DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mhc and LOC100537594

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_021325145.2 Gene:LOC100537594 / 100537594 -ID:- Length:1937 Species:Danio rerio


Alignment Length:1920 Identity:1067/1920 - (55%)
Similarity:1431/1920 - (74%) Gaps:18/1920 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    22 EQRRID-QSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRDLKKDLLQQVNPPKY 85
            |:.||: |:.|:|:|.:.::.|..|.||.|.:.:.:|...:|....|:|..:|:|.:..:||||:
Zfish    20 ERERIEAQNTPFDAKSAYFVIDADEMYLKGTLTSREGGKATVKTHSGKTVTVKEDEVFPMNPPKF 84

  Fly    86 EKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAKMYRGKRRNE 150
            :|.|||:.:|:||:.|||:||::||...:||||||||||.:||||..|||.......||||:|.|
Zfish    85 DKIEDMAMMTHLNEPSVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYDAVVVAGYRGKKRIE 149

  Fly   151 VPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATV----GASKKTDEAAKS 211
            .|||||:|||.||..|||:..|||:|||||||||||.|||:||.|||||    ||.|:...|.|.
Zfish   150 APPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSVLITGESGAGKTVNTKRVIQYFATVGAMSGAKKQEPVAGKM 214

  Fly   212 KGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKARVISQQ 276
            :||||||::..||:|||:|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||:||..|.
Zfish   215 QGSLEDQIIAANPLLEAYGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGSTGKLASADIETYLLEKSRVTFQL 279

  Fly   277 SLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTDQAFDILGFT 341
            |.|||||||||:|:|..|.:.:..|:|.|.|||.::|||::||.||:|.|||..||.|.||||||
Zfish   280 SAERSYHIFYQLMTGHKPELLEALLITTNPYDYPMISQGEITVKSINDVEEFIATDTAIDILGFT 344

  Fly   342 KQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLKPRIKVG 406
            ..||..:|::|.||||.|.|||||:.||||||.||.|...:::.|.|.::|::.|.|..||:|||
Zfish   345 ADEKIAIYKLTGAVMHHGSMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKIAYLMGLNSADMLKALCYPRVKVG 409

  Fly   407 NEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFEIFEYNG 471
            ||.||:|:.|.||.|::.||||.|::::|.|:|.:.||.|||:|.||.|||||||||||||:||.
Zfish   410 NEMVTKGQTVPQVNNAVSALCKSVYEKMFLWMVIRINEMLDTKQPRQFFIGVLDIAGFEIFDYNS 474

  Fly   472 FEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPMGILSILEEE 536
            .||||||||||||||||||||||||||||::|||||.||||||||..||:||||||||.||||||
Zfish   475 LEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMDLAACIELIEKPMGIFSILEEE 539

  Fly   537 SMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWLEKNKDPL 601
            .|||||||.:|..||.:.||||.:.||||||.| |:..|||::.||||.|.|||.|||:||||||
Zfish   540 CMFPKATDTSFKNKLHDQHLGKCSAFQKPKPAK-GKAEAHFSLVHYAGTVDYNIVGWLDKNKDPL 603

  Fly   602 NDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHA---GQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNSLMTTL 663
            ||:||..::||..|:|..::|.||   .:.|||:  |||: ||||.|.|||:.::|.|..|||.|
Zfish   604 NDSVVQLYQKSSLKVLAFLYASHAAAEAEGGGGK--KGGK-KKGGSFQTVSALFRENLGKLMTNL 665

  Fly   664 RSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYKIMCP 728
            |||.||||||:||||.|.||:::..||:|||.||||||||||||||||:|::|.|||.|||::..
Zfish   666 RSTHPHFVRCLIPNESKTPGLMENFLVIHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYGDFKQRYKVLNA 730

  Fly   729 KLL---QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMSWMQAW 790
            .::   |.:: :|||:|.::..||:...||:.|:|||||:||:||.:||.|||:|..:::..||.
Zfish   731 SVIPEGQFID-NKKASEKLLGSIDVDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDEKLATLVTMTQAL 794

  Fly   791 ARGYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIEDEIARLEEKA 855
            .||::.||.|.|:.|:|.|:..:|.|:|.::.::.|||.||:.|:||||..:..|.|:|.::|..
Zfish   795 CRGFVMRKEFVKMMERREAIYSIQYNIRSFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEMAAMKENF 859

  Fly   856 KKAEELHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDLENQLRD 920
            :|.:|.....:..:||||.....||.||..|...::.|...|.|.:||...|...|..||.:|::
Zfish   860 EKMKEDLTKALAKKKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVASESENLSDAEERCEGLIKSKIQLEAKLKE 924

  Fly   921 IQERLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLNDEIAHQD 985
            ..|||..||:...:|..:|:|.:.|.|.|||||:||||.:.|.|::|...:::::||.:|:|.||
Zfish   925 TTERLEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMASQD 989

  Fly   986 ELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVRGDVEKS 1050
            |.|.||.||||...|.:|:|.::|||.|||:|.|.|.|:||||.:|:||.|||:|||:|.|:|::
Zfish   990 ESIAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKSKSKLEQQVDDLEGSLEQEKKLRMDLERA 1054

  Fly  1051 KRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKELQARIE 1115
            |||:||||||.||::.|||.:|::.|:.|::||.|:|.:.:|:||||.:..:.|::|||||||||
Zfish  1055 KRKLEGDLKLAQESIMDLENDKQQSEEKIKKKDFEISQLLSKIEDEQSLGAQLQKKIKELQARIE 1119

  Fly  1116 ELEEEVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKLRRDLEEA 1180
            |||||:||||.||||.|||||||:|||||:.||||||||||:||||:|||||||..||||||||:
Zfish  1120 ELEEEIEAERAARAKVEKQRADLSRELEEISERLEEAGGATAAQIEMNKKREAEFQKLRRDLEES 1184

  Fly  1181 NIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHITNEKAAQE 1245
            .:|||:|.|.||||..|:|||:.||:|.|.::|.|.||||:||..:::||.:.::.:...||..|
Zfish  1185 TLQHEATAAALRKKQADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEYKMEIDDLSSNMEAVAKAKANLE 1249

  Fly  1246 KIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKIKISLTTQ 1310
            |:.:.|:..|:|:::|.||..|.|||.:|.:.:|..||.:..|||||.|:.||||::.|.:.|.|
Zfish  1250 KMCRTLEDQLSEIKTKSDENIRQLNDMNAQRARLQTENGEFSRQLEEKEALVSQLTRGKQAYTQQ 1314

  Fly  1311 LEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKANAEAQVWRSKYE 1375
            :|:.||..:||.:.:..|....::..||.|.||||.|||.|.||:|||.:||||:|...||:|||
Zfish  1315 IEELKRHVEEEVKAKNALAHAVQSARHDCDLLREQFEEEQEAKAELQRGMSKANSEVAQWRTKYE 1379

  Fly  1376 SDGVARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRANAIANA 1440
            :|.:.|:|||||:|:||..||.:|||:||::|.||..||||||||..|||||.::|:||||:|..
Zfish  1380 TDAIQRTEELEESKKKLAQRLQDAEESIEAVNSKCASLEKTKQRLQGEVEDLMIDVERANALAAN 1444

  Fly  1441 AEKKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRRENKNLA 1505
            .:|||:.|||::.|||.|.::..|||:.:|||.|:.|||:|::|.:|||..:|||.::||||||.
Zfish  1445 LDKKQRNFDKVLAEWKQKYEEGQAELEGAQKEARSLSTEIFKMKNSYEEALDQLETLKRENKNLQ 1509

  Fly  1506 DEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLRAQLELSQVRQE 1570
            .|:.||.:|:||.|::|||:|||:|.:|:||.|:|.||||||..||.||:|:||.||||:||:.|
Zfish  1510 QEISDLTEQLGETGKSIHELEKAKKTVESEKVEIQTALEEAEGTLEHEESKILRVQLELNQVKSE 1574

  Fly  1571 IDRRIQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIALDHANKAN 1635
            |||::.||:||.|..::|.||.:||||::|::|.:.:.:|||:|||:|.|:||:||.|.|||:..
Zfish  1575 IDRKLAEKDEEIEQIKRNSQRVMDSMQSTLDSEIRSRNDALRVKKKMEGDLNEMEIQLSHANRQA 1639

  Fly  1636 AEAQKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQADRGRRQ 1700
            |||||.::..|.||||.|..|:|..|.::|.:||:.:.|||.|.:|.|:||.|..|||.:|||:.
Zfish  1640 AEAQKQLRNVQGQLKDAQLHLDEAIRGQEDMKEQVAMVERRNNLMQAEIEELRAALEQTERGRKV 1704

  Fly  1701 AEQELADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMVDAARLA 1765
            |||||.||.|::..:.:||.|:...|:|||::|..:..::|:.:.||:|:|||||||:.|||.:|
Zfish  1705 AEQELVDASERVGLLHSQNTSLINTKKKLEADLVQIQGEVDDAVQEARNAEEKAKKAITDAAMMA 1769

  Fly  1766 DELRAEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELENELDGEQR 1830
            :||:.|||.:...|:::|.||..:|:||.||||||..|:|||||.:||||.||||||:|::.|||
Zfish  1770 EELKKEQDTSAHLERMKKNLEVTVKDLQHRLDEAENLAMKGGKKQLQKLESRVRELESEVEAEQR 1834

  Fly  1831 RHADAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEAEEIAALNLAKF 1895
            |.|||.|.:||.|||||||::|:|||:||..|:||||||||.|:|.||||.|||||.|..:|:::
Zfish  1835 RGADAVKGVRKYERRVKELTYQTEEDKKNVTRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEEAEEQANTHLSRY 1899

  Fly  1896 RKAQQELEEAEERADLAEQAISKFRAKGRAGSVGR 1930
            ||.|.|:|||:||||:||..::|.|||.|  .||:
Zfish  1900 RKVQHEMEEAQERADIAESQVNKLRAKSR--DVGK 1932

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 12/41 (29%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 425/674 (63%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 573/1079 (53%)
LOC100537594XP_021325145.2 None

Return to query results.
Submit another query.