTGYASLPTL 567

  Fly   656 ALLNEQQKEQEHKEKQKGEDDGKVIVKTISAKTKAPIEVAKAKAKTSIVITRP-----EIKNAKA 715
            |||:|....:...||    :|.:...:.:: ..:...|:...:..:...:.:|     :.:.|..
Mosquito   568 ALLDENTNSEAQLEK----NDSQAPKENMN-NIEGDNEIGHTQRGSKRAVEKPAKPTLQARGAAP 627

  Fly   716 KVNSFPVQKSNTNQVKKPEKQEKSDTTAPAAIASSSNTRNSSHSICVGRNSIIKRQKSDLTGLKM 780
            |:|: |:  :.|....||.||:.:.....:.::|.:..:| ..|:.......:.||||||||||:
Mosquito   628 KLNA-PL--ALTMAASKPVKQQSTQLVKSSPVSSDTGAKN-QQSMAPSSRVTVSRQKSDLTGLKL 688

  Fly   781 TSLHKEYMRSEKNALRKLQQK---------------EQGNQQHNSS-SSSAETVVESCNEDH-SK 828
            .:||||::|:|     ||:.|               :.||::...: ||||:   |..|..| :.
Mosquito   689 KTLHKEFLRNE-----KLKSKHFDPQTTAGFMDMNLKNGNERKGQTISSSAQ---EGDNLIHLNM 745

  Fly   829 IDIKIQTNCEFSKTIGELYESIAHCKLPSGSLKTN--------ASTLSAC--DENEEQNTDDNEE 883
            :|:.||||.. :..|..||   |.|......:..|        ....|.|  |:.|||..||.|.
Mosquito   746 VDMNIQTNIA-TTAIDSLY---ATCMDERSEIICNGKKRVAQYVDIASQCTSDDQEEQERDDLES 806

  Fly   884 ERNERILGEVQESLERQIRELEQTEIDVDTETDETDCE--VQLEEQDDGVDGLEMGSGDDSAVFV 946
            :.::|.|.|.|||||.||||||.||||.||||||||||  :..|:.|..|:     ||.:....|
Mosquito   807 DEDQRKLLEEQESLEAQIRELENTEIDFDTETDETDCEAIIDFEDTDATVE-----SGSERPTDV 866

  Fly   947 T---MSDDENASLELRYQALLSDMSWNERAEALATLQAYVARHPGRAQELHQKLSSPSRRRSLQE 1008
            |   ..:||:.:||.||:.:|:.|:|.:||..|.||:|.|||||||||:||.|||||||||||.|
Mosquito   867 TGIEGENDEDITLEARYEHVLAGMNWVDRARTLDTLKAIVARHPGRAQQLHAKLSSPSRRRSLHE 931

  Fly  1009 TLKKYQAKQARAQQKRNLLQQEKAAKLQQLFSRVEDVKAAKNQIIEDKRQKMQGRLQRAAENREQ 1073
            |||||||||.||.:||..||:|||.|:|.|.:|||||||||..:||.||.:|:.|||||||||.|
Mosquito   932 TLKKYQAKQTRALEKRQALQKEKALKIQHLLARVEDVKAAKQCLIEKKRLRMEERLQRAAENRSQ 996

  Fly  1074 YLKQIIEKAHDEEKKLKEINFIKNIEAQNKRLDLLESSKETEGRLQDLEQERQKRVEEKLAKEAA 1138
            |||..|:||||||:||:||.||||:||||||||.|||.||.|.||||||.|||||.|||.|||||
Mosquito   997 YLKDKIKKAHDEEEKLREIAFIKNLEAQNKRLDFLESCKEQEVRLQDLETERQKRAEEKAAKEAA 1061

  Fly  1139 VERRRQALEKERLLKLEKMNETRLEKEQRIGKMQEQKEKQRQALAREKARDREERLLALQVQQQQ 1203
            ||||||.:|:||..||::|:|.|.|:|:|:||||||||:|||||||||||||||||||||.|:..
Mosquito  1062 VERRRQEIEQERQKKLQQMSENRREREKRVGKMQEQKERQRQALAREKARDREERLLALQQQKLA 1126

  Fly  1204 TTEELQRKILQKQMESARRHEENIEHIRQRALEL-TIPTRQADEGRGDQDVSEDILNGNATSTTN 1267
            |.|||||||:|||.|||||||||||.|||||:|: |||:|.|||.|.|:...|     |::.:..
Mosquito  1127 TAEELQRKIIQKQQESARRHEENIEQIRQRAVEMATIPSRSADELRNDEQDEE-----NSSVSER 1186

  Fly  1268 EDCDLSSSLSEVGGNNAHTRSYKKKMKKLKQRMNQCAAEYLESLEALPAHARRDSTVPKLLNLVV 1332
            |.       |..||.:...:..||::|||:|:::..|.|||..|..|....|:.|.||:||..:.
Mosquito  1187 ES-------SHGGGASMVPKINKKRLKKLRQKLSTAAEEYLSELNPLAPSIRKQSQVPRLLGAIA 1244

  Fly  1333 KGG-GAQGLDRNLGNLLRVIPKAQTLDFLAFLCMDGLGILANHVISKGMDENSEISRKSVYLAAQ 1396
            ||| |..|::|.:|.|:|:|.||:..||.:...:||||.:|: ||..|:...:::|:|:|.|:.|
Mosquito  1245 KGGNGVLGVERPIGQLIRLIAKAEVADFQSLWLLDGLGTIAS-VIENGLSPGTDVSKKAVVLSVQ 1308

  Fly  1397 LYRNACSVCPQIARHALLGNSITVLFDAINKSFQLPEEKSPQHPVELSTELMLACTEAL--SSSY 1459
            ||||||::||||||||:|||||.||.:|:..|.::||||:...||||||||:||||.||  :|..
Mosquito  1309 LYRNACTLCPQIARHAVLGNSILVLLNALLLSMKIPEEKNALFPVELSTELILACTVALLPTSPS 1373

  Fly  1460 VKKNTHPKVPERLPDMINYAVITGLIEILSRRIQKVRESIESNKSVMLSLLTTLGFLSRFIDVCQ 1524
            .|:.|||||.||:||:::|.|..||:|.|.:||.||.||||:..|::||||.:||.|::.:::|.
Mosquito  1374 PKQVTHPKVAERMPDLLSYIVCIGLVESLVKRIDKVHESIENQTSLVLSLLASLGLLTKLVEICP 1438

  Fly  1525 PGPADPTRLLSAAKSTELFGTVSMLYGCVMPMGECIPPRTTALAASTFHLYVSLASLDVNTFQET 1589
            .|| |.|:||..|:|||||||:|:||..|:|:||.||||||:|||:||:|.|:.|:|:|.|||..
Mosquito  1439 KGP-DVTKLLLTAQSTELFGTISLLYAAVVPIGESIPPRTTSLAAATFNLLVTFANLNVETFQAV 1502

  Fly  1590 LTVEGPLSLKLLDVMTVILN-CSLVNDQWTTNSESCPMLIDLVASMAFFCVNNRRHQDLLISEQY 1653
            | :|..||||.|||::::|. |....|   ..||:..::|||:|::.|||.||:.:||||.|:||
Mosquito  1503 L-IEENLSLKFLDVISILLQYCVPKAD---VKSETQTVIIDLIATLGFFCANNKINQDLLTSDQY 1563

  Fly  1654 AVIFKRMAKLPTQFNPVIYPFLVTVSFNNPPAREFLSKDFDLTFLDEYSKSEMAQRNVVIKLI 1716
            ..:.|..||||.||:.:.||.|||:..:||.||..:|:||::..|||:..|:||::|.:|.|:
Mosquito  1564 LCVIKNFAKLPKQFDVLTYPTLVTIIHDNPSARAVVSRDFNVELLDEFRGSDMAKKNRIISLL 1626

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ssp3NP_609917.2 SCAPER_N 113..208 CDD:406813 79/94 (84%)
Smc 878..>1192 CDD:440809 210/318 (66%)
ssp3XP_061512013.1 None

Return to query results.
Submit another query.