DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc36C and Dnah11

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001369131.1 Gene:Dhc36C / 35061 FlyBaseID:FBgn0013810 Length:4065 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934019.1 Gene:Dnah11 / 117253 RGDID:621088 Length:4514 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4152 Identity:1296/4152 - (31%)
Similarity:2067/4152 - (49%) Gaps:562/4152 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   133 DPELAAQCAVPFPDQEEREILRYYYYI----KHGIDTIHVSPLSKK--ILKRITDLVPPLLYKWQ 191
            ||:|.|             :||...|:    |..|....:....||  |||.|.:|  .||.:..
  Rat   702 DPKLVA-------------VLREVKYLLMLKKSNIPDSALGIFQKKNIILKHIGNL--ELLVQGY 751

  Fly   192 TALNENIAEVRADYVFAMKK-AVVDFVLRHTVLDRLT--------KEGVGGKYDTAERREVQSMT 247
            ..|.:.:.||  :|....|: ..:|..|| .....||        .|.|.......|||..|:.:
  Rat   752 NKLKQTLLEV--EYPLIEKELGAIDEQLR-VAATWLTWQDDFWVYMEKVQVATAELERRVSQTQS 813

  Fly   248 NFWRYRYDENRNVLMKTLFCIHRSVASILELWSMKYKDKSLIDSKELAK-----VESPFSLFTFV 307
            |.                    :::...::.|:    :..|:..:|..:     ::....||...
  Rat   814 NV--------------------QTIQQTMQAWA----EWPLLPRRETRREAALTLDDKGDLFAKK 854

  Fly   308 YLCGSHIDNGKTLLEESWYGEIHS------SLLKASKRGQLPDIRRFTLVKRFFNCVAALMTQQL 366
            |          .|:.|..| :||:      .|.:|.     |.:..:.:...|           :
  Rat   855 Y----------KLIREDGY-KIHNLVEENRKLFRAD-----PSLDSWKIYVEF-----------I 892

  Fly   367 EDICIRSLKEYADFICDYGHSN--------PGFEISVMLADEDTIQFNPSFSKVQSE-LLRVIDS 422
            :||.:....:......|:...|        |.|:..::|...: |.|.|...:...: ...::::
  Rat   893 DDIVVEGFFQTILHDLDFFLRNTEKQLKPAPFFQAQMLLMPPE-IVFKPPLEREAGDGFYNLVEA 956

  Fly   423 IM-----LSIQM--------LPRIESKLYTDLIVSKKIFLTPTVPESIVQETKNRICAMLE---E 471
            ::     :|.||        :|..::.:...|.:::           :.||..||:..:::   |
  Rat   957 MLCGSFKVSAQMGRVAAHLDIPDYQNDMDNMLGLAE-----------VRQEIMNRVADVIDKVLE 1010

  Fly   472 QRIGPEL--------RLQDFDPFIDLINGSDAERV----GNFMESDATFEQYADMVYEYKEKEDR 524
            .|...|.        |::....|:...:...:|.:    |..:....|.||:.:.:..|:....:
  Rat  1011 FRSSLETYSYLWVDDRVEILRQFLLYGHAVPSEEIDAPAGEDILQSPTLEQFKEQIDIYEALYVQ 1075

  Fly   525 IAK-------EVWAVIRMGFYEFHRDKFITHLESLCRQLQLDLLARMVTDQQARITRLGKEYDAI 582
            ::|       ..|..|.|..::.   ..:..::......|..|| |.|.|..:.:....|:.:|.
  Rat  1076 MSKFDDFRVFNSWFKIDMRPFKL---SMLNVIKKWSWMFQEHLL-RFVVDSLSELQGFIKQTNAG 1136

  Fly   583 AKKALTVPK--DTAELMQLKAYV--VHAEENLVPEMEARLKVNMSEILWL-------MDHTLYSP 636
            .::.   |.  |...|:.:..::  |.:.:....|:...||    |.:.|       |...:|:.
  Rat  1137 LQRQ---PHEGDHDGLVDIMGHLLAVRSRQRATDELFEPLK----ETIMLLESYGQKMPEQVYAQ 1194

  Fly   637 LEIKNNSNSFQWYLKLPSIFEQHR---AIIAEKVIEYQE----LLKKRIELFRRELQNYYEQVQT 694
            ||            :||..:|..:   |::..:|...|.    ||:|:..||..:...:.|:.::
  Rat  1195 LE------------ELPERWETTKKIAAVVRHEVSPLQNAEVTLLRKKCILFDEKQAEFRERFRS 1247

  Fly   695 YDTWGDIKQLSRYKKRAGVLD---QRLVQAMETIDQINEEETSYGWDLSQYPMRKKAHDQLKPYK 756
            |...| .|..:.|    .|||   |.|....|.:.|:......:...|.:|...|:...:::..|
  Rat  1248 YAPLG-FKAENPY----SVLDKANQELEALEEEVVQMQNCARLFEVVLPEYKQMKQCRREVRLLK 1307

  Fly   757 TLFDAGQDFMDKWDLWMHSQVGSFDPDEIDGDVSNFYRIIQKLDK--QMGDHPITMQ-LIQDVKA 818
            .|:|.........|.|..::....:.:::|.::..|.:.|..|||  ::.|....:: .::|:..
  Rat  1308 ELWDIIVYVRRSIDNWTETRWRQVNMEQMDLELRRFAKEIWSLDKAVRVWDAYSGLEGTVKDMTT 1372

  Fly   819 QIEAFREHMPIINTLGNPGMKARHWELVSEIIGFPIKVSPELTLEKIIEYQLDEYVPKFEAISES 883
            .:.|..|       |.||.::.|||:.::..||....::...||..::..||.:.......|.:.
  Rat  1373 SLRAVAE-------LQNPALRDRHWQQLTNAIGVRFSINDSTTLADLLAVQLHQVEEDVRDIVDK 1430

  Fly   884 ATKENNLERAMAKMVNEWEGVEFSISPYRDSGTFKLAAVDDIQILLDDQIIKT------------ 936
            |.||...|:.:..:.:.||.:|||...:..:||..|.:        |:|:.:|            
  Rat  1431 AVKELGTEKVITDVSHTWEALEFSYEVHHRTGTPLLKS--------DEQLFETLEHNQSFLLGLG 1487

  Fly   937 -----------------------QTMKSSPYIKPFEADIIKWEAKLMLLQEILDEWLRVQATWMY 978
                                   ||:..|.|::.|...::.|:.||.:...::..|::||.||.:
  Rat  1488 TSWLATEPLGSAYSHAGILQVQLQTLLQSKYVEYFIDQVLSWQNKLNVADAVIFTWMQVQRTWSH 1552

  Fly   979 LEPIF-SSPDIQQQMPEEGRRFSAVDKIWKELMKQVSQDPKVMVVVQIDKMNDKLKKAYSLLEVI 1042
            ||.|| .|.||:.|:.|:.:||..||..:||||.:.::...|:.......:.:|||.....|.:.
  Rat  1553 LESIFVCSEDIRIQLVEDAQRFDEVDAEFKELMFKTAKIKNVLEATCRPHLYEKLKDFQHRLSLC 1617

  Fly  1043 QKGLNAYLEKKRLYFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQIHLKKCFEGIATLNFTEELDVT--- 1104
            :|.|..|||.||:.|.||:|:|:.:||::||:...|.:|..||.|.|:.|:.|.|.:..:|:   
  Rat  1618 EKALAEYLETKRVTFSRFYFISSADLLDLLSKGAQPKQVTRHLVKLFDSISDLQFEDNPEVSTCK 1682

  Fly  1105 --AMRSSEREEVTLVDVISTSKARGQVEKWLLELEIDMKKSVHHKVSEAFYSYLKMLRHVWVLTW 1167
              .|.|.|:|.|:..   :..:..|.||.|||:||..||::|...::||..:|.:..|.:|:..:
  Rat  1683 AVGMFSKEKEYVSFQ---AGCECIGHVESWLLQLEQTMKETVRLAIAEAIAAYEEKPRELWIFDF 1744

  Fly  1168 PGQCVQSISLTYWTLEITECFES-EEPKENLAK-YLQKCVLQINKIVDLVRGDLNTQNRITLGAL 1230
            |.|...:.|..:||.::...|.. ||..|...| :.:|.:.|:|.::.|:.|:|:..:|..:..:
  Rat  1745 PAQVALTGSQIWWTTDVGIAFSRLEEGYETALKDFHKKQISQLNTLITLLLGELSPGDRQKVMTI 1809

  Fly  1231 VVLDVHARDVLAEIVANQVEDLQDFQWLCQLRYYWEDN--NLDTRMINCSLPYGYEYLGNTPRLV 1293
            ..:|||||||:|::::.:|...:.|.||.|||:.||::  :....:.:....|.||||||:||||
  Rat  1810 CTIDVHARDVVAKLISQKVVSPRAFTWLSQLRHEWEESRKHCIVNICDAHFQYCYEYLGNSPRLV 1874

  Fly  1294 VTPLTDRCYRTLFAALNLHLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFF 1358
            :||||||||.||..:|:|.:.|||.||||||||||||||.:|:.....|||||:.:||.::|..:
  Rat  1875 ITPLTDRCYITLTQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYRSIGNIY 1939

  Fly  1359 KGLASCGAWSCFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTIQRGINSGSPTLVFEGTTLTLDPTCAVFITMNP 1423
            |||...|||.||||||||.:|||||||.|:..|...|.|.....||.|.|:.|.|:..:|||:||
  Rat  1940 KGLVQTGAWGCFDEFNRIAVEVLSVVAVQVKMIHDAIRSRRRRFVFLGETIPLKPSVGIFITLNP 2004

  Fly  1424 GYAGRSELPDNLKALFRSVAMMVPDYALISEIELYSYGFLTAKPLSVKIVATYRLCSEQLSTQCH 1488
            |||||:|||:|||||||..||:.||..||.||.|.:.||:.|:.|:.|.::.|.||.|.||.|.|
  Rat  2005 GYAGRTELPENLKALFRPCAMVAPDTELICEIMLVAEGFVDARSLARKFISLYTLCDELLSKQDH 2069

  Fly  1489 YDYGMRAVKSVLKAAGALKLRYRDENEDILVLRSIKDVNLPKFLNQDIPLFQGITSDLFPGTVLP 1553
            ||:|:||:||||..||:||...::..||.:::|:::|.|:||.:..|:|:|.|:.|||||...:|
  Rat  2070 YDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDKNRPEDQVLMRALRDFNMPKIVTDDVPVFLGLVSDLFPALDVP 2134

  Fly  1554 EADYVLFNKCTQMACERQNKQCT---------PFVLEKVQQLYEMIVVRHGLMLVGYPFGGKTTT 1609
            ......|        |:..||.|         .|:| ||.||.|::.|||.:.:||....||:..
  Rat  2135 RQRKPHF--------EQMVKQSTLELRLQPEESFIL-KVVQLEELLAVRHSIFVVGNAGTGKSKI 2190

  Fly  1610 YRVLAEALECMEKTDGSENKAIYTVINPKAITMGQLYGQFDAVSHEWSDGILAVNYRIFA--ISD 1672
            .|.|......|::      |.::..:||||:|..:|:|.....:.||.||:|:...|..|  ..|
  Rat  2191 LRTLNRTYVNMKQ------KPVWNDLNPKAVTTDELFGFIHHATREWKDGLLSSILREQANLTHD 2249

  Fly  1673 SPDRKWLIFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQLSNTTNLVFEPMDLEVASPATVSRC 1737
            .|  .|::.||.:|.:|||::|||:||||.|.|.|.|.:.|:.:..|:||...|:.|:||||||.
  Rat  2250 GP--TWIVLDGDIDPLWIESLNTVMDDNKVLTLASNERVALTPSMRLLFETHHLQTATPATVSRA 2312

  Fly  1738 GMIYLEPSSLGWEPLVASWKNTLPAAFHTVSKQLISMLISRFCPILLFILRKSLKEIAPTSDANL 1802
            |::|:.|..|||.|.||||   :....|...|..:::|..::.|:.|..||.|.|.|....:::|
  Rat  2313 GILYVNPQDLGWNPYVASW---IDRRRHQSEKANLTILFDKYIPVCLEKLRTSFKAITSVPESSL 2374

  Fly  1803 MVSLMNFFECFI------DDFRDEKYVANVSDLDFRAQTEGIFLFSCIWSLGGSLDADSREKFNI 1861
            :.::....||.:      .|...|.|             |..|:|:|:|:.||:|..|....:..
  Rat  2375 VQTICTLLECLLTPENIPSDSPKETY-------------EVYFVFACVWTFGGTLLRDQLSDYQA 2426

  Fly  1862 IFRALMEKTFPQSLYDTYGVPEDLYVESLAKPFIFPIPKQGSVFDYRYIKEGKGKWKPWQDDVNS 1926
            .|.....|                  |..|..|    |.||::||| |:.....|:.||.|.|..
  Rat  2427 DFSRWWHK------------------EMKAVKF----PSQGTIFDY-YLDHKTKKFLPWTDKVPQ 2468

  Fly  1927 APPIPRDIPVNQIIIQTNESVRIGAVLDLLNRHGKPIMLVGPTGTGKSVYVI--------DYMLK 1983
            . .:..|.|:..:::.|.|:.|:....:||...|||:||||..|.||:|::.        ||::.
  Rat  2469 F-TMDADAPLKTVLVHTPETTRLRYFTELLLNKGKPLMLVGNAGVGKTVFLSDTLASISEDYIVS 2532

  Fly  1984 KMDLSFYKPLLISFSAQTSANQTQDIIMSKLDKRRKGVFGPPLNSRFVIFVDDVSMPLKENYGAQ 2048
            ::..::|          |::...|.|:...|:|:....:||..|.:.|.|:||::||..:.||..
  Rat  2533 RVPFNYY----------TTSADLQRILEKPLEKKAGRNYGPRGNKKLVYFIDDLNMPEVDLYGTV 2587

  Fly  2049 PPIELLRMMLDHMMWYDRKNIVPMKLIDLQMIVAMGPPSTGNTVTPRFQRFFNVISIDDFNNDIL 2113
            .|..|||..:|:..||||..::..::.:.|.:..|.|.:...||.||.:|.|.|::.:..:.|.|
  Rat  2588 QPHALLRQHIDYGHWYDRHKVMLKEIRNCQYVACMNPMAGSFTVDPRLKRHFTVLAFNFPSLDTL 2652

  Fly  2114 NTIFSKIVLWHLDTRGFSKEFDPCIDEIVGATLTIYNDAKLNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQG 2178
            .||:.:|..::|..:.|..........::.||:..:.....|.:||..|.||.|||||.|.:.||
  Rat  2653 TTIYGQIFSFYLQQQAFCPSVLRTGPSLIQATIAFHQTMAENFVPTAIKFHYNFNLRDLSNIFQG 2717

  Fly  2179 VLLSVPEATEDVNSMRRLWVHEVLRVYGDRLVEDADRSWLFENICSTVKSCFNTDPSRLFGRLVE 2243
            :|.:.||..:....:.|||:||..|||||||| ||:.|.||:.                  :::|
  Rat  2718 ILFASPECLKCPEDLARLWLHETSRVYGDRLV-DANDSDLFQR------------------KMLE 2763

  Fly  2244 ---------KDKSLQESDFRQLIYCDFTNPKADTKNYVEVQDLEELRRVVEAYLVEYNNMSKKPM 2299
                     ...:||:   :.|:||.|.:.:.| ..|..|:|.|.|:.|:...:..||.:..: |
  Rat  2764 AAHKYFKGADANTLQQ---QPLVYCHFASGRED-PCYEPVKDWEGLKAVLTEMMGNYNELHSE-M 2823

  Fly  2300 NLVLFRFAIEHLSRICRIIKQPRSHALLIGVGGSGRQSLTRLASHICDYELFQVEITRLYGPYEY 2364
            :||||..|::|:.||.||::.|:.||||:||||||:|||:|||::||..|:||:.:|..||..:.
  Rat  2824 HLVLFEDAMQHVCRISRILRTPQGHALLVGVGGSGKQSLSRLAAYICSLEVFQITLTEGYGTQDL 2888

  Fly  2365 HEDIKAILRKIGASEMHGVFLFTDVQIKDESFLEDISNLLNSGEVPNLFTNEEKIEVQEKMAQID 2429
            ..|:..:..:.||..|..|||.||..:.|||||..|::||.||::|.||::|:    .:|:....
  Rat  2889 RVDLANLYVRTGAKNMPTVFLLTDAHVLDESFLVLINDLLASGDIPGLFSDED----TDKIISGI 2949

  Fly  2430 KQRDKAVQTDGSPVALFNFFVTTCKDQLHIVLAMSPIGDALRNRIRKFPSIVNCCTIDWFQSWPE 2494
            :...:.:....|....:.||:...:.||.:|...||:|..||.|.||||::|||..||||.:||:
  Rat  2950 RNEVRGLGITDSRENCWAFFLARVRLQLKMVFCFSPVGHTLRVRARKFPALVNCTAIDWFHAWPQ 3014

  Fly  2495 DALLAVSTRFLASEDLTALE--RRTAIDMCMEF-HTSTQELSAKFFSRLHRYNYVTPTSYLELIQ 2556
            :||::||.||:  |::..:|  .:.:|.:.|.: |||.:|:||.::....||||.||.|:||.|.
  Rat  3015 EALVSVSRRFI--EEIEGIEPQHKDSISLFMAYVHTSVKEVSAWYYQNERRYNYTTPRSFLEQIS 3077

  Fly  2557 TFKALLSQKRNNITNNRNRYLTGISQLDIAAQQVAVMQEQLIALEPKL----KEASEIVAE---Q 2614
            .||:||.:||..:...:.....||.:|...|.||..::.:|.:.|.:|    ::|..::.:   |
  Rat  3078 LFKSLLKKKRGEVQRKKEHLGNGIQKLQTTASQVGNLKARLASQEAELQLRNQDAEALITKIGLQ 3142

  Fly  2615 VAKVTADSKLAE-EQREIVKLDESAAKEQAAVAQEIKDECDAKLGEALPILESALAALNTLTTAD 2678
            ..||:.:..:|: |:|::..:...|:::|.        ||:|.|.:|.|.|.:|.||||||...:
  Rat  3143 TEKVSREKAIADAEERKVAAIQTEASQKQR--------ECEADLLKAEPALVAATAALNTLNRVN 3199

  Fly  2679 IAVVKTMKSPPIGVRIVMEAVCILKDVKP-DKVPNPSG-------LGTVEDYWGPSKRVLSDMKF 2735
            :..:||..:||..|..|..||.:|  :.| .:||....       :|.|:|             |
  Rat  3200 LTELKTFPNPPNAVTNVTAAVMVL--LAPRGRVPKDRSWKAARIFMGKVDD-------------F 3249

  Fly  2736 LDSLLNFDKDNIPVEVMKKLAQRILSNEAFDPDKIKSASTACEGLCRWVIALTKYDVVAKIVAPK 2800
            |.:|:|:||::||...:|.:.::.|.:..|:|:.|::.|.|..|||.|||.:.|:..|...|.||
  Rat  3250 LQALINYDKEHIPENCLKVVNEQYLKDPEFNPNLIRTKSFAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPK 3314

  Fly  2801 KLALAEAEATYNAAMKTLNEKLAMLAKVEANL----AAIQKILDEQLRQYGILLAEHEACTKKLQ 2861
            :.|||:......||.:.|......|..::.||    |:.:|...|::|    ...|.....|.:.
  Rat  3315 RQALAQTNLDLAAATEKLEAVRRKLVDLDHNLRRLTASFEKATAEKVR----CQEEVNQTNKTID 3375

  Fly  2862 RAQELISGLGGERTRWSETAKMLQASFKSVTGDVLISSGVVSYLGPFTIDFRVDQIR-KW----- 2920
            .|..|:|.|..|:.||.::.|..:...|::.||||:::..|||:|.||..:|.:.:. ||     
  Rat  3376 LANRLVSELESEKIRWGQSIKSFETQEKTLCGDVLLTAAFVSYIGSFTRQYRQELVDCKWIPFLQ 3440

  Fly  2921 ------VTKCLNFGVTCTADFQLAVVLGEPVEIRFWNICGLPTDAFSIESAIMMKNARRWPLMID 2979
                  :.:.|:...|.|.|..:|.          ||..|||:|..|.|:|.::.:.:|||||||
  Rat  3441 QKVSIPIAEGLDMIATLTDDATIAT----------WNNQGLPSDRMSTENATILTHCKRWPLMID 3495

  Fly  2980 PQGQANKWIKNYEKNNKLCVIRLNQADYTRVMENAIQFGLPVLLENIGEELDPVLESVLQKTLFK 3044
            ||.|..||||| :....|.|..|.|..:...:|.|:.||..:|:||:.|.:||||..:|.:...|
  Rat  3496 PQQQGIKWIKN-KYGPDLKVTHLGQKGFLNAIEMALAFGDVILIENLKETVDPVLGPLLGRNTIK 3559

  Fly  3045 QGGALCIKLGDSVIEYNHSFRFYMTTKLRNPHYLPEVAVKVTLLNFMITTQGLQDQLLGITVARE 3109
            :|  ..|::||...|:|.:||..:.|||.||||.||:..:.|||||.:|..||:.|||...|:.|
  Rat  3560 KG--KYIRIGDKECEFNKNFRLILHTKLANPHYKPELQAQTTLLNFTVTEDGLEGQLLAEVVSVE 3622

  Fly  3110 RPDLEAEKNNLIVQGADNKRMLKETEDQILEVLSSAE-NILEDETAVQILSSAKALANDISEKQV 3173
            |||||..|..|.....|.|..|:..|:.:|..||:|| :.|:|...|:.|.:.||.|.:|..|.:
  Rat  3623 RPDLERLKLVLTKHQNDFKIELRHLEEDLLLRLSAAEGSFLDDTDLVERLETTKATAAEIEHKVI 3687

  Fly  3174 ITEATEKQIDIARLSYVPIAEHSTILFFTIVELANIDPMYQYSLVWFVNLYMSSIDNTEKVDDIA 3238
            .....|::|:..|..|.|:|..:::::|.|.:|..|:|:||:||..|..|:..:|:..:||:|..
  Rat  3688 EARENERKINETRECYRPVAARASLMYFVISDLRKINPVYQFSLKAFKTLFHRAIEQADKVEDTQ 3752

  Fly  3239 ARLLDLRNHFTYSLYVNICRSLFERDKLLFSLILNINMMKHDNRIDNAEWMFLLTGGVGLENPYK 3303
            .|:..|....||:.:::..::|||:|||.|...:...::...|.|...|..|||...|  |:.|.
  Rat  3753 ERICALMESVTYATFLHASQALFEKDKLTFLSQMAFQILLRRNEIHPLELDFLLRFTV--EHTYS 3815

  Fly  3304 NPTTWLGVQNWDELCRLTNLTNFKGLREDFNENSAQWKPFFDSKSPQDNKDIPKSWDNRVSVFQK 3368
            :|..:|..|:|..:..:..:..|:||..|...::.||:.:.:|:.|:..| :|:.|..: |:.||
  Rat  3816 SPVDFLTAQSWSAVKAVALMEEFRGLDRDVEGSAKQWRKWVESECPEKEK-LPQEWKKK-SLIQK 3878

  Fly  3369 LLLLRVFRPDKLVPAVLNFVSGELGERFVDPPQFDLMASFADSHCCVPLIFILTPGSDPTATLLK 3433
            |::||..|||::..|:.|||..:||.::|:..:.||..:|.:|....|:.|||:||.|....|..
  Rat  3879 LIILRAVRPDRMTYALRNFVEEKLGTKYVERTRLDLGKAFGESSPGTPVFFILSPGVDALKDLEV 3943

  Fly  3434 FAEDQGF--GTNRLFSLSLGQGQGPIAMKMIDEGVKMGNWVVLQNCHLAASFMPLLEKICENLLP 3496
            ..:..||  .:.:..::||||||..:|...:::....|:||.|||.||.|.::..|||:.|. ..
  Rat  3944 LGKRLGFTIDSGKFHNVSLGQGQELVAEMALEKAAIGGHWVFLQNVHLVAKWLGTLEKLLEK-FS 4007

  Fly  3497 DATHPDFRLWLT--SYPADHFPVV---VLQNGIKMTNEPPKGLRSNILRSMISDPISDPEWYESC 3556
            ..:|.|:|::|:  :.|:.|.||:   :|:|.||:|||||.|:.:|:..::.:   .|.:..|.|
  Rat  4008 QGSHRDYRVFLSAEAAPSQHEPVIPQGLLENSIKITNEPPTGMLANLHAALYN---FDQDTLEMC 4069

  Fly  3557 TQPRIFKQLIYSLCFFHAVIQERRYFGPIGWNIPYEFNETDLRISLMQLRMFLNQYETVNYDALR 3621
            ::.:.||.:::|||:||..:..|..|||.||:..|.|:..||.|....|...|.....|.::.||
  Rat  4070 SKDQEFKSILFSLCYFHGCVAGRLRFGPQGWSRSYPFSPGDLTICTNILYNHLEANPHVPWEDLR 4134

  Fly  3622 YLTGECNYGGRVTDDWDRRTLKTILDKFYCPAVIDLETPYYLDETGL---YYVPVFKEVDLYLNF 3683
            ||.||..|||.:||.|||:..:..|::|..|::|:       ||..|   :..|.:.:...|..:
  Rat  4135 YLFGEIIYGGHITDAWDRKLCRVYLEEFMNPSLIE-------DELMLAPGFAAPPYSDYSGYHQY 4192

  Fly  3684 TRDLPQISAPAIFGFHANADIMKDQKETDMLLSHTLLTQKLEKKQRVYVETLSRRFPENLSLPTY 3748
            ..|:....:||::|.|.||:|     |...:.|:.|....||.:.|                   
  Rat  4193 IEDMLPPESPALYGLHPNAEI-----ELLTVTSNMLFRTLLEMQPR------------------- 4233

  Fly  3749 PTCPPFLALYQMSLKDTSASSDDSGGSKALTPEEVVTNVATDILDKLPKLFDRDAALLKYPTLYH 3813
                            .:.|:::.|.|    .|:.|.|:..|||::||:.|:....:.|.|.  .
  Rat  4234 ----------------NAVSNEEQGQS----TEDKVKNILDDILERLPEEFNMAEIMQKNPN--R 4276

  Fly  3814 QSMNTVLVQEMVRFNVLLNTIRTSLITLRKGIKGLVVMSPAVEAVYKSVLIAKIPAMWAGKSYPS 3878
            .....|..||..|.||||..||.||..|..|:||.:.:||.||....::...::|..|...:|||
  Rat  4277 SPYILVCFQECERMNVLLREIRVSLQHLDLGLKGELTLSPDVETQLSALSYDRVPDTWNKLAYPS 4341

  Fly  3879 LKPLGSYVTDFLRRLEFLQHWF-DHGAPSTFWLSGFFFTQAFLTGAQQNYARKYVISIDLLAFDY 3942
            ...|..:..|.|.|...|..|. |...|:..||||.|..|:|||...|..|||....:|.:....
  Rat  4342 TYGLAQWFNDLLLRCRELDTWTQDLTLPAVVWLSGLFNPQSFLTAIMQTMARKNEWPLDRMCLTI 4406

  Fly  3943 EVLTVEEPQRQGLSGPEDGVFVYGIFLEGARWDRTGKYLAESRPRELFDTMPLIWLK--PLKRVD 4005
            :| |.:..:..| ..|.:|.:::|:.|||||||.....|.::|.:||..|||:|:.|  |..|.:
  Rat  4407 DV-TKKTKEDYG-HPPREGAYLHGLHLEGARWDIQSGALVDARLKELTSTMPVIFAKAIPADRQE 4469

  Fly  4006 LPERHNYLCPMYKTAERRGVLSTTGHSTNFVVAMLLLCNPNTPVSHWIIRGTALLCQ 4062
            :  :|.|.||:||| :.||:        .:|....|  .....::.|::.|.|||.:
  Rat  4470 V--KHAYECPVYKT-KARGL--------TYVWTFRL--RSKDRIAKWVLAGVALLLE 4513

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc36CNP_001369131.1 DHC_N2 746..1151 CDD:400618 121/448 (27%)
DYN1 <984..3651 CDD:227570 983/2752 (36%)
AAA_6 1281..1607 CDD:403853 170/334 (51%)
AAA_8 2299..2561 CDD:403858 113/264 (43%)
AAA_9 2950..3165 CDD:403859 94/215 (44%)
Dynein_C 3779..4061 CDD:408026 97/284 (34%)
Dnah11XP_038934019.1 DHC_N1 220..789 CDD:400611 28/104 (27%)
DHC_N2 1296..1722 CDD:400618 120/443 (27%)
DYN1 1550..4164 CDD:227570 988/2761 (36%)
AAA_6 1862..2188 CDD:403853 170/334 (51%)
MT 3095..3439 CDD:289543 110/370 (30%)
Dynein_C 4217..4512 CDD:408026 105/350 (30%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
21.810

Return to query results.
Submit another query.