DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mhc and Myh3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001093105.1 Gene:Myh3 / 17883 MGIID:1339709 Length:1940 Species:Mus musculus


Alignment Length:1918 Identity:1073/1918 - (55%)
Similarity:1430/1918 - (74%) Gaps:14/1918 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    15 PYLFVSLEQRRIDQSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRDLKKDLLQQ 79
            |:|..|.::|...|::|:|:|..|::.|.||.|:.|:||:::...|:|..:...|..:|.:.:..
Mouse    15 PFLRKSEKERIEAQNQPFDAKTYCFVVDSKEEYVKGKIKSSQDGKVTVETEDSRTLVVKPEDVYA 79

  Fly    80 VNPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAKMYR 144
            :||||::|.|||:.||:||:.:||:||:.||.:.:||||||||||.:||||..|||.......||
Mouse    80 MNPPKFDKIEDMAMLTHLNEPAVLYNLKDRYTSWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNPEVVDGYR 144

  Fly   145 GKRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATVGA----SKKT 205
            ||:|.|.|||||:|||.||..|||:..|||:|||||||||||.|||:||.||||:.|    :||.
Mouse   145 GKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAATGDLAKKK 209

  Fly   206 DEAAKSKGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKA 270
            |  :|.||:||||::..||:|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||:
Mouse   210 D--SKMKGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADIETYLLEKS 272

  Fly   271 RVISQQSLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTDQAF 335
            ||..|...||||||||||:|...|.:.::.|:|.|.|||..:|||::.|||||||||...||.|.
Mouse   273 RVTFQLKAERSYHIFYQILSNKKPELIELLLITTNPYDYPFISQGEILVASIDDAEELLATDSAI 337

  Fly   336 DILGFTKQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLK 400
            ||||||.:||..:|::|.||||.|.|||||:.||||||.||.|...:.:.|.|.::::|.|.|..
Mouse   338 DILGFTPEEKSGLYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKTAYLMGLNSSDLLKALCF 402

  Fly   401 PRIKVGNEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFE 465
            ||:|||||:||:|:.|.||.:::.||.|.|:::||.|:|.:.|:.|||:..||||||||||||||
Mouse   403 PRVKVGNEYVTKGQTVDQVHHAVNALSKSVYEKLFLWMVTRINQQLDTKLPRQHFIGVLDIAGFE 467

  Fly   466 IFEYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPMGIL 530
            |||||..||||||||||||||||||||||||||||::||||||||||||||..||:||||||||.
Mouse   468 IFEYNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLAACIELIEKPMGIF 532

  Fly   531 SILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWLE 595
            ||||||.|||||||.:|..||.:.|||||..|||||..| |:..|||::.||||.|.|:::||||
Mouse   533 SILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNFQKPKVVK-GKAEAHFSLVHYAGTVDYSVSGWLE 596

  Fly   596 KNKDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAGQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNSLM 660
            |||||||:|||..::||.|:||..::|..|.....|.:.|..: |||..|.|||:.::|.||.||
Mouse   597 KNKDPLNETVVGLYQKSSNRLLAHLYATFATTDADGGKKKVAK-KKGSSFQTVSALFRENLNKLM 660

  Fly   661 TTLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYKI 725
            :.||:|.|||||||||||.|.||.::..||:|||.||||||||||||||||||::|.|||.||::
Mouse   661 SNLRTTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHSLVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPNRILYGDFKQRYRV 725

  Fly   726 MCPKLL---QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMSWM 787
            :....:   |.:: .|||.|.::..||:...||:.|:|||||:||:||.:||.|||||.|:::..
Mouse   726 LNASAIPEGQFID-SKKACEKLLASIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDERLAKLITRT 789

  Fly   788 QAWARGYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIEDEIARLE 852
            ||..||:|.|..|:|:.::|.::..:|.|:|.::.::.|||.||:.|:||||..:..|.|:|.::
Mouse   790 QAVCRGFLMRVEFQKMMQRRESIFCIQYNIRAFMNVKHWPWMKLFFKIKPLLKSAETEKEMATMK 854

  Fly   853 EKAKKA-EELHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDLEN 916
            |:.:|. :||..:|.| |||||.....|:.||..|...:..|...|.|.:||..:|...|..||.
Mouse   855 EEFQKTKDELAKSEAK-RKELEEKLVTLVQEKNDLQLQVQAESENLLDAEERCDQLIKAKFQLEA 918

  Fly   917 QLRDIQERLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLNDEI 981
            :::::.||...||:...:|..:|:|.:.|.|.|||||:||||.:.|.|::|...:::::||.:|:
Mouse   919 KIKEVTERAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEL 983

  Fly   982 AHQDELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVRGD 1046
            |..||.|.||.:|||...|.:|:|.::|||.|||:|.|:|:|:||||.:|:||.|||:|||:|.|
Mouse   984 AGLDETIAKLTREKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNSLSKLKSKLEQQVDDLESSLEQEKKLRVD 1048

  Fly  1047 VEKSKRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKELQ 1111
            :|::|||:||||||.||::.|||.:|::|::.:::||.|.|.:.:|:||||.:.|:.|::|||||
Mouse  1049 LERNKRKLEGDLKLAQESILDLENDKQQLDERLKKKDFEYSQLQSKVEDEQTLSLQLQKKIKELQ 1113

  Fly  1112 ARIEELEEEVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKLRRD 1176
            |||||||||:||||..|||.||||:|.|||||||.||||||||.||.|||||||||||..|||||
Mouse  1114 ARIEELEEEIEAERATRAKTEKQRSDYARELEELSERLEEAGGVTSTQIELNKKREAEFLKLRRD 1178

  Fly  1177 LEEANIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHITNEK 1241
            ||||.:|||:|:|.|||||.|:.||:|||:|.|.::|.|.||||:|:..:::||.:.|:.::..|
Mouse  1179 LEEATLQHEATVATLRKKHADSAAELAEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFKLEIDDLSSSVESVSKSK 1243

  Fly  1242 AAQEKIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKIKIS 1306
            |..|||.:.|:..|:|.:.|.:|..|:|::....|.:|..|..:|.|||||.||.|||||:.|.:
Mouse  1244 ANLEKICRTLEDQLSEARGKNEEMQRSLSELTTQKSRLQTEAGELSRQLEEKESIVSQLSRSKQA 1308

  Fly  1307 LTTQLEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKANAEAQVWR 1371
            .|.|:|:.||..:||::.:..|....::..||.|.||||.|||.||||:|||.|||||:|...||
Mouse  1309 FTQQIEELKRQLEEENKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEGKAELQRALSKANSEVAQWR 1373

  Fly  1372 SKYESDGVARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRANA 1436
            :|||:|.:.|:|||||||:||..||.::||.:|::|.||..||||||||..|||||.::|:|||:
Mouse  1374 TKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDSEEQVEAVNAKCASLEKTKQRLQGEVEDLMVDVERANS 1438

  Fly  1437 IANAAEKKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRREN 1501
            :|.|.:|||:.|||::.|||.|.::..|||:|:.||.|:.|||||:||.||||..:|||.|:|||
Mouse  1439 LAAALDKKQRNFDKVLAEWKTKCEESQAELEAALKESRSLSTELFKLKNAYEEALDQLETVKREN 1503

  Fly  1502 KNLADEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLRAQLELSQ 1566
            |||..|:.||.:||.|.|::|||:||:||::|.||.::|.||||||||||.||.|:||.||||:|
Mouse  1504 KNLEQEIADLTEQIAENGKSIHELEKSRKQMELEKADIQMALEEAEAALEHEEAKILRIQLELTQ 1568

  Fly  1567 VRQEIDRRIQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIALDHA 1631
            |:.||||:|.||:||.|..::|:||.:::||.:|:||.:.:.||:|:|||:|.|:||:||.|.||
Mouse  1569 VKSEIDRKIAEKDEEIEQLKRNYQRTVETMQGALDAEVRSRNEAIRLKKKMEGDLNEIEIQLSHA 1633

  Fly  1632 NKANAEAQKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQADR 1696
            |:..||..|:::..|.||||.|..|::..|.::|.:|||.|.|||||.||.|:||.|..|||.:|
Mouse  1634 NRQAAETIKHLRSVQGQLKDTQLHLDDALRGQEDLKEQLAIVERRANLLQAEVEELRATLEQTER 1698

  Fly  1697 GRRQAEQELADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMVDA 1761
            .|:.|||||.|::|::..:..||.|:...|:|||::|..|.|::::...:|:|:|||||||:.||
Mouse  1699 ARKLAEQELLDSNERVQLLHTQNTSLIHTKKKLETDLTQLQSEVEDACRDARNAEEKAKKAITDA 1763

  Fly  1762 ARLADELRAEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELENELD 1826
            |.:|:||:.|||.:...|:::|.|||.:|:||.||||||..|||||||.|||||.|:||||.||:
Mouse  1764 AMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLETRIRELEFELE 1828

  Fly  1827 GEQRRHADAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEAEEIAALN 1891
            |||:|:.::.|.|||.|||||||::||||||||..|:||||||||.|:|:||||.|||:|.|..:
Mouse  1829 GEQKRNTESVKGLRKYERRVKELTYQSEEDRKNVLRLQDLVDKLQVKVKSYKRQAEEADEQANAH 1893

  Fly  1892 LAKFRKAQQELEEAEERADLAEQAISKFRAKGR 1924
            |.||||||.||||||||||:||..::|.|||.|
Mouse  1894 LTKFRKAQHELEEAEERADIAESQVNKLRAKTR 1926

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 14/41 (34%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 418/671 (62%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 585/1080 (54%)
Myh3NP_001093105.1 Myosin_N 33..77 CDD:460670 14/43 (33%)
MYSc_Myh3 100..767 CDD:276878 418/671 (62%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 656..678 16/21 (76%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 758..772 8/13 (62%)
Myosin_tail_1 847..1924 CDD:460256 585/1077 (54%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1260..1289 7/28 (25%)

Return to query results.
Submit another query.