DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mhc and myh13

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017953365.1 Gene:myh13 / 100492956 XenbaseID:XB-GENE-5993071 Length:1935 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1910 Identity:1066/1910 - (55%)
Similarity:1425/1910 - (74%) Gaps:11/1910 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    22 EQRRID-QSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRDLKKDLLQQVNPPKY 85
            |:.||: |::|:|:|.|.::.|.|:.|:.|.|::.:|...:|..:...|..:|.|.:..:|||||
 Frog    20 EKERIEAQNRPFDAKTSTFVIDPKQMYVKGVIQSKEGGKATVKKEDMSTVTVKDDEVFPMNPPKY 84

  Fly    86 EKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAKMYRGKRRNE 150
            :|.|||:.:|:||:.|||:||::||...:||||||||||.:||||..|||.......||||:|.|
 Frog    85 DKIEDMAMMTHLNEPSVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNPEVVNAYRGKKRQE 149

  Fly   151 VPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATVGA--SKKTDEAAKSKG 213
            .|||||:|||.||..|||:..|||:|||||||||||.|||:||.||||:.|  .||.::..|.:|
 Frog   150 APPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAAIGDKKKEQTGKIQG 214

  Fly   214 SLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKARVISQQSL 278
            :||||::|.||:|||||||||||||||||||||||||||.||||:.||||||||||:||..|.|.
 Frog   215 TLEDQIIQANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLSSADIETYLLEKSRVTFQLSA 279

  Fly   279 ERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTDQAFDILGFTKQ 343
            ||||||||||||...|.:.::.|:|.|.||:..||||::|||||||.||...||.|.|||||...
 Frog   280 ERSYHIFYQIMSNKRPELIEMLLITTNPYDFPYVSQGEITVASIDDQEELMATDSAIDILGFNPD 344

  Fly   344 EKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLKPRIKVGNE 408
            ||..:|::|.||||.|.|:|||:.||||||.||.|...:.:.|.|.::|:|.|.|..||:|||||
 Frog   345 EKVGIYKMTGAVMHYGNMRFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLMGLNSADLLKALCYPRVKVGNE 409

  Fly   409 FVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFEIFEYNGFE 473
            |||:|:.||||.||:|||.|.|::::|.|:|.:.|:.|||:|.||||||||||||||||::|..|
 Frog   410 FVTKGQTVQQVYNSVGALGKSVYEKMFLWMVIRINQQLDTKQPRQHFIGVLDIAGFEIFDFNSLE 474

  Fly   474 QLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPMGILSILEEESM 538
            |||||||||||||||||||||||||||::|||:|.||||||||..||:||||||||.||||||.|
 Frog   475 QLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIDWEFIDFGMDLAACIELIEKPMGIFSILEEECM 539

  Fly   539 FPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWLEKNKDPLND 603
            ||||||.:|..||.:.|||||..||||||.| |:..|||::.||||.|.|||:|||:|||||||:
 Frog   540 FPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNFQKPKPAK-GKAEAHFSLVHYAGTVDYNISGWLDKNKDPLNE 603

  Fly   604 TVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAGQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNSLMTTLRSTQP 668
            ||:..::||..|||..:::.::|........|||: |||..|.|||:.::|.||.||:.||||.|
 Frog   604 TVIGLYQKSSVKLLSFLYSAYSGTDADTGGKKGGK-KKGSSFQTVSALFRENLNKLMSNLRSTHP 667

  Fly   669 HFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYKIMCPKLL-- 731
            |||||:||||.|.||.:|.:||||||.||||||||||||||||:|::|.|||.||||:....:  
 Frog   668 HFVRCLIPNETKTPGEMDHYLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYGDFKQRYKILNASAIPE 732

  Fly   732 -QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMSWMQAWARGYL 795
             |.:: .|||:|.::..||:...|||.|:|||||:||:||.:||.|||||.::::..||..||:|
 Frog   733 GQFID-SKKASEKLLGSIDVDHTQYRFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDERLAQLITRTQAMCRGFL 796

  Fly   796 SRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIEDEIARLEEKAKKAEE 860
            .|..|:|:.|:|.::..:|.|:|.::.::.|||.||:.|:||||..:..|.|:..::|:.:|.:|
 Frog   797 MRVEFRKMMERRESVFCIQYNIRSFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSAESEKEMQNMKEEFEKTKE 861

  Fly   861 -LHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDLENQLRDIQER 924
             |..||.| |||||.....:|.||..|...::.|...|.|.:||...|...|..||.::::..||
 Frog   862 ALAKAEAK-RKELEEKMVAILQEKNDLQLQVASESEGLADAEERCEGLIKSKIQLEAKIKEFNER 925

  Fly   925 LTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLNDEIAHQDELIN 989
            |..||::..:|..:|:|.:.|.|.|||||:||||.:.|.|::|...:::::||.:|:|..||.|.
 Frog   926 LEDEEESNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMAVLDETIA 990

  Fly   990 KLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVRGDVEKSKRKV 1054
            ||.||||...|.:|:|.::|||.|||:|.|.|.|.||||.:|:||.|||:|||:|.|:|::|||:
 Frog   991 KLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKTKLEQQVDDLEGSLEQEKKLRMDMERAKRKL 1055

  Fly  1055 EGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKELQARIEELEE 1119
            ||||||.||:..|||.::::|::.:::|:.|:|.:.:|:||||.:..:.|::|||||||||||||
 Frog  1056 EGDLKLAQESTMDLENDRQQLDEKVKKKEFEISQLQSKIEDEQALAAQLQKKIKELQARIEELEE 1120

  Fly  1120 EVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKLRRDLEEANIQH 1184
            |:||||.|||||||||:||:|||||:.|||||||||||||||:|||||||..|:|||||||.:||
 Frog  1121 EIEAERAARAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKREAEFQKMRRDLEEATLQH 1185

  Fly  1185 ESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHITNEKAAQEKIAK 1249
            |:|.:.|||||.|:|||..||:|.|.::|.|.||||:|...:::||.:.::.::..|:..||:.:
 Frog  1186 EATASALRKKHADSVAEFGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEIDDLASNMESVSKSKSNLEKMCR 1250

  Fly  1250 QLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKIKISLTTQLEDT 1314
            .|:...:|:::|.:|..|.:||.:|.:.:|..||.:..|||||.||.:|||::.|.:.|.|.|:.
 Frog  1251 TLEDQFSEIKTKEEEHLRVINDINAQRARLQTENGEFARQLEEKESLISQLTRGKQAFTQQTEEL 1315

  Fly  1315 KRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKANAEAQVWRSKYESDGV 1379
            ||..:||::.:..|....::..||.|.||||.|||.|.|.:|||.|||||.|...||:|||:|.:
 Frog  1316 KRQLEEETKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKGELQRSLSKANGEVAQWRTKYETDAI 1380

  Fly  1380 ARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRANAIANAAEKK 1444
            .|:|||||||:||..||.||||.||::|.||..||||||||..|||||.::|:|:||...|.:||
 Frog  1381 QRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEQIEAVNSKCASLEKTKQRLQNEVEDLMVDVERSNAACAALDKK 1445

  Fly  1445 QKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRRENKNLADEVK 1509
            ||.|||::.|||.|.::..|||:|||||.|:.|||:|::|.:|||..:|||.::||||||..|:.
 Frog  1446 QKNFDKVLAEWKQKFEESQAELEASQKESRSLSTEVFKMKNSYEEALDQLETLKRENKNLQQEIA 1510

  Fly  1510 DLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLRAQLELSQVRQEIDRR 1574
            ||.:||.|.|:.:||:|||:|::|:||.:||::||||||:||.||.|:||.||||:||:.||||:
 Frog  1511 DLTEQIAETGKTMHELEKAKKQIESEKSDLQSSLEEAEASLEHEEAKILRIQLELTQVKSEIDRK 1575

  Fly  1575 IQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIALDHANKANAEAQ 1639
            :.||:||.|..::|.||||:|||::|:||.:.:.:|||:|||:|.|:||:||.|.|||:..||:|
 Frog  1576 LAEKDEEIEQIKRNSQRALESMQSTLDAEIRSRNDALRLKKKMEGDLNEMEIQLSHANRQAAESQ 1640

  Fly  1640 KNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQADRGRRQAEQE 1704
            |.::..|...||.|..|::..|..||.:|||.:||||.|.:..|:||.|:.|||.:|.|:.||||
 Frog  1641 KQLRNVQGLYKDAQLHLDDALRGIDDLKEQLAMSERRNNLMTAEIEEMRSALEQTERARKVAEQE 1705

  Fly  1705 LADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMVDAARLADELR 1769
            |.|..|::..:.:||.|:...|:|||:::..|.|:::|.:.|::|:|||||||:.|||.:|:||:
 Frog  1706 LLDVTERVQLLHSQNTSLINTKKKLETDVSQLQSEVEEAIQESRNAEEKAKKAITDAAMMAEELK 1770

  Fly  1770 AEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELENELDGEQRRHAD 1834
            .|||.:...|:::|.|||.:|:||.||||||..|:|||||.:||||.||||||||||.||:|.:|
 Frog  1771 KEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLAMKGGKKQLQKLEARVRELENELDAEQKRSSD 1835

  Fly  1835 AQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEAEEIAALNLAKFRKAQ 1899
            |.|.:||.||||||||:|||||:||..|:||||||||.|:|.||||.||.||.|.::|::|||||
 Frog  1836 AVKGVRKYERRVKELSYQSEEDKKNVFRLQDLVDKLQLKVKAYKRQSEEVEEQANVHLSRFRKAQ 1900

  Fly  1900 QELEEAEERADLAEQAISKFRAKGR 1924
            .||||||||||:||..::|.|.|.|
 Frog  1901 HELEEAEERADIAESQVNKLRVKTR 1925

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 12/41 (29%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 424/669 (63%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 575/1080 (53%)
myh13XP_017953365.1 Myosin_N 32..76 CDD:460670 13/43 (30%)
Motor_domain 99..766 CDD:473979 424/669 (63%)
Myosin_tail_1 846..1923 CDD:460256 575/1077 (53%)

Return to query results.
Submit another query.