DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Trpgamma and Trpgamma

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001137830.2 Gene:Trpgamma / 34991 FlyBaseID:FBgn0032593 Length:1188 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061512371.1 Gene:Trpgamma / 1277541 VectorBaseID:AGAMI1_008961 Length:1363 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1184 Identity:816/1184 - (68%)
Similarity:912/1184 - (77%) Gaps:104/1184 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    52 RRVKRHSIHGMMEEENTIRPHQEIRQLTLEEKKFLLAVERGDMAGTRRMLQKAQDTEYINVNCVD 116
            :|||||||||||||||.:||||||..|:|||||:||||||||:|.|||:|:||:...:||:||||
Mosquito   115 KRVKRHSIHGMMEEENVVRPHQEIGALSLEEKKYLLAVERGDVATTRRILEKAEAESHININCVD 179

  Fly   117 PLGRTALLMAIDNENLEMVELLINYNVDTKDALLHSISEEFVEAVEVLLDHENVTFHSEGNHSWE 181
            ||||:|||||||||||||||||||:.|||||||||:||||||||||||||||:....|...||||
Mosquito   180 PLGRSALLMAIDNENLEMVELLINHRVDTKDALLHAISEEFVEAVEVLLDHEDSCHKSGDPHSWE 244

  Fly   182 SASEDTSTFTPDITPLILAAHRDNYEIIKILLDRGAVLPMPHDVRCGCDECVQSRQEDSLRHSRS 246
            :...||:|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||:||.||.|||||||||
Mosquito   245 ALPPDTATFTPDITPLILAAHRDNYEIIKILLDRGATLPMPHDVRCGCDDCVTSRMEDSLRHSRS 309

  Fly   247 RINAYRALASPSLIALSSKDPILTAFELSWELRRLSFLEHEFKNEYQELRKQCQDFATALLDHTR 311
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
Mosquito   310 RINAYRALASPSLVALSSKDPILTAFELSWELRRLSFLEHEFKNEYQELRRQCQDFATALLDHTR 374

  Fly   312 TSHELEILLNHDPTGPVYEHGERMHLNRLKLAIKLRQKKFVAHSNVQQLLASIWYEGLPGFRRKN 376
            :|||||:|||||||||.:|||:||||||||||:||||||||:|.|||||||||||||||||||||
Mosquito   375 SSHELEVLLNHDPTGPAFEHGDRMHLNRLKLAVKLRQKKFVSHPNVQQLLASIWYEGLPGFRRKN 439

  Fly   377 MALQAVDIIRIGIMFPIFSLAYILAPYSSIGQTMRKPFIKFICHSASYFTFLFLLMLASQRIETF 441
            |||||::|:|||||||:||.:||:||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Mosquito   440 MALQALEIVRIGIMFPLFSFSYIIAPHSSLGQTMRKPFIKFICHSASYFTFLFLLMLASQRIETV 504

  Fly   442 IGG-WFFADSSGMLNTMEELPTKRGAKPTFIEWLILAWVSGLIWSEVKQLWDVGLQEYLNDMWNV 505
            :|| |...|.|   ...:|:||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||:||||||
Mosquito   505 MGGVWGEPDVS---QQHDEVPTKRGASPTLIEWLILAWVSGLIWSEVKQLWDVGLQEYVNDMWNV 566

  Fly   506 IDFVTNSLYVATVALRVVSFFQVQKEMIYNSHATDLPRERWDAWDPMLISEGLFSAANIFSSLKL 570
            |||||||||||||||||||:|:|||||.||..|.|||||:||.||||||||||||||||||||||
Mosquito   567 IDFVTNSLYVATVALRVVSYFEVQKEMTYNKFAADLPREKWDTWDPMLISEGLFSAANIFSSLKL 631

  Fly   571 VYIFSVNPHLGPLQVSLSRMVMDIMKFFFLYVLVLFAFGSGLNQLLWYYADLEKKRCPEVSPMSA 635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||:||..|.
Mosquito   632 VYIFSVNPHLGPLQVSLSRMVMDIMKFFFLYVLVLFAFSSGLNQLLWYYADLEKKRCPDVSSFSG 696

  Fly   636 LLNMNGTNDPNACIVWRRFSNLFETTQTLFWAVFGLIDLDSFELDGIKIFTRFWGMLMFGTYSVI 700
             ||:..| |||||||||||:|||||.||||||||||:||::||||||||||||||||||||||||
Mosquito   697 -LNITAT-DPNACIVWRRFANLFETIQTLFWAVFGLVDLENFELDGIKIFTRFWGMLMFGTYSVI 759

  Fly   701 NIVVLLNLLIAMMNHSYQLISERADVEWKFARSKLWISYFEEGGTCPPPFNIIPTPKSIWYAIKW 765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|..:|
Mosquito   760 NIVVLLNLLIAMMNHSYQLISERADVEWKFARSKLWISYFEEGGTCPPPFNIIPTPKSLFYIFQW 824

  Fly   766 MRRVFCSGSSAARREHLKTIRRKAQQASDRDFKYQQIMRNLVRRYVTVEQRKAESQGVTEDDVNE 830
            ::|.||..|.|.::||:||||||.:|||:|||:||.|||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   825 VKRKFCGHSKAVKKEHMKTIRRKVKQASERDFRYQSIMRNLVRRYVTVEQRKAESQGVTEDDVNE 889

  Fly   831 IKQDISAFRCELVEILKNSGMDTNVTAGQGGG-GGKKNRQKERRLMKGFNIAPPGSTGS---LAP 891
            |||||||||||||||||||||:|.:..|||.| |||||||||||||||||||||.:..:   |.|
Mosquito   890 IKQDISAFRCELVEILKNSGMNTAIATGQGSGVGGKKNRQKERRLMKGFNIAPPPAPDAGQHLTP 954

  Fly   892 VAEFSTSLDNYDNQHEILSSTLSTLFTP-------NFMHKRQQSQAGSGGGGSESP---TTPTAP 946
            |:||...|.:: :.||:.:.......||       |.|| :..||:.|..|.:.:|   ....||
Mosquito   955 VSEFIAQLPDH-SPHELFAGVFGPGLTPKKALHQVNPMH-QYSSQSQSSFGENNNPIHRLAKLAP 1017

  Fly   947 QGTQGAAMTASSQVTKYNKSALKPYNKRIAGHKKRWGTLIEAAKVGNVSKMLGRSKSEDSVCN-- 1009
                           |:|..:      |...|||||||||||||.|:|||.:|||:|||||||  
Mosquito  1018 ---------------KFNSKS------RPGSHKKRWGTLIEAAKHGSVSKFIGRSRSEDSVCNHG 1061

  Fly  1010 ------SSHTSTPV-------------------------------------HGQMRVTYAQNSPQ 1031
                  :||:::|.                                     |.:.|........:
Mosquito  1062 PGRGESASHSNSPASDEAITESPSDSNPSLDRPDVEQCPDPHKHHNQHHKHHNRSRTDRGHQDRR 1126

  Fly  1032 QEYGYHGETSSTTISTPTPTISVVSNSPAAHAG-VGSHFFHTTSGLTAIAALKRKRKKFSSSKNI 1095
            |    ||.:..|...:.:.|  ..:|......| ..:|.:|...|  |:|||||||||||:|:|.
Mosquito  1127 Q----HGGSDRTQQHSSSGT--ATANGKNGRDGKEHAHHYHLHFG--ALAALKRKRKKFSNSRNS 1183

  Fly  1096 CPVTE------SVA-AANAAEILNDKTLKRVSSYPAAEAGVQHNPAQLVKPRRHEQTQSQHDSVE 1153
            .||.|      ||. |.......:.|.|||.||.|...|..:......|:|.|||.||||..|:|
Mosquito  1184 SPVLEPPCELPSVTNAITTTGNTSSKVLKRASSVPTRGASDEPEATGSVRPARHEATQSQQHSIE 1248

  Fly  1154 TNSTFTLSIDPSNT 1167
            ........:.||.|
Mosquito  1249 QQLEGAAPLTPSTT 1262

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TrpgammaNP_001137830.2 trp 77..841 CDD:273311 650/764 (85%)
ANK repeat 118..147 CDD:293786 25/28 (89%)
ANK repeat 175..217 CDD:293786 33/41 (80%)
TRP_CaM_bind1 865..>891 CDD:467881 20/28 (71%)
TrpgammaXP_061512371.1 None

Return to query results.
Submit another query.