DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment btv and Dnah17

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001036369.3 Gene:btv / 35073 FlyBaseID:FBgn0023096 Length:4236 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038943440.1 Gene:Dnah17 / 287845 RGDID:1563805 Length:4459 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4773 Identity:1049/4773 - (21%)
Similarity:1907/4773 - (39%) Gaps:1035/4773 - (21%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    51 SDGRIRFHHRIPNEELCL-------LFYKVPQVGHHRKEDGSEPLLGILTLEGGMVKSIYNSVSR 108
            |:..::..||:.||...:       ....:|:  |....||:  |..:..:...:..|:.:|:..
  Rat   132 SEDIVKQVHRLKNEMFVMGGKIKGKTLLPIPE--HLGSLDGT--LESMERIPSSLDNSLLHSIET 192

  Fly   109 VFSPSANSARRSEYGPELSGILENLHQNLGSSLGLPQSGITSLRNEIKYWQQKLG--QKSSSRLD 171
            :....::..|..........:|:.||.       ||       |.|.::|..:|.  |....:|:
  Rat   193 IIIDWSHQIRDVLSKDSAQALLDGLHP-------LP-------RVEFEFWDARLMNLQCIHEQLN 243

  Fly   172 REAAQVFIGVLENMEK---------QISTIDGANPSGTIEEFLDHAHTNLDELWR-----LP--- 219
            |......:.:||..:.         .::...|...:..|..:|......|:|:.:     ||   
  Rat   244 RPKVNKIVEILEKAKSCYWPALQNVYMNVTQGLKEANDIVLYLKPLRILLEEMEQADFTVLPSFI 308

  Fly   220 ----------------YNYPQQRMADLLDIIGKRLLEVCLTQLLAEDVWSLNSSHVNNLM---SQ 265
                            ||.| .|:..:|.....:::|:..|.|..|:|.......:..::   ||
  Rat   309 VKVLSTICFIWATSEHYNTP-SRVIVILREFSNQIIEMTRTYLSPEEVLKGLQGEIEEVLGGISQ 372

  Fly   266 SIDTVDAWI---QLCDSLTRLFWPNYVKHPWLGDSHVP-KRGQQFKERLSEIRSIKQLYKQIATL 326
            |:..:....   ..|.:..:||:.:....||...|.:. .|...|..|   :::|:.|||.....
  Rat   373 SVGVLKELFHAYDFCCANMKLFFKDRPPVPWEFPSSLAFSRMNAFFHR---VQTIEDLYKTAIEF 434

  Fly   327 --LEDTEL----------------QEMFQEQAPFTEFNIFDTSSLGQNKWHKALQHFEQVLQPID 373
              ||..||                .|:|:....|.|.. :|....|.:.:......||..:|.:|
  Rat   435 LKLEKIELGGVRGNILGNLVTQIYDEVFELVKVFAECK-YDPLDPGDSSFDDDYNDFETKIQDLD 498

  Fly   374 ERIAAALKRQLH--NHLSNPRQVIFIFSKYETLIQRPAVL-ELL---TIEREQF---LQSLHILL 429
            .|:|....:...  |.:.:..:::::..   .|::||.:| |::   ::..|.|   |.:..::.
  Rat   499 RRLATIFCQAFDDCNCIESSAKLLYMCG---GLLERPLILVEVVPRYSVMLEMFNTELDNAKLMY 560

  Fly   430 QDLRKAMVDSNMEPDTGHLSVICNECRWLKVVQHQIQ-EIEKVSHL-------ISGREGFDKINK 486
            .....|..|..:.|...::..:..:.:|...:|.::: .::.:.|:       :..:..:||.::
  Rat   561 DAQMAASEDGQIPPIHKNMPPVAGQLKWSLELQERLEVSMKYLKHIDHPVMSSVEAKLVYDKYDE 625

  Fly   487 AVQEIKEETESLLRTNFEIWSGQCSTAVKSGELRLRDDQAVVKFEKEGRQLMRVTFNPKLVTFCQ 551
            .:..:|...|...:...|.....|.  ...|:..::.|..        ..|::|.|:..||..  
  Rat   626 MIGLLKGYREKKYQQWVEGVDQDCH--FNLGQPLIQRDPF--------SSLIQVNFSKALVAV-- 678

  Fly   552 DVREFENLGYNVPLELRAAA----THAAKYMCYARRLQQIATFHNTIGDRMIPCQRPIMLKNALE 612
             :||.:.|.:....|:.::|    :....:..:...|:.|..::|.|...::..:.|::.....|
  Rat   679 -LREVKYLNFQQQKEIPSSAEKLFSENEIFRKFVGNLELIVGWYNEIKTTVMEVEFPLIKSELEE 742

  Fly   613 LQ-RLVQSETVAWQDESSVQRYV----DILQAAVSKLSSDNTLLVGY---------------HEQ 657
            :. :|:.:||..:.:..:|..|:    :||....:::......:.|.               .:.
  Rat   743 IDVKLMSAETTLFWNGENVMEYIQEMREILHNLQNRIQKTKQNIEGITQAMQEWSANPLFERKDN 807

  Fly   658 AKRSVLKL--------------------------MSTDLF---TQNQIWKDELRHLRELVATLER 693
            .|.::|.|                          .:.:||   |.:|.|||.:.::..:|     
  Rat   808 KKEALLDLDGRVANLNKRYAAVKDAGVRIQAMVTENAELFKADTTSQPWKDYVNYIDAMV----- 867

  Fly   694 QGYTHLDAFKLHWDHQLYKVLEYQYILGLLDM----NNKLPDIHVKLVLRQRELVFSPPEEEIRE 754
                 ||.|    |..:.|.|.|     |:|.    .|..|...:::.|.:..|.|:|.      
  Rat   868 -----LDEF----DRFIRKSLNY-----LMDNMTMDENIAPLFEIRMELDEDGLTFNPT------ 912

  Fly   755 LYFSQLRRFIERPCNFHGLSEHSQELFKSMV--TVNRHHFGPLYQRAAELFDKLQDFKTIWLPWI 817
                              |....::.|.|::  .:|     .|| ..|.|           :|.:
  Rat   913 ------------------LEMGDEDSFLSLIEGLIN-----DLY-NVARL-----------IPRL 942

  Fly   818 ALGCVDVDQLCGIHLNEAGDWDRNFRSCKHFSQQLAKLQQAEESIDCIVINVLPLRSDIEYISRR 882
            |.|.:                  |::|   ..:.:..|.:..|.:..:||..:.:..:.:....|
  Rat   943 AKGRI------------------NYKS---DLEDITDLIEMREELSSLVIGAMKVAEEYQDSFER 986

  Fly   883 Y---WESLANSLRTAILTDVSLIQEFLQSALQF-------------LQNVPMDEGSISQSGMK-- 929
            |   |              |..:|||:::.|.|             ...:|..:.:::|...:  
  Rat   987 YSYLW--------------VDDLQEFMKNFLIFGHAPTPEELDTKIDDTIPKTQPTLAQFQQQID 1037

  Fly   930 -YEKIMSKLPQIEKTLEAVRAKDSCLGGW----CKERVTALSGILLQWEQL-QPLLENHAV---- 984
             |||:..::.:.|.|        ....||    |:....||...:.:|..| :..|.:|.:    
  Rat  1038 SYEKLYEEVSRCENT--------KVFHGWLQCDCRPFKQALLNTIKRWSLLFKRYLSDHVINSLA 1094

  Fly   985 ----------------------------------ILQRQV-------------DMIKNQAE---- 998
                                              :.:|||             :::|:..|    
  Rat  1095 DLESFMGVTRTGLKKPLKEGDYDGLVEVMGHLMKVKERQVATDSMFEPLKQTIELLKSYGEEMPE 1159

  Fly   999 ---TQLQNLKNE---AEKFLLRWESTISELEANEHSTLDVFKERRLHWQQLQEKKTQLLEECSKF 1057
               .:||.|..:   .:|..::.:..::.|:|||.:.|      |...||.:.|:.:..|   ||
  Rat  1160 ETYLKLQELPEQWTNTKKLAIQVKQNVAPLQANEVNIL------RRKCQQFELKQHEFRE---KF 1215

  Fly  1058 NMEFPAEMLTP------------FTEIEEQMEKQSKQWQVYDSFLTELQP---------VLHEEW 1101
            ..:.|.....|            .:.:|..||...|...:::..:.:.:.         :|.|.|
  Rat  1216 RRDAPFTFSDPDPYKSLNKQQKSISAMEGVMEALCKSGSLFEVTVPDYKQLKACHKEVRLLKELW 1280

  Fly  1102 AIYRRRPYVLNEFIGKWEGSVHASI-----DLPSKRIRQQVEQLQ-------------------- 1141
            .:.    .::|..|..|:.:....|     |:..|:..:.|..|.                    
  Rat  1281 DMI----VMVNTSIDDWKTTKWKDINVEQMDIDCKKFAKDVRSLDKEMKAWDAFVGLDNTVKNMI 1341

  Fly  1142 SALPILQQLQSESLSERHWARIFQLLNHK-----ETKPLHSILLQDILQDFDVLQSAAQEISSIV 1201
            ::|..:.:||:.::.||||.::.|....|     ||      .|.|:||  ..|.....|:.:||
  Rat  1342 TSLRAVSELQNPAIRERHWQQLMQATQVKFEMSEET------TLADLLQ--LNLHKYEDEVRNIV 1398

  Fly  1202 RQASSEQIVRQALIELDQ-WS-VTAQLKLITRTDASGQSVSLIKDYQEVLNKIGDNQSLLQSANN 1264
            .:|..|..:.:.|..||. || :..:.:|..||     ...|:|..:.::..:.|||..||:...
  Rat  1399 DKAVKESGMEKVLKTLDSTWSTMEFEHELHPRT-----GTMLLKSDELLVETLEDNQVQLQNLMM 1458

  Fly  1265 SAAFESFSDQAELWESRLNTLDALLSSLNHSQRRWVYLEPVF-GS----GTLQHEQALFKRIDKD 1324
            |.....|..:...|:.:|:|.|:::|.....||.|.:||.:| ||    ..|..:...|..||::
  Rat  1459 SKYLSHFLKEVTSWQQKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRAQLPEDSRRFDSIDQE 1523

  Fly  1325 FRFVMREIEMDPRVTSLTKINNITTIVNALETQLARCQQNLMSYITDKRNSFPRFYFLGDDDLLE 1389
            |:.:|.:....|.|...|....:...:..|:..||.|::.|..|:..||.:||||||:...|||:
  Rat  1524 FKALMEDAVKTPNVVEATNKPGLYDKLERLKKSLAVCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLD 1588

  Fly  1390 LLGQASKDAEVIQRHIRKLFPGCHSLSIR-QVGPNPATSSDVNQYSITSVHSAEGDELKLSQPVE 1453
            :|...:...|| .||:.|||.....|..| ....||....       ..::|.|.:.:...:..:
  Rat  1589 ILSNGNDPVEV-SRHLSKLFDSLCKLKFRLDASGNPIKVG-------LGMYSKEDEYMDFDKECD 1645

  Fly  1454 MKGDIERWLNQLVTVVQDTLRDQIYECYTGTTGGSDNLDEKILKK----YASQVLATARALHFTR 1514
            :.|.:|.|||:::..:..|||.:|.|...       ..:||..::    |.:||..|...:.:|.
  Rat  1646 LSGQVEVWLNRVLDRMCATLRHEIPEAVV-------TYEEKPREQWIFDYPAQVALTCTQIWWTT 1703

  Fly  1515 QAEQAIGSMSLG---KLKQQLKDEITHLAALKNKSENGTLI--------SLKLRALLLDLVHYSG 1568
            :...|...:..|   .:|...|.:|:.|.||.      ||:        .:|:..:....||...
  Rat  1704 EVGLAFARLEEGYENAIKDYNKKQISQLNALI------TLLIGNLSAGDRMKIMTICTIDVHARD 1762

  Fly  1569 VTEQLQKHNVVHTSDWHWLCQLRYYLGKKGGTSGEVNANRQVCVRMVYAEFEYAYEFLGQASKLV 1633
            |..::....|..:..:.|..|||:...::         .:.....:..|:.:|:||:||...:||
  Rat  1763 VVAKMITAKVESSQAFTWQSQLRHRWDEE---------KKHCFANICDAQIQYSYEYLGNTPRLV 1818

  Fly  1634 HTRLTHRCYLILTQAMHMGLGGNPFGPAGTGKTECVKALGAMLGRLVLVFNCDENVDTESMSLIL 1698
            .|.||.|||:.|||::|:.:||.|.|||||||||..|.||..||.:|.||||.|.:|.:|...|.
  Rat  1819 ITPLTDRCYITLTQSLHLIMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGTMVYVFNCSEQMDYKSCGNIY 1883

  Fly  1699 TGLARCGAWGCFDEFNRLQEATLSSISMLIQPIQSALKERANSVQIGERQIQLNQHCGIFVTLNP 1763
            .|||:.|||||||||||:....||.|::.::.:|.|::.:..........|.|....|||:|:||
  Rat  1884 KGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVIAVQVKCVQDAIRAKKKKFNFLGEMISLIPTVGIFITMNP 1948

  Fly  1764 AGAEYGGRQKLPGNIQALFRPIVMQQPEPGEIARVMLFVEGFTEASAIASRIVELFELSGKMLSA 1828
            .   |.||.:||.|::|||||..|..|:...|..:||..|||.||..:|.:.:.|:.|..::||.
  Rat  1949 G---YAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFLEARLLARKFITLYTLCKELLSK 2010

  Fly  1829 QRHYDWGLRELKTVLMVCGEGLR-DQLTSEDNNQSSANFEMSVVVRCLRSSTMSKLAPHDVNRFE 1892
            |.|||||||.:|:||:|.|...| |...:||          .|::|.||...:.|:...|:..|.
  Rat  2011 QDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPTRAED----------QVLMRALRDFNIPKIVTDDLPVFM 2065

  Fly  1893 MLLRNVFPEIGSSPAPETQLHQSLSAAFAQLGLCRSERQIEKALQLHEQLQKRMGVVLVGPPGCG 1957
            .|:.::||.:......:....:.:..:..:|.|...:..:.|.:||.|.||.|..|.::|..|.|
  Rat  2066 GLIGDLFPALDVPRKRDLNFEKIIKQSIVELKLQAEDSFVLKVVQLEELLQVRHSVFVIGNAGSG 2130

  Fly  1958 KSTIISLLKQALCGTQLK--VHTISPKSMSRIQLLGRLDADTRQWQDGVLTHTAVAVNQESSQVH 2020
            ||.::..|.:.....:.|  ...:.||:::..:|.|.::..||:|:||:.:.....:...:....
  Rat  2131 KSQVLKSLNKTYQNMKRKPVAVDLDPKAVTCDELFGIINPATREWKDGLFSTIMRDLANITHDGP 2195

  Fly  2021 SWIVCDGSIDPEWIEALNSVLDDNKLLTLPSGWRIQFGSNVNFIFETDDVRHASPATISRMGIVN 2085
            .|||.||.|||.|||:||:|:||||:|||.|..||.....:..:||...:|.|:|||:||.||:.
  Rat  2196 KWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNRTMRLVFEISHLRTATPATVSRAGILY 2260

  Fly  2086 MSYDYYPADGILKHELSKEPYGDLLQSYVDGNFQYAVNWIESQ-----------LLLTHLP---- 2135
            ::    |||      |...|              ...:|||.:           |...:||    
  Rat  2261 IN----PAD------LGWNP--------------VVSSWIERRKVQSEKANLIILFDKYLPTCLD 2301

  Fly  2136 ----GINR-------------AHLLRSLLLQLHGTQSLEEYGAATLRALFGYMPNDRQREFAQLI 2183
                |..|             .:||..||.:.:.                   |.|..:|..:|.
  Rat  2302 KLRFGFKRITPVPEITVIQTILYLLECLLTEKNA-------------------PPDSPKELYELY 2347

  Fly  2184 LKHANLYVANPN--YAELTHYESSRNSLEQYAVDAIETPEKGSQLIITSYMKSYLD--------- 2237
            ...|..:.....  ..:|..|   |....::.::..:|.:..||..|..|   |:|         
  Rat  2348 FVFACFWAFGGAMFQDQLIDY---RVEFSKWWINEFKTIKLPSQGTIFDY---YIDPETKKFLPW 2406

  Fly  2238 --------------ILETLLKTQGT------------RLPPFMLIGPSGSGKTLLLQRAVLENSG 2276
                          :..:|:.|..|            :..|.||:|.:|:||::|:        |
  Rat  2407 TDKVPNFELDPDIPLQASLVHTTETIRIRYFMDLLMAKAWPVMLVGNAGTGKSVLM--------G 2463

  Fly  2277 YQLATINCSTQLTPRYILHTLKTHCVTVSGI------------KGREYRPK-QARLVLFMKNLDL 2328
            .:|..::     |..|::..:..:..|.|.:            .||.|.|. ..:|:.|:.::::
  Rat  2464 DKLENLS-----TDDYLVQAVPFNFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTKKLIYFIDDMNM 2523

  Fly  2329 CQQDSWGACEVVELLFQ-LAQRGGFYAENLEWIGVSGLQLCASIGGNTGK--IAP---RYFAINQ 2387
            .:.|.:|......|:.| :..|..:..:.|....|...|..|.:...:|.  |.|   |:|.:  
  Rat  2524 PEVDKYGTVAPHTLIRQHMDHRHWYDRQKLTLKDVHNCQYVACMNPTSGSFTIDPRLQRHFCV-- 2586

  Fly  2388 FVRVSRPTSQDMLEIVQRRLEPLLEEHFRGSENRGRSGVN--LQHVSESLMDCFEKLQATF--TN 2448
             ..||.|..:.::.|    ...:|.:|.  |.....|.:.  ..|:..:.:...:|:.|||  |.
  Rat  2587 -FAVSFPGHEALITI----YNTILAQHL--SYRSAPSVIQRLCSHLVTAALALHQKVAATFLPTA 2644

  Fly  2449 VGGRQAHYQFSPKCIMKLLDALVFYPAS------DFNEALYCELLGMFRDRLISEEHVQQFEGIL 2507
            :   :.||.|:.:.:..:...::|....      |.......|...::.|:::.|:..:....:.
  Rat  2645 I---KFHYIFNLRDLSNIFQGILFSTLEILRTPLDIVRLWLHEAERVYGDKMVDEKDQETLRRVT 2706

  Fly  2508 KQTMRKYY---GKEKVFFVPK----------SPK-----SRGHLHCLTHDEWMEEVQRQVTICNT 2554
            ..:.:|::   |:|.:|..|.          .||     ...||:.|..|        .:...|.
  Rat  2707 MASTKKFFDDLGEEHLFAKPNIFCHFTQGIGDPKYFPVTDVAHLNKLLKD--------VLDSYNE 2763

  Fly  2555 ENYSITAPITEELLSHVARITRVLS--RTDAHMLILGQSGGRHLDAIFTAATFQEAKVVTLQGGP 2617
            .|..:...:.|:.::|:.||.|:|.  |.:|.::.:|.||.:.|..:....:..:...:||:.| 
  Rat  2764 VNAVMNLVLFEDAVAHICRINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLSRLAAYISALDVFQITLKKG- 2827

  Fly  2618 SYDLTDFYNDLKVAMQTAALEQQMSYLLI------EQCWLSYVPDILKPIEALLEGSEILELFG- 2675
             |.:.|...||......:|::...|..|:      |:.:|..:.|       ||...||..||| 
  Rat  2828 -YAIPDLKMDLAAQYIKSAVKNVPSVFLMTDSQVAEEQFLVLIND-------LLASGEIPGLFGD 2884

  Fly  2676 DDLETVASTLKQAAQLEGY---QESMGTYFLKRARDYLHIIIVLDPNSAKVQDYFNNFPAL---- 2733
            ||||.:.|:::...:..|.   :|:...:|:::.|..|.:|:...|..:.::.....|||:    
  Rat  2885 DDLENIISSMRPQVKSLGMTDTREACWKFFIEKVRKQLKVILCFSPVGSVLRVRARKFPAVVNCT 2949

  Fly  2734 -----HRQMDLLYVRGESR---ETIAILP--KQFIELLNESIAGGGSGRGKVPTCSHFADISDEL 2788
                 |...:...|...:|   ||..|.|  |..|.|....:....:...|    ::.|  ::..
  Rat  2950 AIDWFHEWPEDALVSVSARFLQETQGIQPEVKTSISLFMSYVHTTVNEMSK----TYLA--TERR 3008

  Fly  2789 PSEETSQRYYQLIRTYFHMYNNAANEIDQRLGKLQMGVDKLASAHALVDTLKSNAAAQEQALGEK 2853
            .:..|.:.:.:.|:.|.::......|:..::.:|:.|:.||.|..:.||.||:..|.||..|.:|
  Rat  3009 YNYTTPKTFLEQIKLYQNLLAKKRMELVAKIERLENGLMKLQSTASQVDDLKAKLAVQEAELKQK 3073

  Fly  2854 RQLANEALEMISFTMRNANEQKSSMLELKQQTQKSSEQLKIRQKEIQQELAEVEPILAEASNAVG 2918
            .:.|::.::::.......:::|:...|.:.:.:..::.:..:||..:.:||:.||.|..|..|:.
  Rat  3074 NENADKLIQVVGVETEKVSKEKAIADEEEIKVEVINKNVTEKQKACETDLAKAEPALLAAQEALD 3138

  Fly  2919 QIKSEALSEIRSLRAPPEAVRDILEGVLRLMG-----IRDTSWNSMK-------TFL--AKRGVK 2969
            .:....|:|::|..:||:||.::...|:.|..     .:|.||.:.|       |||  .||..|
  Rat  3139 TLNKNNLTELKSFGSPPDAVVNVTAAVMILTAPGGKIPKDKSWKAAKIMMGKVDTFLDSLKRFDK 3203

  Fly  2970 EDIRSLDPARISPENCEAVERLLLAKGD-SYEAKNAKRASAAAAPLAAWVQASVRYSRVIQSIKP 3033
            |.|         ||.|  ::.....:|: :::.:..:..|.|||.|.:|....||:..|...:.|
  Rat  3204 EHI---------PEAC--LKAFKPYQGNPTFDPEFIRSKSTAAAGLCSWCINIVRFYEVYCDVAP 3257

  Fly  3034 LEREQNELQKNLNAAEDEMQELASGLDDVDKRVKQLSAKLQTYTQEAAVLELKLQEASGT---LQ 3095
            ..:...|....|..|:|::..:.:.:.:::..:..|::..:..|.|....:   |||..|   :.
  Rat  3258 KRQALEEANAELAEAQDKLSRIKNKIAELNANLNNLTSAFEKATAEKIKCQ---QEADATNRVIS 3319

  Fly  3096 AAELLVEKLSAEYTTWSLQLTELKKAHKTLDAKTLLIAIAINYCAGLGLEQRCSSLKRLAADFHL 3160
            .|..||..|::|...|:..:...:....||....|||:..::|......:.|    ..|...|.:
  Rat  3320 LANRLVGGLASENVRWAESVENFRSQGVTLCGDVLLISAFVSYVGYFTKKYR----NELMEKFWI 3380

  Fly  3161 PSDFDLRG-----------SLLTEQQQI-IWESQGLARDAQIIESAALLREMLSLPYGACPI--- 3210
            |...:|:.           :|||:...: .|.:|||..|....|:|.:|          |..   
  Rat  3381 PYVNNLKVPIPITEGLDPLTLLTDDADVATWNNQGLPSDRMSTENATIL----------CNTERW 3435

  Fly  3211 PLLLDPTQTAAAWLMAHLKGSGRPCELTTHGND----RLPYQ-----LELAVRFGKTLLVTDCEQ 3266
            ||::|.......|:.            ..:|::    ||..:     :|.|:..|.|||:.:..:
  Rat  3436 PLIVDAQLQGIKWIK------------NKYGSELKAIRLGQKSYLDIIEQAISEGDTLLIENIGE 3488

  Fly  3267 LRPPVLQLLQGHVFVRFNKRQLAIGSKLVDLHESFQLVLISKSHRLDLPEEQRSQLNVLKFTVTA 3331
            ...|||..|.|...:: ..|.:.||.|.|:.|.||:|:|.:|........|.::|..::.|.||.
  Rat  3489 TVDPVLDPLLGRNTIK-KGRFIKIGDKEVEYHPSFRLILHTKYFNPHYKPEMQAQCTLINFLVTR 3552

  Fly  3332 AGLADQLMSKAIVLKNGELEQQRIELLQKEGHLLKQRMEMQDKLLEQLSKSEGDILKNEQLLESL 3396
            .||.|||::..:..:..:|||.:..|.:.:........|::|.||.:||.:.|:.|.:..|:|:|
  Rat  3553 DGLEDQLLAAVVAKERPDLEQLKANLTKSQNEFKIVLKELEDSLLARLSAASGNFLGDTALVENL 3617

  Fly  3397 NEIKQGSTQIDEALKQSGQIRDTLLAQF-GSLRELSSRAATFYAGLIQGYELSPLVYIEL----- 3455
            ...|..:.:|:|.: |..:|.:|.:.:. .:.|..::||:..|..|....:::|:....|     
  Rat  3618 ETTKHTANEIEEKV-QEAKITETKINEARENYRPAAARASLLYFILNDLNKINPIYQFSLKAFNV 3681

  Fly  3456 -FLGALSKSQRDES------KVYDCLVRSVYMNLARATSRDSQLSLSLWVCHQ--AYPDRLNPKE 3511
             |..|:.|:...|.      .:.|.:..||||..||......:|.....|..|  :....|||.|
  Rat  3682 VFEKAIQKTPPAEEVRQRVINLTDEITYSVYMYTARGLFERDKLIFLAQVTFQVLSMKKELNPVE 3746

  Fly  3512 WELFVN-----------NFM--GSSDGSMVLSQLGKLPDCMPKEAQLKLAMLLQLFPDLRSKLQL 3563
            .:..:.           :|:  .|..|...||::.:                   |.:|.|.::.
  Rat  3747 LDFLLRFPFKAGVVSPVDFLQHQSWGGIKALSEMDE-------------------FKNLDSDIEG 3792

  Fly  3564 EKDYIWRGFIEAQA--DDVLP---ALGSSFQRVLIAQIFRPDLMLHQLRKVSSDLLGISPDASTQ 3623
            .... |:..:|::|  .::.|   ...::.|::.:.:..|||.|.:.::....:.:|........
  Rat  3793 SAKR-WKKLVESEAPEKEIFPKEWKNKTALQKLCMVRCMRPDRMTYAVKNFVEEKMGSKFVEGRS 3856

  Fly  3624 PSVEQLLQQSSCDRPILMVSHAENDPTTELRKWA--------NQKYREMAIGKGVEKRVLSEMRQ 3680
            ....:..::||...||..:.....||..::....        |.|...:::|:|.|......:..
  Rat  3857 VEFSKSYEESSPSTPIFFILSPGVDPLKDVEALGKKLGFTIDNGKLHNVSLGQGQEVVAEDALDV 3921

  Fly  3681 AAIDGHWLCVKNVHLVPEFLTQMERELSEIQKS--KDFRLWLLCE-----STEGFSEAAIYKCLK 3738
            ||..|||:.::|:|||..:|:.:::::......  :|:|:::..|     .|....:..:...:|
  Rat  3922 AAEKGHWVILQNIHLVARWLSILDKKVERYSSGSHEDYRVFISAEPAPSVETHIIPQGILENAIK 3986

  Fly  3739 VRYEQPKGLKQIVMRLLQNFAAEQDQKLKNQPKSLKMRLVYFVLT---AVLQQRRQFIPQGWSKY 3800
            :..|.|.|:...:.:.|..|.  || .|:...|.::.:.:.|.|.   ||:.:||:|..|||::.
  Rat  3987 ITNEPPTGMYANLHKALDLFT--QD-TLEMCTKEIEFKCILFALCYFHAVVAERRKFGAQGWNRS 4048

  Fly  3801 YEFGEADLKAALGILRMMDQQLNSG-KCDWLLMQRLSEALAYGGRVNNQRDLEILTTYLNQFCSA 3864
            |.|...||..::.:|.   ..|.:. |..|..::.|...:.|||.:.:..|..:..|||.:|...
  Rat  4049 YPFNNGDLTISINVLY---NYLEANPKVPWDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLIEFIRV 4110

  Fly  3865 DVLSNRWSPLGLSLSIPTSGQLQDYYAALEKLPDTDEPSMYGLANQAQQQREI-------EQAKR 3922
            ::|... ..|.....||.:...:.|:..:::....:.|.:|||...|    ||       |:..|
  Rat  4111 EMLEGE-VLLAPGFQIPPNLDYKGYHEYIDENLPPESPYLYGLHPNA----EIGFLTVTSEKLFR 4170

  Fly  3923 VIKELRGLHYGRGLAKDSG-GAGESKGNDQLTGRQKLEQQIKPLL-NLWRKLAASCTIIQTMKEA 3985
            .:.|::...      .||| |.|.|:           |:::|.:| ::..|:..:..:.:.|.:|
  Rat  4171 TVLEMQPKE------TDSGAGTGVSR-----------EEKVKAVLDDILEKIPETFNMAEIMAKA 4218

  Fly  3986 KTDVGESPWALFVLAELKLGADLYGIVHQTLSQMHAWLKESQEV--DGSTLRT-LAEQQIPASWL 4047
               ..::|:.:....|.:....|...:.::|.:::..||....:  |...|.| |....:|.:|:
  Rat  4219 ---AEKTPYVVVAFQECERMNILTNEMRRSLKELNLGLKGELTITTDMEDLSTALFYDTVPETWV 4280

  Fly  4048 -KLWPGPGSNSA--VDFLRALIVRAQAAELRFREQMHLDFV--EDINFVQVFNCENLLSCLKLLQ 4107
             :.:|.....:|  .|.|:         .:|..|....||.  ..:.....||.::.|:.:....
  Rat  4281 ARAYPSMMGLAAWYSDLLQ---------RIRELESWTTDFALPTTVWLAGFFNPQSFLTAIMQSM 4336

  Fly  4108 SRKLAVSTERLELQTCGSSNLESDSSDIILKLAP---------LKIDGA----QSGMGKSNPFYI 4159
            :||.....:::.|....:.....|.:      ||         |.::||    |:|:      ..
  Rat  4337 ARKNEWPLDKMCLSVEVTKKTREDMT------APPREGSYVYGLFMEGARWDTQTGV------IA 4389

  Fly  4160 KYKIKD------------------EVQNVSHTTTSSSKYGKNSLYSTQNAESKPKLPLYSRSSRD 4206
            :.|:||                  |.:|:.......::....:...|.|.::|.|          
  Rat  4390 EAKLKDLTPVMPVIFIKAIPVDRMETKNIYECPVYKTRIRGPTYVWTFNLKTKEK---------- 4444

  Fly  4207 KLICHLNVDIVTGTAEQILLAGTALIVE 4234
                          |.:.:||..||:::
  Rat  4445 --------------AAKWILAAVALLLQ 4458

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
btvNP_001036369.3 DHC_N1 <219..627 CDD:462457 85/473 (18%)
DHC_N2 1069..1480 CDD:462462 115/457 (25%)
DYN1 <1435..3924 CDD:227570 670/2749 (24%)
AAA_6 1621..1959 CDD:463697 136/338 (40%)
Dnah17XP_038943440.1 DHC_N1 187..764 CDD:462457 108/611 (18%)
DHC_N2 1266..1672 CDD:462462 111/430 (26%)
DYN1 1493..4124 CDD:227570 702/2839 (25%)
AAA_6 1806..2132 CDD:463697 136/338 (40%)
MT 3040..3383 CDD:463699 88/360 (24%)
Dynein_C 4162..4457 CDD:465677 63/359 (18%)

Return to query results.
Submit another query.