DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mhc and myh2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001006805.1 Gene:myh2 / 448514 XenbaseID:XB-GENE-5760121 Length:1939 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1920 Identity:1073/1920 - (55%)
Similarity:1426/1920 - (74%) Gaps:9/1920 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    12 DPTPYLFVSLEQRRIDQSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRDLKKDL 76
            :..|:|..|.::|...|:|.:|:|.:|::.|:||.|:.|.|.|.:|..|:|..:......:|:..
 Frog    11 EAAPFLRKSDKERLEAQNKAFDAKNTCFVEDDKELYVKGLITAREGGKVTVKTEDARNVTVKESQ 75

  Fly    77 LQQVNPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAK 141
            :...||||::|.|||:.:|:||:||||:||::||...:||||||||||.:||||..|||......
 Frog    76 VYPQNPPKFDKIEDMAMMTHLNEASVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNPEVVA 140

  Fly   142 MYRGKRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATVGA----S 202
            .||||:|.|.|||||:|||.||..||.:..|||:|||||||||||.|||:||.||||:.|    :
 Frog   141 GYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLQDRENQSVLITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAAIGDSN 205

  Fly   203 KKTDEAAKSKGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLL 267
            ||.:.:...:|:||||::|.||:|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
 Frog   206 KKKEMSNSMQGTLEDQIIQANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADIETYLL 270

  Fly   268 EKARVISQQSLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTD 332
            ||:||..|.|.||||||||||::...|.:.::.|||.|.|||..:|||::.|.||||.||...||
 Frog   271 EKSRVTFQLSAERSYHIFYQILTNKKPEIVEMLLLTTNPYDYAFISQGEIAVKSIDDEEELMATD 335

  Fly   333 QAFDILGFTKQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKN 397
            .|.||||||.:||..:|::|.:|||.|.|||||:.||||||.||.|...::..|.|.::|:|.|.
 Frog   336 SAIDILGFTAEEKMGIYKMTGSVMHKGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKIGYLMGLNSADLLKA 400

  Fly   398 LLKPRIKVGNEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIA 462
            |..||:||||||||:|:.||||.|:||||.|.||::||.|:|.:.|:.|||:..||:||||||||
 Frog   401 LCYPRVKVGNEFVTKGQTVQQVYNAIGALSKSVFEKLFLWMVTRINQQLDTKLPRQYFIGVLDIA 465

  Fly   463 GFEIFEYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPM 527
            |||||:.|..||||||||||||||||||||||||||||::|||:|.||||||||..||:||||||
 Frog   466 GFEIFDLNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIDWEFIDFGMDLAACIELIEKPM 530

  Fly   528 GILSILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITG 592
            |||||||||.|||||||.:|..||.:.||||...|:||||.| |:..|||::.||||.|.|||.|
 Frog   531 GILSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKCKNFEKPKPAK-GKAEAHFSLVHYAGTVDYNICG 594

  Fly   593 WLEKNKDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAGQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLN 657
            ||:|||||||:|||..::||..|||..:::.:||..|.|:.||.|:.|||..|.|||:.::|.||
 Frog   595 WLDKNKDPLNETVVGLYQKSSLKLLSFLYSSYAGTDGAGDGAKSGKKKKGSSFQTVSALFRENLN 659

  Fly   658 SLMTTLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMR 722
            .|||.||||.||||||:||||.|.||:::.||::|||.||||||||||||||||:|::|.|||.|
 Frog   660 KLMTNLRSTHPHFVRCLIPNESKTPGIMENHLIIHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYGDFKQR 724

  Fly   723 YKIMCPKLL---QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIM 784
            |||:....:   |.:: .|||.|.::..||:...|||.|:|||||:||:||.:||.||::|.:::
 Frog   725 YKILNASAIPDGQFID-SKKACEKLLGSIDIDHTQYRFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDDKLAQLI 788

  Fly   785 SWMQAWARGYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIEDEIA 849
            :..||..||:|.|..|||:.|:|.|:.|:|.|:|.::.::.|||.||:.|:||||..:..|.|:|
 Frog   789 TRTQALCRGFLMRVEFKKMIERRDAIFVIQYNVRSFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEMA 853

  Fly   850 RLEEKAKKAEELHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDL 914
            .::|:.:|.:|........|||||.....||.||..|:.....|..:|.|.:||...|...|.:|
 Frog   854 NMKEEFEKTKEALTKSDARRKELEEKMVALLQEKNDLMLQCQSENESLADAEERCEGLIKNKINL 918

  Fly   915 ENQLRDIQERLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLND 979
            |.:::::.|||..||::..:|..:|:|.:.|.|.|||||:||||.:.|.|::|...:::::||.:
 Frog   919 EAKIKELTERLEDEEESNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTE 983

  Fly   980 EIAHQDELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVR 1044
            |:|..||.|:|::||||...|.:|:|.::|||.|||::.|:|.|.||||.:|:||.|||:|||:|
 Frog   984 EMAGLDETISKISKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVSSLSKAKTKLEQQVDDLEGSLEQEKKLR 1048

  Fly  1045 GDVEKSKRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKE 1109
            .|:|::|||:||||||.||.:.|||.:|::.|:.:::||.|||.:..|:||||.|..:.|::|||
 Frog  1049 LDLERAKRKLEGDLKLAQETIMDLENDKQQTEEKLKKKDFELSQLQGKIEDEQSVGCQLQKKIKE 1113

  Fly  1110 LQARIEELEEEVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKLR 1174
            |||||||:|||:||||.||||.|||||||:|||||:.|||||||||||||||:|||||||..|||
 Frog  1114 LQARIEEVEEEIEAERAARAKVEKQRADLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKREAEFQKLR 1178

  Fly  1175 RDLEEANIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHITN 1239
            |||||:.:|||:|.|.|||||.|:|||:.||:|.|.::|.|.||||:|...:::||.:.:::::.
 Frog  1179 RDLEESTLQHEATSAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEIDDLASNLENVSK 1243

  Fly  1240 EKAAQEKIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKIK 1304
            .||..||:::.|:..|:|::|:.||..|.:||..|.|.:|..||.:|.|||||.||.||||::.|
 Frog  1244 SKANLEKLSRVLEDQLSEIKSRDDEHQRIINDLTAQKARLQTENGELSRQLEEKESLVSQLTRGK 1308

  Fly  1305 ISLTTQLEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKANAEAQV 1369
            ...|.|.|:.||..:||::.:..|....::..||.|.||||.|||.|.||:|||.|||||.|...
 Frog  1309 QGFTQQTEELKRQLEEETKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKAELQRSLSKANTEVSQ 1373

  Fly  1370 WRSKYESDGVARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRA 1434
            ||:|||:|.:.|:|||||||:||..||.||||.:|::|.||..||||||||..|||||.::|:||
 Frog  1374 WRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEQVEAVNSKCASLEKTKQRLQAEVEDLMVDVERA 1438

  Fly  1435 NAIANAAEKKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRR 1499
            |:.|.|.:|||:.|||::.|||.|.::..|||:|||||.|:.|||:|::|.||||..|.||.::|
 Frog  1439 NSAAAALDKKQRNFDKVLVEWKQKYEESQAELEASQKESRSLSTEIFKMKNAYEEALEHLETMKR 1503

  Fly  1500 ENKNLADEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLRAQLEL 1564
            |||||..|:.||.:||||..:...|:|||:|::|.|:.:|||||||||.:||.||.|:||.||||
 Frog  1504 ENKNLQQEISDLSEQIGESAKTTMELEKAKKQVEQERGDLQAALEEAEGSLEHEEAKILRIQLEL 1568

  Fly  1565 SQVRQEIDRRIQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIALD 1629
            :||:.|:||:|.||:||.|..::|.||.:|:||::|::|.:.:.:|||:|||:|.|:|||||.|.
 Frog  1569 NQVKSEVDRKIAEKDEEIEQLKRNSQRVIDTMQSTLDSEIRSRNDALRLKKKMEGDLNELEIQLG 1633

  Fly  1630 HANKANAEAQKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQA 1694
            |||:...||||.::..|.||||.|..|::..||::|.:|||.:.:||....|.|:||.|..|||.
 Frog  1634 HANRQAGEAQKQLRNVQAQLKDTQIHLDDSVRAQEDLKEQLAVVDRRTTLQQAEIEEMRVALEQT 1698

  Fly  1695 DRGRRQAEQELADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMV 1759
            :|.|:.|||||.||.|::..:.:||.|:...|:|||::..||.::::|.:.||:|:|||||||:.
 Frog  1699 ERSRKMAEQELLDASERVQLLHSQNTSLINTKKKLETDAGTLQNEMEEAVQEARNAEEKAKKAIT 1763

  Fly  1760 DAARLADELRAEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELENE 1824
            |||.:|:||:.|||.:...|:::|.|||.:|:||.||||||..|:|||||.:||||.||||||||
 Frog  1764 DAALMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLAMKGGKKQLQKLESRVRELENE 1828

  Fly  1825 LDGEQRRHADAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEAEEIAA 1889
            ||.||:|..:|.|.:||.|||||||::||||||||..|:||||||||.|:|.||||.||:||.|.
 Frog  1829 LDNEQKRSVEAVKGVRKYERRVKELTYQSEEDRKNVLRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEESEEQAN 1893

  Fly  1890 LNLAKFRKAQQELEEAEERADLAEQAISKFRAKGR 1924
            .:||:|||.|.||||:|||||:||..::|.|||.|
 Frog  1894 AHLARFRKVQHELEESEERADIAESQVNKLRAKSR 1928

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 14/41 (34%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 424/671 (63%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 579/1079 (54%)
myh2NP_001006805.1 Myosin_N 32..76 CDD:460670 14/43 (33%)
MYSc_class_II 99..769 CDD:276951 424/671 (63%)
Myosin_tail_1 849..1926 CDD:460256 579/1076 (54%)

Return to query results.
Submit another query.