DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mhc and myh3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001006915.1 Gene:myh3 / 448762 XenbaseID:XB-GENE-989276 Length:1935 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1918 Identity:1072/1918 - (55%)
Similarity:1426/1918 - (74%) Gaps:10/1918 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    13 PTPYLFVSLEQRRID-QSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRDLKKDL 76
            |..:.....|:.||: |:||:|::.|.::.|.||.|:.|.:::.:|...:|..:.|:|..:|.|.
 Frog    12 PAAHFLRKSEKERIEAQNKPFDARTSMFVVDTKESYVKGTLQSKEGGKATVKTEAGQTVTVKDDQ 76

  Fly    77 LQQVNPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAK 141
            :..:||||::|.|||:.:|:||:.|||:||::||...:||||||||||.:||||..|||......
 Frog    77 IFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLNEPSVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNPEVVN 141

  Fly   142 MYRGKRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATVGAS--KK 204
            .||||:|.|.|||||:|||.||..|||:..|||:|||||||||||.|||:||.||||:.|:  ||
 Frog   142 AYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAAAPDKK 206

  Fly   205 TDEAAKSKGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEK 269
            .:|.||:||:||||::|.||:|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
 Frog   207 KEEVAKTKGTLEDQIIQANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADIETYLLEK 271

  Fly   270 ARVISQQSLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTDQA 334
            :||..|...||||||||||||...|.:.::.|:|.|.||:..||||:::||||||.||...||.|
 Frog   272 SRVTFQLKAERSYHIFYQIMSNKKPELIEMLLITTNPYDFPFVSQGEISVASIDDTEELMATDSA 336

  Fly   335 FDILGFTKQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLL 399
            .|||||...||..:|::|.||||.|.|:|||:.||||||.||.|...:.:.|...::|:|.|.|.
 Frog   337 IDILGFNADEKVSIYKLTGAVMHYGNMRFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLMCLNSADLLKALC 401

  Fly   400 KPRIKVGNEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGF 464
            .||:|||||:||:|:.||||.||:|||.|.|::::|.|:|.:.||.|||:|.||:||||||||||
 Frog   402 YPRVKVGNEYVTKGQTVQQVYNSVGALGKAVYEKMFLWMVTRINEMLDTKQPRQYFIGVLDIAGF 466

  Fly   465 EIFEYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPMGI 529
            |||::|..||||||||||||||||||||||||||||::|||||.||||||||..||:||||||||
 Frog   467 EIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMDLAACIELIEKPMGI 531

  Fly   530 LSILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWL 594
            .||||||.|||||||.:|..||.:.|||||..||||||.| |:..|||::.||||.|.|||:|||
 Frog   532 FSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNFQKPKPAK-GKAEAHFSLVHYAGTVDYNISGWL 595

  Fly   595 EKNKDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAGQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNSL 659
            |||||||||||:..|:||..|.|..:|:.:|.....|.: |||: |||..|.|||:.::|.||.|
 Frog   596 EKNKDPLNDTVIGLFQKSSMKTLAYLFSSYAASEAEGAK-KGGK-KKGSSFQTVSALFRENLNKL 658

  Fly   660 MTTLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYK 724
            |:.||:|.|||||||||||.|.||.::..||:|||.||||||||||||||||:|::|.|||.|||
 Frog   659 MSNLRTTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHELVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYGDFKQRYK 723

  Fly   725 IMCPKLL---QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMSW 786
            |:....:   |.:: .|||:|.::..||:...|||.|:|||||:||:||.:||.||:||..:::.
 Frog   724 ILNASAIPEGQFID-SKKASEKLLGSIDVDHTQYRFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDDRLAHVITR 787

  Fly   787 MQAWARGYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIEDEIARL 851
            .||..||||.|..|||:.|:|.|:..:|.|:|.::.::.|||.||:.|:||||..:..|.|:..:
 Frog   788 TQAMCRGYLMRVEFKKMMERREAVFTIQYNIRSFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSAESEKEMQNM 852

  Fly   852 EEKAKKAEELHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDLEN 916
            :|:.:|.:||.|.....|||||....|:|.||..|...:..|...|.|.:||..:|...|..||.
 Frog   853 KEEFEKTKELLAKSEAKRKELEEKMVKVLQEKNDLQLQVQSESENLTDAEERCDQLIKSKIQLEA 917

  Fly   917 QLRDIQERLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLNDEI 981
            :::::.|||..||::..:|..:|:|.:.|.|.|||||:||||.:.|.|::|...:::::||.:|:
 Frog   918 KMKELNERLEDEEESNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEM 982

  Fly   982 AHQDELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVRGD 1046
            |..||.|.||.||||...|.:|:|.::|||.|||:|.|.|.||||||.:|:||.|||:|||:|.|
 Frog   983 AVLDETIVKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKAKLEQQVDDLEGSLEQEKKLRMD 1047

  Fly  1047 VEKSKRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKELQ 1111
            :|:||||:||||||.||.:.|||.::::|::.:::|:.|:|...:|:||||.:..:.|::|||||
 Frog  1048 LERSKRKLEGDLKLAQETIMDLENDRQQLDEKLKKKEFEMSQYASKIEDEQALGAQLQKKIKELQ 1112

  Fly  1112 ARIEELEEEVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKLRRD 1176
            |||||||||:||||.|||||||||:||:|||||:.|||||||||||||||:|||||||..|:|||
 Frog  1113 ARIEELEEEIEAERAARAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKREAEFQKMRRD 1177

  Fly  1177 LEEANIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHITNEK 1241
            ||||.:|||:|.|.||||..|:|||:.||:|.|.::|.|.||||:|...:::||.:.:::::..|
 Frog  1178 LEEATLQHEATAAALRKKQADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEIDDLASNMENLSKAK 1242

  Fly  1242 AAQEKIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKIKIS 1306
            |..|||.:.|:..|:|:::|.:|..|.:||..|.:.:|..||.:..|||||.:|.:||||:.|.:
 Frog  1243 ANFEKICRTLEDQLSELKTKDEEHQRQINDLTAQRARLQTENGEYARQLEERDSLISQLSRGKQA 1307

  Fly  1307 LTTQLEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKANAEAQVWR 1371
            .|.|:|:.||..:||.:.:..|....::..||.|.||||.|||.|.|.:|||.|||||.|...||
 Frog  1308 FTQQIEELKRQLEEEIKAKNALAHGLQSARHDCDLLREQYEEEQEAKGELQRSLSKANGEVAQWR 1372

  Fly  1372 SKYESDGVARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRANA 1436
            :|||:|.:.|:||||:||:||..||.||||.||::|.||..||||||||..|||||.::|:|:|:
 Frog  1373 TKYETDAIQRTEELEDAKKKLAQRLQEAEEHIEAVNSKCASLEKTKQRLQNEVEDLMVDVERSNS 1437

  Fly  1437 IANAAEKKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRREN 1501
            ...|.:||||.||||:.|||.|.::..|||:|||||.|:.|||||::|.||||..:.||..:|||
 Frog  1438 ACAALDKKQKNFDKILAEWKQKFEESQAELEASQKESRSLSTELFKMKNAYEESLDHLETTKREN 1502

  Fly  1502 KNLADEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLRAQLELSQ 1566
            |||..|:.||.:|:.|..:.:||:|||:|.:|.||.|:|:|||||||:||.||.|:||.||||:|
 Frog  1503 KNLQQEISDLTEQVSEVSKTLHEVEKAKKIIEQEKTEIQSALEEAEASLEHEEGKILRIQLELNQ 1567

  Fly  1567 VRQEIDRRIQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIALDHA 1631
            |:.||||:|.||:||.:..::||.|.::|||::|:||.:.:.:|||:|||:|.|:||:||.|.||
 Frog  1568 VKSEIDRKIAEKDEEIDQLKRNHVRVVESMQSTLDAEIRSRNDALRLKKKMEGDLNEMEIQLSHA 1632

  Fly  1632 NKANAEAQKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQADR 1696
            |:..:|:||.::..|..|||:|..|::..||::|.:|||.:.|||||.:|.|:||.|..|||.:|
 Frog  1633 NRQASESQKQLRNVQGLLKDVQIHLDDSLRAQEDLKEQLAMVERRANLMQAEIEEMRAALEQTER 1697

  Fly  1697 GRRQAEQELADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMVDA 1761
            .|:.|||||.||.|::..:.:||.|:...|:|:|:::..|.::::|.:.||:|:|||||||:.||
 Frog  1698 SRKVAEQELLDASERVQLLHSQNTSLINTKKKMETDITQLQTEVEEAIQEARNAEEKAKKAITDA 1762

  Fly  1762 ARLADELRAEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELENELD 1826
            |.:|:||:.|||.:...|:::|.|:|.:|:||.||||||..|:|||||.|||||.||||||||:|
 Frog  1763 AMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLDQTVKDLQHRLDEAEQLAMKGGKKQIQKLEARVRELENEVD 1827

  Fly  1827 GEQRRHADAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEAEEIAALN 1891
            .||:|..:|.|.:||.||||||||:|||||:||..|:||||||||.|:|.||||.||.||.:.:|
 Frog  1828 VEQKRSTEAIKGVRKYERRVKELSYQSEEDKKNILRLQDLVDKLQMKVKAYKRQTEEIEEQSNIN 1892

  Fly  1892 LAKFRKAQQELEEAEERADLAEQAISKFRAKGR 1924
            |.|:||.|.||||||||||:||..::|.|||.|
 Frog  1893 LTKYRKIQHELEEAEERADIAESQVNKLRAKTR 1925

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 12/41 (29%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 427/669 (64%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 574/1079 (53%)
myh3NP_001006915.1 Myosin_N 33..77 CDD:460670 13/43 (30%)
Motor_domain 100..766 CDD:473979 427/669 (64%)
Myosin_tail_1 846..1923 CDD:460256 574/1076 (53%)

Return to query results.
Submit another query.