DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CadN and hmr-1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001027277.1 Gene:CadN / 35070 FlyBaseID:FBgn0015609 Length:3101 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001021650.1 Gene:hmr-1 / 173007 WormBaseID:WBGene00001980 Length:2920 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:3177 Identity:1010/3177 - (31%)
Similarity:1511/3177 - (47%) Gaps:470/3177 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    74 LVLPHDTYPGFSIKKFKTHPVKINGSSHSGAAAYHMLDTDYSKYFTVLEDGV-VMTTADISPLVN 137
            |.||.:..||:.|...:..  .:.|.|........:..|::.     :|||. ::|...::....
 Worm    23 LKLPSNAPPGWLISDLQFQ--NLIGDSEIATLQPSIFSTNFE-----VEDGYRIITNTTVTQFHG 80

  Fly   138 RPVQLVVVEQTPNATNTHNLQLFVMHRNDMLR---FSGSLLDASGEVRENQPAGTRVRGVPLMQA 199
            ...:|.:..:..|......|.::|..|....:   |..::..|: .....||..|.|...|:...
 Worm    81 ELFELFLNVKEQNFQRLVTLHVYVDPRGTSQQPATFLSTVYHAT-VYTSQQPGSTVVFSKPITVR 144

  Fly   200 FSGSILDEELATPKKV-RYTIIDGNVDDAFALQERKANKNIQISAKSLVINGDDESGVWLVTNRP 263
            ...:.:...::...|: :|:       ..|::..|  .|::.|                ::..:.
 Worm   145 NRKNFVISPISKIDKISKYS-------SPFSVMTR--GKSVDI----------------VMMKQK 184

  Fly   264 LDREERAHYDLSVEA-SDVDGLDRTVSKIQITVLDENDNRPIFKSLDYKFAIAGQKSASMESNSS 327
            |:.::...:.:.:.| ::..|.....:|:.|.|:|..|...:.||   |.:||...|| :.:||:
 Worm   185 LEEDDITRHVIFLGAFTEKTGEMIAQTKVIIDVIDSGDVHFLLKS---KKSIAKFASA-IPANST 245

  Fly   328 VTYQRFAIMGKVEATDADGDKIAYRLKSPSNVVIIVPQTGEIMLAGEPTSNELLIEVIAHDLRYP 392
            |.        .||..:. .:.:.:.|:.||....|...:|.:                       
 Worm   246 VF--------DVEKRNL-SEPLLFHLEEPSRFFKIDQFSGRV----------------------- 278

  Fly   393 SLVSAKPAKVLLEFLAAEPVSFIMQHLEHDDINNHSHHREKRRVTRAVRPTKRIEFTEADGDTEG 457
                   :.||       ||.:...|: |....|....|....:..:|:..:::|     ..|..
 Worm   279 -------STVL-------PVGYGTYHI-HVVARNQKKQRSDAWLEISVKKEQKLE-----PMTSS 323

  Fly   458 KS-------VFQLEKETDKETFKIRDDN-PWVTVETNGAVRVKKKW-----D-----YEELGPEK 504
            :|       ||::.:.|..|..:.:|.. |....||.|.:.|.|:|     |     .:.|..||
 Worm   324 RSRRHLDDIVFRIPENTTMEDIEKKDMKIPLFAGETIGEINVAKEWLKIDDDGKIHLLKPLNYEK 388

  Fly   505 TIDFWVIITNMGHNAGIKYTDNQRVIILVKDVNDEPPYFINRPLPMQAVVQLNAPPNTPVFTLQA 569
            |..   ||..:..| |::.|..|.:.|.|.|: ||||.|:|.||||.|||.||......|:...|
 Worm   389 TSS---IIATVPIN-GLQSTRTQTIRIHVADI-DEPPSFVNSPLPMLAVVPLNPTIGRIVYQFVA 448

  Fly   570 RDP--DTDHNIHYFIVRDRTGGRFEVDERSGVVRTRGTDLFQLDMEYVLYVKAEDQNGKVDDRRF 632
            ||.  |.|.|:.|..:.....|.|.||.:|||||| |...::....|.:..:|.|.:.. |:...
 Worm   449 RDEHGDGDSNVLYKTIDVIPAGSFIVDPKSGVVRT-GWSKYERGDTYRISAQAMDLSPS-DNTTS 511

  Fly   633 QSTPEERLSIVGGKRAPQFYMPSYEAEIPENQKKDSDIISIKAKSFADRE-------IRYTLKAQ 690
            |.:....|.|:..:|.|||....||..:.|:...|..::.:||:||...|       |.|:|:..
 Worm   512 QLSEVAILEILADERPPQFAKQEYEVTVSEDNLVDYSVVDVKAQSFRSFEDGRSKGPITYSLEGD 576

  Fly   691 GQGAGT--FNIGPTSGIVKLAKELDFEDLRQPHVYSLIVTATEDSGGFSTSVDLTIRVTDVNDNA 753
            .....|  |.|.|::||:.|.:.|||:|...|.::.|.|||.||:.  .:.||||||:.|||||.
 Worm   577 TPEDETKWFRIDPSTGIIHLTRLLDFDDPALPKLHKLKVTAREDNR--ESHVDLTIRIDDVNDNV 639

  Fly   754 PKFELPDYQAHNVDEDIPLGTSILRVKAMDSDSGSNAEIEYLVSDDHFAVDSNGIIVNNKQLDAD 818
            |.|..|.|.| .|.|||||..:||:|.|:|.|:|.|:.|.|.|.:.:|:::|||.|....:||||
 Worm   640 PTFTRPLYTA-QVREDIPLNQTILKVTAVDKDTGDNSRITYSVDNHNFSINSNGEISAKVRLDAD 703

  Fly   819 NNNA---YYEFIVTAKDKGEPPK-SGVATVRVYTKNKNDEEPKF---SQQVYTPNVDENAGPNTL 876
            ..|.   .|.|.|||:|.|||.. |..|.:.:.|:|.|||...|   ||  ||..|.|:|...|.
 Worm   704 QLNERHFVYRFNVTARDHGEPVSLSSSAMIHIRTENTNDESAVFLPTSQ--YTAFVAEDAQGGTP 766

  Fly   877 VTTVVASDKDGDNVRFGFVGGGTSSGQ----FVIEDITGVIRLHNKAISLD----KDKYELNVTA 933
            |..:.|.|.|.|.|.:.|:.....|.|    |.|::.||:::|.:...:.|    ::...|.|..
 Worm   767 VIQIQARDADRDEVTYSFMDKNGRSTQKMNLFSIDEHTGLVKLRHGVSAADLAEAENPINLTVIV 831

  Fly   934 MDDGSCCVNGDQTIHTSTAVVVVFITDVNDNKPVFKDCSTY--YPKVEEGAPNGSP--VIKVVAT 994
            .|||||||...:| |||.|.:::.|.|||:|||.|.||:.|  ..|:.||.....|  ::||.||
 Worm   832 QDDGSCCVYPSKT-HTSYATLLIGIEDVNNNKPEFPDCAKYSDIAKIMEGTYKTDPPTIVKVEAT 895

  Fly   995 DEDKGVNGQVKYSIVQQPNQKGTKFTVDEETGEV--STNKVFDREGDDGKFVSVTVKATDQGDPS 1057
            |:|...||.:.||:....::....|.:|.:||.:  |.:.|||||....:  .|||||||:||..
 Worm   896 DDDSSANGDIVYSLYYTQSESRKAFVIDRQTGVLTPSPHVVFDRETRPRE--DVTVKATDRGDRP 958

  Fly  1058 LEGVCSFTVEITDVNDNPPLFDRQKYVENVKQDASIGTNILRVSASDEDADNNGAIVYSL----- 1117
            |.|.|.|:||:.|:|||.|.|:|..|..:|.:..::||:::.|.|.|.||.:|..|.|||     
 Worm   959 LIGFCQFSVEVVDINDNSPQFERPSYETSVSRFEAVGTSVITVFAFDNDAAHNAEITYSLEIDTT 1023

  Fly  1118 TAPFNPNDLEYFE-IQAESGWIVLKKPLDGCYPRDRYRLRVSASDKGTP-ASAADVDVELDVVDR 1180
            ....:.|||::|| :...||.|.|.||:.  ....::...|.|.|.|.| |..:...|.|:|:|:
 Worm  1024 AGEEHQNDLDFFELVNRRSGEITLIKPIP--MKTQKFIFNVIADDNGIPEALQSSAQVTLNVLDK 1086

  Fly  1181 NNKPPIWDKSIYGP-----IHIRENVTVGTVVTSVKA-SSGIEGNPTVFYRLM----PGSTAQTN 1235
            ..|.|.|..|   |     |.:.|||.:..|:...:| |||...|..|.|:|.    ||:.|: :
 Worm  1087 QQKAPKWQTS---PDCKPGITVDENVELNKVILRCRAVSSGDSRNSDVIYKLTASGGPGNKAE-S 1147

  Fly  1236 KFHTFYLQQRPDNGDTWADIKVNHPLDYESIKEYNLTIRVENNGAQQLASEATVYIMLEDVNDEI 1300
            ||..|   .:.:||:.|.::.:...||||.:..|.||: ...:...::||..|..:.:.||||.:
 Worm  1148 KFRQF---NKFENGNEWVEVVIMEGLDYEQVNNYTLTL-TATDMTSRVASTKTFVVEVRDVNDVV 1208

  Fly  1301 PLFT---------------EREQETVLEGEPIGTKVTQVNAIDKDGTFPNNQVYYYIVDSPRNEG 1350
            |.||               |..::|  .|:||.|    |.|||.|...|.|:|:|.||.....|.
 Worm  1209 PQFTVDLFTGTIDEEMTPNEHLEKT--NGKPIVT----VKAIDTDSDGPQNEVHYRIVGEANGEE 1267

  Fly  1351 KEFFEINLQSGEIFTKTVFDREKKGAYALEVEARDGAPSARPNSNGPNSVTKFIRIGIADKNDNP 1415
            .:.|.|:..:||||....|||||...|.|.|||.|.:.||.|.:||||.....::|.|.|.|||.
 Worm  1268 TKHFRIDELTGEIFPNEKFDREKIDMYILTVEASDRSVSALPGANGPNKDNVKVQIVINDVNDNA 1332

  Fly  1416 PYFDKSLYEAEVDENEDIQHTVLTVTAKDHDESSRIRYEITSGNIGG--AFAVKNMTGAIYVAGA 1478
            |.|::..|...|.|:|...|.|:|:.|.|.|:.|.:||.:. |..||  .|.|:..:|.|:|...
 Worm  1333 PSFEEQKYIGRVKESEGEGHDVITIKAHDLDKHSNLRYHLI-GAGGGRIPFGVRTDSGTIFVKEP 1396

  Fly  1479 LDYETRRRYELRLAASDNLKENYTTVIIHVKDVNDNPPVFERPTYRTQITEEDDRNLPKRVLQVT 1543
            ||:|...:|.|.|.|||......|.|.||::|||||.|.||:..|.|.:.|| |.::||.:..|.
 Worm  1397 LDFEASDQYHLVLIASDGRHNATTNVYIHIEDVNDNAPQFEQQKYATTVIEE-DVDIPKVLFNVH 1460

  Fly  1544 ATDGDKD-RPQNIVYFLTGQGIDPDNPANSKFDINRTTGEIFVLKPLDRDQPNGRPQWRFTVFAQ 1607
            |||.|:| :...|||.|.|||      |:..|.|.:.:|.|.::|.||||.|.|.|.|.|.|.|.
 Worm  1461 ATDADQDEKSSRIVYRLEGQG------ADEVFRIGKYSGTIELVKALDRDPPAGVPSWNFVVQAI 1519

  Fly  1608 DEGGEGLVGYADVQVNLKDINDNAPIFPQGVYFGNVTEN----GTAGMVVMTMTAVDYDDPNEGS 1668
            |:.|.|||||||||||::|||||:||||:.: ||.:.||    .:.|:..|.:.|.|:|||.. .
 Worm  1520 DDDGNGLVGYADVQVNVRDINDNSPIFPERL-FGYIEENREPIHSDGVYFMDVQARDFDDPTT-E 1582

  Fly  1669 NARLVYSIEKNVIEEETGSPIFEIEPDTGVIKTAVCCLDRERTP--DYSIQVVAMDGG--GLKGT 1729
            ||.:.|.|.:|.:  ..|..:|.|:.:||.| .|:..||||.:.  ::.|:|.|.|.|  ..:|.
 Worm  1583 NANIEYGIVRNKL--INGESVFRIDQNTGKI-FAMRSLDREISSEREFIIEVRANDRGVPSREGF 1644

  Fly  1730 GTASIRVKDINDMPPQFTKDEWFTEVDETDGTALPEMPILTVTVHDEDETNKFQYKVIDNSGYGA 1794
            ...:|:|.|:||..|.|.|..:...|:||.......|........:|.:.|.|.|::.:.|.|  
 Worm  1645 ANVTIKVTDMNDNAPFFEKTRYEGSVEETAPIGAAVMSFSAFDADEEAKDNVFTYQLSEESDY-- 1707

  Fly  1795 DKFTMVRNND----GTGSLKIVQPLDYEDQLQSNGFRFRIQVNDKGEDNDNDKYHVAYSWVVVKL 1855
              |.:..:.|    ..|.|::.|||||||..|.:||...|:|:| |..:.....|||       |
 Worm  1708 --FYVTTDKDSKQSSVGVLRVKQPLDYEDVTQRDGFHLGIRVSD-GRHDAEAAVHVA-------L 1762

  Fly  1856 RDINDNKPHFERANVEVSVFEDTKVGTELEKFKATDPDQGGKSKVSYSIDRSSDRQRQFAINQNG 1920
            .|.||:.||...| .|..|.||...||.:.::.|||.|.|..::  :.|:|.||.:|||.|:|:|
 Worm  1763 VDRNDHAPHIHGA-TEHRVREDVPRGTSIGRYTATDRDAGDTAR--FRINRQSDPKRQFTIDQDG 1824

  Fly  1921 SVTIQRSLDREVVPRHQVKILAIDDGSPPKTATATLTVIVQDINDNAPKFLKDYRP-VLPEHVPP 1984
            ::.:..:||||.:..:.:.|.|.|:.:  ......:.|.:||:|||.|:.....|| :..|:.|.
 Worm  1825 TLRVAHTLDREDIAVYNLIIEAYDNSN--NIGRQMVAVYLQDVNDNGPEPYTVPRPCIFRENTPV 1887

  Fly  1985 RKV--VEILATDDDDRSKSNGPPFQFRLDPSADDIIRASFKVEQ------DQKGANGDGMAVISS 2041
            .::  .||.|||.|  :...||||...:.|        |||..|      :..|..|:|...|:.
 Worm  1888 NQLGTCEIRATDRD--TAEFGPPFTMEVSP--------SFKYSQYLNVIFNANGDGGNGSMTITP 1942

  Fly  2042 LRSFDREQQ---KEYMIPIVIKDHGSPAMTGTSTLTVIIGDVNDNKMQPGSKDIFVYNYQGQSPD 2103
            |:.||||..   |...||:::.|..  .....:::.|||||:|||.|..|...|.|.:|.|:..:
 Worm  1943 LQEFDREAPVPGKILEIPLILADRA--GRRNEASVHVIIGDLNDNTMHDGRMTIHVNSYLGRLKE 2005

  Fly  2104 TPIGRVYVYDLDDWDLPDKKFYWEAMEHPRFKLDEDSGMVTMRAGTREGRYHLRFKVYDRKHTQT 2168
            |.||||||.|.|||||.||.|.|:. ..|.|:| .|.|.:||......|.|.:...|:|....: 
 Worm  2006 TVIGRVYVDDADDWDLGDKTFSWKD-SRPGFEL-SDKGSITMAGEMAAGTYTMSANVHDNARDE- 2067

  Fly  2169 DIPANVTVTVREIPHEAVVNSGSVRLSGISDE-------DFIRVWNYRTQSMSRSKMDRFRDKLA 2226
            |....|||.|..:|..|..|.|||:|. |::|       |||     |..|..:|.||.|:.::.
 Worm  2068 DAVGYVTVIVNAVPQIAFDNQGSVQLL-IAEETPLQLPDDFI-----RADSNGQSLMDTFKQEMT 2126

  Fly  2227 DLLNTERENVDIFSVQ-----LKRKHPPLTDVRFSAHGSPYYKPVRLNGIVLMHREEIEKDVGIN 2286
            ..:..: ..||:||||     |:.:..|:.:|||:|.||.|....:|||::..||.::::.:.:.
 Worm  2127 AYMGGD-VTVDVFSVQVGIATLQTRDVPVLNVRFNARGSTYRDTAQLNGLIAAHRADLQRKLNVE 2190

  Fly  2287 ITMVGIDECLYENQMCEGSC--TNSLEISPLPYMVNANKTALVGVRVDTIADCTCGARNFTKPES 2349
            |..||||.|.:  ..|:..|  .||.:...:  :|:||.|.:|||...:..||||..  :..|.:
 Worm  2191 IVGVGIDMCKF--TQCDAGCQTLNSADYDGI--VVSANSTVIVGVNATSRDDCTCPV--WRAPPA 2249

  Fly  2350 CRTTPCHNGGRCVDTRFGPHCSC-PVGYTGPRCQQTTRSFRGNGWAWYPPLEMCDESHLSLEFIT 2413
            |:.:.|||.|.|.:|..|..|.| ..|..|.|||.|||||.|||:|||.|:..|...::|..|:|
 Worm  2250 CQHSLCHNDGVCHNTNPGFFCECRNDGLKGARCQGTTRSFGGNGFAWYKPMPACTSLNISFSFMT 2314

  Fly  2414 RKPDGLIIYNGPIVPPERDETLI--SDFIALELERGYPRLLIDF-GSGTLELRVKTKKTLDDGEW 2475
            .:.|.|:.||||: ...|::|.|  ||:|.::|..|...|.:.. |.....|.| ....|:||.|
 Worm  2315 TQSDALLFYNGPL-ETLRNDTHIEYSDYIFIQLRGGRISLEVSMNGQSRSSLEV-ASTALNDGTW 2377

  Fly  2476 HRIDLFWDTESIRMVVDFCKSAEIAEMEDGTPPEFDDMSCQARGQIPPFNEYLNVNAPLQVGG-- 2538
            |.|.:..:.:.:.:|||.|:......         ||.||:|....|..:|.||:..|:|:||  
 Worm  2378 HDISVNQEGKRVELVVDNCRFLGAGA---------DDSSCRAELYTPDDDERLNIVTPVQIGGLA 2433

  Fly  2539 -LYREQFDQSLYFWHYMPTAKGFDGCIRNLVHNSKLYDLAHPGLSRNSVAGCPQTEEVC--AQTE 2600
             |..:.:.|::      |.| |.:||:|||..|...||||.|...:||..||......|  ...:
 Worm  2434 PLSGQDYPQTI------PRA-GLNGCVRNLNVNGDQYDLATPAFEQNSEKGCRLWGATCDSNSVD 2491

  Fly  2601 TTARCWEHGNCVGSLS-----EARCHCRPGWTGPACNIPTIPTTFKAQSYVKYA--LSFEPDRFS 2658
            :...| .||:|...:.     .|:|.|.|||.|..|........|...::::|:  ::| |::.|
 Worm  2492 SLNHC-IHGDCFADVQGSGAMVAKCVCDPGWGGARCERRMEWIQFAQGAFIEYSPRIAF-PEQVS 2554

  Fly  2659 TQVQLRFRTREEYG---ELFRVSDQHNREYGILEIKDGHLHFRYNLNSL------------RTEE 2708
             .::|.|.:.:..|   ||...:|. .:.|....::.|.       |.:            |...
 Worm  2555 -DIELLFISGKVNGAPAELSFGTDS-QQSYVSTNLESGQ-------NGVTAAGKFDIGTGGRRAR 2610

  Fly  2709 KDLWLNAIVVNDGQWHVVKVNRYGSAATLELDGGEGRRYNETFEFVGHQWLLVDKQE-------G 2766
            ::|.::.:::.:...:.::..|..:.|:|.:|..    |..:.:        :||.|       .
 Worm  2611 QELRVSEVLLKENASYWLQFTRNPTRASLSIDNA----YTVSTQ--------LDKGEPFSLQVNQ 2663

  Fly  2767 VYAGGKAEYTGVRTFEVYADYQKSCLDDIRLEGKHLPLP--PAMNGTQWGQATMAR--NLEKGCP 2827
            :..|.:.:..|.          :.|:...|...::|||.  .||:..:....:::.  .::.||.
 Worm  2664 ITLGTQGQNKGF----------QGCIGTYRWSKQNLPLKRGGAMDENEESIVSISNMAGVQDGCD 2718

  Fly  2828 SNKPCSNV---ICPDPFECVDLWNVYECTCGEGRIMSPDSKGCMDRNECLDMPCMNGATCINLEP 2889
            ....|:::   .|...|.|||.|....|||.:|                                
 Worm  2719 LRITCADLPAGYCGGSFVCVDFWKGPFCTCNDG-------------------------------- 2751

  Fly  2890 RLRYRCICPDGFWGENCELVQEGQTLKLS-MG----ALAAILVCLLIILILVLVFVVYNRRREAH 2949
                    .:...|::.::|..|:||.:| :|    |:..|||.|.::::||::.|||.||....
 Worm  2752 --------ANAILGDDGQVVGCGETLAVSKLGISSPAIILILVSLALLILLVMMMVVYTRRSPGA 2808

  Fly  2950 IKYPGPDDDVRENIINYDDEGGGEDDMTAFDITPLQIPIGGPMPPELAPMKMPI---MYPVMTLM 3011
            .:...|::..|:|:..|..|||||.|...:.:..|:.|:            ||:   |.|.:...
 Worm  2809 FENVRPEEMNRDNLRQYGVEGGGEADNDQYSMAGLRKPV------------MPLDTGMGPAIGGH 2861

  Fly  3012 PGQEPNVGMF--IEEHK-----KRADGDPNAPPFDDLRNYAYEGGGSTAGSLSSLAS 3061
            |...|..||.  .::|:     |..:.|.||.|:|:||.|..|....:..:|.|:.|
 Worm  2862 PPHYPPRGMAPPKDDHELNSKIKDLETDQNAAPYDELRIYDDERDNISVVTLESIES 2918

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CadNNP_001027277.1 Cadherin_repeat 178..301 CDD:206637 18/124 (15%)
Cadherin_repeat 337..396 CDD:206637 7/58 (12%)
E_set 449..541 CDD:298831 30/109 (28%)
Cadherin_repeat 549..>625 CDD:206637 29/77 (38%)
Cadherin_repeat 655..752 CDD:206637 39/105 (37%)
Cadherin_repeat 765..853 CDD:206637 40/91 (44%)
Cadherin_repeat 862..964 CDD:206637 39/109 (36%)
Cadherin_repeat 973..1074 CDD:206637 42/106 (40%)
Cadherin_repeat 1083..1166 CDD:206637 30/89 (34%)
Cadherin_repeat <1219..1298 CDD:206637 25/82 (30%)
Cadherin_repeat 1310..1414 CDD:206637 45/103 (44%)
Cadherin_repeat 1423..1514 CDD:206637 37/92 (40%)
Cadherin_repeat 1522..1630 CDD:206637 53/108 (49%)
Cadherin_repeat 1638..1741 CDD:206637 36/110 (33%)
Cadherin_repeat 1762..1861 CDD:206637 31/102 (30%)
Cadherin_repeat 1871..1966 CDD:206637 32/94 (34%)
Cadherin_repeat 1974..2083 CDD:206637 38/120 (32%)
EGF 2350..2380 CDD:278437 12/30 (40%)
LamG 2385..2570 CDD:238058 66/190 (35%)
EGF_2 <2605..2631 CDD:285248 11/30 (37%)
Laminin_G_2 2665..2800 CDD:280389 22/156 (14%)
EGF_CA 2869..2907 CDD:238011 1/37 (3%)
Cadherin_C 2952..3088 CDD:279398 34/120 (28%)
hmr-1NP_001021650.1 Cadherin_repeat 431..521 CDD:206637 30/91 (33%)
Cadherin_repeat 534..638 CDD:206637 39/105 (37%)
Cadherin_repeat 647..742 CDD:206637 42/95 (44%)
Cadherin_repeat 752..861 CDD:206637 40/111 (36%)
Cadherin_repeat 875..975 CDD:206637 41/101 (41%)
Cadherin_repeat 983..1085 CDD:206637 34/103 (33%)
Cadherin_repeat 1103..1206 CDD:206637 34/107 (32%)
Cadherin_repeat 1216..1331 CDD:206637 46/120 (38%)
Cadherin_repeat 1340..1432 CDD:206637 37/92 (40%)
Cadherin_repeat 1443..1542 CDD:206637 52/105 (50%)
Cadherin_repeat 1553..1657 CDD:206637 35/107 (33%)
Cadherin_repeat 1666..1768 CDD:206637 34/113 (30%)
Cadherin_repeat 1779..1868 CDD:206637 31/92 (34%)
EGF_CA 2250..2283 CDD:238011 13/32 (41%)
LamG 2286..2459 CDD:238058 66/190 (35%)
LamG 2533..2679 CDD:304605 26/177 (15%)
Cadherin_C 2812..>2919 CDD:279398 34/119 (29%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 187 1.000 Domainoid score I1975
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H121564
Inparanoid 1 1.050 1193 1.000 Inparanoid score I98
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG46492
OrthoDB 1 1.010 - - D4879at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001479
OrthoInspector 1 1.000 - - otm14448
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100175
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R16955
SonicParanoid 1 1.000 - - X2878
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1211.910

Return to query results.
Submit another query.