Protein Alignment Cul3 and cul5b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_723909.2
• Gene: Cul3 / 34896
• FlyBaseID: FBgn0261268
• Length: 934
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073791420.1
• Gene: cul5b / 100006147
• ZFINID: ZDB-GENE-091113-45
• Length: 837
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 863
• Identity: 206/863 - (23%)
• Similarity: 361/863 - (41%)
• Gaps: 167/863 - (19%)

  Fly   206 KNNSGLSFE---QLYRNAYNMVLHKHG--NRLYYGLREVVSEHL----EHKVRADVLEALHSNFL 261
            ||...|.||   .|.|.....:|.:..  .:.::.|...|  |.    :.|..|.:.:||..:.|
Zfish     8 KNKGSLQFEDKWDLMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDV--HAVCLWDDKGPAKIHQALKEDIL 70

  Fly   262 PKLNQAWT---DHQTSMVMIRDILMYMDRVYVQ---------QREVDNVYNLG---LILFRDQVV 311
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Zfish    71 DFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFSKLEITLLGNQGSNKKSNVEDSIV 135

  Fly   312 R-----------YSEIQKALREKLLGMVMEERHGEAINHLAIKNACSMLITLGINS---RTVYEE 362
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Zfish   136 RKLMLDTWNESIFCNIKSRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNTDDKLQIYRE 200

  Fly   363 DFEKPFLAQSAAFYKFESQNFLAENNAGVYIK--------------------------------- 394
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Zfish   201 NFEKSYLDSTERFYKTQAPSYLQQNGVQNYMKYFSFLHRSYTSQLHPRQRFLPDQFVTDLANQHY 265

  Fly   395 ---------KVEARITEESSRAALYLDKDTEPRIVRVVEEELIKKHMRPIVEMENSGVVYMIKNS 450
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Zfish   266 QDGKVLSHSKADGKLREEEKRALRYLETRRECNSVQALMECCVNALVTSFKETILTECPGMIKRN 330

  Fly   451 KTE---------------DLACTYKLFSRLK---EEGLKVIAD-TMSAYLREQGRMLVKEEENGN 496
            :||               :|...:.|..::.   |..||.:.| .|||.|.:    :|...|...
Zfish   331 ETESEYGRSSGTKGSASSELHLMFSLMDKVPSGIEPMLKDLEDHIMSAGLAD----MVASAETIT 391

  Fly   497 TNPITFVQNLLDLKDRFDQFLVHSF--------ANDRIFKNVISSDFEHFLNL------------ 541
            |:...:|:.||.|.:||.:.:..:|        :.|:.:|.|::......|.|
Zfish   392 TDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTSRDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVSLKTQ 456

  Fly   542 -NNKSPEYLSLFIDDKLKKG--GKGMSEQEIESILDKTMVLFRFLLEKDVFERYYKTHLAKRLLL 603
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Zfish   457 PESKCPELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLIL 521

  Fly   604 NKSVSDDFEKNMISKLKTECG--CQFTSKLEGMFKDMSVSNTIMDEFKNFVNNNNLSLGGVELTV 666
            :.|...:.|:||:..|: |.|  ..:.:||..||:|:.||..:...||....:|.|:|....:.:
Zfish   522 DISADSEIEENMVEWLR-EVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQSFKEMHKHNKLALPADSVNI 585

  Fly   667 RILTTGFWPTQTATPNCNIPAAPREAFDIFKNFYLNKHSGRQLTLQPQMGTAYINAVFYGRKAVE 731
            :||..|.|...:.....::|....:.....::||...||||:|.....|....|.
Zfish   586 KILNAGAWSRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEDFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIIT---------- 640

  Fly   732 SEKDKDAPSSSSSGCGVPTTTRKHILQVSTYQMCVLLLFNN--RDVLTYDDIHQETDIPERELVR 794
                            ......::.|:|:|:|:.||..:|.  |:.::::::...|::|:.||.|
Zfish   641 ----------------FKNEVGQYDLEVTTFQLAVLFAWNQRPRERISFENLKLATELPDAELRR 689

  Fly   795 ALQSLSMGKPAQRLLVRNSKT--KTKDIEPTDEFYVNDAF----NSKFH-RVKIQTVA-AKGESE 851
            .|.||......:|.::.....  ..||......|.:|..|    |||.. |.||..:. .:..:|
Zfish   690 TLWSLVAFPKLKRQVLSYEPVVGSPKDFAEGTVFSINQEFSLIKNSKVQKRGKINLIGRLQLTTE 754

  Fly   852 PERKETRGKVDEDRKHEIEAAIVRIMKARKRLAHNLLVSDVTSQLKSRFLPSPVFIKKRIEGLIE 916
            ..|:|....:.:.|....:.||::|||.|||:::..|.:::...||:.|||....||::||.|||
Zfish   755 RMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKRISNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMIKEQIEWLIE 819

  Fly   917 REYLQRSPEDRKVYNYLA 934
            .:|::|...|...:.|:|
Zfish   820 HKYIKRDETDINTFIYMA 837

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul3	NP_723909.2	Cullin	193..832	CDD:459983	169/753 (22%)
		Cullin_Nedd8	864..926	CDD:463146	24/61 (39%)
cul5b	XP_073791420.1	None