DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment btv and Dnah8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001036369.3 Gene:btv / 35073 FlyBaseID:FBgn0023096 Length:4236 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001414021.1 Gene:Dnah8 / 207117 RGDID:619986 Length:4727 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4936 Identity:1097/4936 - (22%)
Similarity:1980/4936 - (40%) Gaps:1118/4936 - (22%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    12 SVEYFSARLPGSELDEQTAMILEFLEQE--------ELTVISAVHSRSDGRIRFHHRIPN--EEL 66
            |::.||     |..::..:..|:||.||        ..|:..........|:...:..|.  :||
  Rat   195 SLDAFS-----SFFEKGGSKTLKFLYQEGDVPGLECGRTITGVPKGGKMMRLYIDNAAPEKLKEL 254

  Fly    67 CLLFYKV-PQVGHHRKEDGSEPLLGILTLEGGMVKSIYNSVSRVFSP---------SANSARRSE 121
            ||.|.:. ..|..:.|....:.|..:|....|::|.|.|.:..:|.|         :.|.:::.|
  Rat   255 CLFFVRCRNDVAINSKTIYEDVLFTVLDASKGLLKGIKNMLKNIFLPAILATGNWGALNQSKQGE 319

  Fly   122 YGPELSGILENLHQNL----GSSLGLPQSGITSLR-------NEIKYWQQKLGQKSSSRLDREAA 175
              .|.....|.:::.|    |:::.:  .|...|:       :::..:::.....|||.:..:..
  Rat   320 --SEKHIFTETINRYLLFLDGATISI--EGTVMLKKVDNIDFSKLHTFEEVTAAASSSEMVHQLE 380

  Fly   176 QVFI-------GVL---ENMEKQISTIDGANPSGTIEEFLDHAHTNLDELWR---LPYNY----- 222
            .|.:       .||   |.|.|:      |:.||.:.| |:|        |:   ..:||     
  Rat   381 DVLMMWYKQIEQVLIESEQMRKE------ADDSGPLTE-LEH--------WKRMSAKFNYIIEQI 430

  Fly   223 --PQ-QRMADLLDIIGKRLL----------------------------EVCLTQLLAEDVWSLNS 256
              |. :.:.::|::...:||                            :|| ..|...|:.|:  
  Rat   431 KGPSCKAVINVLNVAHSKLLKNWRDLDARITDTANESKDNVRYLYTLEKVC-QPLYNYDLVSM-- 492

  Fly   257 SH-VNNLMS--QSIDTVDAWIQLCDSLTRLF----------WPNYV-----KHPWLGDSHVP--- 300
            :| :.||::  :.|.:|..:....:.:|.||          ...|:     .|.|  |...|   
  Rat   493 AHGIQNLINAIRMIHSVSRYYNTSERMTSLFIKVTNQMVTACKAYITDGGTNHVW--DQETPAVL 555

  Fly   301 KRGQQ----FKERLSEIRSIKQLYKQIATLLEDT-----ELQEMFQEQAPFTEFNIF------DT 350
            |:.|.    |||..:   |..:..|||   ||.:     |:.||:    .|.:|..|      .|
  Rat   556 KKIQDCIFLFKEYQA---SFHKTRKQI---LESSGEKSFEVSEMY----IFGKFEAFCKRLEKIT 610

  Fly   351 SSLGQNKWHKALQHFEQVLQPID------ERIAAALKRQLHNHLSNPRQVIF------IFSKYET 403
            ..:...:.:.||.:  ..::.||      :.|...:|:..::.| :||:..|      ...|..|
  Rat   611 EMITIVQTYSALSN--STIEGIDILGIKFKNIYQGIKKNQYDIL-DPRRTEFDTDFSDFMGKINT 672

  Fly   404 L-IQRPA--------------VLELL-----------------TIEREQFLQSLHILLQDLRKAM 436
            | ||..|              .|:||                 ||||  .||.....|:..:|..
  Rat   673 LEIQIQAFMNITFGKILSSQQALQLLQRFQKLNMPCLQLEINHTIER--ILQCYVAELEATKKLY 735

  Fly   437 VDSNMEPDTG-HLSVICNECRWLKVVQHQIQE----IEKVSHLISGREGFDKINKAVQEIKEETE 496
            .....:|... ::..|..:..|::.:..:|.|    ..|.|.::|..||     |||  |::..:
  Rat   736 HSQKDDPPLARNMPPIAGKILWVRQLYRRINEPINYFFKNSDILSSIEG-----KAV--IRQYNK 793

  Fly   497 -SLLRTNFEI-----WSGQCSTAVKSGELRLRDDQAVVKFEKEGRQLMRVTFNPKLVTFCQDVRE 555
             |.:...||:     |..:.|....:.:..|     .|:..:.|:.|  |.|:||::...::.:.
  Rat   794 ISYVLVEFEVVYHTAWVKEISQLQYALQATL-----FVRHPETGKLL--VNFDPKILEVVRETKC 851

  Fly   556 FENLGYNVPLELRAAATHAAKYMCYARRLQQIATFHNTIGDRMIPCQR-PIMLKNALELQRLVQS 619
            ...:..:||.:.:......:|.......||.:..:::.:      ||. |.:..| |...::.:.
  Rat   852 MIKMKLDVPEQAKKLLKLESKLKADKLYLQGLLQYYDDL------CQEVPSVFVN-LMTPKMKKV 909

  Fly   620 ETV--------AWQD---ES---SVQRYVDILQAAVSKLSS------DNTLLVGYHEQAKRSVLK 664
            |:|        .|..   ||   .|:..:|:....:.|::.      |..|    .|.||..::.
  Rat   910 ESVLRQGLTVLTWSSLMLESFFKEVESVLDMFNQLLKKVNDLCEMHIDTVL----KEIAKTLLIS 970

  Fly   665 LMST------DLFTQNQI----WKDELRH--------LRELVATLER---QGYT----------- 697
            |..:      |:.|.|:.    |.|.|.|        ::||:...|:   ..||           
  Rat   971 LSDSGATRVEDMLTLNETYTKEWADILNHKSRHVEEAVKELILIFEQIYEVKYTGKPAKPVPEQR 1035

  Fly   698 -HL-----------------------------DAFK-------LHWDHQLYKVLEYQYILGLLDM 725
             |:                             |.||       ..:.|||...|:....|.|..|
  Rat  1036 KHVVFGSEADEGESLEYDPDSTARDVDNNDKEDEFKKECKEVYAFFSHQLLDSLQKATRLSLDTM 1100

  Fly   726 NNKL------------------PDIH----------------------VKLVLRQRELVFSPPEE 750
            ..::                  .::|                      ::|.|.....|....::
  Rat  1101 KKRIFVGNQGRKRSEDVVSFIKTEVHLAIPNVVMVPSLDDIQQAINRMIQLTLEVSRGVAHWGQQ 1165

  Fly   751 EIRELYFSQL-------------------RRFIER-PC----NFH-GLSEHSQELFKSMVTVNRH 790
            ::|.....|.                   |.|.|. |.    ||: |::||..  ...:|.:...
  Rat  1166 QVRRTKSPQTSSRGSDQPSIMGKALKKEERSFEESIPARKLKNFYPGVAEHKD--ISKLVLLLSS 1228

  Fly   791 HFGPLYQRAAELFDKLQDFKTIWLPWIALGCVDVDQLCGIHLNEAGDWDRNFRSCKHFSQQLAKL 855
            ....|.:.|.|.....|.:||:|..                       ||:.: .|.|......|
  Rat  1229 SVNSLRKAATEALQDFQKYKTLWTE-----------------------DRDVK-VKEFLANNPSL 1269

  Fly   856 QQAEESIDCIVINVLPLRSDIEYISRRYWESLANSLRTAILTDVSLIQEFLQSALQFLQNVPMDE 920
            .:              :||:|.:.:.  :|.....|:..|  ||..::         |...||..
  Rat  1270 TE--------------IRSEILHYAT--FEQEIEELKPII--DVGALE---------LHTEPMKL 1307

  Fly   921 G-SISQSGMK----------YEKIMS-----------KLPQIEKTLEAVRAKDSCLGGWCKERVT 963
            . ||.....|          |:|.||           ||.:..:.|:.||        :..|.::
  Rat  1308 ALSIEAKAWKMLLCRYLNEEYKKKMSDMIVFINEYLKKLSRPIRDLDDVR--------FAMEALS 1364

  Fly   964 ALSGILLQWEQ-LQPLLENHAVILQRQVDMIKNQAE---------TQLQ----NLKNEAEKFLLR 1014
            .:....:|.:. |.|:.|.:.::.:.:|::.|.::|         .:||    ::::|..:...:
  Rat  1365 CIRDNEIQMDMTLGPIEEAYGILNRFEVEVTKEESEGVDTLRYSFNKLQSKAVSVQDELVQVQPK 1429

  Fly  1015 WESTISELEANEHSTLDVFKERRLHWQQLQEKKTQLL-----EECS---------------KFNM 1059
            ::|::.|       ::|||:|..:::.:..|.:..::     :|.|               ||..
  Rat  1430 FKSSLLE-------SVDVFREDVINFTEAYETEGPMVPNIPPQEASNRLQIFQANFDDLWRKFVT 1487

  Fly  1060 EFPAEML--TPFTEIE------EQMEKQSKQWQVYDSFLTELQ------------PVLHEEWAIY 1104
            ....|.|  .|.|:.|      :::....|.:.:||:.:..:.            ..::.|...:
  Rat  1488 YSAGEQLFGLPVTDYEVLHKTRKELNLLQKLYGLYDTVMGSISGYYEILWGDVDIEKINAELLEF 1552

  Fly  1105 RRRPYVLNEFIGKWEGSVHASIDLPSKRIRQQVEQLQSALPILQQLQSESLSERHWARIFQLLN- 1168
            :.|...|.:.:..|:    |.:||     :::::....:.|:|:.:.::::.:|||.||.:|.. 
  Rat  1553 QNRCRKLPKGLKDWQ----AYLDL-----KKRIDDFSESCPLLEMMTNKAMKQRHWDRISELTGT 1608

  Fly  1169 ----HKETKPLHSILLQDILQDFDVLQSAAQEISSIVRQASSEQIVRQALIE-LDQW-------- 1220
                ..:|..|.:|:...:|::.|       :|..|...|..|:.:...:.: ::.|        
  Rat  1609 PFDVESDTFCLRNIMEAPLLKNKD-------DIEDICISAIKEKDIEAKMTQVIENWTNQNLSFS 1666

  Fly  1221 SVTAQLKLITRTDASGQSVSLIKDYQEVLNKIGDNQSLLQSANNSAAFESFSDQAELWESRLNTL 1285
            :...:.:|:.:...||:.::|::|...||.      |||.:..|:    .|....:.|..:|:|.
  Rat  1667 AFKGKGELLLKGTESGEIITLMEDSLMVLG------SLLSNRYNT----PFKKTIQNWVYKLSTS 1721

  Fly  1286 DALLSSLNHSQRRWVYLEPVFGSG----TLQHEQALFKRIDKDFRFVMREIEMDPRVTSLTKINN 1346
            ..::......|..|||||.||..|    .|..|...|:.|||.:..:|:....:|.|.|.. :.:
  Rat  1722 SDIIEEWLVVQNLWVYLEAVFVGGDIAKQLPQEAKRFQNIDKSWVKIMQRAHENPNVISCC-VGD 1785

  Fly  1347 IT--TIVNALETQLARCQQNLMSYITDKRNSFPRFYFLGDDDLLELLGQASKDAEVIQRHIRKLF 1409
            .|  .::..|..||..||::|..|:..||..||||:|:.|..|||:||||| |:..||.|:    
  Rat  1786 ETMGQLLPHLHEQLEVCQKSLTGYLEKKRLLFPRFFFVSDPVLLEILGQAS-DSHTIQPHL---- 1845

  Fly  1410 PGCHSLSIRQVGPNPATSSDVNQYS--------ITSVHSAEGDELKLSQPVEMKGDIERWLNQLV 1466
                          ||.|.::|:.:        :|:|.|.||:::.|..||..||.:|.||..|:
  Rat  1846 --------------PAVSDNINEVTFHPKDYDRMTAVISREGEKIMLDTPVMAKGPVEIWLLDLL 1896

  Fly  1467 TVVQDTLRDQIYECYTGTTGGSDNLDEKILKKYASQVLATARALHFTRQAEQAIGSMSLGKLKQQ 1531
            .|...:|.:.|...:. ....|..|....|..:.:||......:.:|..:|:|:.|         
  Rat  1897 KVQMSSLHNIIRSAFY-QISDSGFLLLPFLNHFPAQVGLLGIQMLWTHDSEEALNS--------- 1951

  Fly  1532 LKDE--ITHLAALKNKSENGTLIS-----------LKLRALLLDLVHYSGVTEQLQKHNVVHTSD 1583
            .||:  |.|:...|......||||           :|...|:...||...:.:.|.|.::...:|
  Rat  1952 AKDDRKIMHITNQKFLDILNTLISQTTHDLTKFDRVKFETLITIHVHQRDIFDDLVKMHIKSVTD 2016

  Fly  1584 WHWLCQLRYYLGKKGGTSGEVNANRQVCVRMVYAEFEYAYEFLGQASKLVHTRLTHRCYLILTQA 1648
            :.||.|.|:|..:      :::   |..|.:...:|.|..||||...:||.|.||.|||:.|.||
  Rat  2017 FEWLKQSRFYFKE------DLD---QTVVSITDVDFNYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQA 2072

  Fly  1649 MHMGLGGNPFGPAGTGKTECVKALGAMLGRLVLVFNCDENVDTESMSLILTGLARCGAWGCFDEF 1713
            :.|.:||.|.|||||||||..|.:|..||:.|:||||.:.:|...:..|..|||:.|:|||||||
  Rat  2073 LGMNMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSWGCFDEF 2137

  Fly  1714 NRLQEATLSSISMLIQPIQSALKERANSVQIGERQ-IQLNQHCGIFVTLNPAGAEYGGRQKLPGN 1777
            ||::...||..:..|..:.:|.|||.......:.. :.||...|||:|:||.   |.|||:||.|
  Rat  2138 NRIELPVLSVAAQQIYIVLTARKERKKQFIFSDGDCVDLNPEFGIFLTMNPG---YAGRQELPEN 2199

  Fly  1778 IQALFRPIVMQQPEPGEIARVMLFVEGFTEASAIASRIVELFELSGKMLSAQRHYDWGLRELKTV 1842
            ::..||.:.|..|:...|.||.|...||.|...:|.:...|::|..:.|:.|.|||:|||.:.:|
  Rat  2200 LKIQFRTVAMMVPDRQIIMRVKLASCGFLENVILAQKFYVLYKLCEEQLTKQVHYDFGLRNILSV 2264

  Fly  1843 LMVCGEGLRDQLTSEDNNQSSANFEMSVVVRCLRSSTMSKLAPHDVNRFEMLLRNVFPEIGSSPA 1907
            |...|...|.:  .||:       |:|.|:|.||...:|||...|...|..|:.::||.:.....
  Rat  2265 LRTLGSQKRAR--PEDS-------ELSTVMRGLRDMNLSKLVDEDEPLFLSLINDLFPGLQLDSN 2320

  Fly  1908 PETQLHQSLSAAFAQLGLCRSERQIEKALQLHEQLQKRMGVVLVGPPGCGKSTIISLLKQAL--C 1970
            ...:|..::.......||........|.:||:|....|.|::.:||.|.||:|:|::|.::|  |
  Rat  2321 TYAELQAAVDNQVNLEGLINHPPWNLKLVQLYETSLVRHGLMTLGPSGSGKTTVITILMKSLTEC 2385

  Fly  1971 GTQLKVHTISPKSMSRIQLLGRLDADTRQWQDGVLTHTAVAVNQESSQVHSWIVCDGSIDPEWIE 2035
            |...:...::||:::..|:.||||..|..|.||:.:.......:.....:.:::.||.:|..|||
  Rat  2386 GRPHREMRMNPKAITAPQMFGRLDTATNDWTDGIFSTLWRKTLKAKKGENIFLILDGPVDAIWIE 2450

  Fly  2036 ALNSVLDDNKLLTLPSGWRIQFGSNVNFIFETDDVRHASPATISRMGIVNMS---YDYYP-ADGI 2096
            .|||||||||.|||.:|.||........:||..::.:|||||:||||:|.:|   ..:.| ....
  Rat  2451 NLNSVLDDNKTLTLANGDRIPMAPTCKLLFEVHNIENASPATVSRMGMVYISSSALSWRPILQAW 2515

  Fly  2097 LKHELSKEPYGDLLQSYVDGNFQYAVNWIESQLLLTHLPGINRAHLLRSLLLQLHG-TQSLEEYG 2160
            ||....:|....|  |..|..|:.|..:::.. |:..:..:...::.:||.| |.| ..|.||.|
  Rat  2516 LKRRTQQEATAFL--SLYDKVFEDAYTYMKLN-LIPKMQLLECNYITQSLNL-LEGLIPSKEEGG 2576

  Fly  2161 AAT---LRALF--------GYMPNDRQREFAQLILKHANLYVANPNYAELTH------------- 2201
            .::   |..||        |.:.....||..::.|:.....:..|..|:.:|             
  Rat  2577 VSSVDHLHKLFVFGLMWSLGALLELESREKLEVFLRGHESKLNLPEIAKDSHHTMYEFYVTDYGD 2641

  Fly  2202 YESSRNSLEQYAVDAIETPEKGSQLI--ITSYMKSYLDILETLLKTQGTRLPPFMLIGPSGSGKT 2264
            :|.....|:.|.......||..|.|:  :.:...::|  ::|:.|..    ...:|.|..|:.||
  Rat  2642 WEHWNKRLQPYFYPTDSIPEYSSILVPNVDNIRTNFL--IDTIAKQH----KAVLLTGEQGTAKT 2700

  Fly  2265 LLLQRAVLE--NSGYQLA-TINCSTQLTPRYILHTLKTHCVTVSGIKGREYRPKQAR-LVLFMKN 2325
            ::: :|.|:  :...||: ::|.|:...|.....|::::   |....|..|.|...| :.:|:.:
  Rat  2701 VMV-KAYLKKYDPEVQLSKSLNFSSATEPMMFQRTIESY---VDKRMGSTYGPPGGRKMTVFIDD 2761

  Fly  2326 LDLCQQDSWGACEVVELLFQLAQRGGFYAENL--EWIGVSGLQLCASI---GGNTGKI---APRY 2382
            :::...:.||.....|::.|:.:..|.|:.:.  ::..:..:||.|::   ||....|   ..|.
  Rat  2762 INMPVINEWGDQITNEIVRQMMEMEGMYSLDKPGDFTTIVDVQLIAAMIHPGGGRNDIPQRLKRQ 2826

  Fly  2383 FAINQFVRVSRPTSQDMLEIVQ-------RRLEPLLEEHFRGSENRGRSGVNLQHVSESLMDCFE 2440
            |.:......|..:...:..|:.       |:..|.:.:......:.||  |..|.....::....
  Rat  2827 FTVFNCTLPSNTSIDKIFGIIGCGYFDPCRKFRPEICDMIGNLVSVGR--VLWQWTKVKMLPTPS 2889

  Fly  2441 KLQATFTNVGGRQAHYQFSPKCIMKLLDALVFYPASDFNEALYCE----LLGMFR--------DR 2493
            |.            ||.|:.:.:.::...::...|.:      |:    |:.:|:        ||
  Rat  2890 KF------------HYIFNLRDLSRIWQGMLTIKAEE------CKTIPILMALFKHECNRVIADR 2936

  Fly  2494 LISEEHVQQFEGILKQTMRKYYGKEK----------VFFVPKSPKSRGHLHCLTHDEWMEEVQRQ 2548
            .|:.:..|.|...|.:.:.:....|.          |.|:...|:..|.    ..::.|.||.:.
  Rat  2937 FITPDDEQWFNTQLIRAVEENISPEVAASINPEPYFVDFLRDMPEPTGD----EPEDTMFEVPKI 2997

  Fly  2549 VT-------ICNTENY------------SITAPITEELLSHVARITRVLSRTDAHMLILGQSGGR 2594
            ..       :|....:            |:.....::.::|:.:|:|::..:..:.|::| .||.
  Rat  2998 YELVPSFEFLCEKLQFYQKQFNEIIRGTSLDLVFFKDAMTHLIKISRIIRTSCGNALLVG-VGGS 3061

  Fly  2595 HLDAIFTAATF---QEAKVVTLQGGPSYDLTDFYNDLKVAMQTAALE-QQMSYL-----LIEQCW 2650
            ...::...|:|   .:...:||.  .||::::..:|||...:.|..: :.::::     :.::.:
  Rat  3062 GKQSLSRLASFIAGYQIFQITLT--RSYNVSNLIDDLKNLYKVAGADGKGITFIFTDNEIKDEAF 3124

  Fly  2651 LSYVPDILKPIEALLEGSEILELFG-DDLETVASTLKQAAQLEGYQ-----ESMGTYFLKRARDY 2709
            |.|       :..||...||..||. |:|:.:...|....:.|..:     :::..||:.|:|..
  Rat  3125 LEY-------LNNLLSSGEISNLFARDELDEITQGLISVMKRELPRHPPTFDNLYEYFISRSRRN 3182

  Fly  2710 LHIIIVLDPNSAKVQDYFNNFPALHRQMDLLYVRGESRETIAILPKQFIELLNESIAGGGSGRGK 2774
            ||:::...|...|.:.....||.|.....:.:.....:|.:..:...|:...| .:......|..
  Rat  3183 LHVVLCFSPVGEKFRARSLKFPGLISGCTMDWFSRWPKEALIAVASYFLSDYN-IVCSMEIKRHV 3246

  Fly  2775 VPTCSHFADISDE----------LPSEETSQRYYQLIRTYFHMYNNAANEIDQRLGKLQMGVDKL 2829
            |.....|.|:..|          ..:..|.:.|...|..|.::|......|:::..::.:|:|||
  Rat  3247 VEAMGLFHDMVSESCENYFQRYRRRAHVTPKSYLSFINGYKNIYTEKVKYINEQAERMNIGLDKL 3311

  Fly  2830 ASAHALVDTLKSNAAAQEQALGEKRQLANEALEMISFTMRNANEQKSSMLELKQQTQKSSEQLKI 2894
            ..|...|..|..:.|.:|:.|......|:|.|..::.:.:.:.:.|:.:.|:|.:.||..:::..
  Rat  3312 MEASESVAKLSQDLAVKEKELAVASVKADEVLAEVTVSAQASAKVKNEVQEVKDKAQKIVDEIDS 3376

  Fly  2895 RQKEIQQELAEVEPILAEASNAVGQIKSEALSEIRSLRAPPEAVRDILEGVLRLMGIR------- 2952
            .:.:.:.:|...:|.|.||..|:..||...::.:|.|..||..:..|::.||.|...:       
  Rat  3377 EKVKAESKLEAAKPALEEAEAALNTIKPNDIATVRKLAKPPHLIMRIMDCVLLLFQKKIDPVTMD 3441

  Fly  2953 ------DTSWNSMKTFLAKRGVKEDIRSLDPARISPENCEAVERLLLAKGDSYEAKNAKRASAAA 3011
                  ..||......::..|....::......|:.|..|.::...  ..|.|..::||:.....
  Rat  3442 PEKPCCKPSWGESLKLMSATGFLFSLQQFPKDTINEETVELLQPYF--NMDDYTYESAKKVCGNV 3504

  Fly  3012 APLAAWVQASVRYSRVIQSIKPLEREQNELQKNLNAAEDEMQELASGLDDVDKRVKQLSAKLQTY 3076
            |.|.:|..|...:..:.:.:.||:....:.:..|..|..|:.:..:.||:....:.::.||....
  Rat  3505 AGLLSWTLAMAIFYGINREVLPLKANLAKQEGRLAVANAELGKAQALLDEKQAELDKVQAKFDAA 3569

  Fly  3077 TQEAAVLELKLQEASGTLQAAELLVEKLSAEYTTWSLQLTELKKAHKTLDAKTLLIAIAINYCAG 3141
            ..|...|..........:|||..|::.||.|...|:.|..|.|.....|....||....::|   
  Rat  3570 MNEKMDLLNDADMCRKKMQAASTLIDGLSGEKVRWTQQSKEFKAQINRLVGDVLLCTGFLSY--- 3631

  Fly  3142 LGLEQRCSSLKRLAADFHLPSDFDL----RGSLLTEQQQII-----------WESQGLARDAQII 3191
            ||      ...::..::.|...::|    |....||...:|           |..|||..|...|
  Rat  3632 LG------PFNQIFRNYLLKDQWELEMKARKIPFTENLNLIAMLVDPPTIGEWGLQGLPGDDLSI 3690

  Fly  3192 ESAALLREMLSLPYGACPIPLLLDPTQTAAAWLMAHLKGSGRPCELTTHGNDRLPYQLELAVRFG 3256
            ::..::.:       |...|||:||......|:.:  |......::|:..:......||.::..|
  Rat  3691 QNGIIVTK-------ATRYPLLIDPQTQGKTWIKS--KEKENDLQVTSLNHKYFRTHLEDSLSLG 3746

  Fly  3257 KTLLVTDC-EQLRPPVLQLLQGHVFVRFNKRQLAIGSKLVDLHESFQLVLISKSHRLDLPEEQRS 3320
            :.||:.|. |:|.|.:..:|:.:........::.:|.|..|:.::|:|.:.:|........|..:
  Rat  3747 RPLLIEDIREELDPALDNVLEKNFIKSGTAFKVKVGDKECDIMDTFKLYITTKLPNPAFTPEINA 3811

  Fly  3321 QLNVLKFTVTAAGLADQLMSKAIVLKNGELEQQRIELLQKEGHLLKQRMEMQDKLLEQLSKSEGD 3385
            :.:|:.||||..||.:||:.:.|:.:..|||.:|::||:......::..|::|.||.:||.::|.
  Rat  3812 KTSVIDFTVTMKGLENQLLRRVILTEKQELESERVKLLEDVTFNKRKMKELEDNLLYKLSTTQGS 3876

  Fly  3386 ILKNEQLLESLNEIKQGSTQIDEALKQSGQIRDTLLAQFGSLRELSSRAATFYAGLIQ------G 3444
            ::.:|.|:..|...||.:.::.|.|..:.:....:.......|..::|.:..|..:.:      .
  Rat  3877 LVDDESLIGVLRITKQTAAEVSEKLHVAAETEIKINTAQEEFRPAATRGSILYFLITEMSMVNIM 3941

  Fly  3445 YELSPLVYIELFLGALSKSQRD--------------ESKVYDCLVRSVYMN-------------- 3481
            |:.|...:::||..::::|::.              ..:|:...||.:|.|              
  Rat  3942 YQTSLAQFLKLFDQSMARSEKSPLPQKRITNIIEYLTYEVFTYSVRGLYENHKFLFALLMTLKID 4006

  Fly  3482 LARATSRDSQL--------SLSLWVCHQAYPDRLNPKEWEL---FVNNFMGSSDGSMVLSQLGKL 3535
            |.|.|.:..:.        :|.|..|    |.:  |..|.|   ::|           |.:|.||
  Rat  4007 LQRGTVKHKEFQALIKGGAALDLKAC----PPK--PFRWILDMTWLN-----------LVELSKL 4054

  Fly  3536 PDCMPKEAQLKLAMLLQLFPDLRSKL-QLEKDYIWRGFIEAQA--DDVLP-----ALGSSFQRVL 3592
            |.                |.::.::: :.||.  |:.:.:..|  ::::|     :| .:.:::|
  Rat  4055 PQ----------------FAEIMNQISRNEKG--WKNWFDKDAPEEEIIPDGYNDSL-DTCRKLL 4100

  Fly  3593 IAQIFRPDLMLHQLRKVSSDLLGISPDASTQP---SVEQLLQQSSCDRPILMVSHAENDPTTE-- 3652
            :.:.:.||..:.|.||..:|.|   .:..|:|   ::|:..::|....|::......:|||.:  
  Rat  4101 LIRSWCPDRTVFQARKYIADSL---EEKYTEPVILNLEKTWEESDTHTPLICFLSMGSDPTIQID 4162

  Fly  3653 -LRKWANQKYREMAIGKGVE----KRVLSEMRQAAIDGHWLCVKNVHLVPEFLTQMERELSEIQK 3712
             |.|....:.|.:::|:|.|    |.|...|:|    |.|:.::|.||..||:.::...|...:.
  Rat  4163 ALAKKLKLECRTISMGQGQEVHARKLVQLSMQQ----GGWVLLQNCHLGLEFMEELLETLMVTET 4223

  Fly  3713 SKD-FRLWLLCESTEGFSEAAIYKCLKVRYEQPKGLKQIVMRLLQNFAA-EQD-QKLKNQPKSLK 3774
            ::| ||:|:..|..:.|....:...||...|.|:|::   ..|.:.||. .|| ..:.|.|....
  Rat  4224 TEDSFRVWITTEPHDRFPITLLQTSLKFTNEPPQGVR---AGLKRTFAGINQDLLDISNLPMWKP 4285

  Fly  3775 MRLVYFVLTAVLQQRRQFIPQGWSKYYEFGEADLKAALGILRMMDQQLNSGKCD------WLLMQ 3833
            |......|.:.:|:||:|.|.||:..|||..||..|::..:     |.:..:||      |..::
  Rat  4286 MLYTVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNSADFSASVQFI-----QNHLDECDIKKGVSWSTVR 4345

  Fly  3834 RLSEALAYGGRVNNQRDLEILTTYLNQFCSADVLSNRWSPLGLSLSIPTSGQLQDYYAALEKLPD 3898
            .:...:.|||||.:..|..:|..:...:.|..:....:. ......||....|..|:..::.||.
  Rat  4346 YMIGEVQYGGRVTDDFDKRLLNCFARVWFSEKMFEPSFC-FYTGYKIPVCKTLDQYFEYIQSLPS 4409

  Fly  3899 TDEPSMYGLANQAQQQREIEQAKRVIKELRGLHYGRGLAKDSGGA-GESKGNDQLTGRQKLEQQI 3962
            .|.|.::||...|....:...|..|::.:..:.     .|:|||. ||:        |:.:..::
  Rat  4410 LDNPEVFGLHPNADITYQSNTASDVLETITNIQ-----PKESGGGMGET--------REAIVYRL 4461

  Fly  3963 KPLLNLWRKLAASCTIIQTMKEAKTDVGESPWALFVLAELKLGADLYGIVHQTLSQMHAWLKESQ 4027
            ..  ::..||..:                     :|..|:|  |.|..:.|  |:.|:.:|:  |
  Rat  4462 SE--DMLSKLPPN---------------------YVAHEVK--ARLMKMGH--LNSMNIFLR--Q 4497

  Fly  4028 EVDG-----STLR-------------------------TLAEQQIPASWLKL-WPGPGSNSAVDF 4061
            |:|.     |.||                         .:.:.:||..|.:: |  ..|.....|
  Rat  4498 EIDRMQRVISLLRNSLNDLKLAIEGTIIMSENLRDALDNMYDARIPQLWKRVSW--DSSTLGFWF 4560

  Fly  4062 LRALIVRAQAAELRFREQMHLDFVEDINFVQVFNCENLLSCLKLLQSRKLAVSTERLELQTCGSS 4126
            ...|...||.:...|..:.::.::...     ||.:..|:.::  |....|.....|:..|..:.
  Rat  4561 TELLERNAQFSTWIFEGRPNVFWMTGF-----FNPQGFLTAMR--QEVTRAHKGWALDSVTIHNE 4618

  Fly  4127 NLESDSSDII------LKLAPLKIDGA----QSG-MGKSNPFYIKYKIKDEVQNVSHTTTSSSKY 4180
            .|.....:||      :.:..|.:|||    ::| :.:|.|..:..::.     |.|.      |
  Rat  4619 VLRQTKEEIITPPVEGVYIYGLYMDGASWDRRNGKLTESTPKVLFMQLP-----VLHI------Y 4672

  Fly  4181 GKNSLYSTQNAESKPKL---PLYSRSSRDKL----ICHLNVDIVTGTAEQILLAGTALIVE 4234
            ..||     .|...|||   |:|.:..|..|    :.:|...:   :.:..:|.|.||:.:
  Rat  4673 AINS-----TAPKDPKLYVCPIYKKPRRTDLTFITVVYLRTVL---SPDHWILRGVALLCD 4725

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
btvNP_001036369.3 DHC_N1 <219..627 CDD:462457 109/546 (20%)
DHC_N2 1069..1480 CDD:462462 113/456 (25%)
DYN1 <1435..3924 CDD:227570 661/2721 (24%)
AAA_6 1621..1959 CDD:463697 130/338 (38%)
Dnah8NP_001414021.1 None

Return to query results.
Submit another query.