DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc36C and Dnah1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001369131.1 Gene:Dhc36C / 35061 FlyBaseID:FBgn0013810 Length:4065 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001028827.2 Gene:Dnah1 / 171339 RGDID:621795 Length:4250 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4203 Identity:1663/4203 - (39%)
Similarity:2435/4203 - (57%) Gaps:379/4203 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    33 YTRPKPDVLQSIL---QSKANPEYKSRRLWYELNMPECASSLLDGKMKSDLPDNILCAKKQQKKR 94
            |.:|.|.  :::|   .:..:.:.||:.|.|..    |...:||    .|....:...:|..|:.
  Rat   257 YRKPVPG--KALLPTDDALGHEDPKSQELDYRW----CEVGVLD----YDEEKKLYLVQKTDKRG 311

  Fly    95 QKKRESGVAKAN---------------YMTMRLEREHFRRKLVELILHMDDDQDPELAAQCAVPF 144
            ..:.|.|:...|               |...|          ::|:...   :||.:..|..|..
  Rat   312 LVRDEMGMPIVNGGVTPEGRPPLLDTQYWVPR----------IQLLFCA---EDPRVFTQRVVQA 363

  Fly   145 P--DQEEREILRYYYYI----KHGIDTIHVSPLSK---------------KILKRITDLVPPLLY 188
            .  .:....:|.|..|:    ..|...|:...|||               .:|:.::.|...:..
  Rat   364 NALRKNTEALLLYNLYVDCMPTEGQRVINEQSLSKIKQWALSTPRMRKGPSVLEHLSSLAREVNL 428

  Fly   189 KWQTALNENIAEVRADYVFAMKKAVVDFV-LRHTVLDRLTKEGVGG--KYDTAERRE-------- 242
            .::.::|    ::..|.:.:.|.....|| |.....:::..:|:..  :|...|::|        
  Rat   429 DYERSMN----KINFDQIVSSKPETFSFVTLPEKEEEKVPNQGLVSVPEYPFREQKEDFTFVSLL 489

  Fly   243 --VQSMTNFWRYRYDENRNVLMKTLFCIHRSVASILELWSMKYKDKSLIDSKELAKVESPFSLFT 305
              .:.:|...:.|.:.|: |...:||..:.|..|.||.:..       |.|:..::|:       
  Rat   490 TRSEVITALSKVRAECNK-VTSMSLFHSNLSKYSRLEEFEQ-------IQSQTFSQVQ------- 539

  Fly   306 FVYLCGSHIDNGKTLLEESWYGEIHSSLLKASKRGQLPDIRR--------------FTLVKRFFN 356
                         ..|::||.     |.||.:.|..|.|:.:              .:.:::...
  Rat   540 -------------MFLKDSWI-----STLKVAMRSSLRDMSKGWYNLYETNWEVYLMSKLRKLME 586

  Fly   357 CVAALMTQQLEDICIRSLKEYADFI---------C----DYG----------HSNPGFEISVMLA 398
            .:..::...|..:...||..:|.||         |    |:|          ..||.|.:.::| 
  Rat   587 LIKYMLQDTLRFLVQDSLGSFAQFIGDACCSVLECIDDMDWGEDLINSPYKPRKNPLFIVDLVL- 650

  Fly   399 DEDTIQFNPSFSKVQSELLRVIDSIMLSIQMLPRIESKLYTDLIVSKKIFLTPT-VPESIVQETK 462
            |...:.::....:.:..||.:.|..:|:...:|::|..:..|:.:|....|... :.|.:|:|.:
  Rat   651 DNTGVHYSTPLEQFEVILLNLFDKGILATHAVPQLEKLVMEDIFISGDPLLESVGLHEPLVEELR 715

  Fly   463 NRICAMLEEQRIGPELRLQDFDPFIDLINGSDAERVGNFMESDATFEQYADMVYEYKEKEDRIAK 527
            ..|...:.:..|..:...:::..:::|.|...:..:..:.....:.|:..::|..:.::::.:..
  Rat   716 ANITNAMHKAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDISTFLKTYQTQCPSAEEVREVVITHLKEKEILDN 780

  Fly   528 EVWAVIRMGFYEFHRDKFITHLESLCRQL---QLDLLARMVTDQQARITRLGKEYDAIAKKALTV 589
            .:.:.|.:|.:..:.|.....|....:.|   .||:||:.:.::   :..:.:|:.:|::|....
  Rat   781 SLPSSIIIGPFYINVDNVKQSLSKKRKALATSMLDILAKNLHNE---VDSICEEFRSISRKIYEK 842

  Fly   590 PKDTAELMQLKAYVVHAEENLVPEMEARLKVNMSEILWLMDHTLYSPLEIKNNSNSFQWYL---- 650
            |....||.:|:.::....|.|| .:|.|:...||: ..:||...|:   :..:..:.:|..    
  Rat   843 PNSIEELAELRDWMKGIPEKLV-ILEERIVKVMSD-YEVMDEFFYN---LTTDDFNDKWAANNWP 902

  Fly   651 -----KLPSIFEQHRAIIAEKVIEYQELLKKRIEL-----FRRELQNYYEQVQTYDTWGDIKQLS 705
                 ::..:.:||        :|.:|..:| |:|     |:.:|:.....|..:.|..:|.:..
  Rat   903 TKILGQIDMVRQQH--------VEDEEKFRK-IQLMDQNNFQEKLEGLQLVVAGFSTHVEIARAH 958

  Fly   706 RYKKRAGVLDQRLVQAMETIDQINEEETSYGWDLSQYPMRKKAHDQLKPYKTLFDAGQDFMDKW- 769
            ........:.::|....:.....|..|..:|..::.|....:...:.:||..|:....|:: :| 
  Rat   959 EIANEVRRVKKQLKDCQQLAMLYNNRERIFGLPITNYDKLSRMVKEFQPYLDLWTTASDWL-RWS 1022

  Fly   770 DLWMHSQVGSFDPDEIDGDVSNFYRIIQKLDKQMGDHPITMQLIQDVKAQIEAFREHMPIINTLG 834
            :.||:..:.:.|.::::.:|...::.:.|..||..|.|....:..|::|:|:.|:.::|:|..|.
  Rat  1023 ESWMNDPLSAIDAEQLEKNVIESFKTMHKCVKQFKDIPACQDVALDIRARIDEFKPYIPLIQGLR 1087

  Fly   835 NPGMKARHWELVSEIIGFPIKVSPELTLEKIIEYQLDEYVPKFEAISESATKENNLERAMAKMVN 899
            ||||:.||||::|..|...::....||..:.:|..|.:|:.....::|.|.||..:|:|:.||..
  Rat  1088 NPGMRNRHWEVLSNEININVRPKANLTFARCLEMNLQDYIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEK 1152

  Fly   900 EWEGVEFSISPYRDSGTFKLAAVDDIQILLDDQIIKTQTMKSSPYIKPFEADIIKWEAKLMLLQE 964
            ||..:.|::.||:::.|:.|.:.|:...||||.|:.||:|..|||.||||..|..||.||.|.||
  Rat  1153 EWASILFNVLPYKETDTYILKSPDEASQLLDDHIVMTQSMSFSPYKKPFEQRINSWETKLKLTQE 1217

  Fly   965 ILDEWLRVQATWMYLEPIFSSPDIQQQMPEEGRRFSAVDKIWKELMKQVSQDPKVMVVVQIDKMN 1029
            :|:|||..|.:|:||||||||.||.:|:|.|.:|:..:::||:::||...::.:|:.|....::.
  Rat  1218 VLEEWLNCQRSWLYLEPIFSSEDITRQLPVESKRYQTMERIWRKIMKNAYENREVINVCSDQRLL 1282

  Fly  1030 DKLKKAYSLLEVIQKGLNAYLEKKRLYFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQIHLKKCFEGIAT 1094
            |.|:....||:::||||:.|||.||..||||:|||:||||||||:|||||.||.||:||||.||.
  Rat  1283 DSLRDCNKLLDLVQKGLSEYLETKRTAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCFENIAR 1347

  Fly  1095 LNFTEELDVTAMRSSEREEVTLVDVISTSKARGQVEKWLLELEIDMKKSVHHKVSEAFYSYLKML 1159
            |.|.|:|::|.|.|:|.|||.|...|..|   ..||.||||:|..||.|||..:..|..:|..||
  Rat  1348 LLFQEDLEITHMYSAEGEEVKLSFSIYPS---SNVEDWLLEVERSMKASVHDIIEMAIKAYPTML 1409

  Fly  1160 RHVWVLTWPGQCVQSISLTYWTLEITECFESEEPKENLAKYLQKCVLQINKIVDLVRGDLNTQNR 1224
            |..|||:||||...:...||||||:.:..|:.....:|...|.|   |::.:|.||||.|:...|
  Rat  1410 RTEWVLSWPGQVTIAGCQTYWTLEVAQALEASSISSSLFPQLSK---QLSDLVALVRGKLSRMQR 1471

  Fly  1225 ITLGALVVLDVHARDVLAEIVANQVEDLQDFQWLCQLRYYWEDNNLDTRMINCSLPYGYEYLGNT 1289
            :.|.||:|::|||:||:::::...|..:.||:|:.||||||.:|:|..|.:|....||||||||:
  Rat  1472 MVLSALIVIEVHAKDVVSKLIDENVVSVHDFEWISQLRYYWTNNDLYIRAVNAEFIYGYEYLGNS 1536

  Fly  1290 PRLVVTPLTDRCYRTLFAALNLHLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLAL 1354
            .|||:||||||||.||..||:|..||||.||||||||||||||.||:|.|.|||||||.||::|:
  Rat  1537 GRLVITPLTDRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAM 1601

  Fly  1355 GKFFKGLASCGAWSCFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTIQRGINSGSPTLVFEGTTLTLDPTCAVFI 1419
            |||||||||.|||:|||||||||:||||||||||.|||:.........:|||..:.|.|:|||||
  Rat  1602 GKFFKGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPSCAVFI 1666

  Fly  1420 TMNPGYAGRSELPDNLKALFRSVAMMVPDYALISEIELYSYGFLTAKPLSVKIVATYRLCSEQLS 1484
            |||||||||:|||||||||||.|||||||||:|:||.|||:||..|..|:.||..|::|.|||||
  Rat  1667 TMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMIAEISLYSFGFNEANVLAKKITTTFKLSSEQLS 1731

  Fly  1485 TQCHYDYGMRAVKSVLKAAGALKLRYRDENEDILVLRSIKDVNLPKFLNQDIPLFQGITSDLFPG 1549
            :|.|||:||||||:|:.|||.||......||:::.||:|:|||:||||.:|:.||.||.|||||.
  Rat  1732 SQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKRENPTMNEELICLRAIRDVNVPKFLQEDLKLFSGIVSDLFPT 1796

  Fly  1550 TVLPEADYVLFNKCTQMACERQNKQCTPFVLEKVQQLYEMIVVRHGLMLVGYPFGGKTTTYRVLA 1614
            |...|.||.:.::..:.|||:.|.:.....|.|..||||..||||||||||....||:..||:||
  Rat  1797 TKEEETDYGILDQAIRKACEKNNLKDVEGFLIKCIQLYETTVVRHGLMLVGPTGSGKSNCYRILA 1861

  Fly  1615 EALECME---KTDGSENKAI-YTVINPKAITMGQLYGQFDAVSHEWSDGILAVNYRIFAISDSPD 1675
            .|:..::   ...|...:|: |.|:|||:||||||||:||.::|||:|||.....|..||:...:
  Rat  1862 AAMTSLKGKPSISGGVYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTHEWTDGIFPSLIRAGAIASDTN 1926

  Fly  1676 RKWLIFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQLSNTTNLVFEPMDLEVASPATVSRCGMI 1740
            :||.:|||||||:|||||||||||||||||.|||||:|:....::||..||.||||||||||||:
  Rat  1927 KKWYMFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMV 1991

  Fly  1741 YLEPSSLGWEPLVASWKNTLPAAFHTVSKQLISMLISRFCPILLFILRKSLKEIAPTSDANLMVS 1805
            |||||.||..|.|..|...||:......:|..::.: :|....:..:|.::||:..::::||.:|
  Rat  1992 YLEPSILGLMPFVECWLKHLPSIIKPYEEQFKTLFV-KFLESSIAFVRTTVKEVVASTNSNLTMS 2055

  Fly  1806 LMNFFECFIDDF---------RDEKYVANVSDLDFRAQTEGIFLFSCIWSLGGSLDADSREKFNI 1861
            |:...:||...|         ..|| ::::.:|     .|..|:||.:||:|.:.|..||..|: 
  Rat  2056 LLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEK-LSHIPEL-----IEPWFIFSLVWSVGATGDHSSRLNFS- 2113

  Fly  1862 IFRALMEKTFPQSLYDTYGVPEDLYVESLAKPFIFPIPKQGSVFDYRYIKEG------------- 1913
                                 :.|.::.:.:......|::|.|:|||....|             
  Rat  2114 ---------------------QWLKIKMVFEQIKLAFPEEGLVYDYRLDDAGISSTEDDDEDDEE 2157

  Fly  1914 --KGKWKPWQDDVNSAP-PIPRDIPVNQIIIQTNESVRIGAVLDLLNRHGKPIMLVGPTGTGKSV 1975
              :..|..|.|  .|.| .:..|.....||:.|.:::::..:|.:|..:.||::.:|||||||::
  Rat  2158 SKQVAWVKWMD--YSVPFTMMPDTNYCNIIVPTMDTMQMSYLLGMLITNHKPVLCIGPTGTGKTL 2220

  Fly  1976 YVIDYMLKKMDLSFYKPLLISFSAQTSANQTQDIIMSKLDKRRKGVFGPPLNSRFVIFVDDVSMP 2040
            .|.:.:||.:.|.:....| :|||:||||||||:|.|||||||||||||||...|:.|:||::||
  Rat  2221 TVSNKLLKNLPLEYISHFL-TFSARTSANQTQDLIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMP 2284

  Fly  2041 LKENYGAQPPIELLRMMLDHMMWYDRKNIVPMK-LIDLQMIVAMGPPSTG-NTVTPRFQRFFNVI 2103
            ..|.|||||||||||..:||..|||||.|...| |:|:..:.|||||..| |.:|||..|.||.:
  Rat  2285 ALETYGAQPPIELLRQWMDHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNAITPRLTRHFNYL 2349

  Fly  2104 SIDDFNNDILNTIFSKIV-LWHLDTRGFSKEFDP---------CIDEIVGATLTIYNDAKLNLLP 2158
            |..:.:......|||.|: .|.....|.....:|         ..:.:|.||::||......|||
  Rat  2350 SFIEMDEVSKKRIFSIILGCWMDGLLGEKSYREPVPGAPNIVHMTEPLVNATISIYAIITSQLLP 2414

  Fly  2159 TPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVLLSVPEATEDVNSMRRLWVHEVLRVYGDRLVEDADRSW---LFE 2220
            |||||||.|||||.|:|.||:|::.|...||...:.|||.||..||:.||||.:.||.|   |.|
  Rat  2415 TPAKSHYTFNLRDLSKVFQGILMAEPAKVEDKVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRGWFDGLLE 2479

  Fly  2221 NICSTVKSCFNTDPSRLFGRLVEKDKSLQESDFRQLIYCDFTNPKADTKNYVEVQDLEELRRVVE 2285
            .....:...||                 :...|:.::|.||.:|.:|.|:|..:....::.:|:|
  Rat  2480 MKMEDLGVAFN-----------------KVCPFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSENKMMQVIE 2527

  Fly  2286 AYLVEYNNMSKKPMNLVLFRFAIEHLSRICRIIKQPRSHALLIGVGGSGRQSLTRLASHICDYEL 2350
            .|:.:||.::...:.||||..|:.|:.||.|.::|...:|||:|||||||.||||||||:.:||.
  Rat  2528 EYMEDYNQINTAKLKLVLFVDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYEC 2592

  Fly  2351 FQVEITRLYGPYEYHEDIKAILRKIGASEMHGVFLFTDVQIKDESFLEDISNLLNSGEVPNLFTN 2415
            ||||:::.||..|:.||:|.||.|.|...:...|||:|.|||:|||||||:|:||||::|||::.
  Rat  2593 FQVELSKNYGMSEWREDVKKILLKAGMQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNILNSGDIPNLYSA 2657

  Fly  2416 EEKIEVQEKMAQIDKQRDKAVQTDG---SPVALFNFFVTTCKDQLHIVLAMSPIGDALRNRIRKF 2477
            :|:.::...|...       :|..|   :...|...:....::.:|:||.|||||:..|.|:|:|
  Rat  2658 DEQDQIVNTMRPY-------IQEQGLQPTKANLMAAYTGRVRNNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQF 2715

  Fly  2478 PSIVNCCTIDWFQSWPEDALLAVSTRFL--------ASEDLTALERRTAIDMCMEFHTSTQELSA 2534
            ||:|||||||||..||.:||.:|:||||        :||.:..|     |.:|:..|.|..:...
  Rat  2716 PSLVNCCTIDWFNEWPAEALQSVATRFLHEIPELECSSEVIEGL-----IHVCVYIHQSVAKKCV 2775

  Fly  2535 KFFSRLHRYNYVTPTSYLELIQTFKALLSQKRNNITNNRNRYLTGISQLDIAAQQVAVMQEQLIA 2599
            ::.:.|.|:|||||.|||||:..|..|:.||:..:...::|..:|:.:|...::.||.|||:|..
  Rat  2776 EYLAELARHNYVTPKSYLELLNIFSILIGQKKMELKTAKHRMKSGLDKLLRTSEDVAKMQEELEI 2840

  Fly  2600 LEPKLKEASEIVAEQVAKVTADSKLAEEQREIVKLDESAAKEQAAVAQEIKDECDAKLGEALPIL 2664
            :.|.|:||::.....:.::..|:.:|||.|:.|:.:|..|.|:|:.||.|.|:....|.||||.|
  Rat  2841 MRPLLEEAAKDTLLTMDQIKVDTAIAEETRKSVQAEEIKANEKASKAQAIADDAQKDLDEALPAL 2905

  Fly  2665 ESALAALNTLTTADIAVVKTMKSPPIGVRIVMEAVCILKDVKPDKVPNPSGLGTVEDYWGPSKRV 2729
            ::|||:|..|...|:..|:.|:.||.||::|:|||||:|.:||.|||.......|:|||.|.|.:
  Rat  2906 DAALASLRNLNKNDVTEVRAMQRPPPGVKLVIEAVCIMKGIKPKKVPGEKPGSKVDDYWEPGKGL 2970

  Fly  2730 LSDM-KFLDSLLNFDKDNIPVEVMKKLAQRILSNEAFDPDKIKSASTACEGLCRWVIALTKYDVV 2793
            |.|. :||:||..||||||...|:|.: |..:.||.|.|..|...|.||..:|:||.|:.||..|
  Rat  2971 LQDPGRFLESLFKFDKDNIGEAVIKAI-QPYIDNEEFQPAAIAKVSKACTSICQWVRAMHKYHFV 3034

  Fly  2794 AKIVAPKKLALAEAEATYNAAMKTLNEKLAMLAKVEANLAAIQKILDEQLRQYGILLAEHEACTK 2858
            ||.|.||:.||.||:.......:.|.|....|.:||..::.:|....|.:.:...|..:.|.|.:
  Rat  3035 AKAVEPKRQALREAQDDLEVTQRILEEAKHHLREVEDGISTLQAKYRECVTKKEELEMKCEQCEQ 3099

  Fly  2859 KLQRAQELISGLGGERTRWSETAKMLQASFKSVTGDVLISSGVVSYLGPFTIDFRVDQIRKWVTK 2923
            :|.||.:||:||..|:.||.:|.:.|:....::.||||:::|.|:||||||..:|......||.:
  Rat  3100 RLGRADKLINGLADEKVRWQDTVENLENMLDNIFGDVLVAAGFVAYLGPFTGQYRAALYEYWVNQ 3164

  Fly  2924 CLNFGVTCTADFQLAVVLGEPVEIRFWNICGLPTDAFSIESAIMMKNARRWPLMIDPQGQANKWI 2988
            ...:||..|:...|...||.||:||.|.|.|||.|..|:|:.::.:.::||...|||||||||||
  Rat  3165 LTVYGVPHTSKPTLISTLGNPVKIRSWQIAGLPNDTLSVENGVINQFSQRWTHFIDPQGQANKWI 3229

  Fly  2989 KNYEKNNKLCVIRLNQADYTRVMENAIQFGLPVLLENIGEELDPVLESVLQKTLFKQGGALCIKL 3053
            ||.||.:.|.|.:|:..|:.|.|||||:||.|.||||:||||||.||.||.|..:||.|...:||
  Rat  3230 KNMEKESGLDVFKLSDRDFLRSMENAIRFGKPCLLENVGEELDPALEPVLLKQTYKQQGNTVLKL 3294

  Fly  3054 GDSVIEYNHSFRFYMTTKLRNPHYLPEVAVKVTLLNFMITTQGLQDQLLGITVARERPDLEAEKN 3118
            ||:||.|:..||.|:||||.||||.|||:.|:||:||.::..||:|||||..||.||||||..||
  Rat  3295 GDTVIPYHEDFRMYITTKLPNPHYSPEVSTKLTLINFTLSPSGLEDQLLGQVVAEERPDLEEAKN 3359

  Fly  3119 NLIVQGADNKRMLKETEDQILEVLSSAE-NILEDETAVQILSSAKALANDISEKQVITEATEKQI 3182
            .||:..|..::.||:.|||||..|||:| |.::|...:::|.::|..|.:|..|..|.|.|||.|
  Rat  3360 QLIISNAKMRQELKDIEDQILYRLSSSEGNPVDDVELIKVLEASKMKAAEIQAKVRIAEQTEKDI 3424

  Fly  3183 DIARLSYVPIAEHSTILFFTIVELANIDPMYQYSLVWFVNLYMSSIDNTEKVDDIAARLLDLRNH 3247
            |:.|:.|:|:|..:.||||.:.:|||:||||||||.||:|:::|.|.|:|:.|::..|::::..:
  Rat  3425 DLTRMEYIPVAVRTQILFFCVSDLANVDPMYQYSLEWFLNIFLSGIANSERADNLKKRIVNINRY 3489

  Fly  3248 FTYSLYVNICRSLFERDKLLFSLILNINMMKHDNRIDNAEWMFLLTGGVGLENPYKNPTT-WLGV 3311
            .|:|||.|:||||||:.||:|:.:|.:.:|.::.:|:..||.:||:|| .::...:||.. ||..
  Rat  3490 LTFSLYSNVCRSLFEKHKLMFAFLLCVRIMMNEGKINQGEWRYLLSGG-SIQTMSENPAPHWLSD 3553

  Fly  3312 QNWDELCRLTNLTNFKGLREDFNENSAQWKPFFDSKSPQDNKDIPKSWDNRVSVFQKLLLLRVFR 3376
            :.|.::..|:||..|.....||.::..:::..|||..|. .:.:|..|:..:..|||||:||..|
  Rat  3554 RAWRDILALSNLPAFSTFSTDFVQHLPKFQAIFDSAEPH-REPLPGIWNTYLDEFQKLLILRCLR 3617

  Fly  3377 PDKLVPAVLNFVSGELGERFVDPPQFDLMASFADSHCCVPLIFILTPGSDPTATLLKFAEDQGFG 3441
            .||:..|:.:||:..|..||::|...:|.|.|.:|:...||||:|:||:||.|.|.||||:..| 
  Rat  3618 GDKVTNAMQDFVANHLEPRFIEPQTANLSAVFKESNSTTPLIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKF- 3681

  Fly  3442 TNRLFSLSLGQGQGPIAMKMIDEGVKMGNWVVLQNCHLAASFMPLLEKICENLLPDATHPDFRLW 3506
            :.:|.::||||||||.|..|:...::.|.||..||||||.|:||.||::.|::.||..|.|||||
  Rat  3682 SKKLSAISLGQGQGPRAEAMMRNSIERGKWVFFQNCHLAPSWMPALERLIEHINPDKVHRDFRLW 3746

  Fly  3507 LTSYPADHFPVVVLQNGIKMTNEPPKGLRSNILRSMISDPISDPEWYESCTQPRIFKQLIYSLCF 3571
            |||.|::.|||.:||||.|||.|||:|:::|:|:|..|  :|| ::..||.:...||.|:.|||.
  Rat  3747 LTSLPSNKFPVSILQNGSKMTIEPPRGVKANLLKSYNS--LSD-DFLHSCQKVVEFKSLLLSLCL 3808

  Fly  3572 FHAVIQERRYFGPIGWNIPYEFNETDLRISLMQLRMFLNQYETVNYDALRYLTGECNYGGRVTDD 3636
            ||....|||.|||:|:||||||.:.||||.:.||:|||::||.:.|..|:|..||.|||||||||
  Rat  3809 FHGNALERRKFGPLGFNIPYEFTDGDLRICISQLKMFLDEYEDIPYKVLKYTAGEINYGGRVTDD 3873

  Fly  3637 WDRRTLKTILDKFYCPAVIDLETPYYLDETGLYY-VPVFKEVDLYLNFTRDLPQISAPAIFGFHA 3700
            ||||.:..||:.||.|||:..|..|  .::|:|: :|...:::.||::.:.||....|.|||.|.
  Rat  3874 WDRRCVMNILEDFYNPAVLSPEHRY--SKSGIYHQIPPTYDLNGYLSYIKSLPLNDMPEIFGLHD 3936

  Fly  3701 NADIMKDQKETDMLLSHTLLTQKLEKKQRVYVETLSRRFPENLSLPTYPTCPPFLALYQMSLKDT 3765
            ||:|...|.||..|                                       |.|:.|:..|.:
  Rat  3937 NANITFAQNETFAL---------------------------------------FGAILQLQPKSS 3962

  Fly  3766 SASSDDSGGSKALTPEEVVTNVATDILDKLPKLFDRDAALLKYPTLYHQSMNTVLVQEMVRFNVL 3830
            |     .||.   :.||:|.:||.|||.::||..|.:..:.|||.||.:|||||||||::|:|.|
  Rat  3963 S-----MGGQ---SREELVEDVAEDILVQVPKPVDLEEVVNKYPVLYEESMNTVLVQEVIRYNKL 4019

  Fly  3831 LNTIRTSLITLRKGIKGLVVMSPAVEAVYKSVLIAKIPAMWAGKSYPSLKPLGSYVTDFLRRLEF 3895
            |..|..:|..:.|.||||||||..:|.:..|:....:|.:|..|:|||||||.|::.|.|:||.|
  Rat  4020 LMVITQTLSDMLKAIKGLVVMSLELELMSTSLYNNAVPELWKSKAYPSLKPLASWIMDLLQRLNF 4084

  Fly  3896 LQHWFDHGAPSTFWLSGFFFTQAFLTGAQQNYARKYVISIDLLAFDYEVLTV---EEPQRQGLSG 3957
            |..|..:|.||.||:|||||.||||||..||:|||:|||||.:.||::||:.   |..:|     
  Rat  4085 LHSWIKNGIPSVFWISGFFFPQAFLTGTLQNFARKFVISIDTITFDFKVLSYASSEIAER----- 4144

  Fly  3958 PEDGVFVYGIFLEGARWDRTGKYLAESRPRELFDTMPLIWLKPLKRVDLPERHNYLCPMYKTAER 4022
            |..|.::||:||||||||.....||||||:||:..|.:|||.|:....:..:..||||:|||..|
  Rat  4145 PSTGCYIYGLFLEGARWDPFDFQLAESRPKELYTEMAVIWLLPVANRKVQNQDFYLCPIYKTLTR 4209

  Fly  4023 RGVLSTTGHSTNFVVAMLLLCNPNTPVSHWIIRGTALLCQLSF 4065
            .|.|||||||||:|:|:.:  ..|.|..|||.||.||:|.|.:
  Rat  4210 AGTLSTTGHSTNYVIAVEI--PSNQPQRHWIKRGVALICALDY 4250

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc36CNP_001369131.1 DHC_N2 746..1151 CDD:400618 170/405 (42%)
DYN1 <984..3651 CDD:227570 1254/2724 (46%)
AAA_6 1281..1607 CDD:403853 211/325 (65%)
AAA_8 2299..2561 CDD:403858 123/272 (45%)
AAA_9 2950..3165 CDD:403859 117/215 (54%)
Dynein_C 3779..4061 CDD:408026 146/284 (51%)
Dnah1NP_001028827.2 DHC_N2 998..1401 CDD:400618 170/406 (42%)
DYN1 <1237..3883 CDD:227570 1251/2719 (46%)
AAA_6 1528..1854 CDD:403853 211/325 (65%)
Dynein_C 3944..4246 CDD:408026 157/355 (44%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG56321
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000321
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
65.720

Return to query results.
Submit another query.