Protein Alignment Mhc and Myo81F

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523587.4
• Gene: Mhc / 35007
• FlyBaseID: FBgn0264695
• Length: 1962
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001303492.1
• Gene: Myo81F / 26067052
• FlyBaseID: FBgn0267431
• Length: 2082
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 2119
• Identity: 486/2119 - (22%)
• Similarity: 874/2119 - (41%)
• Gaps: 478/2119 - (22%)

  Fly    90 DMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAKMYRGKRRNEVPPH 154
            ||:.::.:::..:..||..||.:.:||||:|...:|:||||...::..:....|...:..::.||
  Fly    12 DMTEMSEIDEIGINQNLNVRYNSDIIYTYTGSILLAVNPYKTINIFNKQTISEYHTCKLGDLSPH 76

  Fly   155 IFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATVGASKKTDEAAKSKGSLEDQV 219
            :||:::.||..::.:::||:.:|:|||||||||:||.::.|..|:        .:.....::.|:
  Fly    77 VFAVAEAAYTSIVDDNINQACVISGESGAGKTESTKFILQYLCTI--------TSNVSSWVQQQI 133

  Fly   220 VQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKARVISQQSLERSYHI 284
            ::.|.:|||||||||.|||||||||||:::.|.....:.|..|..||||::|:..|...||:|||
  Fly   134 LEANTILEAFGNAKTTRNDNSSRFGKFMQVCFDDNNCIKGCVILDYLLEQSRITFQSEGERNYHI 198

  Fly   285 FYQIMSGSVPGVKDICLLTD------NIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTDQAFDILGFTKQ 343
            .||:::   .|.|:|.:...      ..|.|...|..:....:: ::::|.....||.:|...:.
  Fly   199 MYQLVA---QGQKNIGIANTFHLRPAEFYKYLNTSNSEKINMNL-ESKKFDAVTMAFTVLQIPQF 259

  Fly   344 EKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGE---------EEGGRVSKLFGCDTAELYKNLL 399
            ..:.|:::.::::.:|.::|        .:.|||         |....:|.|.|....:..|.||
  Fly   260 VIDGVFKVISSILWLGNIEF--------IDVDGEVTDLTRSDQEAISIISMLLGLSRCDFKKVLL 316

  Fly   400 KPRIKVGNEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGF 464
            ..:|.|..........:::...:..||.|.::.::|.|||.|.|...:..|....|:|||||.||
  Fly   317 IRQINVRGNITEIPLKIKEALENRHALAKALYSKMFTWLVSKINNCTNPGQDDAKFLGVLDIFGF 381

  Fly   465 EIFEYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEK-PMG 528
            |.|.:|.|||||||:|||||.:||||::|.|||..|:.|||.:..::| .|...|::::|| |..
  Fly   382 ENFSHNSFEQLCINYTNEKLHKFFNHYVFALEQSIYEHEGIYFNHVEF-TDNTPCLEILEKPPRC 445

  Fly   529 ILSILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAH----FAIAHYAGCVSYN 589
            :..:|.|:...|:.:|..|   |:|.|    ..|:.......|....|    |.|.||||.|.|.
  Fly   446 VFKLLTEQCHMPQGSDLAF---LSNMH----TEFESHPNYIKGSDRRHWETEFGIKHYAGLVIYA 503

  Fly   590 ITGWLEKNKDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAGQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKE 654
            :.|::|||:|...|.:.:....|::..:.::......|.......:|....|    .|||..::.
  Fly   504 VGGFVEKNRDVQQDVMFEYMSYSKDVFIKDLSTYQDIQFINSSYPRGSSKSK----CTVSDNFRN 564

  Fly   655 QLNSLMTTLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDF 719
            ||.||:..|::|:|.:||||.||..|:|...::.||:.||...||::.|||.|:|||..:.:.||
  Fly   565 QLQSLIDVLQNTKPWYVRCIKPNLQKRPNNYNSSLVLDQLKYLGVVDIIRIRREGFPIHLSHKDF 629

  Fly   720 KMRYKIMCPKLLQGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIM 784
            .:|||.:...  :..|..:|....|::...:|..::::|.:|:|.|......:|..|.:.|.|
  Fly   630 IVRYKCLIKN--KSFEYPQKYLTNILEKNGMPTTEWQIGKSKIFLRNAAYELLETNRKDTLYK-- 690

  Fly   785 SWMQAWARGYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVK--PLLNVSRIED- 846
                   ...:.:|.:||...|:..|:..|..||.....|.|.....:.:::  .::..||:..
  Fly   691 -------NAVIIQKNWKKYYIQKSFLRNKQAVLRIQHAYRGWRLRIRFMRMRRSAIVIQSRLRGV 748

  Fly   847 ----------EIARLEEKAKKAEELHAAEVKVRKELEALNAKLLAE-KTALLDSLSGEKGALQDY 900
                      |:.|::|:.||.:.::       ::|.::..|.||: :.::.:.|| ....:.|.
  Fly   749 FAREVAAALREMKRVDEELKKRDGIY-------EQLTSITTKTLADCERSIQEELS-VLAHISDN 805

  Fly   901 QERNAKLTAQKNDLEN------------QLRDIQERLTQEEDA-RNQLFQQ--------KKKADQ 944
            ...:||..:.|||.::            .|.::.:.|.:.:.| .|.|.::        .|..|:
  Fly   806 IRASAKPLSDKNDSDSNTARSSIKQNTVNLDNMFDFLCESKGAFENALIKEINDNWNNLVKNLDE 870

  Fly   945 EISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIR------------------NLNDEIAHQDELINKL 991
            || ||....|| ..:.||..:...||  .:|                  |||.|..::...:.||
  Fly   871 EI-GLCIHTED-SFDSQKTGKLFTTK--TVRTLPEPTVPPPPPPVSISANLNSEPIYEAINLYKL 931

  Fly   992 NKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLER--EKKVRG----DVEK- 1049
            ...|:::.|.....  :.::.:|.....:.....::..:||.|:..::  |||:..    |:.|
  Fly   932 TTTKEIKKEKYMLL--DYKSIKDNSKKPSTSSVFVKYQIDERENRRKQRVEKKIHELTLIDIHKD 994

  Fly  1050 ------------------SKRKVEGDLKL----TQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAK 1092
                              :...:..|...    ||:..:..:..|.|:.. ..:.||..:|....
  Fly   995 IHIDNSFYNILEFAENYFNTHDLSSDCNFISTPTQKGKSSDKTAKHEMTM-FSKSDKIPTSHIHM 1058

  Fly  1093 LEDEQVVV---------------LKHQRQIKELQARI------EELEEE--VEAERQARAKAEKQ 1134
            .:.|.||:               |..:|:::.:|..:      |||.:|  ::..||:|......
  Fly  1059 YDPENVVLSCSMFRELCKYMRGELNAERELQIIQYIVGLGIEREELRDEIFIQCIRQSRNNPNID 1123

  Fly  1135 RAD--------------------------LARELEELGERLEEAG-------GATSAQIELNKKR 1166
            ..|                          :.:.:.||..:|.:..       .:|.....:....
  Fly  1124 WTDRIWIILCLSIVAFQPSKLLFRYFVSFIKKSMIELDGKLRQYSQWCFDNCKSTKVSTRMYPPS 1188

  Fly  1167 EAELSKLRR-----------DLEEANIQ-HESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVD-------QLNKL 1212
            ..|::.:||           |.....|. |.:..|      .|||.::||:::       .:.:.
  Fly  1189 SVEVAAMRRLGTIVCRFFFLDARTKAIDVHPTDTA------GDAVQKLAEKLNLTTTDGWAIYQN 1247

  Fly  1213 KAKAEKEKNEYYGQLNDL----------RAGVDHITNEKAAQEK---IAKQLQHTLNEVQSKLDE 1264
            :...| |..:.|..|.|:          .||....||..::.|.   ..|:|..:.:|:.....|
  Fly  1248 RPDGE-EHIKSYDYLYDVISSWEMKQATYAGTKKTTNGSSSGENQFVFKKRLFKSTHELSQDPVE 1311

  Fly  1265 TNRTL----------NDFDASKKKLSIENSDLLRQL----------EEAESQVSQLSKIKISLTT 1309
            .:...          ::|..| :|::::.:.|..|:          .|..|.::....|:||.|.
  Fly  1312 VSMLYSQAVHSVVKKDEFPVS-EKVALQLAGLQAQVALGDPSNQPKPEYYSDINSFLPIRISKTR 1375

  Fly  1310 QLEDTKRLADEESRERATLLGKFRN------------LEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSK 1362
            :.:....:..:..|:    .|..||            :::.|.. ....:...:|..:|...:..
  Fly  1376 EQQFWIPILAQAHRQ----YGSSRNALTAKVLYLSCVMQYPLYG-TTMFKVNYKGYWNLASNIIL 1435

  Fly  1363 A---------NAE--AQVWRSKY---ESDGVARSEELEEAKRKLQARLAE----AEETIESLNQK 1409
            .         |.|  :.|::.||   ||..:..|:..........|:|.:    ....|||  ||
  Fly  1436 GIHYDGIMFINPEDKSVVFQFKYVDIESILLDPSDSFITISLNRSAQLLKTSLYGSSLIES--QK 1498

  Fly  1410 CIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRA--NAIANAAE--KKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQ 1470
            |...| |.|:  .::..|.:....|  |.|.|..|  ||.|...|   |.:|:       |..:.
  Fly  1499 CFVFE-TPQK--NDIGSLIISYYPALSNWILNNLECSKKYKGTTK---EDRLR-------LYQNV 1550

  Fly  1471 KECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRRENKNLADEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLE-- 1533
            ..||.:..::..:|..::.|......:||.:|:..::::      .|.|.|..|..:..|...
  Fly  1551 VLCRRHLVDMNIVKKPHDFGGFLRNTLRRLSKHRLEKLR------SEVGSNTQEHGETYKGFSHT 1609

  Fly  1534 ---AEKDELQAAL----EEAEAALEQEENKVLRAQLELSQVRQEIDRRIQEKEEEFENTRKNHQR 1591
               ..|.::...:    ::.||.:.|..:.:| ....|....:.|.|    .|:|       |.|
  Fly  1610 FWAFSKQQIPFCISTISDQEEALMIQVFDSIL-TYSGLGSSGESISR----AEDE-------HIR 1662

  Fly  1592 ALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIAL-----DHANKANAEAQKNIKRYQ----- 1646
            .:.|:....            |||  |:.:|||.:.|     ||   .:|.::.|:|.:.
  Fly  1663 IIQSIMDKC------------MKK--ESLLNELYLQLIKQTTDH---PDANSRVNLKNWALLSVL 1710

  Fly  1647 -----QQLKDIQTAL-EEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQADRGRRQ---AE 1702
                 ..:|.::..| ...:|...|...:.|...|.|        |:.....|..| |||   :.
  Fly  1711 CSVILPSMKAVRKYLIAHLKRCSSDFLSEEGKYARYA--------ENCFFRTQGTR-RRQWTPSR 1766

  Fly  1703 QEL------ADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMVDA 1761
            :|:      ...:.:...:..|..||       |.:..:..:|:.|::        |.|..::|.
  Fly  1767 EEILCTTNRRPCYSKFYFMDGQYYSI-------EFQPSSTANDVLEII--------KKKIGLLDN 1816

  Fly  1762 AR---LADELRAEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELEN 1823
            |:   :.:.:...:....::||        :.::..:.::.:..:.:|.:|            ..
  Fly  1817 AKGYSIYEVIGNSERSLSSEEK--------VCDVMAKWEKYQITSQQGFQK------------NT 1861

  Fly  1824 ELDGEQRRHADAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDK------LQQKIKTYKRQIE 1882
            .|..:|.::....|         |.|.|.      |:..::|:|:|      :...:::.:..|.
  Fly  1862 TLISQQNQYMFLFK---------KHLFFD------NYINLEDIVEKELLYHQILHNLRSERYPIT 1911

  Fly  1883 EAEEIAALNLAKFRKAQQELEEAEERADLAEQAISKFRA 1921
            |.|.|....|      |.:|    ||.|..| :|:.:||
  Fly  1912 EMEAIMLTAL------QSQL----ERGDCCE-SITDYRA 1939

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mhc	NP_523587.4	Myosin_N	33..75	CDD:460670
		MYSc_Myh1_insects_crustaceans	100..765	CDD:276874	223/684 (33%)
		Myosin_tail_1	842..1922	CDD:460256	246/1345 (18%)
Myo81F	NP_001303492.1	Motor_domain	23..673	CDD:473979	223/683 (33%)
		MyTH4	1091..1194	CDD:459939	14/102 (14%)
		FERM_F1_DdMyo7_like	1198..1299	CDD:340728	20/107 (19%)
		B41	1202..1419	CDD:214604	39/229 (17%)
		PH-like	1415..1523	CDD:473070	23/113 (20%)
		MyTH4	1664..1771	CDD:459939	28/132 (21%)
		FERM_F1_DdMyo7_like	1775..1880	CDD:340728	19/148 (13%)
		B41	1781..1992	CDD:214604	38/220 (17%)
		PH-like	1988..2076	CDD:473070