DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc36C and Dnah17

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001369131.1 Gene:Dhc36C / 35061 FlyBaseID:FBgn0013810 Length:4065 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038943439.1 Gene:Dnah17 / 287845 RGDID:1563805 Length:4459 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4250 Identity:1343/4250 - (31%)
Similarity:2118/4250 - (49%) Gaps:519/4250 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    19 ICGGRRLCEKSKMLYTRPKPDVL--QSILQSKANPEYKSRRLWYEL---------------NMPE 66
            :|||  |.|:..:|.     :|:  .|::....|.|..:.:|.|:.               |||.
  Rat   524 MCGG--LLERPLILV-----EVVPRYSVMLEMFNTELDNAKLMYDAQMAASEDGQIPPIHKNMPP 581

  Fly    67 CASSL---------------------------LDGKMKSDLPDNIL-CAKKQQKKRQKKRESGVA 103
            .|..|                           ::.|:..|..|.:: ..|..::|:.::...||.
  Rat   582 VAGQLKWSLELQERLEVSMKYLKHIDHPVMSSVEAKLVYDKYDEMIGLLKGYREKKYQQWVEGVD 646

  Fly   104 KANYMTM---RLERE--------HFRRKLVEL---ILHMDDDQDPELAAQCAVPFPDQEEREILR 154
            :..:..:   .::|:        :|.:.||.:   :.:::..|..|:.:.....|   .|.||.|
  Rat   647 QDCHFNLGQPLIQRDPFSSLIQVNFSKALVAVLREVKYLNFQQQKEIPSSAEKLF---SENEIFR 708

  Fly   155 -----------YYYYIKHGIDTIHVSPLSKKILKRITDLVPPLLYKWQTAL---NENIAEVRADY 205
                       :|..||..:..:.. ||.|..|:.| |:   .|...:|.|   .||:.|    |
  Rat   709 KFVGNLELIVGWYNEIKTTVMEVEF-PLIKSELEEI-DV---KLMSAETTLFWNGENVME----Y 764

  Fly   206 VFAMKKAVVDFVLRHTVLDRL--TKEGVGGKYDTAERREVQSMTNFWRYRYDENRNVLMKTLFCI 268
            :..|::      :.|.:.:|:  ||:.:.|        ..|:|..:......|.::...:.|..:
  Rat   765 IQEMRE------ILHNLQNRIQKTKQNIEG--------ITQAMQEWSANPLFERKDNKKEALLDL 815

  Fly   269 HRSVASILELWSMKYKDKSLIDSKELAKVESPFSLFTFVYLCGSHIDNGKTLLEESWYGEIHSSL 333
            ...||::               :|..|.|:.          .|..|   :.::.|      ::.|
  Rat   816 DGRVANL---------------NKRYAAVKD----------AGVRI---QAMVTE------NAEL 846

  Fly   334 LKASKRGQLPDIRRFTLVKRFFNCVAALMTQQLEDICIRSLKEYADFICDYGHSNPGFEISVMLA 398
            .||....| |       .|.:.|.:.|::..:.:....:||....|.:....:..|.|||.:.| 
  Rat   847 FKADTTSQ-P-------WKDYVNYIDAMVLDEFDRFIRKSLNYLMDNMTMDENIAPLFEIRMEL- 902

  Fly   399 DEDTIQFNPSFSK-VQSELLRVIDSIMLSI----QMLPRI-------ESKL--YTDLIVSKKIFL 449
            |||.:.|||:... .:...|.:|:.::..:    :::||:       :|.|  .||||..::.. 
  Rat   903 DEDGLTFNPTLEMGDEDSFLSLIEGLINDLYNVARLIPRLAKGRINYKSDLEDITDLIEMREEL- 966

  Fly   450 TPTVPESIVQETKNRICAM--LEEQRIGPE----LRLQDFDPFID--LINGS-------DAERVG 499
                 .|:|      |.||  .||.:...|    |.:.|...|:.  ||.|.       |.:...
  Rat   967 -----SSLV------IGAMKVAEEYQDSFERYSYLWVDDLQEFMKNFLIFGHAPTPEELDTKIDD 1020

  Fly   500 NFMESDATFEQYADMVYEYKEKEDRIAKEVWAVIRMGFYEFHRDKFITHLESLCRQLQLDLLARM 564
            ...::..|..|:...:..|::..:.:::.....:..|:.:.....|...|.:..::..| |..|.
  Rat  1021 TIPKTQPTLAQFQQQIDSYEKLYEEVSRCENTKVFHGWLQCDCRPFKQALLNTIKRWSL-LFKRY 1084

  Fly   565 VTDQQAR----------ITRLG-----KE--YDA---------------IAKKALTVP-KDTAEL 596
            ::|....          :||.|     ||  ||.               :|..::..| |.|.||
  Rat  1085 LSDHVINSLADLESFMGVTRTGLKKPLKEGDYDGLVEVMGHLMKVKERQVATDSMFEPLKQTIEL 1149

  Fly   597 MQLKAYVVHAEENLVPEMEARLKVNMSEILWLMDHTLYSPLEIKNNSNSFQWYLKLPSIFEQHRA 661
              ||:|   .||  :|| |..||:......|  .:|....:::|.|....|              
  Rat  1150 --LKSY---GEE--MPE-ETYLKLQELPEQW--TNTKKLAIQVKQNVAPLQ-------------- 1190

  Fly   662 IIAEKVIEYQELLKKRIELFRRELQNYYEQVQ-----TYDTWGDIKQLSRYKKRAGVLDQRLVQA 721
              |.:|    .:|:::.:.|..:...:.|:.:     |:......|.|::        .|:.:.|
  Rat  1191 --ANEV----NILRRKCQQFELKQHEFREKFRRDAPFTFSDPDPYKSLNK--------QQKSISA 1241

  Fly   722 ME-TIDQINEEETSYGWDLSQYPMRKKAHDQLKPYKTLFDAGQDFMDKWDLWMHSQVGSFDPDEI 785
            || .::.:.:..:.:...:..|...|..|.:::..|.|:|.........|.|..::....:.:::
  Rat  1242 MEGVMEALCKSGSLFEVTVPDYKQLKACHKEVRLLKELWDMIVMVNTSIDDWKTTKWKDINVEQM 1306

  Fly   786 DGDVSNFYRIIQKLDKQMGDHPITMQLIQDVKAQIEAFREHMPIINTLGNPGMKARHWELVSEII 850
            |.|...|.:.::.|||:|......:.|...||..|.:.|    .::.|.||.::.|||:.:.:..
  Rat  1307 DIDCKKFAKDVRSLDKEMKAWDAFVGLDNTVKNMITSLR----AVSELQNPAIRERHWQQLMQAT 1367

  Fly   851 GFPIKVSPELTLEKIIEYQLDEYVPKFEAISESATKENNLERAMAKMVNEWEGVEFSISPYRDSG 915
            ....::|.|.||..:::..|.:|..:...|.:.|.||:.:|:.:..:.:.|..:||....:..:|
  Rat  1368 QVKFEMSEETTLADLLQLNLHKYEDEVRNIVDKAVKESGMEKVLKTLDSTWSTMEFEHELHPRTG 1432

  Fly   916 TFKLAAVDDIQILLDDQIIKTQTMKSSPYIKPFEADIIKWEAKLMLLQEILDEWLRVQATWMYLE 980
            |..|.:.:.:...|:|..::.|.:..|.|:..|..::..|:.||.....::..|..||.||.:||
  Rat  1433 TMLLKSDELLVETLEDNQVQLQNLMMSKYLSHFLKEVTSWQQKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLE 1497

  Fly   981 PIF-SSPDIQQQMPEEGRRFSAVDKIWKELMKQVSQDPKVMVVVQIDKMNDKLKKAYSLLEVIQK 1044
            .|| .|.||:.|:||:.|||.::|:.:|.||:...:.|.|:.......:.|||::....|.|.:|
  Rat  1498 SIFIGSEDIRAQLPEDSRRFDSIDQEFKALMEDAVKTPNVVEATNKPGLYDKLERLKKSLAVCEK 1562

  Fly  1045 GLNAYLEKKRLYFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQIHLKKCFEGIATLNFTEELDVT----- 1104
            .|..|||.|||.||||:|:|:.:||:|||...||..|..||.|.|:.:..|.|  .||.:     
  Rat  1563 ALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDILSNGNDPVEVSRHLSKLFDSLCKLKF--RLDASGNPIK 1625

  Fly  1105 ---AMRSSEREEVTLVDVISTSKARGQVEKWLLELEIDMKKSVHHKVSEAFYSYLKMLRHVWVLT 1166
               .|.|.|.|   .:|........||||.||..:...|..::.|::.||..:|.:..|..|:..
  Rat  1626 VGLGMYSKEDE---YMDFDKECDLSGQVEVWLNRVLDRMCATLRHEIPEAVVTYEEKPREQWIFD 1687

  Fly  1167 WPGQCVQSISLTYWTLEITECF-ESEEPKENLAK-YLQKCVLQINKIVDLVRGDLNTQNRITLGA 1229
            :|.|...:.:..:||.|:...| ..||..||..| |.:|.:.|:|.::.|:.|:|:..:|:.:..
  Rat  1688 YPAQVALTCTQIWWTTEVGLAFARLEEGYENAIKDYNKKQISQLNALITLLIGNLSAGDRMKIMT 1752

  Fly  1230 LVVLDVHARDVLAEIVANQVEDLQDFQWLCQLRYYW--EDNNLDTRMINCSLPYGYEYLGNTPRL 1292
            :..:|||||||:|:::..:||..|.|.|..|||:.|  |..:....:.:..:.|.||||||||||
  Rat  1753 ICTIDVHARDVVAKMITAKVESSQAFTWQSQLRHRWDEEKKHCFANICDAQIQYSYEYLGNTPRL 1817

  Fly  1293 VVTPLTDRCYRTLFAALNLHLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKF 1357
            |:||||||||.||..:|:|.:||||.||||||||||||||.:|:.....|||||:.:||.:.|..
  Rat  1818 VITPLTDRCYITLTQSLHLIMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGTMVYVFNCSEQMDYKSCGNI 1882

  Fly  1358 FKGLASCGAWSCFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTIQRGINSGSPTLVFEGTTLTLDPTCAVFITMN 1422
            :||||..|||.||||||||.:|||||:|.|:..:|..|.:......|.|..::|.||..:|||||
  Rat  1883 YKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVIAVQVKCVQDAIRAKKKKFNFLGEMISLIPTVGIFITMN 1947

  Fly  1423 PGYAGRSELPDNLKALFRSVAMMVPDYALISEIELYSYGFLTAKPLSVKIVATYRLCSEQLSTQC 1487
            ||||||:|||:|||||||..||:|||:.||.||.|.:.|||.|:.|:.|.:..|.||.|.||.|.
  Rat  1948 PGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFLEARLLARKFITLYTLCKELLSKQD 2012

  Fly  1488 HYDYGMRAVKSVLKAAGALKLRYRDENEDILVLRSIKDVNLPKFLNQDIPLFQGITSDLFPGTVL 1552
            |||:|:||:||||..||:||.......||.:::|:::|.|:||.:..|:|:|.|:..||||...:
  Rat  2013 HYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPTRAEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDLPVFMGLIGDLFPALDV 2077

  Fly  1553 PEADYVLFNKCTQMACERQNKQCTPFVLEKVQQLYEMIVVRHGLMLVGYPFGGKTTTYRVLAEAL 1617
            |....:.|.|..:.:......|.....:.||.||.|::.|||.:.::|....||       ::.|
  Rat  2078 PRKRDLNFEKIIKQSIVELKLQAEDSFVLKVVQLEELLQVRHSVFVIGNAGSGK-------SQVL 2135

  Fly  1618 ECMEKT-DGSENKAIYTVINPKAITMGQLYGQFDAVSHEWSDGILAVNYRIFA--ISDSPDRKWL 1679
            :.:.|| ...:.|.:...::|||:|..:|:|..:..:.||.||:.:...|..|  ..|.|  ||:
  Rat  2136 KSLNKTYQNMKRKPVAVDLDPKAVTCDELFGIINPATREWKDGLFSTIMRDLANITHDGP--KWI 2198

  Fly  1680 IFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQLSNTTNLVFEPMDLEVASPATVSRCGMIYLEP 1744
            :.||.:|.:|||::|||:||||.|.|.|.|.|.|:.|..||||...|..|:||||||.|::|:.|
  Rat  2199 VLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNRTMRLVFEISHLRTATPATVSRAGILYINP 2263

  Fly  1745 SSLGWEPLVASW--KNTLPAAFHTVSKQLISMLISRFCPILLFILRKSLKEIAPTSDANLMVSLM 1807
            :.|||.|:|:||  :..:.:     .|..:.:|..::.|..|..||...|.|.|..:..::.:::
  Rat  2264 ADLGWNPVVSSWIERRKVQS-----EKANLIILFDKYLPTCLDKLRFGFKRITPVPEITVIQTIL 2323

  Fly  1808 NFFECFI------DDFRDEKYVANVSDLDFRAQTEGIFLFSCIWSLGGSLDADSREKFNIIFRAL 1866
            ...||.:      .|...|.|             |..|:|:|.|:.||::..|....:.:.|...
  Rat  2324 YLLECLLTEKNAPPDSPKELY-------------ELYFVFACFWAFGGAMFQDQLIDYRVEFSKW 2375

  Fly  1867 MEKTFPQSLYDTYGVPEDLYVESLAKPFIFPIPKQGSVFDYRYIKEGKGKWKPWQDDVNSAPPIP 1931
            ....|.                      ...:|.||::||| ||.....|:.||.|.|.:....|
  Rat  2376 WINEFK----------------------TIKLPSQGTIFDY-YIDPETKKFLPWTDKVPNFELDP 2417

  Fly  1932 RDIPVNQIIIQTNESVRIGAVLDLLNRHGKPIMLVGPTGTGKSVYVIDYMLKKMDLSFYKPLLIS 1996
             |||:...::.|.|::||...:|||.....|:||||..||||||.:.| .|:.:....|....:.
  Rat  2418 -DIPLQASLVHTTETIRIRYFMDLLMAKAWPVMLVGNAGTGKSVLMGD-KLENLSTDDYLVQAVP 2480

  Fly  1997 FSAQTSANQTQDIIMSKLDKRRKGVFGPPLNSRFVIFVDDVSMPLKENYGAQPPIELLRMMLDHM 2061
            |:..|::...|.::...|:|:....:|||...:.:.|:||::||..:.||...|..|:|..:||.
  Rat  2481 FNFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTKKLIYFIDDMNMPEVDKYGTVAPHTLIRQHMDHR 2545

  Fly  2062 MWYDRKNIVPMKLIDLQMIVAMGPPSTGNTVTPRFQRFFNVISIDDFNNDILNTIFSKIVLWHLD 2126
            .||||:.:....:.:.|.:..|.|.|...|:.||.||.|.|.::....::.|.||::.|:..||.
  Rat  2546 HWYDRQKLTLKDVHNCQYVACMNPTSGSFTIDPRLQRHFCVFAVSFPGHEALITIYNTILAQHLS 2610

  Fly  2127 TRGFSKEFDPCIDEIVGATLTIYNDAKLNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVLLSVPEATEDVN 2191
            .|............:|.|.|.::.......|||..|.||:|||||.|.:.||:|.|..|......
  Rat  2611 YRSAPSVIQRLCSHLVTAALALHQKVAATFLPTAIKFHYIFNLRDLSNIFQGILFSTLEILRTPL 2675

  Fly  2192 SMRRLWVHEVLRVYGDRLVEDADRSWLFE-NICSTVKSCFNTDPSRLFGRLVEKDKSLQESDFRQ 2255
            .:.|||:||..|||||::|::.|:..|.. .:.||.|...:.....||.              :.
  Rat  2676 DIVRLWLHEAERVYGDKMVDEKDQETLRRVTMASTKKFFDDLGEEHLFA--------------KP 2726

  Fly  2256 LIYCDFTNPKADTKNYVEVQDLEELRRVVEAYLVEYNNMSKKPMNLVLFRFAIEHLSRICRIIKQ 2320
            .|:|.||....|.| |..|.|:..|.::::..|..||.:: ..||||||..|:.|:.||.||::.
  Rat  2727 NIFCHFTQGIGDPK-YFPVTDVAHLNKLLKDVLDSYNEVN-AVMNLVLFEDAVAHICRINRILES 2789

  Fly  2321 PRSHALLIGVGGSGRQSLTRLASHICDYELFQVEITRLYGPYEYHEDIKAILRKIGASEMHGVFL 2385
            ||.:|||:||||||:|||:|||::|...::||:.:.:.|...:...|:.|...|.....:..|||
  Rat  2790 PRGNALLVGVGGSGKQSLSRLAAYISALDVFQITLKKGYAIPDLKMDLAAQYIKSAVKNVPSVFL 2854

  Fly  2386 FTDVQIKDESFLEDISNLLNSGEVPNLFTNEEKIEVQEKMAQIDKQRDKAVQTDGSPVALFNFFV 2450
            .||.|:.:|.||..|::||.|||:|.||.:::...:...|    :.:.|::....:..|.:.||:
  Rat  2855 MTDSQVAEEQFLVLINDLLASGEIPGLFGDDDLENIISSM----RPQVKSLGMTDTREACWKFFI 2915

  Fly  2451 TTCKDQLHIVLAMSPIGDALRNRIRKFPSIVNCCTIDWFQSWPEDALLAVSTRFLASEDLTALER 2515
            ...:.||.::|..||:|..||.|.||||::|||..||||..||||||::||.|||........|.
  Rat  2916 EKVRKQLKVILCFSPVGSVLRVRARKFPAVVNCTAIDWFHEWPEDALVSVSARFLQETQGIQPEV 2980

  Fly  2516 RTAIDMCMEF-HTSTQELSAKFFSRLHRYNYVTPTSYLELIQTFKALLSQKRNNITNNRNRYLTG 2579
            :|:|.:.|.: ||:..|:|..:.:...||||.||.::||.|:.::.||::||..:.....|...|
  Rat  2981 KTSISLFMSYVHTTVNEMSKTYLATERRYNYTTPKTFLEQIKLYQNLLAKKRMELVAKIERLENG 3045

  Fly  2580 ISQLDIAAQQVAVMQEQLIALEPKLKEASE-------IVAEQVAKVTADSKLA-EEQREIVKLDE 2636
            :.:|...|.||..::.:|...|.:||:.:|       :|..:..||:.:..:| ||:.::..:::
  Rat  3046 LMKLQSTASQVDDLKAKLAVQEAELKQKNENADKLIQVVGVETEKVSKEKAIADEEEIKVEVINK 3110

  Fly  2637 SAAKEQAAVAQEIKDECDAKLGEALPILESALAALNTLTTADIAVVKTMKSPPIGVRIVMEAVCI 2701
            :..::|.|        |:..|.:|.|.|.:|..||:||...::..:|:..|||..|..|..||.|
  Rat  3111 NVTEKQKA--------CETDLAKAEPALLAAQEALDTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVNVTAAVMI 3167

  Fly  2702 LKDVKPDKVPNPSGLGTVEDYWGPSKRVLSDM-KFLDSLLNFDKDNIPVEVMKKLAQRILSNEAF 2765
            |        ..|.|....:..|..:|.::..: .|||||..|||::|| |...|..:....|..|
  Rat  3168 L--------TAPGGKIPKDKSWKAAKIMMGKVDTFLDSLKRFDKEHIP-EACLKAFKPYQGNPTF 3223

  Fly  2766 DPDKIKSASTACEGLCRWVIALTKYDVVAKIVAPKKLALAEAEATYNAAMKTLNEKLAMLAKVEA 2830
            ||:.|:|.|||..|||.|.|.:.::..|...||||:.||.||.|....|...|:.....:|::.|
  Rat  3224 DPEFIRSKSTAAAGLCSWCINIVRFYEVYCDVAPKRQALEEANAELAEAQDKLSRIKNKIAELNA 3288

  Fly  2831 NL----AAIQKILDEQLRQYGILLAEHEACTKKLQRAQELISGLGGERTRWSETAKMLQASFKSV 2891
            ||    :|.:|...|:::    ...|.:|..:.:..|..|:.||..|..||:|:.:..::...::
  Rat  3289 NLNNLTSAFEKATAEKIK----CQQEADATNRVISLANRLVGGLASENVRWAESVENFRSQGVTL 3349

  Fly  2892 TGDVLISSGVVSYLGPFTIDFRVDQIRK-WV--TKCLNFGVTCTADFQLAVVLGEPVEIRFWNIC 2953
            .||||:.|..|||:|.||..:|.:.:.| |:  ...|...:..|.......:|.:..::..||..
  Rat  3350 CGDVLLISAFVSYVGYFTKKYRNELMEKFWIPYVNNLKVPIPITEGLDPLTLLTDDADVATWNNQ 3414

  Fly  2954 GLPTDAFSIESAIMMKNARRWPLMIDPQGQANKWIKNYEKNNKLCVIRLNQADYTRVMENAIQFG 3018
            |||:|..|.|:|.::.|..||||::|.|.|..||||| :..::|..|||.|..|..::|.||..|
  Rat  3415 GLPSDRMSTENATILCNTERWPLIVDAQLQGIKWIKN-KYGSELKAIRLGQKSYLDIIEQAISEG 3478

  Fly  3019 LPVLLENIGEELDPVLESVLQKTLFKQGGALCIKLGDSVIEYNHSFRFYMTTKLRNPHYLPEVAV 3083
            ..:|:|||||.:||||:.:|.:...|:|  ..||:||..:||:.|||..:.||..||||.||:..
  Rat  3479 DTLLIENIGETVDPVLDPLLGRNTIKKG--RFIKIGDKEVEYHPSFRLILHTKYFNPHYKPEMQA 3541

  Fly  3084 KVTLLNFMITTQGLQDQLLGITVARERPDLEAEKNNLIVQGADNKRMLKETEDQILEVLSSAE-N 3147
            :.||:||::|..||:||||...||:||||||..|.||.....:.|.:|||.||.:|..||:|. |
  Rat  3542 QCTLINFLVTRDGLEDQLLAAVVAKERPDLEQLKANLTKSQNEFKIVLKELEDSLLARLSAASGN 3606

  Fly  3148 ILEDETAVQILSSAKALANDISEKQVITEATEKQIDIARLSYVPIAEHSTILFFTIVELANIDPM 3212
            .|.|...|:.|.:.|..||:|.||....:.||.:|:.||.:|.|.|..:::|:|.:.:|..|:|:
  Rat  3607 FLGDTALVENLETTKHTANEIEEKVQEAKITETKINEARENYRPAAARASLLYFILNDLNKINPI 3671

  Fly  3213 YQYSLVWFVNLYMSSIDNTEKVDDIAARLLDLRNHFTYSLYVNICRSLFERDKLLFSLILNINMM 3277
            ||:||..|..::..:|..|...:::..|:::|.:..|||:|:...|.|||||||:|...:...::
  Rat  3672 YQFSLKAFNVVFEKAIQKTPPAEEVRQRVINLTDEITYSVYMYTARGLFERDKLIFLAQVTFQVL 3736

  Fly  3278 KHDNRIDNAEWMFLLTGGVGLENPYK----NPTTWLGVQNWDELCRLTNLTNFKGLREDFNENSA 3338
            .....::..|..||      |..|:|    :|..:|..|:|..:..|:.:..||.|..|...::.
  Rat  3737 SMKKELNPVELDFL------LRFPFKAGVVSPVDFLQHQSWGGIKALSEMDEFKNLDSDIEGSAK 3795

  Fly  3339 QWKPFFDSKSPQDNKDI-PKSWDNRVSVFQKLLLLRVFRPDKLVPAVLNFVSGELGERFVDPPQF 3402
            :||...:|::|:  |:| ||.|.|:.:: |||.::|..|||::..||.|||..::|.:||:....
  Rat  3796 RWKKLVESEAPE--KEIFPKEWKNKTAL-QKLCMVRCMRPDRMTYAVKNFVEEKMGSKFVEGRSV 3857

  Fly  3403 DLMASFADSHCCVPLIFILTPGSDPTATLLKFAEDQGF--GTNRLFSLSLGQGQGPIAMKMIDEG 3465
            :...|:.:|....|:.|||:||.||...:....:..||  ...:|.::||||||..:|...:|..
  Rat  3858 EFSKSYEESSPSTPIFFILSPGVDPLKDVEALGKKLGFTIDNGKLHNVSLGQGQEVVAEDALDVA 3922

  Fly  3466 VKMGNWVVLQNCHLAASFMPLLEKICENLLPDATHPDFRLWLTSYPADH-----FPVVVLQNGIK 3525
            .:.|:||:|||.||.|.::.:|:|..|. ....:|.|:|:::::.||..     .|..:|:|.||
  Rat  3923 AEKGHWVILQNIHLVARWLSILDKKVER-YSSGSHEDYRVFISAEPAPSVETHIIPQGILENAIK 3986

  Fly  3526 MTNEPPKGLRSNILRSMISDPISDPEWYESCTQPRIFKQLIYSLCFFHAVIQERRYFGPIGWNIP 3590
            :|||||.|:.:|:.:::   .:...:..|.||:...||.::::||:||||:.|||.||..|||..
  Rat  3987 ITNEPPTGMYANLHKAL---DLFTQDTLEMCTKEIEFKCILFALCYFHAVVAERRKFGAQGWNRS 4048

  Fly  3591 YEFNETDLRISLMQLRMFLNQYETVNYDALRYLTGECNYGGRVTDDWDRRTLKTILDKFYCPAVI 3655
            |.||..||.||:..|..:|.....|.:|.||||.||..|||.:|||||||..:|.|.:|....::
  Rat  4049 YPFNNGDLTISINVLYNYLEANPKVPWDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLIEFIRVEML 4113

  Fly  3656 D---LETPYYLDETGLYYVPVFKEVDLYLNFTRDLPQISAPAIFGFHANADIMKDQKETDMLLSH 3717
            :   |..|.:.....|.|....:.:|      .:||. .:|.::|.|.||:|             
  Rat  4114 EGEVLLAPGFQIPPNLDYKGYHEYID------ENLPP-ESPYLYGLHPNAEI------------- 4158

  Fly  3718 TLLTQKLEKKQRVYVETLSRRFPENLSLPTYPTCPPFLALYQMSLKDTSASSDDSGGSKALTPEE 3782
            ..||...||..|..:|                          |..|:|     |||....::.||
  Rat  4159 GFLTVTSEKLFRTVLE--------------------------MQPKET-----DSGAGTGVSREE 4192

  Fly  3783 VVTNVATDILDKLPKLFDRDAALLK--YPTLYHQSMNTVLVQEMVRFNVLLNTIRTSLITLRKGI 3845
            .|..|..|||:|:|:.|:....:.|  ..|.|    ..|..||..|.|:|.|.:|.||..|..|:
  Rat  4193 KVKAVLDDILEKIPETFNMAEIMAKAAEKTPY----VVVAFQECERMNILTNEMRRSLKELNLGL 4253

  Fly  3846 KGLVVMSPAVEAVYKSVLIAKIPAMWAGKSYPSLKPLGSYVTDFLRRLEFLQHW-FDHGAPSTFW 3909
            ||.:.::..:|.:..::....:|..|..::|||:..|.::.:|.|:|:..|:.| .|...|:|.|
  Rat  4254 KGELTITTDMEDLSTALFYDTVPETWVARAYPSMMGLAAWYSDLLQRIRELESWTTDFALPTTVW 4318

  Fly  3910 LSGFFFTQAFLTGAQQNYARKYVISIDLLAFDYEVLTVEEPQRQGLSGPEDGVFVYGIFLEGARW 3974
            |:|||..|:|||...|:.|||....:|.:....||  .::.:....:.|.:|.:|||:|:|||||
  Rat  4319 LAGFFNPQSFLTAIMQSMARKNEWPLDKMCLSVEV--TKKTREDMTAPPREGSYVYGLFMEGARW 4381

  Fly  3975 DRTGKYLAESRPRELFDTMPLIWLKPLKRVDLPERHN-YLCPMYKTAERRGVLSTTGHSTNFVVA 4038
            |.....:||::.::|...||:|::|.:. ||..|..| |.||:|||..|         ...:|..
  Rat  4382 DTQTGVIAEAKLKDLTPVMPVIFIKAIP-VDRMETKNIYECPVYKTRIR---------GPTYVWT 4436

  Fly  4039 MLLLCNPNTPVSHWIIRGTALLCQL 4063
            ..|  ......:.||:...|||.|:
  Rat  4437 FNL--KTKEKAAKWILAAVALLLQV 4459

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc36CNP_001369131.1 DHC_N2 746..1151 CDD:400618 123/413 (30%)
DYN1 <984..3651 CDD:227570 995/2720 (37%)
AAA_6 1281..1607 CDD:403853 167/325 (51%)
AAA_8 2299..2561 CDD:403858 107/262 (41%)
AAA_9 2950..3165 CDD:403859 100/215 (47%)
Dynein_C 3779..4061 CDD:408026 94/285 (33%)
Dnah17XP_038943439.1 DHC_N1 187..764 CDD:400611 50/258 (19%)
DHC_N2 1266..1672 CDD:400618 123/414 (30%)
DYN1 1493..4124 CDD:227570 1002/2744 (37%)
AAA_6 1806..2132 CDD:403853 168/332 (51%)
MT 3040..3383 CDD:289543 112/363 (31%)
Dynein_C 4162..4457 CDD:408026 105/343 (31%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.