Protein Alignment Mhc and Myo18b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523587.4
• Gene: Mhc / 35007
• FlyBaseID: FBgn0264695
• Length: 1962
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_083177.2
• Gene: Myo18b / 74376
• MGIID: 1921626
• Length: 2605
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 1946
• Identity: 449/1946 - (23%)
• Similarity: 844/1946 - (43%)
• Gaps: 440/1946 - (22%)

  Fly    21 LEQRRI-----------DQSKPYDSK----KSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETR 70
            :|:::|           |..:.|:.:    :..|:. :|:|:.|..:  .|.|..:.....|..|
Mouse   524 MEEKQILQDPDRGGQSGDSDQAYEDRWYEAQKVWLV-QKDGFTLATV--LKPDEGTADPPAGRVR 585

  Fly    71 ----------DLKKDLLQQVNPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVA 125
                      ::.::.:...||.:.::|||:::|..:|::||::.|.|||..:|.||.||...:.
Mouse   586 LCIDADRTVIEVDEEQVHPANPSELDQAEDLASLVSVNESSVMNTLLQRYRAQLPYTCSGPDLIT 650

  Fly   126 INPYKRYPVYTNRCAKMYRGKRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTK 190
            :.|   .........|:.|| |::.:|.|:.:::..||..:|:...:||::..|.||||||...:
Mouse   651 LQP---QTTTVPSSGKVPRG-RQDGLPAHVTSLAQRAYWALLSQRRDQSIVALGRSGAGKTTCCE 711

  Fly   191 KVIAYFATVGASKKTDEAAKSKGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTG 255
            :|:.:.  ||.:...|    .:.|:| ::..|..||.|||...|..:..::||...:.:.|..||
Mouse   712 QVLEHL--VGMAGSVD----GRVSVE-KLRATFTVLRAFGCVSTGHSRRATRFAMVMSLDFNATG 769

  Fly   256 KLAGADIETYLLEKARVISQQSLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQ----GK 316
            ::..|.::|.|||.:||..|...|.::.:|.|:::|     .|:.|.|:  .:.|.:::    |.
Mouse   770 RVTAAQLQTVLLENSRVARQPQGEGNFEVFSQLLAG-----MDVDLRTE--LNLHQMAESSAFGM 827

  Fly   317 VTVASIDD----AEEFSLTDQAFDILGFTKQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGE 377
            ...:..:|    |..||....|.::||.::.|::.::|:.||:.|:|.....:.||::...   .
Mouse   828 GLWSKPEDKQKAATAFSQLRGAMELLGISEGEQQAIWRVLAAIYHLGAAGACKVGRKQFMR---F 889

  Fly   378 EEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLKPRIKVGNEFVTQGRNVQQVTNS-------------IGALCKG 429
            |.....::..|||..||.....|..::...|.:|.|...|.:.::             :..:..|
Mouse   890 EWANHAAEALGCDYEELNTATFKHHLRQIIEQMTSGPQRQGLQDNEACSGLKMTGVECVEGMASG 954

  Fly   430 VFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFEIFEYNG------FEQLCINFTNEKLQQFF 488
            ::..||..:|...|.:..:.......|.|:|..||:...:.|      ||:||.|:..|:||..|
Mouse   955 LYQELFVAVVSLINRSFSSHHLSMASIMVVDTPGFQNPRHQGKDRAATFEELCYNYAQERLQLLF 1019

  Fly   489 NHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQ--------LCIDL------------IEKPMGILSIL 533
            .|..||...|.|:.|||...|     ||.        ..:|.            .|...|:..:|
Mouse  1020 YHRTFVSTLERYKEEGIPVPF-----DLPESSPGTTVAVVDQNPSQVHLPAGRGAEDAGGLFWVL 1079

  Fly   534 EEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPK------PP--KPGQQAAHFAIAHYAG--CVSY 588
            :||.....::|.|..|:|       .|.|:|.|      ||  :..:|.....:.|..|  .|.|
Mouse  1080 DEEVRVQGSSDSTVLERL-------RAAFEKKKEAGAEEPPSMRTCEQPLQCELFHQLGRDPVRY 1137

  Fly   589 NITGWLEKNKDPL----NDTVVDQFKKSQNKLLIEIFAD-------HAGQSGGGEQAKGGRGKKG 642
            ::||||.:.|..|    ...::.|.|:.:.:.|.:..|.       .||..|..:||........
Mouse  1138 DLTGWLRRAKPNLAALEAPQILQQSKREELQSLFQARAKLPPVCRAVAGLEGTSQQALHRSRVVR 1202

  Fly   643 GGFATVSSAYKE---------QLNSLMTTLRSTQPHFVRCIIPNEMK------------------ 680
            ..||:..:|.|.         |:::|::.||.::.||:.|::|..::
Mouse  1203 RAFASSLAAVKRKAPCAQIKLQMDALISLLRRSRLHFIHCLVPTTVESKAGQRTPSPSQPSGDQG 1267

  Fly   681 ---QPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYKIMCPKLLQGVE------K 736
               :|..:|...:..||..:.:||.:|:.|.|:...|....|:.|::::.|.||:.::      .
Mouse  1268 VANEPTALDIPALRVQLAGSHILEALRLHRAGYAEHMGLAQFRRRFQVLDPALLKKLDLTSEELD 1332

  Fly   737 DKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMSWMQAWARGYLSRKGFK 801
            ::|..|.::|.:||.:....:|:::||.:|||:.::|..|::.:.:.:...||..||:|||:.:|
Mouse  1333 ERKVVEELLKTLDLEKKAVAVGHSQVFLKAGVVSRLERQREKLVSRNIVLFQAACRGFLSRQEYK 1397

  Fly   802 KLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLN-------VSRIEDEIARLEEKAKKAE 859
            ||:.:|:|...:|:||..:|:::.|||:.|...::|||:       :...|:|:..|.:|.:|:|
Mouse  1398 KLKIRRLATLCIQKNLAVFLKVKDWPWWGLLASLRPLLSSTLGTEQLRAKEEELTLLRQKLQKSE 1462

  Fly   860 ELHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGE--KG-----ALQDYQERNAKLTAQKNDLENQ 917
            .   :..::|:..:.|.:|:    |.|...|:.|  ||     ||:  .||..:|.|
Mouse  1463 N---SRSELRQNTDLLESKI----TDLTSELADERFKGDVACQALE--SERAERLQA-------- 1510

  Fly   918 LRDIQERLT---QEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLND 979
            ||::||..|   |.:||..::.:|.::|.|.|.|                          .||.:
Mouse  1511 LREVQELKTKYQQVQDALGEVQKQLEEAQQRIQG--------------------------ANLEE 1549

  Fly   980 EIA-HQDELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKV 1043
            :.| ..||...:|:. .:|:.:..:|   .||..|::::...|.:.:|||.|.||:.:.|..||:
Mouse  1550 KPAGGADEWQMRLDC-AQMENDFLRK---RLQQCEERLDSEMKARTELEQKLGELQSAYEEAKKM 1610

  Fly  1044 RGDVEKSKRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIK 1108
            ...:::....:..||:.|:..:.:.:....|||:..::.|.:|:
Mouse  1611 AHQLKRKCHHLTWDLEDTRVLLENQQSRNHELEKRQKKFDLQLA--------------------- 1654

  Fly  1109 ELQARIEELEEEVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKL 1173
              ||..|.:     .|:..|.|..::...:..||.:|.::||:              :|.|.|||
Mouse  1655 --QALGESM-----FEKSLREKVSQENNGVRWELGQLQQQLEQ--------------KEQEASKL 1698

  Fly  1174 RRDLEEANIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHIT 1238
            ::::|....| :..|.:.....:..||.:.|:|.:|                :.|.|.
Mouse  1699 KQEVERLQGQ-KRELLSCASVGDQGVASLKERVWEL----------------ETNALE------- 1739

  Fly  1239 NEKAAQEKIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKI 1303
                 |:||..|.::|:.:::..            ..:.:|.||....:.| ::.|.|..:|..:
Mouse  1740 -----QQKIHSQQENTIKQLEQL------------RQRFELEIERMKQMHQ-KDREDQEEELEDV 1786

  Fly  1304 KISLTTQLEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQV-EEEAEGKADLQRQLSKANA-- 1365
            :.|...:|...:...::|..|:...|.:..:||..:..|.:|: ..:.:.:..|:|.|.:.:|
Mouse  1787 RQSCQKRLRQLEMQLEQEYEEKQVALHEKHDLEGLIGTLCDQIGHRDFDVEKRLRRDLRRTHALL 1851

  Fly  1366 -EAQVWRSKYESDGVARS-EELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQ 1428
             :.|:..:..|....:.| ||||:...:|:...|:.|:.:           ||::.|:.::|::.
Mouse  1852 SDVQLLLATIEDSKTSISKEELEKVHSQLEQSEAKCEDAL-----------KTQKVLTADLENMH 1905

  Fly  1429 LEVDRANAIANAAEKKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQ 1493
            .|::      |....|.            .||:                 :|:||:   .|..:.
Mouse  1906 SELE------NVTRSKS------------LVDE-----------------QLYRLQ---FERADL 1932

  Fly  1494 LEAVRRENKNLADEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVL 1558
            |:.:..:..:|.|.::...|.|.:...:|.:|:           |||..|||.     ::|.:.|
Mouse  1933 LKRIDEDQGDLNDLMQKHKDLIAQSAADIGQIQ-----------ELQLQLEET-----KKEKQKL 1981

  Fly  1559 RAQLELSQVRQEIDRRIQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMK-KKLEADIN 1622
            |.||.::|:      |||..|:      ...:||:.|.|.::..:.:.|.|..::: |:.|..:.
Mouse  1982 REQLHMAQL------RIQYLEQ------STVERAIVSRQEAIICDLENKTEFQKVQIKRFEVLVI 2034

  Fly  1623 ELEIA-------LDHANKANAEAQKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANAL 1680
            .|..:       |..|.||.|:.::|.:.|||:|::::..::|..:..::|       .||...|
Mouse  2035 RLRDSMIKMGEELSRAVKAEAQQRENSQYYQQRLEELKAEMQELAQREEEA-------SRRCMEL 2092

  Fly  1681 QNELEESRTLLEQADRGRRQAEQELADAHEQLNEV--------SAQNA------------SISAA 1725
            :..:||..|:.:........:.:.:||....|.||        |.|.|            ::|..
Mouse  2093 EKYVEELATVRQTLQTDLETSIRRIADLQAALEEVVSSDSDTESVQTAVDCSSRSGKEGDNVSVI 2157

  Fly  1726 KRKLESELQTLHSDLDELLNEAKN--SEEKAKKAMVDAARLADELRAEQDHAQTQEKLRKA 1784
            ..:.|..||:..|....|..::..  |.:....:...:.|:::|       |...|:||.|
Mouse  2158 SSQPEGSLQSWMSCSLSLATDSVRIPSGQSVVSSSFHSPRVSEE-------AGDSERLRTA 2211

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mhc	NP_523587.4	Myosin_N	33..75	CDD:460670	8/55 (15%)
		MYSc_Myh1_insects_crustaceans	100..765	CDD:276874	193/768 (25%)
		Myosin_tail_1	842..1922	CDD:460256	209/989 (21%)
Myo18b	NP_083177.2	PHA03247	<55..472	CDD:223021
		COG5022	606..2126	CDD:227355	418/1767 (24%)
		MYSc_Myo18	625..1361	CDD:276837	193/768 (25%)