DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc36C and Dnah5

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001369131.1 Gene:Dhc36C / 35061 FlyBaseID:FBgn0013810 Length:4065 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008759046.2 Gene:Dnah5 / 294854 RGDID:1560828 Length:4621 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4006 Identity:1229/4006 - (30%)
Similarity:2001/4006 - (49%) Gaps:517/4006 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   239 ERREVQSMTNFWRYRYDENRNVLMK----TLFCIHRSV--ASILELWSMKYKDKSLIDSKELAKV 297
            |.||:.|..|      .:|.:.|:|    ||..|.|.:  :.::          :..|||..:||
  Rat   951 EARELLSYFN------HQNTDALLKVTRNTLEAIRRRIHFSHMI----------NFRDSKGASKV 999

  Fly   298 ESPFSLFTFVYLCGSHIDNGKTLLEESWYGEIHSSLLKASKRGQLPDIRRFTLVKRFFNCVAALM 362
            :                             :.|..:.:||....:|:|.               |
  Rat  1000 K-----------------------------QNHLPIFRASVTLAIPNIS---------------M 1020

  Fly   363 TQQLEDI---------CI----RSLKEYADFICDYGHSNPGFEISVMLADEDTIQFNPSFSKV-Q 413
            |..||||         ||    :.:::::..:......... :::.:.::||    :.|.::| :
  Rat  1021 TPALEDIQQTLNKAVECIISVPKGVRQWSSELLSKRKMRER-KMAAVQSNED----SDSDTEVEE 1080

  Fly   414 SELLRVIDSIMLSIQM-LPRIESKLYTDLIVSKKIFLTPTVPESIVQETKNRICAMLEEQRIGPE 477
            |||...::  :.|:.: :|......|.::..:|:|....:|..:::..||..:...::.      
  Rat  1081 SELQETLE--LASVNLPIPVQTQNYYKNISDNKEIVKLVSVLSTVISSTKKEVITSMDR------ 1137

  Fly   478 LRLQDFDPFIDLINGSDAERVGNFMESDATFEQYADMVYEYKEKEDRIAKEVWAVIRMGFYEFHR 542
                 |..:..:......:.:..|:..:....::...:..::..|..|..|...:.......:..
  Rat  1138 -----FKCYNHIWQKEKEDTIMTFIAQNPLLSEFESRILYFQSLEQEINAEPEYICVGSIALYTA 1197

  Fly   543 D-KFITHLESLCRQL------------QLDLLARMVTDQQARITRLGKEYDAIAKKALTVPKDTA 594
            | ||....|:....:            :::.:..:|.:.|.::.|..|:.|.| :.|:...|:..
  Rat  1198 DLKFSLTAETKAWMMVLGRHCNRKYRSEMENIFTVVEEFQKKLNRPIKDLDDI-RIAMAALKEIR 1261

  Fly   595 ELMQL----------KAYVVHAEENLVPEMEARLKVNMSEILWLMDHTLYSPLEIKNNSNSFQWY 649
            | .|:          ::|.:..:..|:...|...||:.....|  :..|....:::|...:.|  
  Rat  1262 E-QQISTDFQVGPIEESYALLNKYGLLVAKEEMDKVDTLRYAW--EKLLARASDVQNELGALQ-- 1321

  Fly   650 LKLPSIFEQHRAIIAEKVIEYQELLKKRIELFRRELQNYYEQVQTYDTWGDIKQLSRYKKRAGVL 714
               ||               :::.|...:|:|.::.|.:|   ..||..|.:  :|..|.:..  
  Rat  1322 ---PS---------------FRKELISTVEVFLQDCQQFY---LDYDLNGPM--VSGLKPQEA-- 1361

  Fly   715 DQRLVQAMETIDQINEE-------ETSYGWDLSQYPMRKKAHDQL-------KPYKTLFDAGQDF 765
            ..||:......|.|..:       |..:|..::|||...:...||       ..|..:.:....:
  Rat  1362 SDRLIIFQNQFDNIYRKYITYTGGEELFGLPVTQYPQLLEIKKQLNLLQKIYSLYNNVIETVNSY 1426

  Fly   766 MDKWDLWMHSQVGSFDPDEIDGDVSNFYRIIQKLDKQMGDHPITMQLIQDVKAQIEAFREHMPII 830
            .|  .||....:     ::|:.::..|....:||.:.:.|    .|...|:|..|:.|.|..|::
  Rat  1427 QD--TLWSEVNI-----EKINSELLEFQNRCRKLPRALKD----WQAFLDMKKTIDDFSECCPLL 1480

  Fly   831 NTLGNPGMKARHWELVSEIIGFPIKVSPE-LTLEKIIEYQLDEYVPKFEAISESATKENNLERAM 894
            ..:.:..|..|||:.::.:.|..:.|..| ..|..|:|..|.:|..:.|.|..||.||.::|:.:
  Rat  1481 EYMASNAMVERHWQRITTLTGHSLDVGNETFKLRNIMEVPLLKYKEEIEDICISAVKERDIEQKL 1545

  Fly   895 AKMVNEWEGVEFSISPYRDSGTFKLAAVDDIQIL--LDDQIIKTQTMKSSPYIKPFEADIIKWEA 957
            .:::|||:....:.|.::..|...|......:::  ::|.::...::.|:.|..||:|.|..|..
  Rat  1546 KQVINEWDNKTLTFSSFKTRGELLLRGDSTSEVIASMEDSLMLLGSLLSNRYNMPFKAQIQNWVQ 1610

  Fly   958 KLMLLQEILDEWLRVQATWMYLEPIFSSPDIQQQMPEEGRRFSAVDKIWKELMKQVSQDPKVM-V 1021
            .|....:|::.|:.||..|:|||.:|...||.:|:|:|.:|||.:||.|.::|.:..:.|.|: .
  Rat  1611 CLSNSTDIIENWMTVQNLWIYLEAVFVGGDIAKQLPKEAKRFSNIDKSWVKIMTRAHEIPNVVQC 1675

  Fly  1022 VVQIDKMNDKLKKAYSLLEVIQKGLNAYLEKKRLYFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQIHLK 1086
            .|..:.|...|......||:.||.|..|||||||.||||||:|:..|||||.:..|...:|.||.
  Rat  1676 CVGDETMGQLLPHLLDQLEICQKSLTGYLEKKRLCFPRFFFVSDPALLEILGQASDSHTIQAHLL 1740

  Fly  1087 KCFEGIATLNFTEELDVTAMRSSEREEVTLVDVISTSKARGQVEKWLLELEIDMKKSVH------ 1145
            ..|:.|.|:.|.:::....:..|.||..| :::.....|.|.||.||..|..:.:.|:|      
  Rat  1741 NVFDNIKTVKFHDKIYDRILSISSREGET-IELDKPVMAEGNVEVWLNSLLEESQSSLHLVIRQA 1804

  Fly  1146 -HKVSEAFYSYLKMLRHVWVLTWPGQC----VQSISLTYWTLEITECFESEE-PKENLAKYLQKC 1204
             ..:.|:.:..::.|.     ::|.|.    :|.:    ||.:..|..::.: .|:.:.|..|..
  Rat  1805 AANIQESGFQLIEFLS-----SFPAQVGLLGIQML----WTRDSEEALQNAKFDKKIMQKTNQSF 1860

  Fly  1205 VLQINKIVDLVRGDLNTQNRITLGALVVLDVHARDVLAEIVANQVEDLQDFQWLCQLRYYWEDNN 1269
            :..:|.::::...||::..|:....|:.:.||.||:..::....|:...||:||.|.|:|:::::
  Rat  1861 LELLNMLIEMTTKDLSSMERVKYETLITIHVHQRDIFDDLCHMHVKSPTDFEWLKQCRFYFKEDS 1925

  Fly  1270 LDTRMI---NCSLPYGYEYLGNTPRLVVTPLTDRCYRTLFAALNLHLGGAPEGPAGTGKTETTKD 1331
             |..||   :.:..|..|:||.|.|||:||||||||.||..||.:.:||||.|||||||||||||
  Rat  1926 -DKTMIHITDVAFTYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALGMSMGGAPAGPAGTGKTETTKD 1989

  Fly  1332 LAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFFKGLASCGAWSCFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTIQRGIN 1396
            :.:.:.|..|||||||.:|:..||:.|||||..|:|.||||||||||.||||.||||..|.....
  Rat  1990 MGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSWGCFDEFNRIDLPVLSVAAQQISIILTCKK 2054

  Fly  1397 SGSPTLVF-EGTTLTLDPTCAVFITMNPGYAGRSELPDNLKALFRSVAMMVPDYALISEIELYSY 1460
            ....:.:| :|..:|::|...:|:|||||||||.|||:|||..||||||||||..:|..::|.|.
  Rat  2055 EHKKSFIFTDGDNVTMNPEFGLFLTMNPGYAGRQELPENLKINFRSVAMMVPDRQIIIRVKLASC 2119

  Fly  1461 GFLTAKPLSVKIVATYRLCSEQLSTQCHYDYGMRAVKSVLKAAGALKLRYRDENEDILVLRSIKD 1525
            ||:....|:.|....|:||.||||.|.|||:|:|.:.|||:..||.|.....:.|..:|:|.::|
  Rat  2120 GFIDNVVLARKFFTLYQLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAAKRASHTDTESTIVMRVLRD 2184

  Fly  1526 VNLPKFLNQDIPLFQGITSDLFPGTVLPEADYVLFNKCTQMACERQNKQC-----TPFVLEKVQQ 1585
            :||.|.:::|.|||..:..||||..:|.:|.|...    :.|..:|.::.     .|:.| ||.|
  Rat  2185 MNLSKLIDEDEPLFLSLIEDLFPNILLDKAGYPEL----ETAISKQVEEAGLINHPPWKL-KVIQ 2244

  Fly  1586 LYEMIVVRHGLMLVGYPFGGKTTTYRVLAEAL-ECMEKTDGSENKAIYTVINPKAITMGQLYGQF 1649
            |:|...||||:|.:|....|||:....|.:|: :|     |..::.:.  :||||||..|::|:.
  Rat  2245 LFETQRVRHGMMTLGPSGSGKTSCIHTLMKAMTDC-----GKPHREMR--MNPKAITAPQMFGRL 2302

  Fly  1650 DAVSHEWSDGILAVNYRIFAISDSPDRKWLIFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQLS 1714
            |..:::|:|||.:..:|....:...:..|::.|||||||||||:|:||||||.|.|.:|:.|.::
  Rat  2303 DVATNDWTDGIFSTLWRKTLKAKKGEHIWIVLDGPVDAIWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRIPMA 2367

  Fly  1715 NTTNLVFEPMDLEVASPATVSRCGMIYLEPSSLGWEPLVASWKNTLPAAFHTVSKQLISMLISRF 1779
            ....:||||.:::.||||||||.||:::..|.|.|.|::..                        
  Rat  2368 PNCKIVFEPHNIDNASPATVSRNGMVFMSSSVLDWSPILEG------------------------ 2408

  Fly  1780 CPILLFILRKSLKEIAPTSDANLMVSLMNFFECFIDDFRDEKYVANVSDLDFRAQ---------- 1834
                 |:.|:|.:|      |.::..|  :.|.|.|.:|     .::.:|:|:.:          
  Rat  2409 -----FLKRRSPQE------AEILRQL--YAETFPDLYR-----FSIQNLEFKMEILEAFVITQS 2455

  Fly  1835 ---TEG------------------IFLFSCIWSLGGSLDADSREKFNIIFRALMEKTFPQSLYDT 1878
               .:|                  :|:|:.:||:|..|:.:.|.:..:..|:....|        
  Rat  2456 THMLQGLIPTKEQAGDVDPEHLGRLFVFAMMWSVGAVLELEGRRRMELWLRSREGPT-------- 2512

  Fly  1879 YGVPEDLYVESLAKPFIFPIPKQGSVFDYRYIKEGKGKWKPWQDDVNSAPPIPRDIP-VNQIIIQ 1942
                  |::..|..|       ..::||| |:.. .|.|:.|...:......|...| ...|::.
  Rat  2513 ------LHLPQLTDP-------GDTMFDY-YVAP-DGTWRHWSMCIPEYVYPPDTTPEYGSILVP 2562

  Fly  1943 TNESVRIGAVLDLLNRHGKPIMLVGPTGTGKSVYVIDYMLKKMDLSFYKPLLISFSAQTSANQTQ 2007
            ..::||...::..:.:.||.::|:|..||.|:|.:..:| .|.|...:....::||:.|:....|
  Rat  2563 NVDNVRTDFLIKTIAKQGKAVLLIGEQGTAKTVIIKGFM-SKFDPESHTVKNLNFSSATTPLMFQ 2626

  Fly  2008 DIIMSKLDKRRKGVFGPPLNSRFVIFVDDVSMPLKENYGAQPPIELLRMMLDHMMWYDRKNIVP- 2071
            ..|.|.:|||....:|||...:..:|:||::||:...:|.|...|::|.:::...:|:.:.  | 
  Rat  2627 RTIESYVDKRMGTTYGPPAGKKMAVFIDDLNMPVINEWGDQVTNEIVRQLMEQNGFYNLEK--PG 2689

  Fly  2072 --MKLIDLQMIVAMGPPSTG-NTVTPRFQRFFNVISIDDFNNDILNTIFSKI-VLWHLDTRGFSK 2132
              ..::|:|.:.||..|..| |.:..|.:|.|::.:....::..::.||..| ..::...|||||
  Rat  2690 EFTSIVDIQFLAAMIHPGGGRNDIPQRLKRQFSIFNCTLPSDASMDKIFGVIGEGYYCAQRGFSK 2754

  Fly  2133 EFDPCIDEIVGATLTIYNDAKLNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVLLSVPEATEDVNSMRRLW 2197
            |....:.::|..|..::...||.:||||||.||:|||||.||:.||:|....|..:|.:.:.|||
  Rat  2755 EVQDAVIKLVPLTRRLWQMTKLKMLPTPAKFHYVFNLRDLSRIWQGMLNITSEVIKDTDELLRLW 2819

  Fly  2198 VHEVLRVYGDRLVEDADRSWLFENICSTVKSCFNTDPSRLFGRLVEKDKSLQESDFRQLIYCDFT 2262
            .||..||..||....:|.:|..:.:.|.|:..|..:.:.:....|:            ..:.||.
  Rat  2820 KHECKRVIADRFSMSSDVTWFDKAVVSLVEEEFGEEKTPVVDCGVD------------AYFVDFL 2872

  Fly  2263 N--PKAD-----------TKNYVEVQDLEELRRVVEAYLVEYN-NMSKKPMNLVLFRFAIEHLSR 2313
            .  |:|.           .|.|..:..|..|:..:..:|..|| ::....|::|.||.|:.||.:
  Rat  2873 RDAPEATGETPEETDAEMPKLYEPIASLNHLQERLSVFLQLYNESIRGTGMDMVFFRDAMVHLVK 2937

  Fly  2314 ICRIIKQPRSHALLIGVGGSGRQSLTRLASHICDYELFQVEITRLYGPYEYHEDIKAILRKIGAS 2378
            |.|:|:.||.:|||:||||||:||||||||.|..|..||:.:||.|......||:|.:.|..|..
  Rat  2938 ISRVIRTPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLASFIAGYTSFQITLTRSYNTSNLMEDLKVLYRTAGQQ 3002

  Fly  2379 EMHGVFLFTDVQIKDESFLEDISNLLNSGEVPNLFTNEEKIEVQEKMAQI-DKQRDKAVQTDGSP 2442
            .....|:|||.:||:|||||.::|:|:||||.|||..:|..|:...:..| .|:..|...|:.: 
  Rat  3003 GKGITFIFTDNEIKEESFLEYMNNVLSSGEVSNLFARDEIDEINSDLTSIMKKEHPKRPPTNDN- 3066

  Fly  2443 VALFNFFVTTCKDQLHIVLAMSPIGDALRNRIRKFPSIVNCCTIDWFQSWPEDALLAVSTRFLAS 2507
              |:.:|::..:..|||||..||:|:..|||..|||::::.||||||..||:|||:|||..||:|
  Rat  3067 --LYEYFMSRVRGNLHIVLCFSPVGEKFRNRALKFPALISGCTIDWFSRWPKDALVAVSEHFLSS 3129

  Fly  2508 E--DLTALERRTAIDMCM-EFHTSTQELSAKFFSRLHRYNYVTPTSYLELIQTFKALLSQKRNNI 2569
            .  |.|| |.:..:..|| .|.....|..|.:|.|..|..:|||.|||..||.:|.:..:|...:
  Rat  3130 YNIDCTA-EIKKELVQCMGSFQDGVAEKCADYFQRFRRSTHVTPKSYLSFIQGYKFIYEEKHVEV 3193

  Fly  2570 TNNRNRYLTGISQLDIAAQQVAVMQEQLIALEPKLKEASEIVAEQVAKVTADSKLAEE-QREIVK 2633
            .:..||..||:.:|..|::.||.:.::|...|.:|:.|:|.....:.:||..::.||: :.|:.|
  Rat  3194 QSLANRMNTGLEKLKEASESVAALSQELAVKEKELQVANEKADMVLKEVTMKAQAAEKVKAEVQK 3258

  Fly  2634 LDESAAKEQAAVAQEIKDE--CDAKLGEALPILESALAALNTLTTADIAVVKTMKSPPIGVRIVM 2696
            :.:   |.||.|....||:  .:.||..|.|.||.|.|||.|:..:|||.|:|:..||..:..:|
  Rat  3259 VKD---KAQAIVDSISKDKAIAEEKLEAAKPALEEAEAALQTIKPSDIATVRTLGRPPHLIMRIM 3320

  Fly  2697 EAVCIL-----KDVKPD-----KVPNPSGLGTVEDYWGPSKRVLSDMKFLDSLLNFDKDNIPVEV 2751
            :.|.:|     ..||.|     .||:          |..|.::::...||.:|..|.||.|..||
  Rat  3321 DCVLLLFHRRVNAVKIDLDKSCTVPS----------WQESLKLMTAGNFLQNLQQFPKDTINEEV 3375

  Fly  2752 MKKLAQRILSNEAFDPDKIKSASTAC---EGLCRWVIALTKYDVVAKIVAPKKLALAEAEATYNA 2813
            ::.|:.....::.    .|::|...|   .|||.|..|:..:..:.|.|.|.|..|...|..:..
  Rat  3376 IEFLSPYFEMSDY----NIETAKRVCGNVAGLCSWTKAMASFFSINKEVLPLKANLIVQENRHAL 3436

  Fly  2814 AMKTLNEKLAMLAKVEANLAAIQKILDEQLRQYGILLAEHEACTKKLQRAQELISGLGGERTRWS 2878
            ||:.|.:..|.|...:|.|..:|...::.:.:...||.:.:.|..|:|.|..|||||.||:.||:
  Rat  3437 AMQDLQKAQAELDDKQAELDVVQAEYEQAMTEKQTLLEDADRCRHKMQTASTLISGLAGEKERWT 3501

  Fly  2879 ETAKMLQASFKSVTGDVLISSGVVSYLGPFTIDFRVDQIRKWVTKCLNFGVTCTADFQLAVVLGE 2943
            |.:|...|..|.:.||||:::..:||.|||..:||...:..|..:.....:....|..|..:|.:
  Rat  3502 EQSKEFAAQIKRLVGDVLLATAFLSYSGPFNQEFRDLLLNDWKKEMKARKIPFGNDLNLNEMLID 3566

  Fly  2944 PVEIRFWNICGLPTDAFSIESAIMMKNARRWPLMIDPQGQANKWIKNYEKNNKLCVIRLNQADYT 3008
            ...|..||:.|||.|..||::.|::..|.|.||:||||.|...||:|.|..|:|.:..||...:.
  Rat  3567 APTISEWNLQGLPNDDLSIQNGIIVTKASRSPLLIDPQTQGKIWIRNKESQNELQITSLNHKYFR 3631

  Fly  3009 RVMENAIQFGLPVLLENIGEELDPVLESVLQKTLFKQGGALCIKLGDSVIEYNHSFRFYMTTKLR 3073
            ..:|:::..|.|:|:|::||||||.|::||:|...|.|....:|:||..::....|:.|:||||.
  Rat  3632 NHLEDSLSLGRPLLIEDVGEELDPALDNVLEKNFIKTGSTFKVKVGDKEVDVMDGFKLYITTKLP 3696

  Fly  3074 NPHYLPEVAVKVTLLNFMITTQGLQDQLLGITVARERPDLEAEKNNLIVQGADNKRMLKETEDQI 3138
            ||.|.||::.:..:::|.:|.:||:|||||..:..|:.:||.|:.:|:.:...|||..||.||.:
  Rat  3697 NPAYTPEISARTAIIDFTVTVKGLEDQLLGRVILTEKQELEKERTHLLEEVTANKRRTKELEDNL 3761

  Fly  3139 LEVLSSAE-NILEDETAVQILSSAKALANDISEKQVITEATEKQIDIARLSYVPIAEHSTILFFT 3202
            |..|:|.: :::|||:.:.:||:.|..|.::::|..|:..||.||:.||..|.|:|...:||:|.
  Rat  3762 LYRLTSTQGSLVEDESLIVVLSNTKKTAEEVTQKLEISGETEIQINSAREEYRPVATRGSILYFL 3826

  Fly  3203 IVELANIDPMYQYSLVWFVNLYMSSIDNTEKVDDIAARLLDLRNHFTYSLYVNICRSLFERDKLL 3267
            |.|:..::.|||.||..|:.|:..|:..:.|....:.|:.::..|.||.::....:.|:|..|.|
  Rat  3827 ITEMRLVNEMYQTSLRQFLGLFDLSLARSVKSPITSKRIGNIIEHMTYEVFKYAVQGLYEEHKFL 3891

  Fly  3268 FSLILNINMMKHDNRIDNAEWMFLLTGGVGLE---NPYKNPTTWLGVQNWDELCRLTNLTNFKGL 3329
            |:|:|.:.:....|.:.:.|::.|:.||..|:   .|:| |:.|:....|..|..|:.|..|..:
  Rat  3892 FTLLLTLKIDIQRNLVKHEEFLTLIKGGASLDLKACPHK-PSKWILDMTWLNLVELSKLKQFSDI 3955

  Fly  3330 REDFNENSAQWKPFFDSKSPQDNKDIPKSWDNRVSVFQKLLLLRVFRPDKLVPAVLNFVSGELGE 3394
            .:..:.|...|:.:||.::|:: :.:|.::|..:..|::|||:|.:.||:.:.....::...:||
  Rat  3956 LDQISRNEKLWRIWFDKENPEE-EPLPNAYDKSLDCFRRLLLIRSWCPDRTIAQARKYIMDSMGE 4019

  Fly  3395 RFVDPPQFDLMASFADSHCCVPLIFILTPGSDPTATLLKFAEDQGFGTNRLFSLSLGQGQGPIAM 3459
            .:.:....||..::.:|....|||.:|:.|||||.:::...:.....|.   .:|:||||...|.
  Rat  4020 NYAEGVILDLEKTWEESDPRTPLICLLSMGSDPTDSIIALGKRLKIETR---YVSMGQGQEVHAR 4081

  Fly  3460 KMIDEGVKMGNWVVLQNCHLAASFM-PLLEKICENLLPDATHPDFRLWLTSYPADHFPVVVLQNG 3523
            |::.:.:..|.||:||||||...|: .|::.:.|.   :..|..||||:|:.....||:.:||..
  Rat  4082 KLLHQTMANGGWVLLQNCHLGLDFLDELMDVVTET---ETVHDTFRLWITTEVHKQFPITLLQMS 4143

  Fly  3524 IKMTNEPPKGLRSNILRSM--ISDPISD----PEWYESCTQPRIFKQLIYSLCFFHAVIQERRYF 3582
            ||..||||:|||:.:.|:.  :|..:.|    .:|          |.::|::.|.|:.:||||.|
  Rat  4144 IKFANEPPQGLRAGLRRTYGGVSQDLLDVSVGAQW----------KPMLYAVAFLHSTVQERRKF 4198

  Fly  3583 GPIGWNIPYEFNETDLRISLMQLRMFLNQYET---VNYDALRYLTGECNYGGRVTDDWDRRTLKT 3644
            ||:|||||||||:.|...::..::..|:..:.   |::..:||:.||..||||||||:|:|.|.|
  Rat  4199 GPLGWNIPYEFNQADFNATVQFIQNHLDDMDIKKGVSWTTVRYMIGEIQYGGRVTDDYDKRLLNT 4263

  Fly  3645 ILDKFYCPAVIDLETPYYLDETGLYYVPVFKEVDLYLNFTRDLPQISAPAIFGFHANADIMKDQK 3709
            ....::...:...:..:|..    |.:|....||.||.:.:.||...:|.:||.|.||||....|
  Rat  4264 FAKVWFSENMFGPDFTFYQG----YNIPKCSTVDGYLQYIQSLPAYDSPEVFGLHPNADITYQSK 4324

  Fly  3710 ETDMLLSHTLLTQKLEKKQRVYVETLSRRFPENLSLPTYPTCPPFLALYQMSLKDTSASSDDSGG 3774
            ....:|...|..|.                                       ||:|...|:   
  Rat  4325 LAKDVLDTILGIQP---------------------------------------KDSSGGGDE--- 4347

  Fly  3775 SKALTPEEVVTNVATDILDKLPK---LFDRDAALLKYPTLYHQSMNTVLVQEMVRFNVLLNTIRT 3836
                |.|.||..:|.|:|:|||:   .|:....|.|....  |.||..|.||:.|...:|:.:|:
  Rat  4348 ----TREAVVARLADDMLEKLPEDYSPFEVKERLQKMGPF--QPMNIFLRQEIDRMQRVLSLVRS 4406

  Fly  3837 SLITLRKGIKGLVVMSPAVEAVYKSVLIAKIPAMWAGKSYPSLKPLGSYVTDFLRRLEFLQHWFD 3901
            :|..|:..:.|.::||..:......:..|:|||.|...|:.| ..||.:.|:.|.|......|..
  Rat  4407 TLTELKLAVDGTIIMSDNLRDALDCMFDARIPARWKKASWVS-STLGFWFTELLERNCQFTSWVS 4470

  Fly  3902 HGAPSTFWLSGFFFTQAFLTGAQQNYARKYVISIDLLAFDYEVL--TVEEPQRQGLSG-PEDGVF 3963
            :|.|..||::|||..|.|||..:|...|    :....|.|..||  .|.:..:..:|. |.:||:
  Rat  4471 NGRPHCFWMTGFFNPQGFLTAMRQEITR----ANKGWALDNMVLCNEVTKFMKDDISAPPTEGVY 4531

  Fly  3964 VYGIFLEGARWDRTGKYLAESRPRELFDTMPLIWLKPLKRVDLPERHN------YLCPMYKTAER 4022
            |||::||||.||:....|.||:|:.||:.||:|.:       ..|.:.      |.||:||...|
  Rat  4532 VYGLYLEGAGWDKRNMKLIESKPKVLFELMPVIRI-------FAENNTARDPRLYCCPIYKKPVR 4589

  Fly  4023 RGVLSTTGHSTNFVVAMLLLCNPNTPVSHWIIRGTALLCQL 4063
            ..:        |::.|:.|. ....| .|||:||.||||.:
  Rat  4590 TDL--------NYIAAVDLK-TAQAP-EHWILRGVALLCDV 4620

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc36CNP_001369131.1 DHC_N2 746..1151 CDD:400618 123/422 (29%)
DYN1 <984..3651 CDD:227570 949/2774 (34%)
AAA_6 1281..1607 CDD:403853 164/331 (50%)
AAA_8 2299..2561 CDD:403858 121/265 (46%)
AAA_9 2950..3165 CDD:403859 87/215 (40%)
Dynein_C 3779..4061 CDD:408026 98/293 (33%)
Dnah5XP_008759046.2 DHC_N1 250..802 CDD:400611
DHC_N2 1399..1804 CDD:400618 123/416 (30%)
DYN1 <1640..4282 CDD:227570 949/2783 (34%)
AAA_6 1939..2266 CDD:403853 164/331 (50%)
Dynein_C 4326..4618 CDD:408026 105/361 (29%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.