DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mhc and Myh1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_109604.1 Gene:Myh1 / 17879 MGIID:1339711 Length:1942 Species:Mus musculus


Alignment Length:1925 Identity:1066/1925 - (55%)
Similarity:1430/1925 - (74%) Gaps:16/1925 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    12 DPTPYLFVSLEQRRIDQSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRDLKKDL 76
            :..|||..|.::|...|:||:|:|.|.::.|.||.::...:::.:|..|:...:||.|..:|.|.
Mouse    12 EAAPYLRKSEKERIEAQNKPFDAKSSVFVVDAKESFVKATVQSREGGKVTAKTEGGTTVTVKDDQ 76

  Fly    77 LQQVNPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAK 141
            :..:|||||:|.|||:.:|:|::.:||:||::||...:||||||||||.:||||..|||......
Mouse    77 VYPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNAEVVA 141

  Fly   142 MYRGKRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATVGAS--KK 204
            .||||:|.|.|||||:|||.||..|||:..|||:|||||||||||.|||:||.||||:..:  ||
Mouse   142 AYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAVTGEKK 206

  Fly   205 TDEA--AKSKGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLL 267
            .:||  .|.:|:||||::..||:|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Mouse   207 KEEATSGKMQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADIETYLL 271

  Fly   268 EKARVISQQSLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTD 332
            ||:||..|...||||||||||||...|.:.::.|:|.|.|||..||||::||.||||.||...||
Mouse   272 EKSRVTFQLKAERSYHIFYQIMSNKKPDLIEMLLITTNPYDYAFVSQGEITVPSIDDQEELMATD 336

  Fly   333 QAFDILGFTKQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKN 397
            .|.||||||..|:..:|::|.||||.|.|||||:.||||||.||.|...:.:.|...::|:|.|.
Mouse   337 SAIDILGFTSDERVSIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLQNLNSADLLKA 401

  Fly   398 LLKPRIKVGNEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIA 462
            |..||:|||||:||:|:.||||.||:|||.|.|::::|.|:|.:.|:.|||:|.||:||||||||
Mouse   402 LCYPRVKVGNEYVTKGQTVQQVYNSVGALAKAVYEKMFLWMVTRINQQLDTKQPRQYFIGVLDIA 466

  Fly   463 GFEIFEYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPM 527
            |||||::|..||||||||||||||||||||||||||||::|||||.||||||||..||:||||||
Mouse   467 GFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMDLAACIELIEKPM 531

  Fly   528 GILSILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITG 592
            ||.||||||.|||||||.:|..||...|||||..||||||.| |:..|||::.||||.|.|||.|
Mouse   532 GIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYEQHLGKSNNFQKPKPAK-GKVEAHFSLVHYAGTVDYNIAG 595

  Fly   593 WLEKNKDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHA----GQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYK 653
            ||:|||||||:|||..::||..|.|..:|:..|    .:||||...||.: |||..|.|||:.::
Mouse   596 WLDKNKDPLNETVVGLYQKSSMKTLAYLFSGAAAAAEAESGGGGGKKGAK-KKGSSFQTVSALFR 659

  Fly   654 EQLNSLMTTLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPD 718
            |.||.|||.||||.|||||||||||.|.||.::..||:|||.||||||||||||||||:|::|.|
Mouse   660 ENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHELVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYAD 724

  Fly   719 FKMRYKIMCPKLL---QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERL 780
            ||.|||::....:   |.:: .|||:|.::..||:...||:.|:|||||:||:||.:||.||::|
Mouse   725 FKQRYKVLNASAIPEGQFID-SKKASEKLLGSIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDDKL 788

  Fly   781 GKIMSWMQAWARGYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIE 845
            .::::..||..||||:|..::|:.|:|.::..:|.|:|.::.::.|||.||:.|:||||..:..|
Mouse   789 AQLITRTQAMCRGYLARVEYQKMVERRESIFCIQYNVRAFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSAETE 853

  Fly   846 DEIARLEEKAKKAEE-LHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTA 909
            .|:|.::|:.:||:| |..||.| |||||.....|:.||..|...:..|..:|.|.:||..:|..
Mouse   854 KEMANMKEEFEKAKENLAKAEAK-RKELEEKMVALMQEKNDLQLQVQSEADSLADAEERCDQLIK 917

  Fly   910 QKNDLENQLRDIQERLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQI 974
            .|..||.:::::.||...||:...:|..:|:|.:.|.|.|||||:||||.:.|.|::|...::::
Mouse   918 TKIQLEAKIKEVTERAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKV 982

  Fly   975 RNLNDEIAHQDELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLER 1039
            :||.:|:|..||.|.||.||||...|.:|:|.::|||.|||:|.|.|.|.||||.:|:||.|||:
Mouse   983 KNLTEEMAGLDETIAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKIKLEQQVDDLEGSLEQ 1047

  Fly  1040 EKKVRGDVEKSKRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQ 1104
            |||:|.|:|::|||:||||||.||:..|:|.:|::|::.:::|:.|:|::.:|:||||.:.::.|
Mouse  1048 EKKIRMDLERAKRKLEGDLKLAQESTMDVENDKQQLDEKLKKKEFEMSNLQSKIEDEQALGMQLQ 1112

  Fly  1105 RQIKELQARIEELEEEVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAE 1169
            ::||||||||||||||:||||.:||||||||:||:|||||:.|||||||||||||||:|||||||
Mouse  1113 KKIKELQARIEELEEEIEAERASRAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKREAE 1177

  Fly  1170 LSKLRRDLEEANIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGV 1234
            ..|:|||||||.:|||:|.|.|||||.|:|||:.||:|.|.::|.|.||||:|...:::||.:.:
Mouse  1178 FQKMRRDLEEATLQHEATAATLRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEMKMEIDDLASNM 1242

  Fly  1235 DHITNEKAAQEKIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQ 1299
            :.|:..|...||:.:.|:..::|:::|.:|..|.:|:..|.:.:|..|:.:..|||:|.:|.|||
Mouse  1243 EVISKSKGNLEKMCRTLEDQVSELKTKEEEQQRLINELTAQRGRLQTESGEYSRQLDEKDSLVSQ 1307

  Fly  1300 LSKIKISLTTQLEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKAN 1364
            ||:.|.:.|.|:|:.||..:||.:.::.|....::..||.|.||||.|||.|.||:|||.:||||
Mouse  1308 LSRGKQAFTQQIEELKRQLEEEIKAKSALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKAELQRAMSKAN 1372

  Fly  1365 AEAQVWRSKYESDGVARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQL 1429
            :|...||:|||:|.:.|:|||||||:||..||.:|||.:|::|.||..||||||||..|||||.:
Mouse  1373 SEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQNEVEDLMI 1437

  Fly  1430 EVDRANAIANAAEKKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQL 1494
            :|:|.||...|.:|||:.||||:.|||.|.::..|||:|||||.|:.|||||::|.||||..:.|
Mouse  1438 DVERTNAACAALDKKQRNFDKILAEWKQKYEETHAELEASQKESRSLSTELFKIKNAYEESLDHL 1502

  Fly  1495 EAVRRENKNLADEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLR 1559
            |.::||||||..|:.||.:||.|||:.|||:||.:|::|.||.|||||||||||:||.||.|:||
Mouse  1503 ETLKRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKRIHELEKIKKQIEQEKSELQAALEEAEASLEHEEGKILR 1567

  Fly  1560 AQLELSQVRQEIDRRIQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINEL 1624
            .||||:||:.||||:|.||:||.:..::||.|.::|||::|:||.:.:.:|:|:|||:|.|:||:
Mouse  1568 IQLELNQVKSEIDRKIAEKDEEIDQLKRNHIRVVESMQSTLDAEIRSRNDAIRLKKKMEGDLNEM 1632

  Fly  1625 EIALDHANKANAEAQKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRT 1689
            ||.|:|:|:..|||.:|.:..|..|||.|..|::..|.::|.:|||.:.|||||.||.|:||.|.
Mouse  1633 EIQLNHSNRMAAEALRNYRNTQGILKDTQLHLDDALRGQEDLKEQLAMVERRANLLQAEIEELRA 1697

  Fly  1690 LLEQADRGRRQAEQELADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKA 1754
            .|||.:|.|:.|||||.||.|::..:..||.|:...|:|||:::..:..::::::.||:|:||||
Mouse  1698 TLEQTERSRKIAEQELLDASERVQLLHTQNTSLINTKKKLETDISQIQGEMEDIVQEARNAEEKA 1762

  Fly  1755 KKAMVDAARLADELRAEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVR 1819
            |||:.|||.:|:||:.|||.:...|:::|.|||.:|:||.||||||..|||||||.|||||.|||
Mouse  1763 KKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARVR 1827

  Fly  1820 ELENELDGEQRRHADAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEA 1884
            |||.|::.||:|:.:|.|.|||.|||||||::|:||||||..|:||||||||.|:|.||||.|||
Mouse  1828 ELEGEVENEQKRNVEAIKGLRKHERRVKELTYQTEEDRKNVLRLQDLVDKLQSKVKAYKRQAEEA 1892

  Fly  1885 EEIAALNLAKFRKAQQELEEAEERADLAEQAISKFRAKGR 1924
            ||.:.:|||||||.|.||||||||||:||..::|.|.|.|
Mouse  1893 EEQSNVNLAKFRKIQHELEEAEERADIAESQVNKLRVKSR 1932

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 12/41 (29%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 424/675 (63%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 575/1080 (53%)
Myh1NP_109604.1 Myosin_N 33..77 CDD:460670 13/43 (30%)
MYSc_Myh1_mammals 100..773 CDD:276875 424/675 (63%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 662..684 18/21 (86%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 764..778 8/13 (62%)
Myosin_tail_1 853..1930 CDD:460256 575/1077 (53%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1156..1175 17/18 (94%)

Return to query results.
Submit another query.