Protein Alignment Ku80 and LOC1279324

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609767.2
• Gene: Ku80 / 34930
• FlyBaseID: FBgn0041627
• Length: 699
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_319031.5
• Gene: LOC1279324 / 1279324
• VectorBaseID: AGAMI1_007731
• Length: 732
• Species: Anopheles gambiae
• Alignment Length: 790
• Identity: 199/790 - (25%)
• Similarity: 334/790 - (42%)
• Gaps: 181/790 - (22%)

  Fly     9 IIVLDV-RTCAAEEVKLK-----SAKCVAEILKDKIVCDR-KDYVSFVLVGCD--TDEIKTEDAS 64
            :||||| |:||....:.|     .||..|.::..:::... .|:|..||.|.|  .:::..:...
Mosquito    10 MIVLDVGRSCAIATGRDKQSFFDKAKTCASLIVQRLIFSAPNDHVGIVLFGTDETNNQLNVDSGG 74

  Fly    65 HPNVLPFGEPRLCSWQLLLEFFQFVNKTACEDGEWLNGLQAALE-LQNVATTLRVARRRILL--- 125
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Mosquito    75 YENITEAFELKPPNWQTLRILQNQVVQTESEAG-WFDALIVATNFLRNGALGKKFTGYSIILLSP 138

  Fly   126 LFDFNDFPQDYEKFNEITDELLGENIELIVGTHNIAYIDNAITS---QPQA----IF----NFSR 179
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Mosquito   139 LFVAGDI--DQGQLESVAD-----------GISNMLGVVHVITNYVLHPAASVASIFTTTGTFDE 190

  Fly   180 KCGPDE--LNNQKYALSLVPRCNATLC--SFKEALHTVFKVTNRRPWVWNAKLNIGSKISISLQG 240
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Mosquito   191 QASKTEARIENERYVRQILHTTDGTLANINWAERMLTFFDAKAVRPTPWNSTLTIGTKVKLSISA 255

  Fly   241 IIAMKNQTPVKLVKVWAEKDEI--VIRETRHYI--KGTEITPLPENLITGYMLGGTPVPYDEAV- 300
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Mosquito   256 YYIVCEQKGLGSFKVDSVDDAASRVEMRTQYFLNDKPAEIS--MQDIIMGYMYGSTVVPYDNTID 318

  Fly   301 LEPKEPHPPG---LHFFGFIKRNAVPDEYFCGESLYLLVHQKHNQSAAVKLDALVRALVSSDRAI 362
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Mosquito   319 IEYKS----GDCRLACLGFTASSNILEEHLSGKGSHVVVAKKGCGASNQKLCALVKAMHELNVVM 379

  Fly   363 LCWKIYSTKFNRPQMVVLLPRLADDTHPATLYMLEVSYTSQHHFWDFPA-LRTTKTECSEEQLNA 426
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Mosquito   380 IATKVY-RKDTKPRLNALIPTYKHG-NPC-LVMLELIFKDELCSLKFPSLLKSSKNKPTNEQYDA 441

  Fly   427 IDQLIDSTDL---------EC----TLRDTQQP------RPWAQNDLLPFDALPSIFEQNVMDIL 472
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Mosquito   442 IDKLIDSMNLMDAVDDSNGECREAFALNSTFNPTLQHVYRTVAHRALNPKQPLPDV-NSTLQELI 505

  Fly   473 ERKVIYDNDKEDKMLKDKNFADVFWRVPDPLEEKSKRAAAIVKKLFPLR----YSRA-WQEKL-- 530
            :                         ||..:.::||.|...|:|.|.|:    .:|| |.:::
Mosquito   506 D-------------------------VPKKVVDRSKAALEEVRKAFELKEIKQNTRAEWLQRMAK 545

  Fly   531 --------------------LAKEQAENGVAVKSEPAEKEIPLPSDGVGLIDPISDFRRVL---- 571
                                |..|:|::|    |:.|.:.:.:   .||.:.|..||..:|
Mosquito   546 IKVGTDASGSSSSTTIDSGVLMDEEADDG----SDDANRRMVV---SVGTVTPAEDFALLLRRGE 603

  Fly   572 --ASVHT-ISNATERDARFQALAADTR----VVIITLLQRRK--QNIGQLGELITLYRQSCIDFN 627
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Mosquito   604 KFATVATQLQNAV-----FELLFTSMRPPGSKVIAALLAYRSEAQKLGP-------YR------- 649

  Fly   628 TFLEYDKFAEELKKIALAKNRSEFWQDVMVDKQLGPLVLGE---PTLDDELALKAYYT-IEN--W 686
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Mosquito   650 ----YNEWMTEFKEMLLTRQKADFWETVIVGEKLGLIDSQESEMSTVSVDQAANFYKTPTQNKMA 710

  Fly   687 VESGANDMED 696
            |||...|..|
Mosquito   711 VESSDGDYID 720

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ku80	NP_609767.2	Ku_N	7..213	CDD:427470	55/231 (24%)
		KU80	221..524	CDD:238445	88/334 (26%)
		Ku_PK_bind	562..>659	CDD:462604	29/109 (27%)
LOC1279324	XP_319031.5	None