Protein Alignment ck and myh9a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523571.1
• Gene: ck / 34882
• FlyBaseID: FBgn0000317
• Length: 2167
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001091647.3
• Gene: myh9a / 333938
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-5870
• Length: 1961
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 2106
• Identity: 520/2106 - (24%)
• Similarity: 870/2106 - (41%)
• Gaps: 477/2106 - (22%)

  Fly    33 GRRIQVRDDDGDEVWLAPERRIKAMHASSVQGVEDMISLGDLHEAGILRNLLIRYKENLIYTYTG 97
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Zfish    60 GKKIKVNKDD-----------IQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLRERYYSGLIYTYSG 113

  Fly    98 SILVAVNPYQILPIYTGDQIKLYKERKIGELPPHIFAIGDNAYAHMKRYRQDQCIVISGESGAGK 162
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Zfish   114 LFCVVINPYKYLPIYTEEIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGK 178

  Fly   163 TESTKLILQYLA-------------AISGKHSWIEQQILEANPILEAFGNAKTIRNDNSSRFGKY 214
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Zfish   179 TENTKKVIQYLAYVASSFKTKKDQSSIALSHGELEKQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKF 243

  Fly   215 IDIHFSANGVIEGAKIEQYLLEKSRIVSQNHSERNYHVFYCILAGLSADEKSRLDLGMAADYKYL 279
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Zfish   244 IRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKDERAFHIFYYLLTGAGDKLRSELCLEDYNKYRFL 308

  Fly   280 TGGNSITCEGRDDAAEFSDIRSAMKVLLFSDQEIWEIIKLLAALLHCGNIKYKATVVDNLDATEI 344
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Zfish   309 SNGN-VTIPGQQDRELFAETIDAFRIMGIPEDEQTGLLKVVSAVLQLGNMSFKKE--RNSDQASM 370

  Fly   345 PEHINVERVAGLLGLPIQPLIDALTRRTLFAHGETVVSTLSRDQSVDVRDAFVKGIYGRMFVHIV 409
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Zfish   371 PDDTAAQKVSHLLGMNVTDFTRAILSPRIKVGRDFVQKAQTQEQAEFAVEALAKATYERLFRWLV 435

  Fly   410 RKINTAIFKPRGTSRNAIGVLDIFGFENFDQNSFEQFCINYANENLQQFFVQHIFKLEQEEYNHE 474
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Zfish   436 MRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFELNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQRE 500

  Fly   475 AINWQHIEF-VDNQDALDLIAIKQLN----IMALIDEEARFPKGTDQTMLAKLHKTHGSHKNYLK 534
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Zfish   501 GIEWSFIDFGLDLQPCIEL--IEKPNGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVVQELGNNPKFQK 563

  Fly   535 PKS-DINTSFGLNHFAGVVFYDTRGFLDKNRDTFSPDLLHLVSQSTNKFLRQIFAQDIE------ 592
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Zfish   564 PKKLKDDADFCIIHYAGKVDYKANEWLMKNMDPLNDNVATLLNQSVDKFVSELW-KDVDRIVGLD 627

  Fly   593 ----MG------AETRK-RTPTLSTQFRKSLDALMKTLSSCQPFFIRCIKPNELKKPMMFDRGLC 646
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Zfish   628 KVAGMGESLHGAVKTRKGMFRTVGQLYKEQLMNLMTTLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLAHHLV 692

  Fly   647 CRQLRYSGMMETIRIRRAGYPIRHGFREFVERYRFLIP-GVPPAHRTDCQAATSRICAVVLGKSD 710
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Zfish   693 LDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIVFQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACVLMVKALELDSNL 757

  Fly   711 YQLGHTKVFLKDAHDLFLEQERDRVLTRKILILQRSIRGWVYRRRFLRLRAAAITVQRFWKGYAQ 775
            |::|.:|||.:......||:|||..:|..|:..|...||:|.||.|.:
Zfish   758 YRIGQSKVFFRAGVLAHLEEERDMKITDVIISFQAWCRGYVARRAFAK----------------- 805

  Fly   776 RKRYRNMRVGYMRLQALIRSRVLSHRFRHLRGHIVGLQAHARGYLVRREYGHKMWAVIKIQSHVR 840
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Zfish   806 ------------RQQQLTAMRV--------------IQRNCAAYLKLRN-----WQWWRLFTKVK 839

  Fly   841 RMIAMRRYRKLRLEHKQFAEVLQLRKLEEQELLHRGNKHAREIAEQHYRDRLHELERRE------ 899
            .::.:.|.     |.:..|:..:|.|::|:              :|...|:|.|.|.::
Zfish   840 PLLQVTRQ-----EEEMVAKEEELVKMKER--------------QQQAEDQLKESEAKQKQLNAE 885

  Fly   900 ---IQEQL-----------ENRRRVEVNMNIINDAARKQEEPVDDGKLVEAMFDFLPDSSSDAPT 950
               :||||           |.|.|:...|..:.:...:.|..:::.:...|.|
Zfish   886 KLALQEQLQAETELCQEAEEMRSRLTARMQEMEEVLHELESRLEEEEERVAQF------------ 938

  Fly   951 PHGGRETSVFNDLPHAQNVNQDDIIAPIHISEDEEDLSEFKFQKFAATYFQGNVNHQYAK-KALK 1014
                          .::.......|..:....|||:.:..|.|....|        ..|| |.::
Zfish   939 --------------QSEKKKMQQNIGDLEQQLDEEEAARQKLQLEKVT--------MDAKLKKIE 981

  Fly  1015 HPLLPLHTQGDQLAAQALWI--TILRFTGDMPE------------PKYHTM-----DRM------ 1054
            ..|:.:..|..:|:.:...:  .|..||.::.|            .|:.||     ||:
Zfish   982 EDLMVIEDQNAKLSKEKKQMEERISEFTTNLAEEEEKSKSLQKLKTKHETMITDLEDRLRKEEKM 1046

  Fly  1055 -------------DTTSVMSKVT------ATLGRNFIRSKEFQEAQLMGLDPDAFLKQ-KPRSIR 1099
                         |:|.:..::.      |.|.....:.:|..:|.|..::.:|.||. ..:|||
Zfish  1047 RQELEKNRRKLEGDSTELHDQIAELQAQIAELRAQLAKKEEELQAALARIEEEAALKNAAQKSIR 1111

  Fly  1100 HKLVSLT----------------LKRKNKLGEDVRRRLQDDEYTADS--YQSWLQSRPTSNLEKL 1146
            .....::                .|::..|||::.....:.|.|.||  .|..|:::..:.:.:|
Zfish  1112 EMEAQISELQEDLELEKAARNKAEKQRRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRAKRETEVTQL 1176

  Fly  1147 HFII-----GHGILRAELRDEIYCQICKQLTNNPLKSSHARGWILLSLCVGCFAPSEKFVNYLRA 1206
            ...:     .|..:.:|:|.: :.|..::|.....:|..::            |..:|....|.:
Zfish  1177 KKTLEDEARAHEQMLSEVRQK-HNQAFEELNEQLEQSKRSK------------ASVDKAKQALES 1228

  Fly  1207 FIREGPPGYAPYCEERLK-----RTFNNGTRNQPPSWL-ELQ-----ATKSKKPIMLPITFMDG- 1259
            ...|        .:..||     :..:...|.:..|.| |||     :.:.|..::..::.|..
Zfish  1229 ERNE--------LQIELKSLSQSKNDSENRRKKAESQLQELQVKHTESERQKHELLDKVSKMQAE 1285

  Fly  1260 -----NTKTLLADSATTARELC----NQLSDKISLKDQFGFSLYIALFDKVSSLGSGGDHVMDAI 1315
                 .|.|.:...:..|.:.|    :||.|..:|.:: .....:|:..::..|....:::.:.:
Zfish  1286 LESLQGTVTKVESKSIKAAKDCSAVESQLKDAQALLEE-ETRQKLAISTRLRQLEDEQNNLKEML 1349

  Fly  1316 SQCEQYAKEQGAQERNAPWRLF-FRKEIFAPWHEPTHDQVATNLIYQQVVRGVKFGEYRCDKEED 1379
            .:.|:..|....|...|..:|. .:|:|         :|.|      |.:..::.|:.:..:|.:
Zfish  1350 EEEEESKKNVEKQLHTAQAQLAEMKKKI---------EQEA------QSLESMEDGKKKLQREVE 1399

  Fly  1380 LAMIAAQQYFIEYSTDMSMERLFTLLPNFIPDFCLSGVDKAIERWAALVLQAYKKSY-------- 1436
            ..:...::....|.   .:::..|.|...:.|..   ||:...|.....|:..:|.:
Zfish  1400 SVLQQLEERNASYD---KLDKTKTRLQRELDDVL---VDQGHLRQTVQELERKQKKFDQMLAEEK 1458

  Fly  1437 YVKDKIAPLKIKEDIVSYAKYKWPLLFSRFYEAYRNSGPNLPK---------NDVIIAVNWTGVY 1492
            .:..|.|..:.:.:..:..|....|..:|..||..:....|.:         .|::.:.:..|..
Zfish  1459 SISTKYAEERDRAEAEAREKETKSLTLARELEAMTDLKNELERVNKQLKTEMEDLVSSKDDAGKS 1523

  Fly  1493 VVD------DQEQVLLELSFP--------EIT-------AVSSQKTNKVFTQTFSLSTVRGEEFT 1536
            |.:      ..||.|.|:...        ::|       .|:.|.....|.:.......:|||..
Zfish  1524 VHELERAKRGMEQQLEEMKTQLEELEDELQLTEDAKLRLEVNMQALKAQFERDLQSRDEQGEEKR 1588

  Fly  1537 FQSPNAEDIRDLVVYFLDGLKKRSKYV------------IALQDYRAPSDGTSFLSFFK------ 1583
            .|.  .:.:|::.:...|..|:|::.|            :|.|...|.......|...|
Zfish  1589 KQL--VKQVREMEMELEDERKQRAQAVSVRKKLELDLSELAAQIDLANKARDEALKQLKKLQAQM 1651

  Fly  1584 -------GDLIILEDESCGESVLNNGWC-------------IGRCDRS-----QERGDFPAETVY 1623
                   .||.:..|||..::..|....             :...||:     |||.:...|
Zfish  1652 KEQMREFEDLRLSRDESLNQAKENERKIKSMEAEIMQLHEDLAAADRAKRQIQQERDELQDE--- 1713

  Fly  1624 VLPTLSKPPQDILALFNIEEAHHG-----RRLSMASNGGAVEPRDRPHTLMEYALDHFRLPPKRT 1683
                           .|.:.|.:.     ||...|......|..:..|..:|...|..:....:.
Zfish  1714 ---------------INSQNAKNSLSSDERRRLEARIAQLEEELEEEHLSVELVNDRLKKASLQA 1763

  Fly  1684 MSKTLTLSSKRS---------EELWRYSRDPIKAPLLRKLQSKEEFAEEACFAFAAILKYMGDLP 1739
            ...|:.|:::||         .:|.|.::|     :.:|||..|.         |...||...:.
Zfish  1764 EQVTVELTAERSNSQRLEGLRSQLDRQNKD-----MKQKLQELEG---------AVKSKYKSTIT 1814

  Fly  1740 SKRPRMGNEITDHIFDGPLKHEILRDEIYCQLMKQLTDNRNRMSEERGWELMWLATGLFACSQGL 1804
            :...:: .::.:.: |..:|.            :|.:..:.|..|::
Zfish  1815 ALETKI-QQLEEQL-DSEMKE------------RQQSTKQVRRVEKK------------------ 1847

  Fly  1805 LKELLLFLRTRRHPISQDSMHRLQKTIRHGQRKYPPHQVEVEAIQHKTTQIFHKVYFPDDTDEAF 1869
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Zfish  1848 LKEVLLQVEDERRNADQSKTETEKANIRLKQMKRQLEETEEEAARANASCRKLRRELEDATESAS 1912

  Fly  1870 EVD-------SSTRAKDFCNNISQRL 1888
            .::       :..|..||..|:.:.:
Zfish  1913 AMNREVSTLKNKLRRGDFTGNVRRAI 1938

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ck	NP_523571.1	MYSc_Myo7	77..721	CDD:276832	268/680 (39%)
		MyTH4	<1138..1245	CDD:214535	19/122 (16%)
		FERM1_F1_Myosin-VII	1249..1347	CDD:340612	18/108 (17%)
		B41	1251..1467	CDD:214604	37/234 (16%)
		FERM_C1_MyoVII	1461..1559	CDD:270019	23/127 (18%)
		SH3	1560..1624	CDD:473055	18/106 (17%)
		MyTH4	1701..1849	CDD:214535	27/147 (18%)
		FERM2_F1_Myosin-VII	1854..1951	CDD:340613	7/42 (17%)
		B41	1856..2068	CDD:214604	7/40 (18%)
		FERM_C2_MyoVII	2064..2159	CDD:270020
myh9a	NP_001091647.3	None