Protein Alignment glu and smc3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_723996.1
• Gene: glu / 35001
• FlyBaseID: FBgn0015391
• Length: 1409
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_999854.1
• Gene: smc3 / 324475
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-3196
• Length: 1216
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1325
• Identity: 305/1325 - (23%)
• Similarity: 550/1325 - (41%)
• Gaps: 268/1325 - (20%)

  Fly    87 LIISKIVNRNFKSYAGEVELGPFHQSFTAIIGPNGSGKSNVIDSMMFVFGCRANRIRCKRVSTLI 151
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Zfish     1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTVVDPFGSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALL 65

  Fly   152 HSSSSYPNLRSCSVAVHFKQIVDKGDGTCEDVP-DSSIVIERTAMSDNSSYYQINDKRAQLKDVA 215
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Zfish    66 HEGTG-PRVISAFVEIIF-------DNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVM 122

  Fly   216 KLLKKHHVDLEHNRFLILQGEVESIAMMKPKGQTENETGMLEYLEDIVGTQRYIRPLQQINQRVD 280
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Zfish   123 NLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMA-------TAPDSQRLKLLREVAGTRVY-------DERKE 173

  Fly   281 QL------TDDRTEKHNR-CKLAEREMKDLEQPFNEAVDYLKKENELVRTKSFHI-QKIISIKKS 337
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Zfish   174 ESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEDEKEELAQY-QKWDKMRRALEYTIYNQELNETRA 237

  Fly   338 KLEQYTQEHEACAEELKTHDEGTAALKQSRAEKETIIRKEI--------EEYEAL-VKKREQIKK 393
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Zfish   238 KLDELSSKRETCGDKSRQLRDAQQDARDKVEETERVVR-ELKSRISAMKEEKEQLSAERQEQIKQ 301

  Fly   394 RLVTVESAYTEIQSTMENTNKQRKKDKAQIEKNEKELEDLHKLPEKNQREIEDCNKKLESLEVSK 458
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Zfish   302 R-TKLELKAKDLQDELAGNSEQRK----------RLLKERQKLLEK----IEEKQKELQETEPKF 351

  Fly   459 VTLNEELEKQQAELTKTTAPLT---------------EKRLK-LSDELVGLKEKVNTAKGEVQVF 507
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Zfish   352 NTVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAA- 415

  Fly   508 ESQLKILKQAETTESRKYETLKSSYEQSQKSLEEKVTRVDELKE---SIPRMKTEIAS------- 562
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Zfish   416 -----IHKDLEDTEQNKERNLE-QYNKLDQDLNEVKTRVEELDKKYYEVKNRKDELQSERNYLWR 474

  Fly   563 -KSAEVDKMVKEERNLSMQCNKLRTEINERSSVMQAQRSNNKVLDFLMRMKMEGKI----PGILG 622
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Zfish   475 EENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGK--AILNGIDSINKVLEHFRRKGINQHVINGYHGIV- 536

  Fly   623 RLGDLGGIDAKYDIAISTACGRLDNIVTDNYETASAAIGALKEYNV-GRATFITLDKIEHHRREA 686
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Zfish   537 -MNNFECEPAFYTCVEVTAGTRLFYHIVETDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLSKLD-VRDTA 599

  Fly   687 NSRINTPENVPRLYDLVKVED-DRVRTAFYFALRNTLVCDDLEQGTRIAYGRERYRV--VTLRGE 748
            ....|  :.:|.:..|...:: |:   ||......||:|..:|..|::|   ..:.:  :||.|:
Zfish   600 YPETN--DAIPMISKLRYSQNFDK---AFKHVFGKTLICRSMEVSTQLA---RAFTMDCITLEGD 656

  Fly   749 MIEMTGTMSGGGSRPIRGKMGTQVRTKTAESADSSQISQKALEDMQIQAEELQARVNYCQEQQGS 813
            .:...|.::||.....:.::..|...:.||.                :..||:|::|      .:
Zfish   657 QVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDMRKAEE----------------ELGELEAKLN------EN 699

  Fly   814 LEREIQTLKNGLQRDEAEYKRLAVSITSLEQQMASNLKQCEAQRQRMLKKTTDE-----RAVKER 873
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Zfish   700 LRRNIETINNEI------------------DQLMNQMQQIETQ-QRKFKASRDSILSEMKMLKEK 745

  Fly   874 EEQIEAA----KQELEQAQFAEQAVSSQIEEIQNQY--DTLRNESVKPVEAKIKKVNSQIEKLAA 932
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Zfish   746 RQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGADLLSQLSLED-QRRVDDLNDEIRQLQQ 809

  Fly   933 NVRSLNVGLATADRNITKI-TGNNNNLRENIKAAEEKLKSLNEDR---------------NK--- 978
            :.|.|.......:..:|:: |..|.|||:.:...|::|..|.|..               ||
Zfish   810 DNRQLLNERIKLEGIMTRVETYLNENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELDGINKRIK 874

  Fly   979 -AKEKKEELEKEIEESEASI-EGAKSQSSDIKKEIDEITKEENKRNIERIEIDTKLQAAAGKMNK 1041
             ...:.|:|:..|:::|..| |..||.     :....|.||:|    |.|..|||      ::.|
Zfish   875 DTMARSEDLDTLIDKTEVEIKEHQKSM-----ERWKNIEKEQN----EAINHDTK------ELEK 924

  Fly  1042 VKNDIPGWQAQLAPLKLNEIPGETEPQAPLKELNEEELEA-ETLEALQYKQ---------TMLEE 1096
            :.|.    |..|  ||..|     |....::||.....|| |..:.|..||         |.|::
Zfish   925 MTNR----QGML--LKKKE-----ECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLTLKQLFRKLEQCNTELKK 978

  Fly  1097 DLKTKKPNLSCIKEFNEKRLVYLDRVRVLEDITSKRNEMRDKYEEVRK-------RRYKEFMDGF 1154
            .....|..|.....|:|::          |.:..:::|:...|:.:.:       |:|:.....|
Zfish   979 YSHVNKKALDQFVNFSEQK----------EKLIKRQDELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTF 1033

  Fly  1155 SIITRKLKEMYQMITLGGDAELEL----------------------------VDSMDPFT-EGVN 1190
            ..:::...|::|.:..||.|.|.:                            |.|:|.|| .|:.
Zfish  1034 KQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDTEGGQSQDEGEGGDSERASSSQSSVPSVDQFTGVGIR 1098

  Fly  1191 FTVRPPKKSWKYISNLSGGEKTLSSLALVFALHYYKPSPLYFMDEIDAALDFKNVSIVGHYIKER 1255
            .:....:...:.:..||||:|:|.:|||:||:....|:|.|..||||.|||.::.......|.|.
Zfish  1099 VSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAASDMIMEL 1163

  Fly  1256 TKNAQFIIVSLRVNMFELANFLVGI 1280
            ..:||||..:.|..:.|.|:...|:
Zfish  1164 AGHAQFITTTFRPELLESADKFYGV 1188

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
glu	NP_723996.1	SMC_N	89..1287	CDD:426784	305/1323 (23%)
smc3	NP_999854.1	SMC_N	2..1196	CDD:481474	305/1324 (23%)