DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc36C and Dnah8

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001369131.1 Gene:Dhc36C / 35061 FlyBaseID:FBgn0013810 Length:4065 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038955254.1 Gene:Dnah8 / 207117 RGDID:619986 Length:4727 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4245 Identity:1285/4245 - (30%)
Similarity:2067/4245 - (48%) Gaps:577/4245 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    38 PDVLQSILQSKANPEYKSRRLWYELNMPECASSL--LDGKMKSD-----------------LPD- 82
            |.:|:.:.::|...:.|       |::||.|..|  |:.|:|:|                 :|. 
  Rat   840 PKILEVVRETKCMIKMK-------LDVPEQAKKLLKLESKLKADKLYLQGLLQYYDDLCQEVPSV 897

  Fly    83 --NILCAKKQQKKRQKKRESGVAKANYMTMRLEREHFRRKLVELILHMDDDQDPELAAQCAVPFP 145
              |::..|  .||.:.....|:....:.::.|| ..|  |.||.:|.|.:....::...|.:.. 
  Rat   898 FVNLMTPK--MKKVESVLRQGLTVLTWSSLMLE-SFF--KEVESVLDMFNQLLKKVNDLCEMHI- 956

  Fly   146 DQEEREILRYYYYIKHGIDTIHVSPLSKKILKRITDLVPPLLYKWQTALNENIAEVRADYV---- 206
            |...:||.:          |:.:| ||.....|:.|::         .|||...:..||.:    
  Rat   957 DTVLKEIAK----------TLLIS-LSDSGATRVEDML---------TLNETYTKEWADILNHKS 1001

  Fly   207 FAMKKAVVDFVL----------------------RHTVLDRLTKEGVGGKYD-TAERREVQSMTN 248
            ..:::||.:.:|                      :|.|......||...:|| .:..|:|     
  Rat  1002 RHVEEAVKELILIFEQIYEVKYTGKPAKPVPEQRKHVVFGSEADEGESLEYDPDSTARDV----- 1061

  Fly   249 FWRYRYDENRNVLMKTLFCIHRSVASILELWSMKYKDKSLIDSKELAKVESPFSLFTFVYLCGSH 313
                  |.|                           ||.....||..:          ||...||
  Rat  1062 ------DNN---------------------------DKEDEFKKECKE----------VYAFFSH 1083

  Fly   314 IDNGKTLLEESWYGEIHSSLLKASKRGQLPDIRRFTLVKRFFNCVAALMTQQLEDICIRSLKEYA 378
                          ::..||.||::      :...|:.||.|  |.....::.||:        .
  Rat  1084 --------------QLLDSLQKATR------LSLDTMKKRIF--VGNQGRKRSEDV--------V 1118

  Fly   379 DFICDYGHSNPGFEISVMLADEDTIQFNPSFSKVQSELLRVIDSIMLSIQM-------------- 429
            .||          :..|.||..:.:.. ||...:|..:.|:   |.|::::              
  Rat  1119 SFI----------KTEVHLAIPNVVMV-PSLDDIQQAINRM---IQLTLEVSRGVAHWGQQQVRR 1169

  Fly   430 ------------LPRI-------ESKLYTDLIVSKKI--FLTPTVPESIVQETKNRICAMLEEQR 473
                        .|.|       |.:.:.:.|.::|:  |.........:.:....:.:.:...|
  Rat  1170 TKSPQTSSRGSDQPSIMGKALKKEERSFEESIPARKLKNFYPGVAEHKDISKLVLLLSSSVNSLR 1234

  Fly   474 IGPELRLQDFDPFIDLINGSDAERVGNFMESDATFEQYADMVYEYKEKEDRIAKEVWAVIRMGFY 538
            ......||||..:..|.......:|..|:.::.:..:....:..|...|..| :|:..:|.:|..
  Rat  1235 KAATEALQDFQKYKTLWTEDRDVKVKEFLANNPSLTEIRSEILHYATFEQEI-EELKPIIDVGAL 1298

  Fly   539 EFHRD--KFITHLES------LCRQLQLDLLARM------VTDQQARITRLGKEYDAI--AKKAL 587
            |.|.:  |....:|:      |||.|..:...:|      :.:...:::|..::.|.:  |.:||
  Rat  1299 ELHTEPMKLALSIEAKAWKMLLCRYLNEEYKKKMSDMIVFINEYLKKLSRPIRDLDDVRFAMEAL 1363

  Fly   588 TVPKDTAELMQLKAYVVHAEENLVPEMEARLKVNMSEILWLMDHTLYSPLEIKNNSNSFQWYLKL 652
            :..:|....|.:....:.....::...|..:....||   .:|...||             :.||
  Rat  1364 SCIRDNEIQMDMTLGPIEEAYGILNRFEVEVTKEESE---GVDTLRYS-------------FNKL 1412

  Fly   653 PSIFEQHRAI-IAEKVIEYQELLK----KRIELFRRELQNYYEQVQTYDTWGDI----------K 702
                 |.:|: :.:::::.|...|    :.:::||.::.|:.|   .|:|.|.:          .
  Rat  1413 -----QSKAVSVQDELVQVQPKFKSSLLESVDVFREDVINFTE---AYETEGPMVPNIPPQEASN 1469

  Fly   703 QLSRYKKRAGVLDQRLVQAMETIDQINEEETSYGWDLSQYPMRKKAHDQLKPYKTLFDAGQDFMD 767
            :|..::.....|.::.|       ..:..|..:|..::.|.:..|...:|...:.|:......|.
  Rat  1470 RLQIFQANFDDLWRKFV-------TYSAGEQLFGLPVTDYEVLHKTRKELNLLQKLYGLYDTVMG 1527

  Fly   768 KWD-----LWMHSQVGSFDPDEIDGDVSNFYRIIQKLDKQMGDHPITMQLIQDVKAQIEAFREHM 827
            ...     ||     |..|.::|:.::..|....:||.|.:.|    .|...|:|.:|:.|.|..
  Rat  1528 SISGYYEILW-----GDVDIEKINAELLEFQNRCRKLPKGLKD----WQAYLDLKKRIDDFSESC 1583

  Fly   828 PIINTLGNPGMKARHWELVSEIIGFPIKV-SPELTLEKIIEYQLDEYVPKFEAISESATKENNLE 891
            |::..:.|..||.|||:.:||:.|.|..| |....|..|:|..|.:.....|.|..||.||.::|
  Rat  1584 PLLEMMTNKAMKQRHWDRISELTGTPFDVESDTFCLRNIMEAPLLKNKDDIEDICISAIKEKDIE 1648

  Fly   892 RAMAKMVNEWEGVEFSISPYRDSGTFKLAAVD--DIQILLDDQIIKTQTMKSSPYIKPFEADIIK 954
            ..|.:::..|.....|.|.::..|...|...:  :|..|::|.::...::.|:.|..||:..|..
  Rat  1649 AKMTQVIENWTNQNLSFSAFKGKGELLLKGTESGEIITLMEDSLMVLGSLLSNRYNTPFKKTIQN 1713

  Fly   955 WEAKLMLLQEILDEWLRVQATWMYLEPIFSSPDIQQQMPEEGRRFSAVDKIWKELMKQVSQDPKV 1019
            |..||....:|::|||.||..|:|||.:|...||.:|:|:|.:||..:||.|.::|::..::|.|
  Rat  1714 WVYKLSTSSDIIEEWLVVQNLWVYLEAVFVGGDIAKQLPQEAKRFQNIDKSWVKIMQRAHENPNV 1778

  Fly  1020 M-VVVQIDKMNDKLKKAYSLLEVIQKGLNAYLEKKRLYFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQI 1083
            : ..|..:.|...|...:..|||.||.|..|||||||.||||||:|:..|||||.:..|...:|.
  Rat  1779 ISCCVGDETMGQLLPHLHEQLEVCQKSLTGYLEKKRLLFPRFFFVSDPVLLEILGQASDSHTIQP 1843

  Fly  1084 HLKKCFEGIATLNF-TEELD-VTAMRSSEREEVTLVDVISTSKARGQVEKWLLELEIDMKKSVHH 1146
            ||....:.|..:.| .::.| :||:.|.|.|::.|...:   .|:|.||.|||:|......|:|:
  Rat  1844 HLPAVSDNINEVTFHPKDYDRMTAVISREGEKIMLDTPV---MAKGPVEIWLLDLLKVQMSSLHN 1905

  Fly  1147 KVSEAFYS-------YLKMLRHVWVLTWPGQC----VQSISLTYWTLEITECFESEEPKENLAKY 1200
            .:..|||.       .|..|.|     :|.|.    :|.:    ||.:..|...|.:....:...
  Rat  1906 IIRSAFYQISDSGFLLLPFLNH-----FPAQVGLLGIQML----WTHDSEEALNSAKDDRKIMHI 1961

  Fly  1201 LQKCVLQI-NKIVDLVRGDLNTQNRITLGALVVLDVHARDVLAEIVANQVEDLQDFQWLCQLRYY 1264
            ..:..|.| |.::.....||...:|:....|:.:.||.||:..::|...::.:.||:||.|.|:|
  Rat  1962 TNQKFLDILNTLISQTTHDLTKFDRVKFETLITIHVHQRDIFDDLVKMHIKSVTDFEWLKQSRFY 2026

  Fly  1265 WEDNNLDTRMINCS---LPYGYEYLGNTPRLVVTPLTDRCYRTLFAALNLHLGGAPEGPAGTGKT 1326
            ::: :||..:::.:   ..|..|:||.|.|||:||||||||.||..||.:::||||.||||||||
  Rat  2027 FKE-DLDQTVVSITDVDFNYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALGMNMGGAPAGPAGTGKT 2090

  Fly  1327 ETTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFFKGLASCGAWSCFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTI 1391
            |||||:.:.:.|..|||||||.:|:..||:.|||||..|:|.||||||||:|.||||.||||..:
  Rat  2091 ETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQIYIV 2155

  Fly  1392 QRGINSGSPTLVF-EGTTLTLDPTCAVFITMNPGYAGRSELPDNLKALFRSVAMMVPDYALISEI 1455
            ...........:| :|..:.|:|...:|:|||||||||.|||:|||..||:|||||||..:|..:
  Rat  2156 LTARKERKKQFIFSDGDCVDLNPEFGIFLTMNPGYAGRQELPENLKIQFRTVAMMVPDRQIIMRV 2220

  Fly  1456 ELYSYGFLTAKPLSVKIVATYRLCSEQLSTQCHYDYGMRAVKSVLKAAGALKLRYRDENEDILVL 1520
            :|.|.|||....|:.|....|:||.|||:.|.|||:|:|.:.|||:..|:.|....:::|...|:
  Rat  2221 KLASCGFLENVILAQKFYVLYKLCEEQLTKQVHYDFGLRNILSVLRTLGSQKRARPEDSELSTVM 2285

  Fly  1521 RSIKDVNLPKFLNQDIPLFQGITSDLFPGTVLPEADYVLFNKCTQMACERQNK-----QCTPFVL 1580
            |.::|:||.|.:::|.|||..:.:|||||..|....|...    |.|.:.|..     ...|:.|
  Rat  2286 RGLRDMNLSKLVDEDEPLFLSLINDLFPGLQLDSNTYAEL----QAAVDNQVNLEGLINHPPWNL 2346

  Fly  1581 EKVQQLYEMIVVRHGLMLVGYPFGGKTTTYRVLAEAL-ECMEKTDGSENKAIYTVINPKAITMGQ 1644
             |:.||||..:||||||.:|....||||...:|.::| ||     |..::.:.  :||||||..|
  Rat  2347 -KLVQLYETSLVRHGLMTLGPSGSGKTTVITILMKSLTEC-----GRPHREMR--MNPKAITAPQ 2403

  Fly  1645 LYGQFDAVSHEWSDGILAVNYRIFAISDSPDRKWLIFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLMSGE 1709
            ::|:.|..:::|:|||.:..:|....:...:..:||.|||||||||||:|:||||||.|.|.:|:
  Rat  2404 MFGRLDTATNDWTDGIFSTLWRKTLKAKKGENIFLILDGPVDAIWIENLNSVLDDNKTLTLANGD 2468

  Fly  1710 IIQLSNTTNLVFEPMDLEVASPATVSRCGMIYLEPSSLGWEPLVASW--KNTLPAA------FHT 1766
            .|.::.|..|:||..::|.||||||||.||:|:..|:|.|.|::.:|  :.|...|      :..
  Rat  2469 RIPMAPTCKLLFEVHNIENASPATVSRMGMVYISSSALSWRPILQAWLKRRTQQEATAFLSLYDK 2533

  Fly  1767 VSKQLISMLISRFCPILLFILRKSLKEIAPTSDANLMVSLMNFFECFIDDFRDEKYVANVSDLDF 1831
            |.:...:.:.....|.:..:            :.|.:...:|..|..|.. ::|..|::|..|  
  Rat  2534 VFEDAYTYMKLNLIPKMQLL------------ECNYITQSLNLLEGLIPS-KEEGGVSSVDHL-- 2583

  Fly  1832 RAQTEGIFLFSCIWSLGGSLDADSREKFNIIFRALMEK-TFPQSLYDTYGVPEDLYVESLAKPFI 1895
                ..:|:|..:||||..|:.:||||..:..|....| ..|:...|::....:.||.       
  Rat  2584 ----HKLFVFGLMWSLGALLELESREKLEVFLRGHESKLNLPEIAKDSHHTMYEFYVT------- 2637

  Fly  1896 FPIPKQGSVFDYRYIKEGKGKWKPWQDDVNSAPP--IPRD-IP-VNQIIIQTNESVRIGAVLDLL 1956
                      ||       |.|:.|...:.   |  .|.| || .:.|::...:::|...::|.:
  Rat  2638 ----------DY-------GDWEHWNKRLQ---PYFYPTDSIPEYSSILVPNVDNIRTNFLIDTI 2682

  Fly  1957 NRHGKPIMLVGPTGTGKSVYVIDYMLKKMDLSFYKPLLISFSAQTSANQTQDIIMSKLDKRRKGV 2021
            .:..|.::|.|..||.|:|.|..| |||.|........::||:.|.....|..|.|.:|||....
  Rat  2683 AKQHKAVLLTGEQGTAKTVMVKAY-LKKYDPEVQLSKSLNFSSATEPMMFQRTIESYVDKRMGST 2746

  Fly  2022 FGPPLNSRFVIFVDDVSMPLKENYGAQPPIELLRMMLDHMMWY--DRKNIVPMKLIDLQMIVAMG 2084
            :|||...:..:|:||::||:...:|.|...|::|.|::....|  |:.... ..::|:|:|.||.
  Rat  2747 YGPPGGRKMTVFIDDINMPVINEWGDQITNEIVRQMMEMEGMYSLDKPGDF-TTIVDVQLIAAMI 2810

  Fly  2085 PPSTG-NTVTPRFQRFFNVISIDDFNNDILNTIFSKIVLWHLD-TRGFSKEFDPCIDEIVGATLT 2147
            .|..| |.:..|.:|.|.|.:....:|..::.||..|...:.| .|.|..|....|..:|.....
  Rat  2811 HPGGGRNDIPQRLKRQFTVFNCTLPSNTSIDKIFGIIGCGYFDPCRKFRPEICDMIGNLVSVGRV 2875

  Fly  2148 IYNDAKLNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVLLSVPEATEDVNSMRRLWVHEVLRVYGDRLVED 2212
            ::...|:.:||||:|.||:|||||.||:.||:|....|..:.:..:..|:.||..||..||.:..
  Rat  2876 LWQWTKVKMLPTPSKFHYIFNLRDLSRIWQGMLTIKAEECKTIPILMALFKHECNRVIADRFITP 2940

  Fly  2213 ADRSW--------LFENICSTVKSCFNTDPSRLFGRLVEKDKSLQESDFRQLIYCDFTNPKAD-- 2267
            .|..|        :.|||...|.:..|.:|..:              ||.:    |...|..|  
  Rat  2941 DDEQWFNTQLIRAVEENISPEVAASINPEPYFV--------------DFLR----DMPEPTGDEP 2987

  Fly  2268 -------TKNYVEVQDLEELRRVVEAYLVEYNNMSK-KPMNLVLFRFAIEHLSRICRIIKQPRSH 2324
                   .|.|..|...|.|...::.|..::|.:.: ..::||.|:.|:.||.:|.|||:....:
  Rat  2988 EDTMFEVPKIYELVPSFEFLCEKLQFYQKQFNEIIRGTSLDLVFFKDAMTHLIKISRIIRTSCGN 3052

  Fly  2325 ALLIGVGGSGRQSLTRLASHICDYELFQVEITRLYGPYEYHEDIKAILRKIGASEMHGVFLFTDV 2389
            |||:||||||:|||:||||.|..|::||:.:||.|......:|:|.:.:..||......|:|||.
  Rat  3053 ALLVGVGGSGKQSLSRLASFIAGYQIFQITLTRSYNVSNLIDDLKNLYKVAGADGKGITFIFTDN 3117

  Fly  2390 QIKDESFLEDISNLLNSGEVPNLFTNEEKIEVQEKMAQIDKQRDKAVQTDGSPVA---LFNFFVT 2451
            :||||:|||.::|||:|||:.|||..:|..|:.:.:..:.|:     :....|..   |:.:|::
  Rat  3118 EIKDEAFLEYLNNLLSSGEISNLFARDELDEITQGLISVMKR-----ELPRHPPTFDNLYEYFIS 3177

  Fly  2452 TCKDQLHIVLAMSPIGDALRNRIRKFPSIVNCCTIDWFQSWPEDALLAVSTRFLASEDLT-ALE- 2514
            ..:..||:||..||:|:..|.|..|||.:::.||:|||..||::||:||::.||:..::. ::| 
  Rat  3178 RSRRNLHVVLCFSPVGEKFRARSLKFPGLISGCTMDWFSRWPKEALIAVASYFLSDYNIVCSMEI 3242

  Fly  2515 RRTAIDMCMEFHTSTQELSAKFFSRLHRYNYVTPTSYLELIQTFKALLSQKRNNITNNRNRYLTG 2579
            :|..::....||....|....:|.|..|..:|||.|||..|..:|.:.::|...|.....|...|
  Rat  3243 KRHVVEAMGLFHDMVSESCENYFQRYRRRAHVTPKSYLSFINGYKNIYTEKVKYINEQAERMNIG 3307

  Fly  2580 ISQLDIAAQQVAVMQEQLIALEPKLKEAS----EIVAEQVAKVTADSKLAEEQREIVKLDESAAK 2640
            :.:|..|::.||.:.:.|...|.:|..||    |::||......|.:|:..|.:|:        |
  Rat  3308 LDKLMEASESVAKLSQDLAVKEKELAVASVKADEVLAEVTVSAQASAKVKNEVQEV--------K 3364

  Fly  2641 EQAAVAQEIKDECD-------AKLGEALPILESALAALNTLTTADIAVVKTMKSPPIGVRIVMEA 2698
            ::   ||:|.||.|       :||..|.|.||.|.|||||:...|||.|:.:..||..:..:|:.
  Rat  3365 DK---AQKIVDEIDSEKVKAESKLEAAKPALEEAEAALNTIKPNDIATVRKLAKPPHLIMRIMDC 3426

  Fly  2699 VCILKDVKPDKVPNPSGLGTVEDYWGPSKRVLSDMKFLDSLLNFDKDNIPVEVMKKLAQRILSNE 2763
            |.:|...|.|.|.........:..||.|.:::|...||.||..|.||.|..|.: :|.|...:.:
  Rat  3427 VLLLFQKKIDPVTMDPEKPCCKPSWGESLKLMSATGFLFSLQQFPKDTINEETV-ELLQPYFNMD 3490

  Fly  2764 AFDPDKIKSASTACEGLCRWVIALTKYDVVAKIVAPKKLALAEAEATYNAAMKTLNEKLAMLAKV 2828
            .:..:..|.......||..|.:|:..:..:.:.|.|.|..||:.|.....|...|.:..|:|.:.
  Rat  3491 DYTYESAKKVCGNVAGLLSWTLAMAIFYGINREVLPLKANLAKQEGRLAVANAELGKAQALLDEK 3555

  Fly  2829 EANLAAIQKILDEQLRQYGILLAEHEACTKKLQRAQELISGLGGERTRWSETAKMLQASFKSVTG 2893
            :|.|..:|...|..:.:...||.:.:.|.||:|.|..||.||.||:.||::.:|..:|....:.|
  Rat  3556 QAELDKVQAKFDAAMNEKMDLLNDADMCRKKMQAASTLIDGLSGEKVRWTQQSKEFKAQINRLVG 3620

  Fly  2894 DVLISSGVVSYLGPFTIDFRVDQIR-KWVTKCLNFGVTCTADFQLAVVLGEPVEIRFWNICGLPT 2957
            |||:.:|.:||||||...||...:: :|..:.....:..|.:..|..:|.:|..|..|.:.|||.
  Rat  3621 DVLLCTGFLSYLGPFNQIFRNYLLKDQWELEMKARKIPFTENLNLIAMLVDPPTIGEWGLQGLPG 3685

  Fly  2958 DAFSIESAIMMKNARRWPLMIDPQGQANKWIKNYEKNNKLCVIRLNQADYTRVMENAIQFGLPVL 3022
            |..||::.|::..|.|:||:||||.|...|||:.||.|.|.|..||...:...:|:::..|.|:|
  Rat  3686 DDLSIQNGIIVTKATRYPLLIDPQTQGKTWIKSKEKENDLQVTSLNHKYFRTHLEDSLSLGRPLL 3750

  Fly  3023 LENIGEELDPVLESVLQKTLFKQGGALCIKLGDSVIEYNHSFRFYMTTKLRNPHYLPEVAVKVTL 3087
            :|:|.|||||.|::||:|...|.|.|..:|:||...:...:|:.|:||||.||.:.||:..|.::
  Rat  3751 IEDIREELDPALDNVLEKNFIKSGTAFKVKVGDKECDIMDTFKLYITTKLPNPAFTPEINAKTSV 3815

  Fly  3088 LNFMITTQGLQDQLLGITVARERPDLEAEKNNLIVQGADNKRMLKETEDQILEVLSSAE-NILED 3151
            ::|.:|.:||::|||...:..|:.:||:|:..|:.....|||.:||.||.:|..||:.: ::::|
  Rat  3816 IDFTVTMKGLENQLLRRVILTEKQELESERVKLLEDVTFNKRKMKELEDNLLYKLSTTQGSLVDD 3880

  Fly  3152 ETAVQILSSAKALANDISEKQVITEATEKQIDIARLSYVPIAEHSTILFFTIVELANIDPMYQYS 3216
            |:.:.:|...|..|.::|||..:...||.:|:.|:..:.|.|...:||:|.|.|::.::.|||.|
  Rat  3881 ESLIGVLRITKQTAAEVSEKLHVAAETEIKINTAQEEFRPAATRGSILYFLITEMSMVNIMYQTS 3945

  Fly  3217 LVWFVNLYMSSIDNTEKVDDIAARLLDLRNHFTYSLYVNICRSLFERDKLLFSLILNINMMKHDN 3281
            |..|:.|:..|:..:||......|:.::..:.||.::....|.|:|..|.||:|::.:.:.....
  Rat  3946 LAQFLKLFDQSMARSEKSPLPQKRITNIIEYLTYEVFTYSVRGLYENHKFLFALLMTLKIDLQRG 4010

  Fly  3282 RIDNAEWMFLLTGGVGLE---NPYKNPTTWLGVQNWDELCRLTNLTNFKGLREDFNENSAQWKPF 3343
            .:.:.|:..|:.||..|:   .|.| |..|:....|..|..|:.|..|..:....:.|...||.:
  Rat  4011 TVKHKEFQALIKGGAALDLKACPPK-PFRWILDMTWLNLVELSKLPQFAEIMNQISRNEKGWKNW 4074

  Fly  3344 FDSKSPQDNKDIPKSWDNRVSVFQKLLLLRVFRPDKLVPAVLNFVSGELGERFVDPPQFDLMASF 3408
            ||..:|:: :.||..:::.:...:||||:|.:.||:.|.....:::..|.|::.:|...:|..::
  Rat  4075 FDKDAPEE-EIIPDGYNDSLDTCRKLLLIRSWCPDRTVFQARKYIADSLEEKYTEPVILNLEKTW 4138

  Fly  3409 ADSHCCVPLIFILTPGSDPTATLLKFAEDQGFGTNRLFSLSLGQGQGPIAMKMIDEGVKMGNWVV 3473
            .:|....|||..|:.|||||..:...|:.......   ::|:||||...|.|::...::.|.||:
  Rat  4139 EESDTHTPLICFLSMGSDPTIQIDALAKKLKLECR---TISMGQGQEVHARKLVQLSMQQGGWVL 4200

  Fly  3474 LQNCHLAASFMPLLEKICENLL-PDATHPDFRLWLTSYPADHFPVVVLQNGIKMTNEPPKGLRSN 3537
            ||||||...||   |::.|.|: .:.|...||:|:|:.|.|.||:.:||..:|.|||||:|:|:.
  Rat  4201 LQNCHLGLEFM---EELLETLMVTETTEDSFRVWITTEPHDRFPITLLQTSLKFTNEPPQGVRAG 4262

  Fly  3538 ILRSM--ISDPISD----PEWYESCTQPRIFKQLIYSLCFFHAVIQERRYFGPIGWNIPYEFNET 3596
            :.|:.  |:..:.|    |.|          |.::|::.|.|:.:||||.|||:|||||||||..
  Rat  4263 LKRTFAGINQDLLDISNLPMW----------KPMLYTVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNSA 4317

  Fly  3597 DLRISLMQLRMFLNQYET---VNYDALRYLTGECNYGGRVTDDWDRRTLKTILDKFYCPAVIDLE 3658
            |...|:..::..|::.:.   |::..:||:.||..||||||||:|:|.|......::...:.:  
  Rat  4318 DFSASVQFIQNHLDECDIKKGVSWSTVRYMIGEVQYGGRVTDDFDKRLLNCFARVWFSEKMFE-- 4380

  Fly  3659 TPYYLDETGLYYVPVFKEVDLYLNFTRDLPQISAPAIFGFHANADI-MKDQKETDMLLSHTLLTQ 3722
             |.:...|| |.:||.|.:|.|..:.:.||.:..|.:||.|.|||| .:....:|:|        
  Rat  4381 -PSFCFYTG-YKIPVCKTLDQYFEYIQSLPSLDNPEVFGLHPNADITYQSNTASDVL-------- 4435

  Fly  3723 KLEKKQRVYVETLSRRFPENLSLPTYPTCPPFLALYQMSLKDTSASSDDSGGSKALTPEEVVTNV 3787
                      ||:                             |:....:|||....|.|.:|..:
  Rat  4436 ----------ETI-----------------------------TNIQPKESGGGMGETREAIVYRL 4461

  Fly  3788 ATDILDKLPKLF---DRDAALLKYPTLYHQSMNTVLVQEMVRFNVLLNTIRTSLITLRKGIKGLV 3849
            :.|:|.|||..:   :..|.|:|...|  .|||..|.||:.|...:::.:|.||..|:..|:|.:
  Rat  4462 SEDMLSKLPPNYVAHEVKARLMKMGHL--NSMNIFLRQEIDRMQRVISLLRNSLNDLKLAIEGTI 4524

  Fly  3850 VMSPAVEAVYKSVLIAKIPAMWAGKSYPSLKPLGSYVTDFLRRLEFLQHWFDHGAPSTFWLSGFF 3914
            :||..:.....::..|:||.:|...|:.| ..||.:.|:.|.|......|...|.|:.||::|||
  Rat  4525 IMSENLRDALDNMYDARIPQLWKRVSWDS-STLGFWFTELLERNAQFSTWIFEGRPNVFWMTGFF 4588

  Fly  3915 FTQAFLTGAQQNYARKYV-ISIDLLAFDYEVLTVEEPQRQGLSGPEDGVFVYGIFLEGARWDRTG 3978
            ..|.|||..:|...|.:. .::|.:....|||  .:.:.:.::.|.:||::||::::||.|||..
  Rat  4589 NPQGFLTAMRQEVTRAHKGWALDSVTIHNEVL--RQTKEEIITPPVEGVYIYGLYMDGASWDRRN 4651

  Fly  3979 KYLAESRPRELFDTMPLIWLKPLKRVDLPERHNYLCPMYKTAERRGVLSTTGHSTNFVVAMLLLC 4043
            ..|.||.|:.||..:|::.:..:......:...|:||:||...|..:...|      ||.:..:.
  Rat  4652 GKLTESTPKVLFMQLPVLHIYAINSTAPKDPKLYVCPIYKKPRRTDLTFIT------VVYLRTVL 4710

  Fly  4044 NPNTPVSHWIIRGTALLCQL 4063
            :|:    |||:||.||||.:
  Rat  4711 SPD----HWILRGVALLCDI 4726

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc36CNP_001369131.1 DHC_N2 746..1151 CDD:400618 136/415 (33%)
DYN1 <984..3651 CDD:227570 948/2757 (34%)
AAA_6 1281..1607 CDD:403853 162/331 (49%)
AAA_8 2299..2561 CDD:403858 104/266 (39%)
AAA_9 2950..3165 CDD:403859 85/215 (40%)
Dynein_C 3779..4061 CDD:408026 90/285 (32%)
Dnah8XP_038955254.1 DHC_N1 376..930 CDD:400611 21/99 (21%)
DYN1 1328..4375 CDD:227570 1053/3212 (33%)
AAA_6 2045..2372 CDD:403853 162/331 (49%)
Dynein_C 4429..4724 CDD:408026 98/356 (28%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.