Protein Alignment Mhc and myo18ab

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523587.4
• Gene: Mhc / 35007
• FlyBaseID: FBgn0264695
• Length: 1962
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_068069826.1
• Gene: myo18ab / 559005
• ZFINID: ZDB-GENE-080423-1
• Length: 2689
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 2155
• Identity: 528/2155 - (24%)
• Similarity: 994/2155 - (46%)
• Gaps: 427/2155 - (19%)

  Fly     6 ANQEDEDPTPYL----------FVSLEQRRIDQSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGE-IKATKGDI 59
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Zfish   521 SEQVEEDPVAILKADHAAAAHPKVKTEEQIAAEQAWYGSEK-VWLV-HKDGFSLATVVKTEAGSL 583

  Fly    60 ----VSVGLQ-GGETRDLKKDLLQQVNPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYS 119
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Zfish   584 PEGKVKIKLEHDGTVLDVDEDDVEKANPPSFDRCEDLAALLYLNESSVMHSLRQRYGGNLIHTHA 648

  Fly   120 GLFCVAINPYKRYPVYTNRCAKMYRGKRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAG 184
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Zfish   649 GPNMVIVNPISAPSMYSEKVMHMFKGCRREDTAPHIYAVAQSAYRNLLTTRQDQSIVLLGKSGSG 713

  Fly   185 KTENTKKVIAYFATV-GASKKTDEAAKSKGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIR 248
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Zfish   714 KTTNCQHLVQYLVSIAGSTGKIFTAEKW------QAVYT--ILEAFGNSATSMNNNASRFSQIVS 770

  Fly   249 IHFGPTGKLAGADIETYLLEKARVISQQSLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYD----- 308
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Zfish   771 LDFDQAGQVASASIQTMLLEKLRVVKRPETESTFNVFYYMMAGA-----DSTLRTELHFNHFAEN 830

  Fly   309 --YHIVSQGKVTVASIDD----AEEFSLTDQAFDILGFTKQEKEDVYRITAAVMHMGG-----MK 362
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Zfish   831 SAFGIVPQSKP-----EDKQKASQQFTKLQAAMKVLGISSDEQKALWLILGAIYHLGAAGATKAE 890

  Fly   363 FKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAEL----YKNLLKPRIKVGNEFVTQGRNVQQVTNSI 423
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Zfish   891 ADEAGRKQFARHEWAQ---KAAYLLGCTLEELSSAIFKHQPKGTLQRSTSF-RQGPDDAGTGDNS 951

  Fly   424 G----------ALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFEIFEYN-------- 470
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Zfish   952 GPKITALECLEAMAAGLYSELFTLVISLVNRALKSSQHSLCSLLIVDTPGFQ----NPKLAKRER 1012

  Fly   471 --GFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLI---------- 523
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Zfish  1013 GATFEELCHNYAQERLQTLFHERTFVQELERYKEENIELALDDIESSTSLSVAAIDQASSQALVR 1077

  Fly   524 -----EKPMGILSILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKP----KPPKPGQQAAHFAI 579
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Zfish  1078 TLARTDEARGLLWLMEEEALQPGGSEETLLERLFSYYSPADGESKGPALLLKSDKP----HHFLL 1138

  Fly   580 AHYAGC--VSYNITGWLEKNK-DPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAGQSGGGEQAKGG-RGK 640
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Zfish  1139 GHSHGTDWVEYDAGGWLSHAKQNPASQNAAILLQDSQKKNISSLF---MGRSGGATVLSGSIAGL 1200

  Fly   641 KGGG-------------FATVSSAYKE---------QLNSLMTTLRSTQPHFVRCIIPN------ 677
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Zfish  1201 EGGSQLALRRATSMRKTFTTGVAAVKKKSLCIQVKLQVDALMDTVRRSRVHFVHCLLPKAETLSA 1265

  Fly   678 EMKQPG---------VVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYKIMCPKLLQG 733
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Zfish  1266 DVKVPGGESCDTGLMQLDVCLLRAQLRGSKLLDALRIYRQGYPDHLVFSEFRRRFDVLTPHLTKK 1330

  Fly   734 ------VEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMSWMQAWAR 792
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Zfish  1331 HGRNYIVTDEKRAVEELLESLELEKSSYHMGLSRVFFRAGVLAKLEENRDIQTRRNLTLFQAACR 1395

  Fly   793 GYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIE-------DEIAR 850
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Zfish  1396 GYLARQAFKKRKIQDLAIRCIQKNIKKNRGVKGWPWWKLFTTVRPLIEVQLTEEQIRGKDEEIQL 1460

  Fly   851 LEEKAKKAEELHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDLE 915
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Zfish  1461 LKSKLEKVE-------KERNELRLNSDRLESKITELSSELADERNTGESASQLLESETSERLRLE 1518

  Fly   916 NQLRDIQERLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLNDE 980
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Zfish  1519 KDMKDLQAKF----DA-----------------MKKQTESMEMEVMEARLIRASE------LNGE 1556

  Fly   981 IAHQDELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAA-EDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVR 1044
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Zfish  1557 MDDDD-------------------TGGEWRLKYERAIREIEFTKKRLQQ---EFDDKLEVE---- 1595

  Fly  1045 GDVEKSKRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKE 1109
               :::||::|  .|||     ||:.:.:|:::..|:..|:...:||:|:|.::.:...|.:..:
Zfish  1596 ---QQNKRQLE--RKLT-----DLQADNEEVQRVAQQLKKKCQRLTAELQDTKLHLEGQQSRNHD 1650

  Fly  1110 LQARIEELEEEVEAERQARAKAEK-QRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKL 1173
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Zfish  1651 LEKKQRKFDSE-QTQAQEEVQREKSQREKLSREKDML---------------------TGEVFSL 1693

  Fly  1174 RRDLEEANIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHIT 1238
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Zfish  1694 RQQLEDKDL--EICAVNLK------LEQMEAELQDLNSQESKDEASLAKIKKQLRDLEAKV---- 1746

  Fly  1239 NEKAAQEKIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQL--EEAESQVSQLS 1301
                             .:.:.:|||...|:...:.:|.:|.:| .:.|||.  :|.||:..::.
Zfish  1747 -----------------KDQEEELDEQAGTIQMLEQAKLRLEME-MERLRQTHSKEIESKEDEVE 1793

  Fly  1302 KIKISLTTQLEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQV-EEEAEGKADLQRQLSKAN- 1364
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Zfish  1794 EIRQSCSKKLKQMEVQLEEEYEDKQKVLREKRDMEAKLMSAQDQVSHRDVEAEKRLRKDLKRTKA 1858

  Fly  1365 --AEAQVWRSKYESDGVARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDL 1427
              |:||:.....:::..:: .|:.:.|.:|:    |:|.|       |....|.::.:..|:|||
Zfish  1859 LLADAQIMLDHLKNNAPSK-REIAQLKNQLE----ESEFT-------CAAAVKARKSMEVEIEDL 1911

  Fly  1428 QLEVDRANAIANAAEKKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQE 1492
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Zfish  1912 HVQMDDIS-------KSKQALEEQLSRLQREKNDLQSRMEEDQED----MNELMKKHKA------ 1959

  Fly  1493 QLEAVRRENKNLADEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEK----ARKRLEAEKDEL---------QAALE 1544
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Zfish  1960 ---AVAQSSQNLA-QISDLQAQLEEAMKEKQDVQEKLTALQSQLEFQEQSMVDKSLVSRQEAKIR 2020

  Fly  1545 EAEAALEQEENKVLRAQLELSQVRQEIDRRIQEKEEE--FENTRKNHQRALDSMQASLEAE---- 1603
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Zfish  2021 ELETKLEFEKTQVKRLESLVARLKENLEKLTEERDQRSASENREKEQNKRLLRQIRDIKEEMAEL 2085

  Fly  1604 AKGKAEALRMKKKLEADINELEIALDHANKANAEAQKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDARE 1668
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Zfish  2086 AKKEAEASRKKHELEMDIESLE-------AANQSLQADLKLAFKRIGDLQAAIEDEMESDD---- 2139

  Fly  1669 QLGISERRANALQN---ELEESRTLLEQADRGRRQAEQELADAHEQL--NEVSAQNASISAAKRK 1728
                :|...|:||:   :.::.:..:|.|.....:.|..:......|  |:.||:|.|...:
Zfish  2140 ----NEDLINSLQDMVTKYQKRKNKIEGASDTDSEVEDRVDGVKSWLSKNKGSAKNLSDDGS--- 2197

  Fly  1729 LESELQTLHSDLDE--LLNEAKNSEEKAKKAMVDAAR---------------LADELRAEQDHAQ 1776
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Zfish  2198 LKSSRYAVNVDGKEGKEWEEGKEWKESGKGKELEPSRPVSVMSSLSYRKRSNMKDSIGGKGDESS 2262

  Fly  1777 TQEKLRKALE-QQIKELQVRLDEAEAN----ALKGGKKAIQKLEQR---VRELENEL-----DGE 1828
            ....|::..: |.:...:....:.||.    ::...:||...|:.|   :.::.:|.     .|.
Zfish  2263 LLNTLKEQSDSQDLSSFRKNKGKQEAEDDSYSVSSWRKAGDDLDDRGSVISQVYSEAASRARKGM 2327

  Fly  1829 QRRHADAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVD----------KLQQKIKTYKRQIEE 1883
            :.|.:|..|....|......:|        |:....||.|          .:.::....:.:..:
Zfish  2328 ESRWSDFDKESVVSSIAPSRVS--------NYRTAMDLDDDAISSVSRMSSVSRRRSMPRLEDHQ 2384

  Fly  1884 AEEIAALNLAKFRKAQQELEEAEERADLAEQA-ISKFRAKGRAGSV----GRGASPAPRATSVRP 1943
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Zfish  2385 SEYGSAVSPSLSCRSPGSVSRADSRMSLSRSCRLSEFDIEDDSRSVAFTEGRSSAYSPHSTSGR- 2448

  Fly  1944 QFDGLAFPPR 1953
               ..:.||:
Zfish  2449 ---SFSMPPQ 2455

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mhc	NP_523587.4	Myosin_N	33..75	CDD:460670	12/47 (26%)
		MYSc_Myh1_insects_crustaceans	100..765	CDD:276874	212/771 (27%)
		Myosin_tail_1	842..1922	CDD:460256	242/1159 (21%)
myo18ab	XP_068069826.1	PTZ00449	<25..285	CDD:185628
		PHA03247	<173..533	CDD:223021	4/11 (36%)
		COG5022	554..2053	CDD:227355	432/1688 (26%)
		MYSc_Myo18	629..1368	CDD:276837	212/771 (27%)
		EnvC	1959..>2169	CDD:443969	55/234 (24%)