DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mhc and myhz1.1l

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_021325144.1 Gene:myhz1.1l / 100008376 ZFINID:ZDB-GENE-200402-1 Length:1936 Species:Danio rerio


Alignment Length:1911 Identity:1064/1911 - (55%)
Similarity:1426/1911 - (74%) Gaps:11/1911 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    22 EQRRID-QSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRDLKKDLLQQVNPPKY 85
            |:.||: |:.|:|:|.:.::.|..|.||.|.:::.:|...:|....|:|..:|:|.:..:||||:
Zfish    20 ERERIEAQNTPFDAKTAYFVVDADEMYLKGTLQSKEGGKATVKTHSGKTVTVKEDEIFPMNPPKF 84

  Fly    86 EKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAKMYRGKRRNE 150
            :|.|||:.:|:||:..||:||::||...:||||||||||.:||||..|||.......||||:|.|
Zfish    85 DKIEDMAMMTHLNEPCVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYDAIVVAGYRGKKRIE 149

  Fly   151 VPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATV----GASKKTDEAAKS 211
            .|||||:|||.||..|||:..|||:|||||||||||.|||:||.|||||    ||.|:...|.|.
Zfish   150 APPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSVLITGESGAGKTVNTKRVIQYFATVGAMSGAKKQEPVAGKM 214

  Fly   212 KGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKARVISQQ 276
            :||||||:|..||:|||:|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||:||..|.
Zfish   215 QGSLEDQIVAANPLLEAYGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADIETYLLEKSRVTFQL 279

  Fly   277 SLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTDQAFDILGFT 341
            |.|||||||||:|:|..|.:.:..|:|.|.|||.::|||::||.||:|.|||..||.|.||||||
Zfish   280 SAERSYHIFYQLMTGHKPELLEALLITTNPYDYPMISQGEITVKSINDVEEFIATDTAIDILGFT 344

  Fly   342 KQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLKPRIKVG 406
            ..||..:|::|.||||.|.|||||:.||||||.||.|...:::.|.|.::|::.|.|..||:|||
Zfish   345 ADEKIAIYKLTGAVMHHGSMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKIAYLMGLNSADMLKALCYPRVKVG 409

  Fly   407 NEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFEIFEYNG 471
            ||.||:|:.|.||.|::.||||.|::::|.|:|.:.||.|||:|.||.|||||||||||||::|.
Zfish   410 NEMVTKGQTVPQVNNAVSALCKSVYEKMFLWMVIRINEMLDTKQPRQFFIGVLDIAGFEIFDFNS 474

  Fly   472 FEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPMGILSILEEE 536
            .||||||||||||||||||||||||||||::|||||.||||||||..||:||||||||.||||||
Zfish   475 LEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMDLAACIELIEKPMGIFSILEEE 539

  Fly   537 SMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWLEKNKDPL 601
            .|||||||.:|..||.:.||||.:.||||||.| |:..|||::.||||.|.|||.|||:||||||
Zfish   540 CMFPKATDTSFKNKLHDQHLGKCSAFQKPKPAK-GKAEAHFSLVHYAGTVDYNIVGWLDKNKDPL 603

  Fly   602 NDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAGQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNSLMTTLRST 666
            ||:||..::||..|:|..::|.|.|::.||...|||: ||||.|.|||:.::|.|..|||.||||
Zfish   604 NDSVVQLYQKSSLKVLAFLYASHGGEAEGGGGKKGGK-KKGGSFQTVSALFRENLGKLMTNLRST 667

  Fly   667 QPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYKIMCPKLL 731
            .||||||:||||.|.||:::..||:|||.||||||||||||||||:|::|.|||.|||::...::
Zfish   668 HPHFVRCLIPNESKTPGLMENFLVIHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYGDFKQRYKVLNASVI 732

  Fly   732 ---QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMSWMQAWARG 793
               |.:: :|||:|.::..||:...||:.|:|||||:||:||.:||.|||:|..:::..||..||
Zfish   733 PEGQFID-NKKASEKLLGSIDVDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDEKLASLVTMTQALCRG 796

  Fly   794 YLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIEDEIARLEEKAKKA 858
            |:.||.|.|:.|:|.|:..:|.|:|.::.::.|||.||:.|:||||..:..|.|:|.::|..:|.
Zfish   797 YVMRKEFVKMMERREAIYSIQYNIRSFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEMAAMKENYEKM 861

  Fly   859 EELHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDLENQLRDIQE 923
            :|.....:..:||||.....||.||..|...::.|...|.|.:||...|...|..||.:|::..|
Zfish   862 KEDLTKALAKKKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVASEGENLSDAEERCEGLIKSKIQLEAKLKETTE 926

  Fly   924 RLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLNDEIAHQDELI 988
            ||..||:...:|..:|:|.:.|.|.|||||:||||.:.|.|::|...:::::||.:|:|.|||.|
Zfish   927 RLEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMASQDESI 991

  Fly   989 NKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVRGDVEKSKRK 1053
            .||.||||...|.:|:|.::|||.|||:|.|.|.|:||||.:|:||.|||:|||:|.|:|::|||
Zfish   992 AKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKSKSKLEQQVDDLEGSLEQEKKLRMDLERAKRK 1056

  Fly  1054 VEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKELQARIEELE 1118
            :||||||.||::.|||.:|::.|:.|::||.|:|...:|:||||.:..:.|::||||||||||||
Zfish  1057 LEGDLKLAQESIMDLENDKQQSEEKIKKKDFEISQFLSKIEDEQSLGAQLQKKIKELQARIEELE 1121

  Fly  1119 EEVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKLRRDLEEANIQ 1183
            ||:||||.||||.|||||||:|||||:.||||||||||:||||:|||||||..||||||||:.:|
Zfish  1122 EEIEAERAARAKVEKQRADLSRELEEISERLEEAGGATAAQIEMNKKREAEFQKLRRDLEESTLQ 1186

  Fly  1184 HESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHITNEKAAQEKIA 1248
            ||:|.|.||||..|:|||:.||:|.|.::|.|.||||:||..:::||.:.::.:...||..||:.
Zfish  1187 HEATAAALRKKQADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEYKMEIDDLSSNMEAVAKAKANLEKMC 1251

  Fly  1249 KQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKIKISLTTQLED 1313
            :.|:..|:|:::|.||..|.|||.:|.:.:|..||.:..|||||.|:.||||::.|.:.|.|:|:
Zfish  1252 RTLEDQLSEIKTKSDENIRQLNDMNAQRARLQTENGEFSRQLEEKEALVSQLTRGKQAYTQQIEE 1316

  Fly  1314 TKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKANAEAQVWRSKYESDG 1378
            .||..:||.:.:..|....::..||.|.||||.|||.|.||:|||.:||||:|...||:|||:|.
Zfish  1317 LKRHVEEEVKAKNALAHAVQSARHDCDLLREQFEEEQEAKAELQRGMSKANSEVAQWRTKYETDA 1381

  Fly  1379 VARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRANAIANAAEK 1443
            :.|:|||||:|:||..||.:|||:||::|.||..||||||||..|||||.::|:||||:|...:|
Zfish  1382 IQRTEELEESKKKLAQRLQDAEESIEAVNSKCASLEKTKQRLQGEVEDLMIDVERANALAANLDK 1446

  Fly  1444 KQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRRENKNLADEV 1508
            ||:.|||::.|||.|.::..|||:.:|||.|:.|||:|::|.:|||..:|||.::||||||..|:
Zfish  1447 KQRNFDKVLAEWKQKYEEGQAELEGAQKEARSLSTEIFKMKNSYEEALDQLETLKRENKNLQQEI 1511

  Fly  1509 KDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLRAQLELSQVRQEIDR 1573
            .||.:|:||.|::|||:|||:|.:|:||.|:|.||||||..||.||:|:||.||||:||:.||||
Zfish  1512 SDLTEQLGETGKSIHELEKAKKTVESEKVEIQTALEEAEGTLEHEESKILRVQLELNQVKSEIDR 1576

  Fly  1574 RIQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIALDHANKANAEA 1638
            ::.||:||.|..::|.||.||:||::|::|.:.:.:|||:|||:|.|:||:||.|.|||:..|||
Zfish  1577 KLAEKDEEIEQIKRNSQRVLDAMQSTLDSEVRSRNDALRVKKKMEGDLNEMEIQLSHANRQAAEA 1641

  Fly  1639 QKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQADRGRRQAEQ 1703
            ||.::..|.||||.|..|:|..|.::|.:||:.:.|||.|.:|.|:||.|..|||.:|||:.|||
Zfish  1642 QKQLRNVQGQLKDAQLHLDEAVRGQEDMKEQVAMVERRNNLMQAEIEELRAALEQTERGRKVAEQ 1706

  Fly  1704 ELADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMVDAARLADEL 1768
            ||.||.|::..:.:||.|:...|:|||::|..:..::|:.:.||:|:|||||||:.|||.:|:||
Zfish  1707 ELVDASERVGLLHSQNTSLINTKKKLEADLVQIQGEVDDAVQEARNAEEKAKKAITDAAMMAEEL 1771

  Fly  1769 RAEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELENELDGEQRRHA 1833
            :.|||.:...|:::|.||..:|:||.||||||..|:|||||.:||||.||||||:|::.||||.|
Zfish  1772 KKEQDTSAHLERMKKNLEVTVKDLQHRLDEAENLAMKGGKKQLQKLESRVRELESEVEAEQRRGA 1836

  Fly  1834 DAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEAEEIAALNLAKFRKA 1898
            ||.|.:||.|||||||::|:|||:||..|:||||||||.|:|.||||.|||||.|..:|:::||.
Zfish  1837 DAVKGVRKYERRVKELTYQTEEDKKNVTRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEEAEEQANTHLSRYRKV 1901

  Fly  1899 QQELEEAEERADLAEQAISKFRAKGR 1924
            |.|:|||:||||:||..::|.|||.|
Zfish  1902 QHEMEEAQERADIAESQVNKLRAKSR 1927

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 12/41 (29%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 423/671 (63%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 573/1079 (53%)
myhz1.1lXP_021325144.1 Myosin_N 32..76 CDD:460670 13/43 (30%)
MYSc_class_II 99..768 CDD:276951 423/671 (63%)
Myosin_tail_1 848..1925 CDD:460256 573/1076 (53%)

Return to query results.
Submit another query.