DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment btv and Dnah7

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001036369.3 Gene:btv / 35073 FlyBaseID:FBgn0023096 Length:4236 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001406479.1 Gene:Dnah7 / 252893 RGDID:621798 Length:4023 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4383 Identity:971/4383 - (22%)
Similarity:1765/4383 - (40%) Gaps:883/4383 - (20%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   314 RSIKQLYKQIATLLEDTELQEMFQEQAPFTEFNIFDTSSL------GQNKWHKALQHF---EQVL 369
            |::.||     ||   |.::..:|:.||....|:...:.:      .:..:.:.::||   .::|
  Rat    40 RALPQL-----TL---TGVKPQWQQTAPSFHLNVKQENPIEPYNVKNEQSYAEYMEHFGKKGKLL 96

  Fly   370 QPIDE-RIAAALKRQLHNHLSNPRQVIFIFSKYETLIQRPAVLELLTIEREQFLQSL-HILLQDL 432
            ..||: |.|.:..|   :.:.:|.:                       |||.|..:| ::::|. 
  Rat    97 DQIDDTRSAPSTSR---SKVKSPHK-----------------------ERENFRSTLVNVIMQQ- 134

  Fly   433 RKAMVDSNMEPDTGHLSVICNECRWLKVVQHQIQ-EIEKVSHLISGREGFDKINKAVQEIK--EE 494
                 ||::|||      :.:|....|.....|: :|.:..:.|  ..|.|..|.|..|..  |.
  Rat   135 -----DSSLEPD------VTDESGIPKATTSAIEKDILRYYYYI--HHGIDTDNVAPMEDSWLEH 186

  Fly   495 TESLLRTNFEIWSGQCSTAVKSGELR----LRDDQAVVKF------EKEG----------RQLMR 539
            ...|:..:.::.:.  |..|.|.|:|    |...:::|.|      |||.          |..|.
  Rat   187 VLQLVPQHLKVLTN--SITVLSDEMREDYLLSVKKSIVDFVLKDPREKEDDTKITELPPHRAEME 249

  Fly   540 V---------------------TFNPKLV--------TFCQ----DVREFENLGYNVPLELRAAA 571
            |                     ..||.::        ||.:    |:.||.|  ....|||....
  Rat   250 VLPKPWRRSFLSACSYIRDHLNAMNPTMLAVLDLWHSTFKKLRLVDIEEFHN--RQDALELSGFQ 312

  Fly   572 THAAKYMCYAR-------------------RLQQIATFHNTIGD------RMIPCQRPIMLKNAL 611
            ....|:|..|:                   :.:|:.|     ||      ....|...:|   .|
  Rat   313 NIVIKHMESAKETLLKTWFPEVQNIYYQGNKKKQLPT-----GDSSAKLESFFNCAATLM---TL 369

  Fly   612 ELQRLVQSETVAWQD---------------------------------ESSVQRYVDILQ----- 638
            :||.|:   .|:.||                                 |.....|:|||.     
  Rat   370 QLQDLI---LVSMQDFTDLIAQPPESIRAFEHPGFIMRLVLDKKAVKFEPEFTDYIDILVNVYEI 431

  Fly   639 --AAVSKLSSDNTLLVG-YHEQAKRSVLKLMSTDLFTQNQIWKDELRH--LRELVATLERQGYTH 698
              .|||.:....|.|.. :..::|.:.||.:..|......  |:::|.  |||.||..|     |
  Rat   432 MIKAVSFVPRVETKLYSKWESKSKPTTLKPIILDEIIDAH--KEKIREVVLRESVAPTE-----H 489

  Fly   699 LDAFKLHWDHQLYKVLEYQYILGLLDMNNKLPDIHVKLVLRQRELVFSPPEEEIRELYFSQLRRF 763
            |..:.           :||:                 |:.||       .|::|.|        |
  Rat   490 LKMYD-----------KYQF-----------------LITRQ-------AEQDIEE--------F 511

  Fly   764 IERPCNFHGLSEHSQELFKSMVTVNRHHFGPLYQRAAELFDKLQ--DFKTIWLPWIALGCVDV-- 824
            :.:..|:..|.|..::                ||:..|   ::|  ..||:.|....:.|.::  
  Rat   512 LTQSQNYERLIEEIRK----------------YQKLGE---EIQYTSRKTVRLGMFEMHCEELIR 557

  Fly   825 ------DQLCGIHLNEAGDWDRNFRSCKHFSQQLAKLQQAEESIDCIVINVLPLRSDIEYISRRY 883
                  |.:||                    :.:||:.:..:.::.:      |..:.|.|:.: 
  Rat   558 SLVKRADIICG--------------------KLIAKMFRDHQEVNTM------LCEEFEKIAEK- 595

  Fly   884 WESLANSLRTAILTDVSLIQEFLQSALQFLQNVPM-DEGSISQSGMKYEKIMSKLPQIEKTLEAV 947
              :|:....||.|.:       :::.:|.::...| |.|         ::::.....:...:|.|
  Rat   596 --ALSTPPNTAELME-------MKAHIQKVETTDMLDLG---------QRLVDSKNCLAFLIECV 642

  Fly   948 RAKDSCLGGWCKERVTALSGILLQW-EQLQPLLENHAVILQRQVDMIKNQAETQLQNLKNEAEKF 1011
            ....:.:         .|:..:.|| .::..:.:.|..|       ||::.|...:.||...|:|
  Rat   643 NFSPADI---------RLNNSVFQWYGRMGEIFDEHRKI-------IKDKTEQYQEGLKLRCERF 691

  Fly  1012 LLRWESTISELEANEHSTLDVFKERRLHWQQLQEKKTQLL--------EECSKFNMEFPAEMLTP 1068
                   :.|||:......:.:....|...|...||.|:|        ::..:||.|..|....|
  Rat   692 -------VEELESYAKQAEEFYTFGDLQDVQRYLKKAQVLNSKLDAAADKIEQFNAEEEAFGWIP 749

  Fly  1069 FT-----EIEEQMEKQSKQWQVYDSFLTELQPVLHEEWA---IYRRRPYVLNEFIGK-WEG---- 1120
            ..     :|::.:....:.::....|.|:     |..|.   .::..|..:...:|. |.|    
  Rat   750 SVYPQRKKIQDGLNPYLRLYETAVEFSTK-----HRAWTEGPYHKVNPDQVEADVGNYWRGLYKL 809

  Fly  1121 --SVHASIDLP-----SKRIRQQVEQLQSALPILQQLQSESLSERHWARIFQLLNH----KETKP 1174
              :.|   |.|     :|::|.:||..:..:|::|.:.:..|..|||..:..::.:    .:...
  Rat   810 EKAFH---DSPNALAMTKKVRARVEDFKQYIPLVQVICNPGLRPRHWEAMSAIVGYPLQPSDDST 871

  Fly  1175 LHSIL---LQDILQDFDVLQSAAQEISSIVRQASSEQIVRQALIELDQWSVTAQLKLITRTDASG 1236
            :.|.:   |:..|..|:.:..||.:..|:.:...                     |::|..:|  
  Rat   872 VFSFIDMNLEPFLDRFEGISEAASKEYSLEKSMD---------------------KMMTEWEA-- 913

  Fly  1237 QSVSLIKDYQE----VLNKIGDNQSLL-------QSANNSAAFESFSDQAELWESRLNTLDALLS 1290
             ...:|..|:|    :|:.:.|.|.||       |:...|...:.:..|...||.:|..|..:|.
  Rat   914 -MEFVIHPYRESGTFILSAVDDIQMLLDDHIIKTQTMRGSPFIKPYEKQMREWEGKLLLLQEILD 977

  Fly  1291 SLNHSQRRWVYLEPVFGS----GTLQHEQALFKRIDKDFRFVMREIEMDPRVTSLTKINNITTIV 1351
            .....|..|:||||:|.|    ..:..|...|..:||.:|.||:.:..:..|.::..|..:...:
  Rat   978 EWLKVQATWLYLEPIFSSPDIMSQMPEEGRRFTAVDKTWRDVMKMVVQNKHVLAVVTIERMLERM 1042

  Fly  1352 NALETQLARCQQNLMSYITDKRNSFPRFYFLGDDDLLELLGQASKDAEVIQRHIRKLFPGCHSLS 1416
            ......|....:.|..|:..||..||||:||.:|:|||:|.: :||...:|.|::|.|.|...:.
  Rat  1043 KKSNELLELILKGLNEYLEKKRLFFPRFFFLSNDELLEILSE-TKDPTRVQPHLKKCFEGIARVE 1106

  Fly  1417 IRQVGPNPATSSDVNQYSITSVHSAEGDELKLSQPV---EMKGDIERWLNQLVTVVQDTLRDQIY 1478
            ..:.            ..||.:.|:||:.::|...:   :.:|.:|:||.:|..::..::...|.
  Rat  1107 FTET------------LDITHMKSSEGEVVELVDTISTTKARGQVEKWLVELERIMIKSIHKVIG 1159

  Fly  1479 ECYTGTTGGSDNLDEKILKKYASQVLATARALHFTRQAEQAI--GSMS----LGKLKQQLKDEIT 1537
            :..|..|   .|.....::.:..|.:.......:|.:.:.||  |..:    |||...|:.|.:|
  Rat  1160 DAITAYT---KNARINWVRDWPGQTVLCVSQTFWTVEVQVAIPMGHKALEDYLGKCNHQIDDIVT 1221

  Fly  1538 HLAALKNKSENGTLISLKLRALLLDLVHYSGVTEQLQKHNVVHTSDWHWLCQLRYYLGKKGGTSG 1602
            .:....:|....||.:|    ::|| ||...|...|.|..:...:|:.||.|||||..:      
  Rat  1222 LVRGKLSKQNRVTLGAL----VVLD-VHARDVLANLVKKRISDDTDFEWLSQLRYYWHE------ 1275

  Fly  1603 EVNANRQVCVRMVYAEFEYAYEFLGQASKLVHTRLTHRCYLILTQAMHMGLGGNPFGPAGTGKTE 1667
                 ..:..:|:.|...|.||:||.:.:||.|.||.|||..|..|:|:.|||.|.|||||||||
  Rat  1276 -----NNLETKMINAGLRYGYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRTLFGALHLHLGGAPEGPAGTGKTE 1335

  Fly  1668 CVKALGAMLGRLVLVFNCDENVDTESMSLILTGLARCGAWGCFDEFNRLQEATLSSISMLIQPIQ 1732
            ..|.|...:.:..:||||.:.:|..::.....||..||||.|||||||:....||.::..|..||
  Rat  1336 TTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFFKGLLSCGAWACFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTIQ 1400

  Fly  1733 SALKERANSVQIGERQIQLNQHCGIFVTLNPAGAEYGGRQKLPGNIQALFRPIVMQQPEPGEIAR 1797
            ..:......:.....:::|:..|.:|:|:||.   |.||.:||.|::||||.:.|..|:...||.
  Rat  1401 IGINSGTELLVFEGTELKLDPTCAVFITMNPG---YAGRSELPDNLKALFRTVAMMVPDYAMIAE 1462

  Fly  1798 VMLFVEGFTEASAIASRIVELFELSGKMLSAQRHYDWGLRELKTVLMVCGEGLRDQLTSEDNNQS 1862
            ::|:..||..|..::.:||..:.|..:.||:|.|||:|:|.:|:||...| .|:.:..:|:    
  Rat  1463 IVLYSCGFVTARPLSIKIVATYRLCSEQLSSQHHYDYGMRAVKSVLTAAG-NLKLKYPNEN---- 1522

  Fly  1863 SANFEMSVVVRCLRSSTMSKLAPHDVNRFEMLLRNVFPEIGSSPAPETQLHQSLSAAFAQ----L 1923
                |..:::|.:....:.|...||:..||.:..::||.: ..|.|:   :..|.||..:    :
  Rat  1523 ----EEILLLRSIIDVNLPKFLSHDLPLFEGITSDLFPGV-KLPKPD---YNDLLAAIRENCHSM 1579

  Fly  1924 GLCRSERQIEKALQLHEQLQKRMGVVLVGPPGCGKSTIISLLKQAL---C------GTQLKVHTI 1979
            .|..:....||.||::|.:..|.|.::||.|..||::...:|..||   |      ..::::..:
  Rat  1580 NLQMTNFFSEKILQIYEMMIVRHGFMIVGEPFGGKTSAYRVLAGALGDICEKGLMEENKVQITVL 1644

  Fly  1980 SPKSMSRIQLLGRLDADTRQWQDGVLTHTAVAVNQESSQVHSWIVCDGSIDPEWIEALNSVLDDN 2044
            :|||::..||.|:.|..:.:|.||:|..:..|....|:....|::.||.:|..|||.:|:|||||
  Rat  1645 NPKSVTMGQLYGQFDLVSHEWSDGILAVSFRAFAASSTPDRKWLIFDGPVDAVWIENMNTVLDDN 1709

  Fly  2045 KLLTLPSGWRIQFGSNVNFIFETDDVRHASPATISRMGIVNMS---------------------- 2087
            |.|.|.||..||....:|.|||..|:..|||||:||.|::.|.                      
  Rat  1710 KKLCLMSGEIIQMSPQMNLIFEPMDLEVASPATVSRCGMIYMEPQMLGWRPLMVSWINTLPQSVS 1774

  Fly  2088 ----------YDY---YPADGILKHELSKEPYGD-------------LLQSYVDGNFQYAVNWIE 2126
                      :|.   ...:.|.:|.....|..|             .:..:.|.|.|...|..|
  Rat  1775 IIQKEFIEGLFDRMVPLSVEFIRRHTKELSPTSDTNLVRSLMNLIDCFMDDFADENKQKERNDRE 1839

  Fly  2127 SQLLLTHLPGINRAHLLRSLLLQLHGTQSLEE---YGAATLRALFGYMPNDRQREFAQLI----- 2183
            :..|   |.||    .|.||:..:..:.:.::   |. ..||.|.....:|..|...:|:     
  Rat  1840 NFSL---LEGI----FLFSLIWSVGASCTADDRIKYN-KILRELMEGPISDLTRNKFKLLSGTEQ 1896

  Fly  2184 LKHANLYVANPNYAELTHYESSRNSL---EQYAVDAIETPEKGSQLIITSYMKSYLDIL--ETLL 2243
            .....|.|..|....:..|:.....|   :|:.....:||.....:.....:...||.:  ..|:
  Rat  1897 TSSKALTVPFPEKGTIYDYQFIPEGLGRWDQWIKKLADTPPIPKDVQFNEIIVPTLDTVRYSALM 1961

  Fly  2244 KTQGTRLPPFMLIGPSGSGKTLLLQRAVLENSG---YQLATINCSTQLTPRYILHTLKTHCVTVS 2305
            ....|...|.:.:||:|:||::.:...:|....   |:...:|.|.|.|      ..:|..:.:|
  Rat  1962 SLLTTHQKPSIFVGPTGTGKSVYIINFLLNQLNKDIYKPLIVNFSAQTT------AAQTQNIIMS 2020

  Fly  2306 GI----KGREYRPKQARLVLFMKNLDLCQQDSWGACEVVELLFQLAQRGGFY-AENLEWIGVSGL 2365
            .:    ||....|...|:::|:.::::..::.:||...:|||.|......:| .::...|.:..:
  Rat  2021 KLDKRRKGVFGPPLGKRMIVFVDDVNMPAREVYGAQPPIELLRQWLDHWNWYDLKDCSMIKLVDI 2085

  Fly  2366 QLCASI---GGNTGKIAPRYFAINQFVRVSRPTSQDMLEIVQRRLEPLLEEHFRGSENRGRSGVN 2427
            |:..::   ||....|.|||......:.::..:.:.|..|..|    :|..|.|.........::
  Rat  2086 QIMCAMGPPGGGRNPITPRYMRHFNIITINEFSDKSMFTIFSR----ILTWHLRTCYKFPDDFLD 2146

  Fly  2428 L--QHVSESL---MDCFEKLQATFTNVGGRQAHYQFSPKCIMKLLDALVFY--PASDFNEAL--- 2482
            |  |.|:.::   .|..:.|..|     ..::||.|:.:...:::..:...  ..::..||:   
  Rat  2147 LTTQIVNGTMTLYKDAMKNLLPT-----PAKSHYLFNLRDFSRVIQGVCLSRPETAENKEAIKRL 2206

  Fly  2483 -YCELLGMFRDRLISEEHVQQFEGILKQTMRKYYGKE------KVFF----VPKSPKSRGHLHCL 2536
             ..|:|.::.|||:...........:::.:|.|..::      .:.|    :.:....|..:.|.
  Rat  2207 WVHEVLRVYYDRLLDNADRSWLVNYIQEILRNYMQEDFHDLFKNLDFDNDGIVEEDDLRSLMFCD 2271

  Fly  2537 THDEWME----------EVQRQVTICNTENYSITA--PITEEL----LSHVARITRVLSRTDAHM 2585
            .||...|          :..|.:...:.:.|:..:  |:...|    :.|::||:|:|.:..:|.
  Rat  2272 FHDPKREDFGYREIPNVDALRVIVEGHLDEYNNMSKKPMNLVLFRFAIEHISRISRILKQPRSHA 2336

  Fly  2586 LILGQSGGRHLDAIFTAATFQEAKVVTLQGGPSYDLTDFYNDLKVAMQTAALEQQMSYLLIEQCW 2650
            |::|..|.........||...:..:..::....|...:::.||||.::..|........|.....
  Rat  2337 LLVGVGGSGRQSVTRLAAHMADYSLFQVEISKGYGSHEWHEDLKVILRKCAEGDMQGVFLFTDTQ 2401

  Fly  2651 LSYVPDILKPIEALLEGSEILELFG-DDLETVASTLKQ-------AAQLEGYQESMGTYFLKRAR 2707
            :.. ...|:.:..||...|:..||. |:.:.:...::|       ..|.:|...::...|:.|.|
  Rat  2402 IKR-ESFLEDVNNLLNAGEVPNLFALDEKQEICEKMRQLDRQRDKTKQTDGSPIALFNMFIDRCR 2465

  Fly  2708 DYLHIIIVLDPNSAKVQDYFNNFPALHRQMDLLYVRGESRETIAILPKQFIE--LLNESIAGGGS 2770
            :.||:::.:.|.....:.....||||.....:.:.:....:.:..:..:|:|  .::|.|.    
  Rat  2466 NQLHVVLAMSPIGDAFRIRLRKFPALVNCCTIDWFQSWPEDALEAVASRFLEDIEMSEEIR---- 2526

  Fly  2771 GRGKVPTCSHF----ADISDELPSE------ETSQRYYQLIRTYFHMYNNAANEIDQRLGKLQMG 2825
             .|.:..|..|    .::|....:|      .|...|.:||.|:..:.....||:.:...:.::|
  Rat  2527 -EGCIDMCKSFHTSTINLSTTFHNELQRYNYVTPTSYLELISTFKLLLEKKRNEVMKMKRRYEVG 2590

  Fly  2826 VDKLASAHALVDTLKSNAAAQEQALGEKRQLANEALE--MISFTMRNANEQKSSMLELKQQTQKS 2888
            :|||.||.:.|.|::    .:.:||..:.::|:..::  ||.....:....|:..:....:|..:
  Rat  2591 LDKLDSASSQVATMQ----GELEALHPQLKVASRQVDDMMIMIEKESIEVAKTEKIVKADETVAN 2651

  Fly  2889 SEQL--KIRQKEIQQELAEVEPILAEASNAVGQIKSEALSEIRSLRAPPEAVRDILEGVLRLMGI 2951
            .:.:  |..:.|...:|||..|||..|..|:..:.::.::.::|:::||..|:.::|.:..|.||
  Rat  2652 DQAMAAKAIKDECDADLAEALPILESALAALDTLTAQDITVVKSMKSPPAGVKLVMEAICILKGI 2716

  Fly  2952 R--------------DTSWNSMKTFLAKRGVKEDIRSLDPARISPENCEAVERLLLAKGDSYEAK 3002
            :              :..|...|..|......:.:...|...|.|.....:.:..:...| :..:
  Rat  2717 KADKIPDPTGSGKKIEDFWGPAKRLLGDIRFLQSLHEYDKDNIPPAYMNIIRKSYIPNPD-FVPE 2780

  Fly  3003 NAKRASAAAAPLAAWVQASVRYSRVIQSIKPLEREQNELQKNLNAAEDEMQELASGLDDVDKRVK 3067
            ..:.||.||..|..||.|...|.:|.:.:.|.:.:....:..|..|.:.:::..:.|.:|..::.
  Rat  2781 KIRNASTAAEGLCKWVIAMDSYDKVAKIVAPKKIKLAAAEGELRIAMEGLRKKQAALREVQDKLA 2845

  Fly  3068 QLSAKLQTYTQEAAVLELKLQEASGTLQAAELLVEKLSAEYTTWSLQLTELKKAHKTLDAKTLLI 3132
            :|...|:...|:.|.||.::...|..|:.||.|:..|..|.|.||....||...:..|....|:.
  Rat  2846 KLQDTLELNKQKKADLENQVDLCSKKLERAEQLIGGLGGEKTRWSNSALELGHLYVNLTGDILIS 2910

  Fly  3133 AIAINYCAGLGLEQRCSSLKRLA-----ADFHLPSDFDLRGSLLTEQQQIIWESQGLARDAQIIE 3192
            :..:.|........|....|..:     .|.....|:.|.|:|........|...||..|...|:
  Rat  2911 SGVVAYLGAFTSNYRQHQTKEWSHSCKERDIPCSDDYSLMGTLGEAVTIRAWNIAGLPSDLFSID 2975

  Fly  3193 SAALLREMLSLPYGACPIPLLLDPTQTAAAWLMAHLKGSGRPCELTTHGNDRLPYQLELAVRFGK 3257
            :..::       ..|...||::||...|..|:....|.:.  .:|....:......||..::||.
  Rat  2976 NGIII-------MNARRWPLMIDPQGQANKWIKNMEKTNS--LQLIKLSDPDYVRTLENCIQFGT 3031

  Fly  3258 TLLVTDC-EQLRPPVLQLLQGHVFVRFNKRQLAIGSKLVDLHESFQLVLISKSHRLDLPEEQRSQ 3321
            .:|:.:. |:|.|.:..||....|.:.....:.:|...::....|:..:.:|........|...:
  Rat  3032 PVLLENVGEELDPILEPLLLKQTFKQGGSTCIRLGDSTIEYAPDFRFYITTKLRNPHYLPETSVK 3096

  Fly  3322 LNVLKFTVTAAGLADQLMSKAIVLKNGELEQQRIELLQKEGHLLKQRMEMQDKLLEQLSKSEGDI 3386
            :.:|.|.:|..|:.|||:...:..:..:||:::..|:.:.....:|..|::||:||.||.|||:|
  Rat  3097 VTLLNFMITPEGMQDQLLGIVVARERPDLEEEKQALILQGAENKRQLKEIEDKILEVLSSSEGNI 3161

  Fly  3387 LKNEQLLESL-------NEIKQGSTQIDEALKQSGQIR---------DTLLAQFGSLRELSSRAA 3435
            |::|..::.|       |||.|.....:|..|:....|         .::|  |.|:.:|     
  Rat  3162 LEDETAIKILSSSKALANEISQKQEVAEETEKKIDNTRMGYRPIAVHSSIL--FFSIADL----- 3219

  Fly  3436 TFYAGLIQGYELSPLVYIELFLGALSKSQRDE---SKVY---DCLVRSVYMNLARAT-SRDSQL- 3492
               |.:...|:.|...:|.||:.::..|::.:   .:::   |....|:|:|:.|:. .:|..| 
  Rat  3220 ---ANIEPMYQYSLTWFINLFILSIENSEKSDILSQRLHILRDHFTYSLYVNICRSLFEKDKMLF 3281

  Fly  3493 SLSLWVCHQAYPDRLNPKEWELFVNNFMGSSDGSMVLSQLGKLP---DC--MPKEAQLKLAML-- 3550
            |..|.|....:.:.:|..||...:...:|..:           |   .|  :|:::..::..|  
  Rat  3282 SFCLTVNLLIHENAINKAEWRFLLTGGIGLDN-----------PYTNPCTWLPQKSWDEICRLDE 3335

  Fly  3551 LQLFPDLRSKLQLEKDYIWRGFIEAQA--DDVLPA----LGSSFQRVLIAQIFRPDLMLHQLRKV 3609
            |..|..:|.:....|:. |:...::..  .::.|.    ..:.|||:||.:..|||.::..|::.
  Rat  3336 LHAFKTIRREFMRLKEG-WKKVYDSMEPHHEIFPEEWENKANDFQRMLIIRCLRPDKVIPMLQEF 3399

  Fly  3610 SSDLLGISPDASTQPSVEQLLQQSSCDRPILMVSHAENDPTTELRKWAN------QKYREMAIGK 3668
            ....||.|........:.:....|:|..|::.|.....||...|.|:|:      .|...:::|:
  Rat  3400 IIKKLGRSFIEPPPFDLAKAFGDSNCCAPLIFVLSPGADPMNALLKFADDQGYGGSKLSSLSLGQ 3464

  Fly  3669 GVEKRVLSEMRQAAIDGHWLCVKNVHLVPEFLTQMER---ELSEIQKSKDFRLWLLCESTEGFSE 3730
            |.....:..:.:|..||.|:.::|.||...::..:|:   |||......|||:||....:..|..
  Rat  3465 GQGPIAMKMLEKAVKDGTWVVLQNCHLATSWMPTLEKVCEELSPESTHPDFRIWLTSYPSPNFPV 3529

  Fly  3731 AAIYKCLKVRYEQPKGLKQIVMR--LLQNFAAEQDQKLKNQPKSLKMRLVYFV--LTAVLQQRRQ 3791
            :.:...:|:..|.||||:..::|  |:...:..:......:|:..| :|:|.:  ..|::|:||:
  Rat  3530 SVLQNGVKMTNEAPKGLRANIIRSYLMDPISDPEFFGSCRKPEEFK-KLLYGLCFFHALVQERRK 3593

  Fly  3792 FIPQGWSKYYEFGEADLKAALGILRMMDQQLN----------SGKCDWLLMQRLSEALAYGGRVN 3846
            |.|.||:..|||.|.||:.::..|.|...|..          :|:|:            |||||.
  Rat  3594 FGPLGWNIPYEFNETDLRISVQQLHMFLNQYEELPYDALRYMTGECN------------YGGRVT 3646

  Fly  3847 NQRDLEILTTYLNQFCSADVLSN---RWSPLGLSLSIPTSGQLQDYYAALEKLPDTDEPSMYGLA 3908
            :..|...|.:.||:|...:::.|   ::...|:.. :|.||..:.|....:.||...:|.::|:.
  Rat  3647 DDWDRRTLRSILNKFFCTELVENPQYKFDSSGIYF-VPPSGDHKSYIEYTKTLPLIPDPEIFGMN 3710

  Fly  3909 NQAQQQREIEQAKRVIKELRGLHYGRGLAKDSGGAGESKGNDQLTGRQKLEQQIKPLLNLWRKLA 3973
            ..|...::..:.:.:...:. |...|     |.|:| :|.:|::     :.:....:|.   ||.
  Rat  3711 ANADITKDQSETQLLFDNIL-LTQSR-----SSGSG-AKSSDEV-----VNEVAGDILG---KLP 3760

  Fly  3974 ASCTIIQTMKEAKTDVGESPWALFVLAELKLGADLYGI------VHQTLSQMHAWLKESQEVDGS 4032
            .:..|...|:...|...:|...:.|....:....|..|      :.:.:..:.....|.:||..|
  Rat  3761 NNFDIESAMRRYPTTYTQSMNTVLVQEMGRFNKLLITIRESCINIQKAIKGLVVMSTELEEVVSS 3825

  Fly  4033 TLRTLAEQQIPASWL-KLWPG--PGSNSAVDFLRALIVRAQAAELRFREQMH------LDFVEDI 4088
            .|..    :||..|: |.:|.  |..:...|||         |.|:|.:|.:      :.::...
  Rat  3826 ILNV----KIPGMWMGKSYPSLKPLGSYVNDFL---------ARLKFLQQWYEVGPPPVFWLSGF 3877

  Fly  4089 NFVQVFNCENLLSCLKLLQSRKLAVSTERL--ELQTCGSSNLESDSSDIILKLAPLKIDGAQ--- 4148
            .|.|.|     |:..:...:||..:..:.|  :.:.......::...|.:. :..|.:|||.   
  Rat  3878 FFTQAF-----LTGAQQNYARKFTIPIDLLGFDYEVMDDKEYKNAPEDGVY-IHGLFLDGASWNR 3936

  Fly  4149 --SGMGKSNP---------FYIK-----------------YKIKDEVQNVSHTTTSSSKYGKNSL 4185
              ..:.:|:|         .::|                 ||..:.     ..|.|::.:..|.:
  Rat  3937 KTKKLAESHPKVLYDTVPVMWLKPCKKSDIPKRPSYVAPLYKTSER-----RGTLSTTGHSTNFV 3996

  Fly  4186 YSTQNAESKPKLPLYSRSSRDKLICHLN 4213
            .:......:||.....|..  .|:|.||
  Rat  3997 IAMILPSDQPKEHWIGRGV--ALLCQLN 4022

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
btvNP_001036369.3 DHC_N1 <219..627 CDD:462457 83/437 (19%)
DHC_N2 1069..1480 CDD:462462 100/455 (22%)
DYN1 <1435..3924 CDD:227570 650/2726 (24%)
AAA_6 1621..1959 CDD:463697 121/341 (35%)
Dnah7NP_001406479.1 DHC_N2 756..1161 CDD:462462 100/449 (22%)
DYN1 958..3665 CDD:227570 685/2832 (24%)
AAA_6 1289..1615 CDD:463697 121/341 (35%)
AAA_8 2310..2572 CDD:463701 53/267 (20%)
AAA_9 2960..3181 CDD:463702 55/229 (24%)
Dynein_C 3719..4019 CDD:465677 59/340 (17%)

Return to query results.
Submit another query.