DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CadN2 and CadN

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609855.3 Gene:CadN2 / 35071 FlyBaseID:FBgn0262018 Length:1799 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061517965.1 Gene:CadN / 1279132 VectorBaseID:AGAMI1_007196 Length:3101 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1704 Identity:1245/1704 - (73%)
Similarity:1449/1704 - (85%) Gaps:19/1704 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    18 VTKFVRIGIADKNDSPPYFDRFLYETEIDENADLQSTVLTVNAKDHNESTNIRYQITGGNIGNAF 82
            ||||:|||||||||:|||||:.|||.|:|||.|:|.|||||.||||:||:.|||:||.||||.||
Mosquito  1403 VTKFIRIGIADKNDNPPYFDKALYEAEVDENEDIQHTVLTVTAKDHDESSRIRYEITSGNIGGAF 1467

  Fly    83 AVQNTTGVIYVASPLDYETRPRYELRLEATRNRKNNYTTVVINVRDVNDNPPVFDRQTYRTQITE 147
            ||:|.||.||||..||||||.||||||.|:.|.|.|||||||:|:|||||||||:|.||||||||
Mosquito  1468 AVKNMTGAIYVAGALDYETRKRYELRLAASDNLKENYTTVVIHVKDVNDNPPVFERPTYRTQITE 1532

  Fly   148 EDDRNLPKRILQVTATDGDVDRPINIVYFLTGQGIDPDNPANSKFDINRTTGDIFVLKPLDRDQP 212
            |||||||||:|||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
Mosquito  1533 EDDRNLPKRVLQVTATDGDKDRPQNIVYFLTGQGIDPDNPANSKFDINRTTGEIFVLKPLDRDQP 1597

  Fly   213 NGRPQWRFTVFAQDEGGEGLVGYADIQVNLKDINDNAPQFPQGIYFGNVTENGTAGSSVMTMSAV 277
            |||||||||||||||||||||||||:||||||||||||.||||:||||||||||||..||||:||
Mosquito  1598 NGRPQWRFTVFAQDEGGEGLVGYADVQVNLKDINDNAPIFPQGVYFGNVTENGTAGMVVMTMTAV 1662

  Fly   278 DYDDPNESTNAKLIYSIEKNVIEEETGAPIFEIEPETGLIKTAVCCLDRERTPDYSIQVVAMDGG 342
            |||||||.|||||||||||||||||||:||||||.:||:||||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1663 DYDDPNEGTNAKLIYSIEKNVIEEETGSPIFEIEADTGVIKTAVCCLDRERTPDYSIQVVAMDGG 1727

  Fly   343 GLKGTGTASIRVKDLNDMPPQFTKDEWVTEVDETNGTYIPETPILTVTVQDEDETNTFQYKVVPN 407
            ||||||||||||||:||||||||||||.||||||:||.:||.|||||||.||||||.|||||:.|
Mosquito  1728 GLKGTGTASIRVKDINDMPPQFTKDEWFTEVDETDGTNLPEMPILTVTVHDEDETNKFQYKVIDN 1792

  Fly   408 SGFGADKFAMVRNGDGTGSLKIIQPLDYEDPLQSSGFRFRIQVNDKGDDGPGGSDKYHVAYSWVV 472
            ||:|||||.||||.||||||||:|||||||||||:||||||||||||:|  ..:|||||||||||
Mosquito  1793 SGYGADKFTMVRNNDGTGSLKIVQPLDYEDPLQSNGFRFRIQVNDKGED--NDNDKYHVAYSWVV 1855

  Fly   473 VKLRDINDNVPKFDREHIEVSIYEDTKVGTILEQFKATDADQGGHSKVAYKIVRSTNRKRQFAIS 537
            |||||||||.|:|:|.:||||:||:..||..||.|||||.||||.|||:|.|.||::|:|||:|:
Mosquito  1856 VKLRDINDNKPQFERPNIEVSVYENADVGKTLETFKATDPDQGGKSKVSYAIDRSSDRQRQFSIN 1920

  Fly   538 DRGAVSIQRPLDRETQDRHHIQILAIDDGSPARTATATLTVIVKDVNDNAPTFAQDYKPTLPENV 602
            ..|.|:|||.||||...||.::|||||||.|.:||||||||||:|:|||.|.|.:||:|.|||:|
Mosquito  1921 QEGTVTIQRNLDREVTPRHQVKILAIDDGIPPKTATATLTVIVQDINDNPPKFLKDYRPVLPEHV 1985

  Fly   603 SGKKILEVAAKDPDDRLRGNGGPFTFRLDPLASDEIKAGFKVEYDRRGDNENGVAIISSLRPFDR 667
            ..:|::|:.|.|.|||.:.||.||.|||||.|.|.|:|.||||.|::|.|.:|:||:||||.|||
Mosquito  1986 PPRKVVEILATDDDDRSKSNGPPFQFRLDPGADDIIRASFKVEQDQKGANGDGMAIVSSLRSFDR 2050

  Fly   668 EAQKSYAIPIEIKDNGAPAMTGTSTLTVTIGDVNDNKMQPGSKSVLVYNYQGQSQDTPIGRVYVN 732
            |.||.|.|||.|||:|.|||||||||||.||||||||||||||.:.||||.||:.||.||||||.
Mosquito  2051 EQQKEYLIPIVIKDHGNPAMTGTSTLTVVIGDVNDNKMQPGSKDIFVYNYLGQAPDTQIGRVYVY 2115

  Fly   733 DPDDWDVPDKKYYWEVQEHQRFKLDTDTGILTMRAGTRRGRYQLRFKVYDREHGQEDIPANLSVT 797
            |.||||:||||::||.|||.|||||.|||::|||.|||.|||.||||||||:|.|.|:|||::||
Mosquito  2116 DLDDWDLPDKKFHWESQEHPRFKLDEDTGMITMRQGTRDGRYHLRFKVYDRKHTQADVPANVTVT 2180

  Fly   798 VRDITAEAVQQAGSMRLSHITDEDFVRTWNPVKNQVEPSKLERFRNKLAELLYTDRDNVDVFSVQ 862
            ||:|..:||..:||:|::.||||||:|.||.....:..||.:||::|||:||..||:||||||||
Mosquito  2181 VREIPHDAVINSGSIRIAGITDEDFIRVWNYRTQSLSRSKADRFKDKLADLLNIDRENVDVFSVQ 2245

  Fly   863 LKEGSPYPLTDVHFAARSATQQPYFKAVRLNGVVQMHREEIEKDVGLNITMVNINECLHEGKGKC 927
            |:...| |||||.|:|..:   ||:|.|||||:|.|||||||||||:|||||.|:|||:|.: .|
Mosquito  2246 LRRKHP-PLTDVRFSAHGS---PYYKPVRLNGIVLMHREEIEKDVGVNITMVGIDECLYENQ-MC 2305

  Fly   928 GSNSCTSKVELGKKPYTVSVNRTALVGVRLDISAQCVCRARNFTHQDHNCRTHLCYNGGRCVETR 992
             ..|||:.:::...||.|:.|:|:|||||:|:.|:|.|.||||:..: :||:..|:|||||:|||
Mosquito  2306 -EGSCTNTLDISSLPYMVNANKTSLVGVRVDVLAECTCGARNFSKAE-SCRSSPCHNGGRCMETR 2368

  Fly   993 NGPKCVACPVGYNGPRCQQSTRSFRGNGWAWYPPLQLCQESHLSLEFITRVADGLILYNGPIVPP 1057
            .|..| :||.||.||||||:|||||||||||||||.:|.:||||.|||||.:|||:|||||||||
Mosquito  2369 YGLSC-SCPTGYTGPRCQQTTRSFRGNGWAWYPPLAMCDDSHLSFEFITRKSDGLLLYNGPIVPP 2432

  Fly  1058 KPEETVISDFIALELEQGYPRLLIDFGSGTLELRVKTKKTLDDGVWHRLDIFWDTENVRMVVDFC 1122
            :.:|.::||||::|||:|:||||||||||||||||||||:||||.||||||||||||||||||:|
Mosquito  2433 ERDELLVSDFISVELERGFPRLLIDFGSGTLELRVKTKKSLDDGEWHRLDIFWDTENVRMVVDYC 2497

  Fly  1123 RTALVSEMEDGTPPEFDDNACQARGQIPPFAESLNLNQPLQLGGLYRQHFDQTLYNWQYAFSSKG 1187
            ::|.|||||||:||||||::|||||.||||.|.||:|.|||:||.||:.||.|.|.|.|....||
Mosquito  2498 KSAEVSEMEDGSPPEFDDSSCQARGTIPPFNEYLNVNAPLQIGGFYREQFDPTHYRWNYMPMGKG 2562

  Fly  1188 FDGCIRNVIHNSEHYDLAFPALARNSFPACPQTDEVCLKTEHTARCWEHGNCVASLVQAKCHCQP 1252
            |||||:|::|||:.||||.|.|:|||...||||:|||.::|.|:|||||||||.|..:|:|.|:|
Mosquito  2563 FDGCIKNLVHNSKLYDLAHPGLSRNSVAGCPQTEEVCSQSEQTSRCWEHGNCVGSFTEARCQCRP 2627

  Fly  1253 GWMGPGCNVPTIPTTFKAQSYVKFALSFEPDRFSTQLQLRFRTREQGGELFRVSDQHHREYAILE 1317
            ||.||.||:||||||||.|||||:||||||||||||:|||||||||.||||||||||:|||.|||
Mosquito  2628 GWTGPACNIPTIPTTFKQQSYVKYALSFEPDRFSTQIQLRFRTREQHGELFRVSDQHNREYGILE 2692

  Fly  1318 LRRGHLQFRYNLNSMRNEEQLLTLTAIAVNDGQWHVIRISRYGSAALMELDGGESRRYNESFHFT 1382
            ::...|:|||||||:|.||:.:.|.||||:||||||:|::|:||||.:||||||.|||||:|.|.
Mosquito  2693 IKDARLRFRYNLNSLRTEERDIWLNAIAVDDGQWHVVRVNRHGSAATLELDGGEGRRYNETFTFD 2757

  Fly  1383 GHQWLTIDKQEGVYAGGKAEYTGIKTFEVQSDFQRSCLDDIRLDGKHLPLPPAMNGTQWGQATMA 1447
            |||||.:||||||||||||||||::||||.:|:|:||||||||:|||||||||||||||||||||
Mosquito  2758 GHQWLLVDKQEGVYAGGKAEYTGVRTFEVYADYQKSCLDDIRLEGKHLPLPPAMNGTQWGQATMA 2822

  Fly  1448 RNLERNCPSNRPCSNVICPDPFDCVDLWNEYECTCSEGRIMSSDTKGCVDRNECLDLPCLNGATC 1512
            ||||||||||:||:||||||||:||||||||||||.|||:||.|.|||:|||||||||||||..|
Mosquito  2823 RNLERNCPSNKPCANVICPDPFECVDLWNEYECTCGEGRVMSPDGKGCMDRNECLDLPCLNGGIC 2887

  Fly  1513 INLEPRLRYRCICPEGYWGENCELVQEGQRLKLSMGALGAIFVCLIIILILALIFVLYSRKRKTT 1577
            :|.||||||||.||:|:|||||||:||||.||||||||.||.|||:|||||.|:||:|:|:|:: 
Mosquito  2888 VNQEPRLRYRCDCPDGFWGENCELIQEGQTLKLSMGALAAILVCLLIILILVLVFVVYNRRRES- 2951

  Fly  1578 KKKKRSGPEKDVRETVISYEDEGGGEDDMTAFDITPLQIPISAQGGP-PDIAACKM-PIIYPVMT 1640
             ..|..||:.||||.:|:|:|||||||||||:|||||||||    || |::..||| |::|||||
Mosquito  2952 -HIKYPGPDDDVRENIINYDDEGGGEDDMTAYDITPLQIPI----GPMPELTQCKMPPLMYPVMT 3011

  Fly  1641 LLPPGQELNVAYLMEERKQRIDKDNNAPPFDDLRNFTFEGSGSIAESLSSLASGTDDENQDFNYL 1705
             :.||.|.||...:||.|:|.|.|.||||||||||:.:||.||.|.|||||.||||||.|:|:||
Mosquito  3012 -MGPGHEPNVGMFIEEHKKRADSDPNAPPFDDLRNYAYEGGGSTAGSLSSLQSGTDDEVQEFDYL 3075

  Fly  1706 QNWGPRFNALAAMY 1719
            ..|||||:.||.||
Mosquito  3076 DAWGPRFDKLANMY 3089

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CadN2NP_609855.3 Cadherin_repeat 41..132 CDD:206637 65/90 (72%)
Cadherin_repeat 140..248 CDD:206637 102/107 (95%)
Cadherin_repeat 256..359 CDD:206637 92/102 (90%)
CA 388..483 CDD:214520 79/94 (84%)
Cadherin_repeat 489..586 CDD:206637 62/96 (65%)
Cadherin_repeat 594..703 CDD:206637 70/108 (65%)
EGF_CA 977..1010 CDD:238011 20/32 (63%)
LamG 1013..1198 CDD:238058 137/184 (74%)
EGF_2 1233..1259 CDD:400365 17/25 (68%)
LamG 1265..1426 CDD:238058 122/160 (76%)
EGF_CA 1497..1535 CDD:238011 30/37 (81%)
CADH_Y-type_LIR 1662..1719 CDD:460041 39/56 (70%)
CadNXP_061517965.1 None

Return to query results.
Submit another query.