DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc36C and Dnah6

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001369131.1 Gene:Dhc36C / 35061 FlyBaseID:FBgn0013810 Length:4065 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038964640.1 Gene:Dnah6 / 117250 RGDID:621797 Length:4156 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4319 Identity:1551/4319 - (35%)
Similarity:2331/4319 - (53%) Gaps:518/4319 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    27 EKSKMLYTRPKPDVLQSILQSKANPEYKSRRLWYELNMPECASSLLDGKMKSDLPDNI------- 84
            ||::   .|.:|..|:.:...|...::|.....||.|..:..|:   |.:|.. |..|       
  Rat    74 EKTR---KRQQPVKLEPLPVLKLYQDHKQPEYIYEQNRQQLMST---GILKPS-PSMIERSSIGS 131

  Fly    85 LCAKKQQKKRQKKRESGVAKANYMTM---RLEREHFRRKLVELILHMDDDQDPELAAQCAVPFPD 146
            |.|::..|::|..|.|    |:..::   :|.|....|:   .:..|.....|:..      |.|
  Rat   132 LEAQEALKRKQVLRPS----ADVFSLSPSKLPRTSIGRR---GLFGMRSSTYPKYT------FND 183

  Fly   147 QEE---------REILRYYYYIKHGIDTIHVSP-LSKKILKRITDLVPPLLYKWQTALNENIAEV 201
            :||         .:|::..:..:| :..:::.| :.|..::..|       |..:....|||.  
  Rat   184 REEVVKANIRDPLQIIKIVHENEH-LGFLYMIPAVPKSSIEYDT-------YNLKVVSYENIN-- 238

  Fly   202 RADYVFAMKKAVVDFVLRHTVLDRLTKEGVGGKYDTAERREVQSMTNFWRYRYDENRNVLMKTLF 266
            :.||....|.||.     |...|.:       :|...||         |...|..:|.:....:|
  Rat   239 KNDYYTISKDAVT-----HVFNDDI-------EYIETER---------WEQEYLYHRELTKIPIF 282

  Fly   267 CIHRSVASILELWSMKYKDKSLIDSKE----------------LAKVESPFSLFTFVYLCGSHID 315
            .:.|...: ..:|....:.|.:...::                |.|:.......:|:.||     
  Rat   283 SLFRKWKA-FSVWRKNVRSKKITGCRKALRKNLFIVNPYLRPALLKINDMCYQLSFMGLC----- 341

  Fly   316 NGKTLLEESWYGEIHSSLLKASKRGQLPDIRRFTLVKRFF----------NCVAALMTQQ-LEDI 369
                     :..:.|:..|:..|..|:..::..|....:|          :|..||.... :.|.
  Rat   342 ---------YIEKFHTYTLQEFKAAQVVRVQEVTERLEYFRFEAKDVVRKSCRFALRAAGFIPDD 397

  Fly   370 C-IRSLKEY-----ADFI-------------------------------C-----DYGHSNPGFE 392
            | :.:.::|     |.||                               |     ||...|....
  Rat   398 CEVETHEDYFKINIASFIDAPSDLPTYGESEKMTYTEQASKRHHCMRLTCFIRLNDYLIQNTLHV 462

  Fly   393 ISVMLAD------EDTIQFNPSFSKVQS-------ELLRVIDSIMLSIQ-----MLPRIESKLYT 439
            ::|..|.      .|.::..||...:|.       |::....:.|:..|     ::|    ...|
  Rat   463 LTVNTASSLLNYLSDKLKRTPSADVIQKWITEDKPEVIEKKGAPMMEKQEEDESLIP----MFLT 523

  Fly   440 DLIVS-KKIFLTPTVPE------SIVQETKNRICAM--------------------LEEQRIGPE 477
            :||:: :.:...|::.:      .|:...:|.:.::                    :||:..||.
  Rat   524 ELILTVQSLLFEPSLEDFLDGISGIINHFENTVLSVPNLVPDSYFNAFTSPFINKKVEEKTCGPG 588

  Fly   478 LRL----QDFDPFIDLINGSDAERVGNFMES----DATFEQYADMVYEYKE------KEDRIAKE 528
            ..|    :|...|:.:|. ...|.:.:..:|    .||||::.....|.:.      ||:....|
  Rat   589 PSLSAVFEDDRNFLTIIQ-QIKETIHSAFDSARLYAATFEKFQIFFKENESLDLEALKEEEPDVE 652

  Fly   529 VWAVIRMGFYEFHRDKFI---THLESL----CRQLQLDLL---ARMVTDQQARITRLG-KEYDAI 582
            .::.....:::.|:|...   |....|    .:||:..|:   .|.:......:.||. |:.|||
  Rat   653 FFSSQLEKYHKQHKDSVALKPTRNVGLLLIDTKQLKEKLIPSPLRCLEVLNLMLPRLSKKKVDAI 717

  Fly   583 AKKALT-------VPKDTAELMQLKAYVVHAEENL-VPEMEARLKVNMSEILWLMDHTLYSPLEI 639
            ..:|..       ||..|.|.:....::...:|.: ..|.|....|.|.::  :..:.:.:|.| 
  Rat   718 ISEAQDAEYKLEFVPTTTIEYVNSLVFLDEIQERIETLEEEGNTVVQMYKL--IEQYQVLTPPE- 779

  Fly   640 KNNSNSFQWYLKL-PSIFEQHRAIIAEKVIEYQELLKKRIEL-FRRELQNYYEQV---------- 692
                 .|..:..: |||.....||  :|.:..:|...|:..| ..|:|::...:|          
  Rat   780 -----DFAVFATMKPSITAVRNAI--DKSVGDRESSIKQFCLHLGRDLEDLNNEVNEVKLLAQDP 837

  Fly   693 QTYDTWGDIKQL-SRYKKRAGVLDQRLVQAMETIDQINEEETSYGWDLSQYPMRKKAHDQLKPYK 756
            |..|...|.::: :.......|||....:|.    |....:.::..::|::...::...:|:..:
  Rat   838 QILDISADPEKIKTMLSDLQSVLDDLQKRAF----QYKSYQKNFKVEVSKFDALEEVCAELRLKQ 898

  Fly   757 TLFDAGQDFMDKWDL----WMHSQVGSFDPDEIDGDVSNFYRIIQKLDKQMGDHPITMQLIQDVK 817
            .|:|:    :.:||.    |:.|:....||:.::|.|:.:.:.:.:|:|.:..:.:..||    |
  Rat   899 LLWDS----LSEWDKLQQEWLKSKFDCLDPEVLNGQVTKYAKFVTQLEKGLPPNSVVPQL----K 955

  Fly   818 AQIEAFREHMPIINTLGNPGMKARHWELVSEII-GFPIKVSPELTLEKIIEYQLDEYVPKFEAIS 881
            .::|..:|.:|:||.|.||.:|.|||..:.:.: ...:.:...||||::.|..:.::..:.:.||
  Rat   956 QKVERMKEKLPVINDLRNPTLKPRHWSAIEQTVDALLVDIEIPLTLERLSELHVFDFAQEIQDIS 1020

  Fly   882 ESATKENNLERAMAKMVNEWEGVEFSISPYRDS-GTFKLAAVDDIQILLDDQIIKTQTMKSSPYI 945
            ..|:.|..||..:.|:.:.|:..||.|.|:||| ..|.|...||||:||||..|...|:.||.|:
  Rat  1021 GQASGEAALEIILKKVEDSWKTTEFVILPHRDSKDVFILGGTDDIQVLLDDSTINVATIASSRYV 1085

  Fly   946 KPFEADIIKWEAKLMLLQEILDEWLRVQATWMYLEPIFSSPDIQQQMPEEGRRFSAVDKIWKELM 1010
            .|.:..:..|:.:|.|..:.|:|||..|..|:|||.||::||||:|:|.|.:.|..|||.|||:|
  Rat  1086 GPLKTRVDDWQKQLSLFNQTLEEWLNCQRNWLYLESIFNAPDIQRQLPAEAKMFLQVDKSWKEIM 1150

  Fly  1011 KQVSQDPKVMVVVQIDKMNDKLKKAYSLLEVIQKGLNAYLEKKRLYFPRFFFLSNDELLEILSET 1075
            ::|::.|..:.......:.:..:...:||:.|||.|.||||.||:.||||:|||||||||||::|
  Rat  1151 RKVNRLPNALRAATQPGLLETFQNNNALLDQIQKCLEAYLESKRVIFPRFYFLSNDELLEILAQT 1215

  Fly  1076 KDPTRVQIHLKKCFEGIATLNFT----------------EEL---DVTAMRSSEREEVTLVDVIS 1121
            ::|..||.||:|||:.|:.|.|.                |::   |:.||.|.|.|.|.|...: 
  Rat  1216 RNPQAVQPHLRKCFDSISKLEFALMPPTEGKIPGIDTEPEKVFTNDILAMLSPEGERVGLGKGL- 1279

  Fly  1122 TSKARGQVEKWLLELEIDMKKSVHHKVSEAFYSYLKMLRHVWVLT-WPGQCVQSISLTYWTLEIT 1185
              ||||.||:||.::|..|..|:......|...|...||..||:. .|.|.:.:||...|..::|
  Rat  1280 --KARGNVEEWLGKVEEAMFSSLRRLCKAAIADYQGKLRTEWVIAGHPSQVILTISQIMWCRDLT 1342

  Fly  1186 ECFESEEPK-ENLAKYLQKCVLQINKIVDLVRGDLNTQNRITLGALVVLDVHARDVLAEIVANQV 1249
            |..|.|:.. |.|.|:.|....::|.:..:|||.|...:|..:.||:.:||||||:::|:|.::|
  Rat  1343 ESLECEDNHLEALEKFEQVNFERLNALAAIVRGSLPKLHRNIITALITIDVHARDIVSELVQSKV 1407

  Fly  1250 EDLQDFQWLCQLRYYWEDNNLD---TRMINCSLPYGYEYLGNTPRLVVTPLTDRCYRTLFAALNL 1311
            :..:.|.|..|||||| |.:||   .||......|.|||||..||||:||||||||..|..||.|
  Rat  1408 DSAESFDWQRQLRYYW-DVDLDNCVARMALSQYTYAYEYLGACPRLVITPLTDRCYLCLMGALQL 1471

  Fly  1312 HLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFFKGLASCGAWSCFDEFNRI 1376
            .|||||.|||||||||||||||||:|.|||||||||||||..:|:||.|||..|||.||||||||
  Rat  1472 DLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALAIQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQSGAWCCFDEFNRI 1536

  Fly  1377 DLEVLSVVAQQILTIQRGINSGSPTLVFEGTTLTLDPTCAVFITMNPGYAGRSELPDNLKALFRS 1441
            |:|||||:|||::||:....:.....:|||..:.|..|||.|||||||||||:|||||||||||.
  Rat  1537 DIEVLSVIAQQLITIRNAKAAKLSRFMFEGREIKLVMTCAAFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRP 1601

  Fly  1442 VAMMVPDYALISEIELYSYGFLTAKPLSVKIVATYRLCSEQLSTQCHYDYGMRAVKSVLKAAGAL 1506
            :|||||:||||:|:.|||.||.::|.|:.|:...|:|||||||.|.|||:|||||||||..||:|
  Rat  1602 MAMMVPNYALIAEVILYSEGFESSKILARKMTQMYKLCSEQLSQQDHYDFGMRAVKSVLVMAGSL 1666

  Fly  1507 KLRYRDENEDILVLRSIKDVNLPKFLNQDIPLFQGITSDLFPGTVLPEADYVLFNKCTQMACERQ 1571
            |....|.:||::::|:::|.||||||..|..||.||.||||||..:||.||.:.:.........|
  Rat  1667 KRENPDLSEDVVLIRALRDSNLPKFLTDDALLFSGIISDLFPGVQIPEHDYGILHSTIVDVMISQ 1731

  Fly  1572 NKQCTPFVLEKVQQLYEMIVVRHGLMLVGYPFGGKTTTYRVLAEALECMEK--TDGSENKAIYT- 1633
            |.|....:::||.||||.::||||:||||...|||||.|:||||.|..:||  |.....:.:.| 
  Rat  1732 NLQPEICMVKKVIQLYETMLVRHGVMLVGPTGGGKTTVYQVLAETLGNLEKLNTGNPFYQPVKTF 1796

  Fly  1634 VINPKAITMGQLYGQFDAVSHEWSDGILAVNYRIFAISDSPDRKWLIFDGPVDAIWIENMNTVLD 1698
            |:|||:||||:|||:.:.|:.||.||::|::.|......|.|.||:|.||||||:||||||||||
  Rat  1797 VLNPKSITMGELYGEVNNVTLEWKDGLMALSVRAAVNDTSEDHKWIISDGPVDALWIENMNTVLD 1861

  Fly  1699 DNKKLCLMSGEIIQLSNTTNLVFEPMDLEVASPATVSRCGMIYLEPSSLGWEPLVASWKNTLPAA 1763
            |||.|||.:.|.|:|:...:::||..||:||||||||||||::::|..|.|.|.|.:|.:||...
  Rat  1862 DNKMLCLANSERIKLTPQVHMLFEVQDLKVASPATVSRCGMVFVDPEELKWMPYVKTWMSTLSKK 1926

  Fly  1764 FHTVSKQLISMLISRFCPILLFILRKSLKEIAPTSDANLMVSLMNFFECFIDDFRDEKYVANVSD 1828
            .....::.:..|.:|:....|..:.|...:..|..|.:.:.:|....|..:  ...:..:.::..
  Rat  1927 LSEEIREYLLNLFNRYVDDGLRFVNKKCTQAIPQVDISKVTTLCCLLESLL--LSKDGNILSLEQ 1989

  Fly  1829 LDFRAQTEGIFLFSCIWSLGGSLDADSREKFNIIFRALMEKTFPQSLYDTYGVPEDLYVESLAKP 1893
            :.........|:|..:|||||:|..:..:.|:...|...:.. |.:...:.|....::|:     
  Rat  1990 MKLNTVVCQTFVFCYLWSLGGNLTENHWDSFDTFIRTQFDDN-PDARLPSSGDLWSIHVD----- 2048

  Fly  1894 FIFPIPKQGSVFDYRYIKEGKGKWKPWQDDVNSAPPIPRDIPVNQIIIQTNESVRIGAVLD--LL 1956
                       ||.:       :..||:..:.:. ...|::|..::::.|.::||.|.:::  |.
  Rat  2049 -----------FDTK-------RLDPWERIIPTF-KYSREVPFFEMLVPTADTVRYGYLMEKLLA 2094

  Fly  1957 NRHGKPIMLVGPTGTGKSVYVIDYMLKKMDLSFYKPLLISFSAQTSANQTQDIIMSKLDKRRKGV 2021
            .||.  ::..|.||.||||.....:.:..:.:.|.|:.::||||||:.:||:||.|||:::||.:
  Rat  2095 VRHS--VLFTGTTGVGKSVIAKGLLNRIQESAGYVPVYLNFSAQTSSARTQEIIESKLERKRKNI 2157

  Fly  2022 FGPPLNSRFVIFVDDVSMPLKENYGAQPPIELLRMMLDHMMWYDRKNIVPMKLIDLQMIVAMGPP 2086
            .|.|.|.:.||||||::||..:.||:||||||||...|...:|||..:...::.|:.::.|..||
  Rat  2158 LGAPGNKQVVIFVDDLNMPRLDRYGSQPPIELLRQYQDFGGFYDRNKLFWKEIQDVTIVSACAPP 2222

  Fly  2087 STG-NTVTPRFQRFFNVISIDDFNNDILNTIFSKIVLWHLDTRGFSKEFDPCIDE----IVGATL 2146
            ..| |.|||||.|.|:::.:...:...|..||..|:      .||..:|...:.:    ||.|.:
  Rat  2223 GGGRNPVTPRFIRHFSMLCLPMPSEHSLKQIFQAIL------NGFLADFTEAVKQTSSNIVEAAV 2281

  Fly  2147 TIYNDAKLNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVLLSVPEATEDVNSMRRLWVHEVLRVYGDRLVE 2211
            .|||...::||||||||||:|||||.|:.:||:|...|....:...:.||:.||..||:.|||:.
  Rat  2282 EIYNRMSVDLLPTPAKSHYVFNLRDLSKCVQGILQCDPGTIREEMQIFRLFCHECQRVFHDRLIN 2346

  Fly  2212 DADRSWLFENICSTVKSCFNTDPSRLFGRLVEKDKSLQESDFRQLIYCDFTNPKADTKN--YVEV 2274
            :.|:.: |..|.:.:       .::.||..::.:..|.    :.:|:.||....||..:  |.::
  Rat  2347 NEDKHY-FHVILTEM-------ANKHFGIAIDLEYFLS----KPIIFGDFIKFGADKADRIYDDL 2399

  Fly  2275 QDLEELRRVVEAYLVEYNNMSKKPMNLVLFRFAIEHLSRICRIIKQPRSHALLIGVGGSGRQSLT 2339
            .|:|::..|::.||.:||..:.|.:.||.|:.||||:|||.|:|:|.|.:|||:||||:|:||||
  Rat  2400 PDIEKIENVLQDYLDDYNLTNPKEVKLVFFQDAIEHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTGKQSLT 2464

  Fly  2340 RLASHICDYELFQVEITRLYGPYEYHEDIKAILRKIGASEMHGVFLFTDVQIKDESFLEDISNLL 2404
            |||:|||.|:..|:|::|.|....:|||::.:.:..|..:.:.||||||.||..|.|||||:|:|
  Rat  2465 RLAAHICGYKCLQIELSRGYNYDSFHEDLRKLYKMAGVEDKNMVFLFTDTQIVVEEFLEDINNIL 2529

  Fly  2405 NSGEVPNLFTNEEKIEVQEKMAQIDKQRDKAVQTDGSPVALFNFFVTTCKDQLHIVLAMSPIGDA 2469
            |||||||||   ||.|:::.:|....:..:...::|:...:|.:|::..:.:|||||.|||:|:|
  Rat  2530 NSGEVPNLF---EKDELEQVLAATRPKAKEVGISEGNRDEVFQYFISRVRQKLHIVLCMSPVGEA 2591

  Fly  2470 LRNRIRKFPSIVNCCTIDWFQSWPEDALLAVSTRFLASEDLTALERRTAID-MCMEFHTSTQELS 2533
            .|:|.|.|||:|||||||||..||.:|||:||..|.:..|....|.:..:. ||:..|.|...::
  Rat  2592 FRSRCRMFPSLVNCCTIDWFVQWPREALLSVSKSFFSVVDTGNEELKEKLSLMCVNVHLSVSHMA 2656

  Fly  2534 AKFFSRLHRYNYVTPTSYLELIQTFKALLSQKRNNITNNRNRYLTGISQLDIAAQQVAVMQEQLI 2598
            .:::|.|.|..|.|||||||||..:..:|::||..:.:.|:|...|:::|......|..|:..|.
  Rat  2657 DRYYSELRRRYYTTPTSYLELINLYLTMLTEKRKQLVSARDRVTNGLTKLLETNILVDKMKLDLS 2721

  Fly  2599 ALEPKLKEASEIVAEQVAKVTADSKLAEEQREIVKLDESAAKEQAAVAQEIKDECDAKLGEALPI 2663
            ||||.|.:.|:.|...:.|:..|.:.|::.|.:|:.||:.||.:|...|.|.|:....|.||||.
  Rat  2722 ALEPVLFQKSQDVEALMEKLVVDQESADQVRNVVQEDEAIAKVKAEETQAIADDAQRDLEEALPA 2786

  Fly  2664 LESALAALNTLTTADIAVVKTMKSPPIGVRIVMEAVCILKDVKPDKVPNPSGLGTVEDYWGPSKR 2728
            ||:|..||::|..|||:.::....||..|..||||:.||.:.|||              |..:|:
  Rat  2787 LEAANKALDSLDKADISEIRVFTKPPDLVMTVMEAISILLNAKPD--------------WPTAKQ 2837

  Fly  2729 VLSDMKFLDSLLNFDKDNIPVEVMKKLAQRILSNEAFDPDKIKSASTACEGLCRWVIALTKYDVV 2793
            :|.|..||..||.:||:||..:::.|| ||.::|..|.|:|::..|.||:.:|.||.|:..|..|
  Rat  2838 LLGDSNFLRRLLEYDKENIKPQILSKL-QRYINNPDFVPEKVEKVSKACKSMCMWVRAMDLYSRV 2901

  Fly  2794 AKIVAPKKLALAEAEATYNAAMKTLNEKLAMLAKVEANLAAIQKILDEQLRQYGILLAEHEACTK 2858
            .|.|.||:..|..|:|..:|.:.||.||.|:|.:||..:.|:|:..|:.:.:.. .||:..|.||
  Rat  2902 VKEVEPKRQKLRAAQAELDATITTLKEKQALLKQVEEQIRALQEEYDKGVNEKE-SLAKTMALTK 2965

  Fly  2859 -KLQRAQELISGLGGERTRWSETAKMLQASFKSVTGDVLISSGVVSYLGPFTIDFRVDQIRKWVT 2922
             :|.||.:|.:.||.|:.||.|:.:..|....::.|:|.|::..|:|.|.||..:|...|..|:.
  Rat  2966 ARLVRAGKLTAALGDEQVRWEESIEKFQEEIANIVGNVFIAAACVAYYGAFTAQYRQLLIECWID 3030

  Fly  2923 KCLNFGVTCTADFQLAVVLGEPVEIRFWNICGLPTDAFSIESAIMMKNARRWPLMIDPQGQANKW 2987
            .||...:.....|.|...||:|.|||.||..|||.|..|.|:.|::...||||||||||.|||:|
  Rat  3031 SCLALDIPIDPSFSLINTLGDPYEIRQWNADGLPRDLISTENGILVTQGRRWPLMIDPQDQANRW 3095

  Fly  2988 IKNYEKNNKLCVIRLNQADYTRVMENAIQFGLPVLLENIGEELDPVLESVLQKTLFKQGGALCIK 3052
            |:|.|..:.|.||:|...::.|::||:|:.|||||||.:.|.|||.||.:|.|..|..||.|.|:
  Rat  3096 IRNKESKSGLKVIKLTDTNFLRILENSIRLGLPVLLEELREVLDPALEPILLKQTFMSGGRLLIR 3160

  Fly  3053 LGDSVIEYNHSFRFYMTTKLRNPHYLPEVAVKVTLLNFMITTQGLQDQLLGITVARERPDLEAEK 3117
            ||||.|:|:.|||||||||:.||||||||.:|||::||.:|..||:||||...|..|:|:||.::
  Rat  3161 LGDSDIDYDKSFRFYMTTKMPNPHYLPEVCIKVTIINFTVTKSGLEDQLLSDVVRLEKPELEGQR 3225

  Fly  3118 NNLIVQGADNKRMLKETEDQILEVLSSAE-NILEDETAVQILSSAKALANDISEKQVITEATEKQ 3181
            ..|||:...:|..||..||:||::|.::| |||::|..:..|..:|..:..|..:....|:||..
  Rat  3226 VQLIVRINSDKNQLKSIEDKILKLLFTSEGNILDNEELIDTLQDSKITSGAIKTRLKEAESTELM 3290

  Fly  3182 IDIARLSYVPIAEHSTILFFTIVELANIDPMYQYSLVWFVNLYMSSIDNTEKVDDIAARLLDLRN 3246
            |:|||..|.|:|...::::|.|..|:.|||||||||.:|..|:.::|:.:||.|.:..||..|..
  Rat  3291 INIARERYRPVATQGSVMYFVIASLSEIDPMYQYSLKYFKQLFNTTIETSEKSDSLQERLAILLQ 3355

  Fly  3247 HFTYSLYVNICRSLFERDKLLFSLILNINMMKHDNRIDNAEWMFLLTGGVGL--ENPYKNPTTWL 3309
            ....:.|.|:.|.|||:.||::|.:|.:::|:...::..|||.|.|.|..|:  |.|.|....||
  Rat  3356 QTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIYSFMLCVDIMRQQEQLTEAEWNFFLRGSAGMEKERPPKPEAPWL 3420

  Fly  3310 GVQNWDELCRLTNLTNFKGLREDFNENSAQWKPFFDSK--------------------SPQDNKD 3354
            .:|.|...|.|                 .:|.|.|:..                    :||..:.
  Rat  3421 PIQMWFSCCDL-----------------EEWFPIFEGLTRHILLHPISISLGSFETYINPQSWEG 3468

  Fly  3355 IPKS---------WDNRVSVFQKLLLLRVFRPDKLVPAVLNFVSGELGERFVDPPQFDLMASFAD 3410
            .||.         |.:..|.|.||:|::..:.:|:|.|:.:||...||::|::.|..||...:.|
  Rat  3469 YPKQRHEEEKEHVWGSNFSSFHKLILVKCCKEEKVVFALTDFVIENLGKQFIETPPVDLATLYQD 3533

  Fly  3411 SHCCVPLIFILTPGSDPTATLLKFAEDQGFGTNRLFSLSLGQGQGPIAMKMIDEGVKMGNWVVLQ 3475
            .....||:|||:.||||.....:||.:.|: ..|:.|:||||||||||.|||.:..|.||||.||
  Rat  3534 MSSSTPLVFILSTGSDPMGAFQRFARESGY-AERVQSISLGQGQGPIAEKMIKDATKSGNWVFLQ 3597

  Fly  3476 NCHLAASFMPLLEKICENLL-PDATHPD-FRLWLTSYPADHFPVVVLQNGIKMTNEPPKGLRSNI 3538
            |||||.|:|..:|::.:... |:.:..| |||:|:|.|...|||.||||.:|:|||||||||:||
  Rat  3598 NCHLAVSWMLAMEELIKTFTDPNQSIKDTFRLFLSSMPCSTFPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRANI 3662

  Fly  3539 LRSMISDPISDPEWYESCTQPRIFKQLIYSLCFFHAVIQERRYFGPIGWNIPYEFNETDLRISLM 3603
            .|:...   ..|.::|.......:::||:.:|||||:||||:.|||:||||.||||::|...:|:
  Rat  3663 RRAFTE---MTPSFFEENILGMKWRKLIFGICFFHAIIQERKKFGPLGWNICYEFNDSDRECALL 3724

  Fly  3604 QLRMFLNQYETVNYDALRYLTGECNYGGRVTDDWDRRTLKTILDKFYCPAVIDLETPYYLDETGL 3668
            .|.::.::.: :.:|||.|:|||..|||||||.||:|.|:|:|.:|:.|..  ||..|...|:|:
  Rat  3725 NLNLYCHEGK-IPWDALIYITGEITYGGRVTDTWDQRCLRTVLKRFFSPET--LEDEYTYSESGI 3786

  Fly  3669 YYVPVFKEVDLYLNFTRDLPQISAPAIFGFHANADIMKDQKETDMLLSHTLLTQKLEKKQRVYVE 3733
            |:.|:...:..:.::..|||.|..|.|||.|.||:::...|||     :||:|..||.:.|    
  Rat  3787 YFAPLADSLQEFKDYIEDLPLIDDPEIFGMHENANLVFQYKET-----NTLITTILEVQPR---- 3842

  Fly  3734 TLSRRFPENLSLPTYPTCPPFLALYQMSLKDTSASSDDSGGSKALTPEEVVTNVATDILDKLPKL 3798
                                                 .|.|.:..:.:|:|..:...|..::|:.
  Rat  3843 -------------------------------------SSSGGEGKSNDEIVQELVASIRTRVPES 3870

  Fly  3799 FDRDAA----LLKYPTLYHQSMNTVLVQEMVRFNVLLNTIRTSLITLRKGIKGLVVMSPAVEAVY 3859
            ...:.|    .:|.|.....|:.|||.||:.|||.||..|..||.||.|.|.||||||..:|.||
  Rat  3871 LQMEGASETLFVKDPQGRLNSLTTVLGQEVDRFNNLLKLIHISLETLNKAIAGLVVMSEEMEKVY 3935

  Fly  3860 KSVLIAKIPAMWAGKSYPSLKPLGSYVTDFLRRLEFLQHWFDHGAPSTFWLSGFFFTQAFLTGAQ 3924
            :|.|..::|::|:..:|||||||||:|.|.:.|..|:..|...|.|.:||:|||||.|.||||..
  Rat  3936 QSFLNNQVPSLWSNTAYPSLKPLGSWVKDLILRTAFVDLWLKRGQPKSFWISGFFFPQGFLTGTL 4000

  Fly  3925 QNYARKYVISIDLLAFDYEVLTV------------------EEPQRQGLSGPEDGVFVYGIFLEG 3971
            ||:||||.:.||.|:|.|.::.|                  |.|..:.|..|||||.|:|:|::.
  Rat  4001 QNHARKYNLPIDELSFKYNMIPVYRDQALVIEAAKDIQFGTELPMDKELPTPEDGVLVHGMFMDA 4065

  Fly  3972 ARWDRTGKYLAESRPRELFDTMPLIWLKPLKRVDLPERHNYLCPMYKTAERRGVLSTTGHSTNFV 4036
            :|||.....:.::.|.::...:|::..:|.:..: |.:..|..|:|||..|.|.|||||||||||
  Rat  4066 SRWDDKDMIIEDALPGQMNPMLPVVHFEPQQNYE-PIQTLYHSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFV 4129

  Fly  4037 VAMLLLCNPN-TPVSHWIIRGTALLCQLS 4064
            |.:||   |: .|..:||.:|:|||||||
  Rat  4130 VTVLL---PSKRPSDYWIAKGSALLCQLS 4155

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc36CNP_001369131.1 DHC_N2 746..1151 CDD:400618 154/429 (36%)
DYN1 <984..3651 CDD:227570 1151/2738 (42%)
AAA_6 1281..1607 CDD:403853 203/325 (62%)
AAA_8 2299..2561 CDD:403858 125/262 (48%)
AAA_9 2950..3165 CDD:403859 112/215 (52%)
Dynein_C 3779..4061 CDD:408026 124/304 (41%)
Dnah6XP_038964640.1 DHC_N2 887..1307 CDD:400618 154/430 (36%)
DYN1 <1127..3774 CDD:227570 1151/2738 (42%)
AAA_6 1441..1767 CDD:403853 203/325 (62%)
Dynein_C 3827..4152 CDD:408026 135/374 (36%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG56321
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000321
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
54.820

Return to query results.
Submit another query.