DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc36C and Dync2h1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001369131.1 Gene:Dhc36C / 35061 FlyBaseID:FBgn0013810 Length:4065 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063122173.1 Gene:Dync2h1 / 65209 RGDID:71042 Length:4313 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4402 Identity:1105/4402 - (25%)
Similarity:1908/4402 - (43%) Gaps:886/4402 - (20%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    28 KSKMLYTRP---KPDVLQ-SILQSKANPEYKSRRLWYE---LNMPECASSLLDGKMKSDLPDNIL 85
            |.|.|..||   |..:|: ..|.::.....|..||.:|   ..:|..||..|.||..|::.:||:
  Rat   423 KYKELVKRPTISKELMLERETLLARLGDSAKDFRLDFENRCRGIPGDASGPLSGKNLSEVVNNIV 487

  Fly    86 CAKKQQKK------------------------------------------RQKKRESGVA----- 103
            ..::.:.|                                          ..::.:||::     
  Rat   488 WVRQLELKVDDTIKIAEALLSDLSGFRSFHRSAEDLLDQFKLYEQEQFDDWSREVQSGLSDSRSG 552

  Fly   104 ---KANYMTMRLE------REHFRRKLVELILHMDDDQDPELAAQCAVPFPDQEEREILRYYYYI 159
               :||...|.|:      :.|:..:||.|:                     :|.|::....:.|
  Rat   553 LCIEANSRIMELDPNDGALKVHYSDRLVILL---------------------REVRQLSALGFVI 596

  Fly   160 KHGIDTIHVSPLSKKILKRITDLVPPLLYKWQTALNENIA----EVRADYVFAMKKAVVDFVLRH 220
            ...|.  .|:.:::|..|             |..:.:.:|    .:....:.:.:..::...|..
  Rat   597 PAKIQ--QVANVAQKFCK-------------QAIILKQVAHFYNSIDQQMIQSQRPMMLQSALAF 646

  Fly   221 TVLDRLTKEGVGGK----YDTAERRE--VQSMTNFWRYRYDENRNVLMKTLFCIHRSVASILELW 279
            ..:.:.:|.|.|||    :|..:..|  :|.:.|.......|||.                |..|
  Rat   647 EQIIKNSKAGSGGKSQITWDNPKELEGYIQKLQNAAERLATENRR----------------LRKW 695

  Fly   280 SMKYKDKSLIDSKELAKVESPFSLFTFVYLCGSHIDNGKTLL--EESW---YGEIHSSLLKASKR 339
            ...:.:|.:|    |..::                     ||  ::.|   ..|:.:.|...:.:
  Rat   696 HTTFCEKVVI----LMNID---------------------LLRQQQRWKDGLQELRTGLASVAAQ 735

  Fly   340 GQLP-DIRRFTLVKRFFNCVAALMTQQLEDICIRSLKEYADFICDYGHSNPGFEISVMLA-DEDT 402
            |..| |:|.:   ::.:|.......:....:.:.:|.|...            ||:|.|. .:..
  Rat   736 GFQPSDMRAW---RQHWNHQLYKALEHQYQMGLEALNENLP------------EINVDLTYKQGR 785

  Fly   403 IQFNPSFSKVQS----ELLRVI-------------DSIMLSIQMLPRIESKLYTDLIVSKKIFLT 450
            :||.|.|.::::    |:.|.|             |..:.|: |:.|..|...|  |.||     
  Rat   786 LQFRPPFEEIRAKYYREMKRFIGIPNQFKGVGEAGDESIFSV-MIDRNASGFLT--IYSK----- 842

  Fly   451 PTVPESIVQETKNRICAMLEEQR----IGPELRLQDFDPFIDLINGSDAERVGNFMESDATFEQY 511
                   .::...|:.|:|.:.:    ||.                         ::.:|..|:.
  Rat   843 -------AEDLFRRLSAVLHQHKEWVVIGQ-------------------------VDMEALVEKN 875

  Fly   512 ADMVYEYKEKEDRI---AKEVW---AVIRMGFYEFHRDKFITHLESLCRQLQLDLLARMVTDQQA 570
            ...|:::::....:   .|||.   :.:::.....:.....|.::.|.::| .|||   |...:.
  Rat   876 LSTVHDWEKNFKALKIKGKEVERLPSAVKVDCLNINCSPVKTVIDDLIQKL-FDLL---VLSLKK 936

  Fly   571 RITRLGKEYDAI---AKKALTV-PKDTAELMQLKAYVVHAEENLVPEMEARLKVNMSEILWLMDH 631
            .|.....|.|..   |.|.||| |:...|:         .:.||   ..:.|:....|||     
  Rat   937 SIQTHIHEIDTFVTEAMKVLTVIPQSVEEI---------GDTNL---QYSNLQDRRPEIL----- 984

  Fly   632 TLYSPLEIKNN-------------SNSFQWYLKLPSIFEQHRAIIAEKVIEYQELLKKRIELFRR 683
            .|:...|.||.             ||....:.|...:.|.|:.:|.:::...:..:|.|::::.:
  Rat   985 PLFQEAEDKNRLLRTVAGGGVETVSNLRAKWDKFELMMESHQLMIKDQIEVMKGNVKSRLQIYYQ 1049

  Fly   684 ELQNY---YEQVQTYDTWGDIKQLSRYKKRAGVLDQRLVQ--AMETIDQ----------INEEET 733
            ||..:   ::|::..|...:..|.:...:.|..:.::.::  .:|.|.:          :.|...
  Rat  1050 ELDKFKARWDQLKPGDDIIETGQQNTMDQSAKSIKEKKIEFDDLEVIRKKLVDDCHHFGLEEPNF 1114

  Fly   734 SYGWDLS----------------QYPMRKKAHDQLKPYKTLFDAGQDFMDKWDLWMHSQVGSFDP 782
            |..:.:|                |..:::.|.:....|:|.....::|:..|    |.::     
  Rat  1115 SLAYSISKDIESCAQIWALYEEFQQGLQEMAKEDWITYRTKIYIFEEFLINW----HERL----- 1170

  Fly   783 DEIDGDVSNFYRIIQKLDKQMGDHPI-TMQLIQDVKAQIEAFREHMPIINTLGNPGMKARHWELV 846
                              :::.:|.: |::|    :::::.::..:||:..:....:...||..:
  Rat  1171 ------------------RKVEEHSVMTVKL----QSEVDRYKIIIPILKYVRGEHLSPDHWLDL 1213

  Fly   847 SEIIGFPIKVSPELTLEKIIEYQL----DEYVPK---FEAISESATKENNLERAMAKMVNEWEGV 904
            ..::|.|...|    |||::...|    |..|.|   .:.::..|..|..:..|:.::.....|.
  Rat  1214 FRLLGLPRGTS----LEKLLFGDLLRVADTIVEKASDLKDLNSRAQGEVTIREALRELDLWGVGA 1274

  Fly   905 EFSISPYRDSGTFKLAAVDDIQILLD---DQIIKTQTMKSSPYIKPFEADIIKWEAKLMLLQEIL 966
            .||:..|.||....:..:.|.:.:::   |.....|::|.|||.|.||..:..||.||..|.|.|
  Rat  1275 VFSLIDYEDSQNRTIKLIKDWKDIVNQVGDNRCLLQSLKDSPYYKGFEDKVSIWERKLAQLDEYL 1339

  Fly   967 DEWLRVQATWMYLEPIFSSPDIQQQMPEEGRRFSAVDKIWKELMKQVSQDPKVMVVVQIDKMNDK 1031
            .....:|..|:||||||.    :..:|:|..||:.||:.::.:|..:.:|.:|..:.....:.:.
  Rat  1340 QNLNHIQRKWVYLEPIFG----RGALPKEQTRFNKVDEDFRSIMMDIRKDSRVTTLTTHAGIRNT 1400

  Fly  1032 LKKAYSLLEVIQKGLNAYLEKKRLYFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQIHLKKCFEGIATLN 1096
            |......|:..||.||.:||:||..||||:|:.:|:|||||.::.:|:.:|.||||.|.||.::.
  Rat  1401 LLTILDQLQRCQKSLNEFLEEKRSAFPRFYFIGDDDLLEILGQSTNPSVIQSHLKKLFAGINSVC 1465

  Fly  1097 FTEE-LDVTAMRSSEREEVTLVDVISTSKARGQVEKWLLELEIDMKKSVHHKVSEAFYSYLKMLR 1160
            |.|| ..:|||||.|.|.|.....:..|   ..||.||.:|.::||:::...:.|...:......
  Rat  1466 FDEESKHITAMRSLEGEVVPFKSKVLLS---NNVEAWLNDLALEMKQTLKQLLKECVTAGRSSQG 1527

  Fly  1161 HVWVLTWPGQCVQSISLTYWTLEITECFESEEPKENLAKYLQKCVLQINKIVDLVRGDL-NTQN- 1223
            .:....:|.|.:.......:|.::.:........:..|:...|  |:....||....|. |::: 
  Rat  1528 AIDPSLFPSQILCLAEQIKFTEDVEDAIRDHSLHQIEAQLAAK--LERYTSVDTSSEDPGNSESG 1590

  Fly  1224 --RITLGALVVLDVHARDVLAEIVANQVEDLQDFQWLCQLRYYWE-DNNLDTRMINCSLPYGYEY 1285
              .:.|.||::..:|..|::.::...||....|:.|..|:|:|.: |:....:|::..|.|.|||
  Rat  1591 ILELKLKALILDIIHNIDIVKQLNQAQVHTTDDWAWKKQVRFYMKSDHTCYVQMVDSELQYTYEY 1655

  Fly  1286 LGNTPRLVVTPLTDRCYRTLFAALNLHLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLD 1350
            .||.|:||.|||||:||.||..|:.:.|||.|.|||||||||:.|.|...:.:|.:||||.:|:|
  Rat  1656 QGNAPKLVYTPLTDKCYLTLTQAMKMGLGGNPYGPAGTGKTESVKALGGLLGRQVLVFNCDEGID 1720

  Fly  1351 YLALGKFFKGLASCGAWSCFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTIQRGINSGSPTLVFEGTTLTLDPTC 1415
            ..::|:.|.||..||||.|||||||::..|||.|:.||.|||..:.:........|..:.::...
  Rat  1721 VKSMGRIFVGLVKCGAWGCFDEFNRLEEAVLSAVSMQIQTIQDALKNHRSVCELLGKEVEINANS 1785

  Fly  1416 AVFITMNP---GYAGRSELPDNLKALFRSVAMMVPDYALISEIELYSYGFLTAKPLSVKIVATYR 1477
            .:||||||   ||.||.:||||||.|||.|||..||..||:|:.|||.||..||.|..|:||.:.
  Rat  1786 GIFITMNPAGKGYGGRQKLPDNLKQLFRPVAMSRPDNDLIAEVILYSEGFKDAKELGRKLVAIFN 1850

  Fly  1478 LCSEQLSTQCHYDYGMRAVKSVLKAAGALKLRY-------RDENEDILVLRSIKDVNLPKFLNQD 1535
            |..|.|:.|.|||:|:||:|:||:.:|.| ||.       :|.||:.:|:::::...:.||...|
  Rat  1851 LSRELLTPQQHYDWGLRALKTVLRGSGNL-LRQLKKSGTKQDVNENHIVVQALRLNTMSKFTFAD 1914

  Fly  1536 IPLFQGITSDLFPGTVLPEADYVLFNKCTQMACERQNKQCTPFVLEKVQQLYEMIVVRHGLMLVG 1600
            ...|..:..|:|||....|.:|...:...:...|..|.:..|..::|..:|||.:..|.|:::||
  Rat  1915 CTRFDALIKDVFPGIDFKEVEYNELSSALKQVFEEANYEVIPNQMKKALELYEQLRQRTGVVIVG 1979

  Fly  1601 YPFGGKTTTYRVLAEALECMEKTDGSENKAI--YTVINPKAITMGQLYGQFDAVSHEWSDGILAV 1663
            ....||:|.:|:|..|| |      ...|.:  || :||||:...||.|..|..:.|||||:|..
  Rat  1980 PSGAGKSTLWRMLRAAL-C------KIGKVVKQYT-MNPKAMPRHQLLGHIDMDTREWSDGVLTN 2036

  Fly  1664 NYRIFAISDSPDRKWLIFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQLSNTTNLVFEPMDLEV 1728
            :.|...........|:|.||.:|..|||::|:|||||:.|.:.|||.||.....|.|||..||..
  Rat  2037 SARQVVREPQDVSSWIICDGDIDPEWIESLNSVLDDNRLLTMPSGERIQFGPNVNFVFETHDLSC 2101

  Fly  1729 ASPATVSRCGMIYLEPSSLGWEPLVASWKNTLPAAFHTVSKQLISMLISRFCPILLFILRKSLKE 1793
            |||||:||.|||:|.........|:.||....|..:.:   .|.:.:...|...|.::|:::...
  Rat  2102 ASPATISRMGMIFLSDEETDLNSLIKSWLRNQPVEYRS---NLENWIGDYFSKALQWVLKQNDYV 2163

  Fly  1794 IAPTSDANLMVSLMNFFECFIDDFRDEKYVANVSDLDFRAQTEGIFLFSCIWSLGGSLDADSREK 1858
            :..:....:|..|.:...|   .:.|:                  |:.:.|..|||:|:..||.:
  Rat  2164 VETSLVGTVMNGLSHLHGC---KYHDQ------------------FIINLIRGLGGNLNMKSRLE 2207

  Fly  1859 FNIIFRALMEKTFPQS--LYDTY-------------GVPEDLYVESLAKPFIFPI---PKQGSVF 1905
            |.........:|.|.|  ..|||             ..||.|..:..:.....|:   |......
  Rat  2208 FTKEVFNWARETPPDSHRPMDTYFDCDRGQLASYVLKKPESLTADDFSSGHSLPVIQTPDMQRGL 2272

  Fly  1906 DYRYIKEGKGKWKPWQDDVNSAPPIPRDIPVNQIIIQTNESVRIGAVLDLLNRHGKPIMLVGPTG 1970
            ||         :|||                                  |.:...:|.:||||.|
  Rat  2273 DY---------FKPW----------------------------------LSSETKQPFILVGPEG 2294

  Fly  1971 TGKSVYVIDY---MLKKMDLSFYKPLLISFSAQTSA-------NQTQDIIMSKLDKRRKGVFGPP 2025
            .||.: ::.|   .|:..:::     .|..||||::       :||..:|.:...:    |:.|.
  Rat  2295 CGKGM-LLRYAFSQLRSTEIA-----TIHCSAQTTSRHLLQKLSQTCMVISTNTGR----VYRPK 2349

  Fly  2026 LNSRFVIFVDDVSMPLKENYGAQPPIELLRMMLDHMMWYDRKNIVPMKLIDLQMIVAMGPPSTG- 2089
            ...|.|:::.|:::|..:.:|....:..|:.:|.:..:|| :|:..:.|.::|::.:|   |.| 
  Rat  2350 DCERLVLYLKDINLPKLDKWGTSTLVAFLQQVLTYQGFYD-ENLEWVGLENIQIVASM---SAGG 2410

  Fly  2090 ----NTVTPRFQRFFNVISIDDFNNDILNTIFSKIV------------LWHLDTRGFSKEFDPCI 2138
                :.:|.||.....:.::|....:.|.||:...:            :|     |.|.:    |
  Rat  2411 RLGRHKLTTRFTSIVRLCAVDYPEREQLQTIYGAYLEAVLHKNLKNHSIW-----GSSSK----I 2466

  Fly  2139 DEIVGATLTIYNDAKLNLLPTPAK------SHYLFNLRDFSRVIQGVL---LSVPEATEDVNSMR 2194
            ..:.|:.:.:|...:       ||      |||.|.....::.:.|:.   |....:...::.:.
  Rat  2467 YLLAGSMVQVYEQVR-------AKFTVDDYSHYFFTPCILTQWVLGLFRYDLEGGSSNHPLDYVL 2524

  Fly  2195 RLWVHEVLRVYGDRLVEDADRSWLFENICSTV-KSCFNTD--------------PSRLFGRLVEK 2244
            .:..:|..|::.|::| ......||:||.::| :..:.:|              ...:.|..:..
  Rat  2525 EIVAYEARRLFRDKIV-GVKELHLFDNILTSVLQGDWGSDILDNMADSFYVTWGAQHISGAKIAP 2588

  Fly  2245 DKSLQESDFRQLIYCDFTNPKADTKNYVEVQDLEELRRVVEAYLVEYNNMSKKPMNLVLFRFAIE 2309
            .:.|.              |.......:...||::   |::..|:.|.. ..:.::::||:..:|
  Rat  2589 GQPLP--------------PHGKPLGKLSSADLKD---VIKKGLIHYGR-DNQNLDILLFQEVLE 2635

  Fly  2310 HLSRICRIIKQPRSHALLIGVGGSGRQSLTRLASHICDYELFQVEITRLYGPYEYHEDIKAILRK 2374
            ::|||.|::..|....||.|..|.||:::|.|.||:....||..:|:|.|.|.::..|:|.:|..
  Rat  2636 YMSRIDRVLSFPGGSLLLAGRSGVGRRTVTSLVSHMHGAVLFSPKISRGYEPKQFRTDLKHVLHL 2700

  Fly  2375 IGASEMHGVFLFTDVQIKDESFLEDISNLLNSGEVPNLFTNEEKIEVQEKMAQIDKQRDKAVQTD 2439
            .|......|.|..|.|....:|||.|::||:|||||.|:|.|   |::..:..:   :|:|.| |
  Rat  2701 AGIEAQQVVLLLEDYQFVHPTFLEMINSLLSSGEVPGLYTLE---ELEPLLLPL---KDQASQ-D 2758

  Fly  2440 GSPVALFNFFVTTCKDQLHIVLAMSPIGDALRNRIRKFPSIVNC---------CTIDWFQSWPED 2495
            |....:||:|....:..|||||.|..         .....|:||         |.:.|.:.|.:.
  Rat  2759 GFFGPVFNYFTYRIQQNLHIVLIMDS---------ANLNFIINCESNPALHKKCQVLWMEGWSDS 2814

  Fly  2496 ALLAVSTRFLASEDLTAL--------ERRTAIDMCMEFHTSTQELSAKFFSRLHR----YNYVTP 2548
            ::..:.....:..|:...        ::::::|  .:|        .|.|..:|.    |. .||
  Rat  2815 SMKKIPEMLFSEADIEEKYEKKRKDEKKKSSVD--PDF--------IKSFLLIHESCKAYG-ATP 2868

  Fly  2549 TSYLELIQTFKALLSQKRNNITNNRNRYLTGISQLDIAAQQVAVMQ----EQLIALEPKLKEASE 2609
            :.|:..::.:.|:.|.||..:...::....|:|:|:.|...|..:.    ||.|.|..|..||..
  Rat  2869 SRYMTFLRVYSAISSSKRKELLKRQSHLQAGVSKLNEAKALVDELNRKAGEQSILLRIKQDEADS 2933

  Fly  2610 IVAEQVAKVTADSKLAEEQR-EIVKLDESAAKEQAAVAQEIKDECDAKLGEALPILESALAALNT 2673
            .:.|    :|...:.|.||: |:.:|....|:|...: :|.|.:.|.:|.|..|::..|..|:..
  Rat  2934 ALQE----ITVSMQDASEQKTELERLKHRIAEEVVKI-EERKSKIDDELKEVQPLVNEAKLAVGN 2993

  Fly  2674 LTTADIAVVKTMKSPPIGVRIVMEAVCILKDVKPDKVPNPSGLGTVEDYWGPSKRVLSDMKFLDS 2738
            :....::.:::::.||..:|.::|.|..|             :|..:..|...|..|:.....:.
  Rat  2994 IRPESLSEIRSLRMPPDVIRDILEGVLRL-------------MGIFDTSWVSMKSFLAKRGVRED 3045

  Fly  2739 LLNFDKDNIPVEVMKKLAQRILSNEA-FDPDKIKSASTACEGLCRWVIALTKYDVVAKIVAPKKL 2802
            :..||..|||.|:.:.:.:.:..|:| |||...|.||||...|..||.|..:|..|.:.:.|.:.
  Rat  3046 IATFDARNIPKEIRESVEELLFKNKASFDPKNAKRASTAAAPLAAWVKANVQYSHVLERIQPLET 3110

  Fly  2803 ALAEAEATYNAAMKTLNEKLAMLAKVEANLAAI-QKI--LDEQLRQYGILLAEHEACTKKLQR-- 2862
            ..:..|....   ||.:.|    .|:|..|.:: ||:  |.|:.:......|:.||...|.|.  
  Rat  3111 EQSGLELNLK---KTEDRK----RKLEDLLNSVGQKVSELKEKFQSRTSEAAKLEAEVSKAQETI 3168

  Fly  2863 --AQELISGLGGERTRWSETAKMLQASFKSVTGDVLISSGVVSYLGPFTIDFRVDQIRKWVTKCL 2925
              |:.|||.|..|..||:.....:.....::.....:::..::||.......|.:.:.:| ||..
  Rat  3169 KAAEVLISQLDREHRRWNAQVAEIAEELATLPKRAQLAAAFITYLSAAPEGLRKNCLEEW-TKAA 3232

  Fly  2926 NFGVTCTADFQLAVVLGEPVEIRFWNICGLPTDAFSIESAIMMK---NARRW----PLMIDPQGQ 2983
            ..     ..|.|...|....|...|...|||:|..|||:|:::.   ..:.|    |.:|||..|
  Rat  3233 GL-----EKFDLRRFLCTESEQLIWKSEGLPSDDLSIENALVILQIIGLKSWSRVCPFLIDPSSQ 3292

  Fly  2984 ANKWIKNYEKNNKLCVIRLNQADYTRVMENAIQFGLPVLLENIGEELDPVLESVLQKTLFKQGGA 3048
            |.:|:|.:.|::.|.||....:::...:|.|::||..::::.: :.::|||..:|::.|..||..
  Rat  3293 ATEWLKTHLKDSHLEVINQQDSNFITALELAVRFGKTLIIQEM-DGVEPVLYPLLRRDLVAQGPR 3356

  Fly  3049 LCIKLGDSVIEYNHSFRFYMTTKLRNPHYLPEVAVKVTLLNFMITTQGLQDQLLGITVARERPDL 3113
            ..:::||.:|:||..||.:::|:..||...|:.|..||.:||..|..||:.|||.:|:..|:|||
  Rat  3357 YVVQIGDKIIDYNEDFRLFLSTRNPNPFIPPDAASIVTEVNFTTTRSGLRGQLLALTIQHEKPDL 3421

  Fly  3114 EAEKNNLIVQGADNKRMLKETEDQILEVLSSAE-NILEDETAVQILSSAKALANDISEKQVITEA 3177
            |.:|..|:.|..|.|..|...|:.:||.|:::: ||||::..::.|:..||.:..|.:.  :.|:
  Rat  3422 EEQKTKLLQQEEDKKIQLARLEESLLETLATSQGNILENKDLIESLNQTKASSALIQDS--LKES 3484

  Fly  3178 TEKQI--DIARLSYVPIAEHSTILFFTIVELANIDPMYQYSLVWFVNLYMSSIDNTEKVDDIAAR 3240
            .:.||  |..|.:|:|:||.::.::|.|.:|:.|:.||::||..|:.|:..::.|.:..:....|
  Rat  3485 YKLQISLDQERDAYLPLAESASKMYFIISDLSKINNMYRFSLASFLRLFQRALQNKQDSESTEQR 3549

  Fly  3241 LLDLRNHFTYSLYVNICRSLFERDKLLFSLILNINMMKHDNRIDNAEWMFLLTGGVGLENPYKNP 3305
            :..|.|...:.:|..|||.||:.|:|:|:|.....|  |.......||                 
  Rat  3550 IQCLVNSLKHMVYEYICRCLFKADQLMFALHFVRGM--HPEFFQENEW----------------- 3595

  Fly  3306 TTWLGV-------------------QNWDELCRLTNLTNFK----GLREDF-NENSAQWKPFFDS 3346
            .|:.||                   .:|.:..|...:...|    ||.:.. .|:...|:.::..
  Rat  3596 DTFTGVVVGDMLRKADSQQRIRDQLPSWIDQERSWAVATLKISLPGLYQTLCFEDGTLWRTYYHH 3660

  Fly  3347 KSPQDNKDIPKSWDNRVSVFQKLLLLRVFRPDKLVPAVLNFVSGELGERFVDPPQFDLMASFADS 3411
            ...:  ::.|.....:||:||::|:::..|||:|..|:..|....||.:.:.|...:|...:.::
  Rat  3661 SMCE--QEFPSILAKKVSLFQQVLVVQALRPDRLQSAMALFACKALGLKELSPLPLNLKRLYKET 3723

  Fly  3412 HCCVPLIFILTPGSDPTATLLKFAEDQGFGTNRLFSLSLGQGQGPIAMKMIDEGVKMGNWVVLQN 3476
            ....|::.|::||:||:..|.:.|..:. .:.....:::||||..:|::|:.|..:.|:|:.|:|
  Rat  3724 LEIEPILIIISPGADPSQELQELANAER-SSECYHQVAMGQGQADLAIQMLKECARNGDWLCLKN 3787

  Fly  3477 CHLAASFMPLLEKICENLLPDATHPDFRLWLTSYPADHFPVVVLQNGIKMTNEPPKGLRSNILRS 3541
            .||..|::|:|||....|.|..:   ||||||:....:|..::||:.:|:|.|.|.||:.|::|:
  Rat  3788 LHLVVSWLPVLEKELNTLQPKES---FRLWLTAEVHPNFTPILLQSSLKITYESPPGLKKNLMRT 3849

  Fly  3542 MISDPISDPEWYESCTQPRIFKQ-------LIYSLCFFHAVIQERRYFGPIGWNIPYEFNETDLR 3599
                       |||.|..:|.|:       .::||.:|||..||||.|.|.||...|||:.:|||
  Rat  3850 -----------YESWTPEQISKKDNIHRAHALFSLAWFHAACQERRNFIPQGWTKFYEFSLSDLR 3903

  Fly  3600 ISLMQLRMFLNQYETVNYDALRYLTGECNYGGRVTDDWDRRTLKTILDKFYCPAVIDLET----- 3659
            .....:....:..:.|.::.:..|.....||||:.:.:|.|.|::.|.:|:..::||:..     
  Rat  3904 AGYHVIDRLFDGSKDVQWEFVHGLLENSIYGGRIDNYFDLRVLQSYLKQFFNSSIIDVLNQRNKK 3968

  Fly  3660 ---PYYLDETGLYYVPVFKEVDLYLNFTRDLPQISAPAIFGFHANADIMKDQKETDMLLSHTLLT 3721
               ||.:.      :|....:..|......||:...|:.||..||.     .:.:..:.|..:::
  Rat  3969 SIFPYSIS------LPNSCSILDYRAVIEKLPEDDKPSFFGLPANI-----ARSSQRMTSSQVIS 4022

  Fly  3722 QKLEKKQRVYVETLSRRFPENLSLPTYPTCPPFLALYQMSLKDTSASSDDSGGSKALTPEEVVTN 3786
            |         :..|.|..                                :.|.|  ...|:.:|
  Rat  4023 Q---------LRILGRSV--------------------------------TAGCK--FDREIWSN 4044

  Fly  3787 VATDILDKLPKLFDRDAALLKYPTLYHQSMN-----------TVLVQEMVRFNV--LLNTIRTSL 3838
            ..:.:|:...||....       .|.||.::           :.::.|  :||.  |:.::..||
  Rat  4045 ELSPVLNLWKKLNQNS-------NLIHQKVSPPNDRQGSPILSFIILE--QFNAIRLVQSVHQSL 4100

  Fly  3839 ITLRKGIKGLVVMSPAVEAVYKSVLIAKIPAMWAGKSYPSLKPLGSYVTDFLRRLEFLQHWFDHG 3903
            ..|.|.|:|..::|..|:.:..::|..|.|..|..|......|| .|:...:.|...:|:|.:..
  Rat  4101 AALSKVIRGTTLLSSEVQKLASALLNQKCPLTWQSKWEGPEDPL-QYLRGLVARTLAIQNWVEKA 4164

  Fly  3904 -----APSTFWLSGFFFTQAFLTGAQQNYARKYVISIDLLAFDYEVLT----VEEPQRQGLSGPE 3959
                 ...|..||..|....||...:|..||....|:|.|.|   |.:    ::|.:.|      
  Rat  4165 EKQALLADTLDLSELFHPDTFLNALRQETARATGCSVDSLKF---VASWKGRLQEAKLQ------ 4220

  Fly  3960 DGVFVYGIFLEGARWDRTGKYLAESR--PRELFDTMP--LIW--------LKPLKRVDLPERHNY 4012
              :.:.|:.|||..:|  |..|:|::  ...:...:|  :.|        ..|.:.:.|      
  Rat  4221 --IKISGLLLEGCSFD--GSRLSENQHDSPSVSSVLPCYMGWTPQGSYGPYSPDECISL------ 4275

  Fly  4013 LCPMYKTAERRGVLSTTGHSTNFVVAMLLLCNPNTPVSHWIIRGTAL 4059
              |:|.:|||..|:      ||..|.    |..|.  ..||..|.||
  Rat  4276 --PVYTSAERDCVV------TNIDVP----CGGNQ--DQWIQCGAAL 4308

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc36CNP_001369131.1 DHC_N2 746..1151 CDD:462462 115/416 (28%)
DYN1 <984..3651 CDD:227570 805/2828 (28%)
AAA_6 1281..1607 CDD:463697 147/335 (44%)
AAA_8 2299..2561 CDD:463701 77/282 (27%)
AAA_9 2948..3168 CDD:463702 78/227 (34%)
Dynein_C 3779..4061 CDD:465677 75/315 (24%)
Dync2h1XP_063122173.1 None

Return to query results.
Submit another query.