DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mhc and LOC100495802

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_031747898.1 Gene:LOC100495802 / 100495802 XenbaseID:XB-GENE-29082827 Length:1937 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1924 Identity:1068/1924 - (55%)
Similarity:1429/1924 - (74%) Gaps:19/1924 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    16 YLFVSLEQRRIDQSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRDLKKDLLQQV 80
            ||..|.::|...||||:|:|.:.::.|.||.|:.|.:.|.:...|:|....|....:|...:...
 Frog    15 YLRKSEKERIEAQSKPFDAKNTVFVDDAKELYVKGMVTAREDGKVTVKTDAGNNVTVKDSQIYPQ 79

  Fly    81 NPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAKMYRG 145
            |||||:|.|||:.:|:||:||||:||::||...:||||||||||.:||||..|||.......|||
 Frog    80 NPPKYDKIEDMAMMTHLNEASVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNPEVVAGYRG 144

  Fly   146 KRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATVGA----SKKTD 206
            |:|.|.|||||:|||.||..|||:..|||:|||||||||||.|||:||.||||:.|    .||.:
 Frog   145 KKRVEAPPHIFSISDNAYQAMLTDRENQSVLITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAAIGDSGKKKE 209

  Fly   207 EAAKSKGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKAR 271
            .:...:|:||||::|.||:|||||||||||||||||||||||||||.||||:.||||||||||:|
 Frog   210 PSNSLQGTLEDQIIQANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLSSADIETYLLEKSR 274

  Fly   272 VISQQSLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTDQAFD 336
            |..|.|.|||||||||:|:...|.:.::||:|.|.||:..:|||::.|.||||.||...||.|.|
 Frog   275 VTFQLSAERSYHIFYQMMTNKKPEIIEMCLITTNPYDFPFISQGEIVVKSIDDQEELMATDSAID 339

  Fly   337 ILGFTKQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLKP 401
            ||||.:.||..:|::|.||||...|||||:.||||||.||.|:..:::.|.|.::|:|.|.|..|
 Frog   340 ILGFNQDEKVGIYKLTGAVMHHSNMKFKQKQREEQAEPDGTEDADKIAYLMGLNSADLLKALCYP 404

  Fly   402 RIKVGNEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFEI 466
            |:||||||||:|:.|.||.|::|||||.|:::||.|:|.:.|:.|||:|.||.||||||||||||
 Frog   405 RVKVGNEFVTKGQTVGQVNNAVGALCKSVYEKLFLWMVTRINQQLDTKQPRQFFIGVLDIAGFEI 469

  Fly   467 FEYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPMGILS 531
            |::|..||||||||||||||||||||||||||||::|||:|.||||||||..||:||||||||.|
 Frog   470 FDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIDWEFIDFGMDLAACIELIEKPMGIFS 534

  Fly   532 ILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWLEK 596
            |||||.|||||||.:|..||...||||...|:||||.| |:..|||::.||||.|.|||:|||:|
 Frog   535 ILEEECMFPKATDTSFKNKLYEQHLGKCKNFEKPKPGK-GKAEAHFSLGHYAGTVDYNISGWLDK 598

  Fly   597 NKDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHA---GQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNS 658
            ||||||::||..::||..|||..:::.:|   ..:||    |||:.|||..|.|||:.::|.||.
 Frog   599 NKDPLNESVVQLYQKSSVKLLSFLYSSYAAADADAGG----KGGKKKKGSSFQTVSALFRENLNK 659

  Fly   659 LMTTLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRY 723
            |||.||||.||||||:||||.|.||:::.||::|||.||||||||||||||||:|::|.|||.||
 Frog   660 LMTNLRSTHPHFVRCLIPNESKTPGIMENHLIIHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYGDFKQRY 724

  Fly   724 KIMCPKLL---QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMS 785
            |::....:   |.:: .|||:|.::..||:...||:.|:|||||:||:||.:||.|||:|.::::
 Frog   725 KVLNASAIPDGQFID-SKKASEKLLGSIDVDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDEKLAQLIT 788

  Fly   786 WMQAWARGYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIEDEIAR 850
            ..||..||:|.|..||::.|:|.::..:|.|||.::.::.|||.||:.|:||||..:..|.|:..
 Frog   789 RTQALCRGFLMRVEFKQMMERRESIYTIQYNLRSFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEMQN 853

  Fly   851 LEEKAKKAEE-LHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDL 914
            ::|:.:|.:: |..||.| :||||.....||.||..|...:..|...|.|.:||...|...|..|
 Frog   854 MKEEFEKTKDALAKAEAK-KKELEEKMVVLLQEKNDLSLQVQTESETLADSEERCEGLIKVKIQL 917

  Fly   915 ENQLRDIQERLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLND 979
            |:::::|.|||..||::..:|..:|:|.:.|.|.|||||:||||.:.|.|::|...:::::||.:
 Frog   918 ESKIKEITERLEDEEESNAELTAKKRKLEDETSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTE 982

  Fly   980 EIAHQDELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVR 1044
            |:|..||.|:||.||||...|.:|:|.::|||.|||::.|.|.|.||||.:|:||.|||:|||:|
 Frog   983 EMAVLDENISKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVSSLTKAKTKLEQQVDDLEGSLEQEKKLR 1047

  Fly  1045 GDVEKSKRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKE 1109
            .|:|::|||:||||||:||.|.|||.:|::.|:.:::||.|:|.:..|:||||.:..:.|::|||
 Frog  1048 LDLERAKRKLEGDLKLSQETVMDLENDKQQTEEKLKKKDFEISQLQGKIEDEQTLGTQLQKKIKE 1112

  Fly  1110 LQARIEELEEEVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKLR 1174
            |||||||||||:||||.||||.|||||||:|||||:.|||||||||||||||:|||||||..|:|
 Frog  1113 LQARIEELEEEIEAERAARAKIEKQRADLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKREAEFQKVR 1177

  Fly  1175 RDLEEANIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHITN 1239
            ||||||.:|||:|...|||||.|:|||:.||:|.|.::|.|.||||:|...:::||.:.:::::.
 Frog  1178 RDLEEATLQHEATAGALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEIDDLASNLENVSK 1242

  Fly  1240 EKAAQEKIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKIK 1304
            .||..||:.:.::..|:||:||.||..|.:||..|.:.:...||.:|.||:||.||.:||||:.|
 Frog  1243 AKANLEKVNRVIEDQLSEVKSKGDEQQRLVNDLGAQRARFQTENGELSRQVEEKESLISQLSRGK 1307

  Fly  1305 ISLTTQLEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKANAEAQV 1369
            ...|.|:|:.||..:|||:.:..|....::..||.|.||||.|||.|.||:|||.|||||.|...
 Frog  1308 QGFTQQIEELKRQLEEESKAKNALAHALQSARHDSDLLREQYEEEQEAKAELQRSLSKANGEVAQ 1372

  Fly  1370 WRSKYESDGVARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRA 1434
            ||:|||:|.:.|:|||||||:||..||.||||.:|::|.||..|:||||||.:|||||.::|:||
 Frog  1373 WRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEQVEAVNSKCASLDKTKQRLQSEVEDLMVDVERA 1437

  Fly  1435 NAIANAAEKKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRR 1499
            |:.|.|.:|||:.|||::.|||.|.::..|||:|:.||.|:.|||:|::|.||||..|.:|.::|
 Frog  1438 NSAAAALDKKQRNFDKVLSEWKQKYEEGQAELEAALKEARSQSTEIFKVKNAYEESLEHVETLKR 1502

  Fly  1500 ENKNLADEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLRAQLEL 1564
            |||||..|:.||.:||||.|::|:|:|||:|::|.||.:|||||||||.:||.||.|:||.||||
 Frog  1503 ENKNLQQEISDLTEQIGETGKSINELEKAKKQVEQEKSDLQAALEEAEGSLEHEEAKILRIQLEL 1567

  Fly  1565 SQVRQEIDRRIQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIALD 1629
            :||:.|:||:|.||:||.|..::|.|||:|::|::|::|.:.:.:|||:|||:|.|:|||||.|.
 Frog  1568 NQVKSEVDRKIAEKDEENEQLKRNSQRAIDTIQSTLDSEIRSRNDALRLKKKMEGDLNELEIQLS 1632

  Fly  1630 HANKANAEAQKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQA 1694
            |||:...||||.::..|.|.||.|..|::..|.:||.:||:.:.|||.|..|.|:||:|..|||.
 Frog  1633 HANRQAGEAQKQLRNVQAQYKDAQLQLDDAVRGQDDLKEQVAVIERRNNLQQAEIEENRAALEQT 1697

  Fly  1695 DRGRRQAEQELADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMV 1759
            :|.|:.|||||.||.|::..:.:||.|:..:|:|||::|..|.::::|.:.||:|:|||||||:.
 Frog  1698 ERSRKIAEQELLDASERVQLLHSQNTSLIGSKKKLEADLSQLQNEVEEAVQEARNAEEKAKKAIT 1762

  Fly  1760 DAARLADELRAEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELENE 1824
            |||.:|:||:.|||.:...|:::|.|||.:|:||.||||||..|:|||||.:||||.||||||||
 Frog  1763 DAALMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQNRLDEAEQLAMKGGKKQLQKLESRVRELENE 1827

  Fly  1825 LDGEQRRHADAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEAEEIAA 1889
            ||.||:|..||.|.:||.|||||||::|:||||||..|:||||||||.|:|.||||.||:||.|.
 Frog  1828 LDNEQKRGVDAVKGVRKYERRVKELTYQTEEDRKNVLRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEESEEQAT 1892

  Fly  1890 LNLAKFRKAQQELEEAEERADLAEQAISKFRAKGR-AGS 1927
            .:|::|||.|.||||||||||:||..::|.|||.| |||
 Frog  1893 THLSRFRKVQHELEEAEERADIAESQVNKLRAKSRDAGS 1931

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 12/41 (29%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 416/674 (62%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 579/1080 (54%)
LOC100495802XP_031747898.1 Myosin_N 32..76 CDD:460670 12/43 (28%)
MYSc_class_II 99..768 CDD:276951 416/674 (62%)
Myosin_tail_1 848..1925 CDD:460256 579/1077 (54%)

Return to query results.
Submit another query.