DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ck and hum-6

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001285949.1 Gene:ck / 34882 FlyBaseID:FBgn0000317 Length:2167 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_508420.1 Gene:hum-6 / 180539 WormBaseID:WBGene00002039 Length:2098 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2190 Identity:1161/2190 - (53%)
Similarity:1540/2190 - (70%) Gaps:130/2190 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVIVTRGDYIWIEPASGREFDVAIGARVVSAEGRRIQVRDDDGDEVWLAPERRIKAMHASSVQGV 65
            ||:|::||:|||||.. .|..:.|||||:..:..|::|.||.|:|.||:.:||::.||.:|||||
 Worm     1 MVLVSKGDFIWIEPGK-TEGSIPIGARVIDQDHGRLKVIDDLGNEQWLSADRRVRLMHPTSVQGV 64

  Fly    66 EDMISLGDLHEAGILRNLLIRYKENLIYTYTGSILVAVNPYQILPIYTGDQIKLYKERKIGELPP 130
            |||..|||.||:.|||||.|||:|.|||.||||||:|||||..:.|||.|:|::||.::||||||
 Worm    65 EDMCQLGDFHESAILRNLFIRYREKLIYAYTGSILIAVNPYMDIAIYTADEIRMYKRKRIGELPP 129

  Fly   131 HIFAIGDNAYAHMKRYRQDQCIVISGESGAGKTESTKLILQYLAAISGKHSWIEQQILEANPILE 195
            |||||.||||.:|:|.:::|.::|||||||||||||||:||:||.|||:|||||||:|||||:||
 Worm   130 HIFAIADNAYTNMRREKKNQSVIISGESGAGKTESTKLVLQFLATISGQHSWIEQQVLEANPVLE 194

  Fly   196 AFGNAKTIRNDNSSRFGKYIDIHFSANGVIEGAKIEQYLLEKSRIVSQNHSERNYHVFYCILAGL 260
            |||||||||||||||||||||:||:.:|.|||||||||||||||||:|:.:|||||:|||:||||
 Worm   195 AFGNAKTIRNDNSSRFGKYIDVHFNESGSIEGAKIEQYLLEKSRIVTQSENERNYHIFYCLLAGL 259

  Fly   261 SADEKSRLDLGMAADYKYLTGGNSITCEGRDDAAEFSDIRSAMKVLLFSDQEIWEIIKLLAALLH 325
            |.:|||.|:||.||||.||..|.::|.|||||||:.::|||||:||:.::|||..|.||||:|||
 Worm   260 SREEKSELELGTAADYYYLIQGKTLTAEGRDDAADLAEIRSAMRVLMINEQEIGSIFKLLASLLH 324

  Fly   326 CGNIKYKATVVDNLDATEIPEHINVERVAGLLGLPIQPLIDALTRRTLFAHGETVVSTLSRDQSV 390
            .|||:::....||:::.::.:...:.|:|.||.|..|.|:||:|.::|....|.|:|.|:..|:|
 Worm   325 IGNIRFRQNTNDNMESVDVADPSTLVRIAKLLQLHEQNLLDAITTKSLVTREERVISRLNGQQAV 389

  Fly   391 DVRDAFVKGIYGRMFVHIVRKINTAIFKPRGTSRNAIGVLDIFGFENFDQNSFEQFCINYANENL 455
            |.|||..|.|||::|:||||::|.||:||..:.|.:||:|||||||||:.|||||.|||:|||.|
 Worm   390 DARDALAKAIYGKLFIHIVRRVNDAIYKPSQSRRTSIGILDIFGFENFESNSFEQLCINFANETL 454

  Fly   456 QQFFVQHIFKLEQEEYNHEAINWQHIEFVDNQDALDLIAIKQLNIMALIDEEARFPKGTDQTMLA 520
            |||||.|:||:||:||:.|.|||:||:|||||..:||||.:.|||::|||||:.||||||:|||.
 Worm   455 QQFFVHHVFKMEQKEYDEEHINWRHIKFVDNQATVDLIAQRPLNILSLIDEESIFPKGTDKTMLL 519

  Fly   521 KLHKTHGSHKNYLKPKSDINTSFGLNHFAGVVFYDTRGFLDKNRDTFSPDLLHLVSQSTNKFLRQ 585
            |||.|||.::.||:|||::..:||:.||||.|||:|||||:||||:||.||..|:|.|...||.:
 Worm   520 KLHSTHGRNELYLQPKSELQRAFGVTHFAGNVFYNTRGFLEKNRDSFSADLSVLISSSKMPFLAR 584

  Fly   586 IFAQDIEMGAETRKRTPTLSTQFRKSLDALMKTLSSCQPFFIRCIKPNELKKPMMFDRGLCCRQL 650
            :| .|||....:||:. |:..|||:||:.||..|:...|||||||||||:|:.::.||.|..|||
 Worm   585 LF-DDIEYDTSSRKKV-TVGNQFRRSLEQLMSQLTQTHPFFIRCIKPNEMKRALVMDRDLVLRQL 647

  Fly   651 RYSGMMETIRIRRAGYPIRHGFREFVERYRFLIPGVP-PAHRTDCQAATSRICAVVLG-KSDYQL 713
            |||||||||:|||:||||||.:..||.|||.|:..:. |.:|.|...|..:||.::|| .:||||
 Worm   648 RYSGMMETIKIRRSGYPIRHDYYPFVFRYRVLVSSIQGPVNRIDLHDAAKKICHMILGTNADYQL 712

  Fly   714 GHTKVFLKDAHDLFLEQERDRVLTRKILILQRSIRGWVYRRRFLRLRAAAITVQRFWKGYAQRKR 778
            |.|||||||.|||.||||..|:|..|.:::|:::|.|:.|:.|.:.|.||:|:|..|:|:.||||
 Worm   713 GKTKVFLKDKHDLVLEQEYYRILKDKAIVIQKNVRRWLVRKDFEKQRQAAVTIQTAWRGFDQRKR 777

  Fly   779 YRNMRVGYMRLQALIRSRVLSHRFRHLRGHIVGLQAHARGYLVRREYGHKMWAVIKIQSHVRRMI 843
            ||.:..|:.||||::|||.|...::.||..|:..||..||.||||:.|.|               
 Worm   778 YRQIISGFSRLQAVLRSRQLVSHYQTLRKTIIQFQAVCRGSLVRRQVGEK--------------- 827

  Fly   844 AMRRYRKLRLEHKQFAEVLQLRKLEEQELLHRGNKHAREIAEQHYRDRLHELERREIQEQLENRR 908
                                 ||..|:..|...:..|..|::.|                     
 Worm   828 ---------------------RKRGEKAPLTEVSSTASVISDSH--------------------- 850

  Fly   909 RVEVNMNIINDAARKQEEPVDDGKLVEAMFDFLPDSSSDAPTPHGGRETSVFNDLPHAQNVNQDD 973
                            ||      ||..:|||||....|:...:...::|.....   ..::...
 Worm   851 ----------------EE------LVGHLFDFLPSDGKDSGNENDSADSSRRGSY---SRLHTSP 890

  Fly   974 IIAPIHI----SEDEEDLSEFKFQKFAATYFQGNVNHQYAKKALKHPLLPLHTQ-GDQLAAQALW 1033
            ::.|.:|    |..:||||:::|.|:|||:||......:.||.||..|| .||: ..||||...|
 Worm   891 VMPPANIPRVDSYVDEDLSKYQFGKYAATFFQAQATATHVKKPLKTALL-THTEPSAQLAALTAW 954

  Fly  1034 ITILRFTGDMPEPK---YHTMDRMDTTSVMSKVTATLGRNFIRSKEFQEAQLMGLDPDAFLKQKP 1095
            .|||||.||:.:.|   .:..:..|.|.||.|:.||||:.| .:.:.:||.|......|  |...
 Worm   955 TTILRFMGDLADVKPGSTNGSEVYDKTPVMIKLYATLGKKF-SAHDLEEAMLSSEYGGA--KTLK 1016

  Fly  1096 RSIRHKLVSLTLKRKNKL-GEDVRRRLQDDEYTADSYQSWLQSRPTSNLEKLHFIIGHGILRAEL 1159
            :.:..||:|:|||||.|: |.|......|..|:  |:.:.|:::|.::|:|||:|||.||||.:|
 Worm  1017 KGMGRKLISMTLKRKGKINGSDTSSISSDSVYS--SFNAMLENKPMTSLDKLHYIIGLGILREDL 1079

  Fly  1160 RDEIYCQICKQLTNNPLKSSHARGWILLSLCVGCFAPSEKFVNYLRAFIREGPP---GYAPYCEE 1221
            |||||||:||||:|||.|.|.||||||||||||||||||:|:.||..||||..|   ||:.|.|:
 Worm  1080 RDEIYCQLCKQLSNNPSKLSAARGWILLSLCVGCFAPSERFIKYLFCFIRERGPAGTGYSKYIED 1144

  Fly  1222 RLKRTFNNGTRNQPPSWLELQATKSKKPIMLPITFMDGNTKTLLADSATTARELCNQLSDKISLK 1286
            ||:||..||||:||||::||||.||:||::|.:|||||:.|||.|||||||.|||.||::|:.|.
 Worm  1145 RLRRTQVNGTRHQPPSYVELQANKSQKPVVLAVTFMDGSVKTLCADSATTAAELCKQLAEKVGLT 1209

  Fly  1287 DQFGFSLYIALFDKVSSLGSGGDHVMDAISQCEQYAKEQGAQERNAPWRLFFRKEIFAPWHEPTH 1351
            :.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||:|||:|..
 Worm  1210 NSFGFSLYIALFDKVSSLGSGTDHVMDAISQCEQYAKEQGRQERNAPWRLFFRKEIFSPWHDPRD 1274

  Fly  1352 DQVATNLIYQQVVRGVKFGEYRCDKEEDLAMIAAQQYFIEYSTDMSMERLFTLLPNFIPDFCLSG 1416
            |.|:||||||||:||:|:|||||||:|:||.|.||||:|:..| |.:.:|...||:::|||.:||
 Worm  1275 DPVSTNLIYQQVIRGIKYGEYRCDKDEELAAICAQQYYIDEGT-MDVNKLENNLPSYLPDFEMSG 1338

  Fly  1417 VDKAIERWAALVLQAYKKSYYVKDKIAPLKIKEDIVSYAKYKWPLLFSRFYEAYRNSGPNLPKND 1481
            .:.|:|:|...::..|:|.:..: ..:.:::||::||.||.||||||||||||.:.:||.||||:
 Worm  1339 KEMALEKWTQTIMHQYRKKFTGR-LPSQIEVKENVVSVAKTKWPLLFSRFYEALKFAGPPLPKNE 1402

  Fly  1482 VIIAVNWTGVYVVDDQEQVLLELSFPEITAVSSQKTNKVFTQTFSLSTVRGEEFTFQSPNAEDIR 1546
            |||||||||||||||:|.|:||.|||||:.....|..:..|.|.::.||.|:|:|||||||:||.
 Worm  1403 VIIAVNWTGVYVVDDREHVMLEFSFPEISTAYYGKGKRSTTDTCTVRTVVGDEYTFQSPNADDIT 1467

  Fly  1547 DLVVYFLDGLKKRSKYVIALQDYRAPSDGTSFLSFFKGDLIILEDESCGESVLNNGWCIGRCDRS 1611
            :|:|.||:||||||:|::|::..:. .:..:||.|.||||:||.:|..|.::|......|...|:
 Worm  1468 NLIVMFLEGLKKRSRYLVAIKSQKG-DEKNNFLEFEKGDLLILVNEFTGNTLLTESVVKGENSRT 1531

  Fly  1612 QERGDFPAETVYVLPTLSKPPQDILALF------NIEEAHHGRRLSMASNGGAVEPRDRPHTLME 1670
            ...|...||.|||||||.||.::.|.:|      :::..::.:::::      |:....|:||..
 Worm  1532 CLFGLIRAENVYVLPTLVKPSKNTLQIFPKDMDLSLDLFNNNKQVTV------VDYNAEPYTLEN 1590

  Fly  1671 YALDHFRLPPKRTMSK--TLTLSSKRSE-ELWRYSRDPIKAPLLRKLQSKEEFAEEACFAFAAIL 1732
            :|.|:|....||..|:  .:||..|.|: |.||:||:.|..|||:||..:|:....|...||||:
 Worm  1591 FAEDNFNSQVKRVGSQISLMTLRKKESQIECWRFSREHIDQPLLKKLNGREDACRGAIEIFAAIM 1655

  Fly  1733 KYMGDLPSKRPRMGNEITDHIFDGPLKHEILRDEIYCQLMKQLTDNRNRMSEERGWELMWLATGL 1797
            |||||.||||.|:|..:|||||..|:..|.||||:||||:||||.|.:.|||||||||:|:||||
 Worm  1656 KYMGDEPSKRSRLGTHLTDHIFKLPISMEALRDELYCQLVKQLTLNPSIMSEERGWELLWMATGL 1720

  Fly  1798 FACSQGLLKELLLFLRTRRHPISQDSMHRLQKTIRHGQRKYPPHQVEVEAIQHKTTQIFHKVYFP 1862
            ||.|..|.||:..||::|.|||:.|..:|:||..:.|.||||||.|||||||||||||||||:||
 Worm  1721 FAPSAALAKEISHFLKSRPHPIALDCQNRMQKLAKGGSRKYPPHLVEVEAIQHKTTQIFHKVFFP 1785

  Fly  1863 DDTDEAFEVDSSTRAKDFCNNISQRLSLRTSEGFSLFVKIADKVISVPEGDFFFDFVRHLTDWIK 1927
            |:||||.||||:|||:|||:.|..||.|::|:||||||||.|||::|||.:||||:||.|:||:.
 Worm  1786 DNTDEAIEVDSATRARDFCHKIGYRLGLKSSDGFSLFVKIKDKVLAVPESEFFFDYVRSLSDWVH 1850

  Fly  1928 KARPI-RDGANPQFTYQVFFMKKLWTNTVPGKDRNADLIFHYHQELPKLLRGYHKCSREEAAKLA 1991
            ..... :|.......|||:||:|||.|.|.|.|..||:|||||||..|.|.||||.::.:..:||
 Worm  1851 TNHATQKDATMIPINYQVYFMRKLWYNFVAGADPQADIIFHYHQESQKYLLGYHKTTKNDVIELA 1915

  Fly  1992 ALVFR--VRFGENKQELQAIPQMLRELIPSDIMKIQSTSEWKRSIVASYNQDGGMTSEDAKVAFL 2054
            ||:.|  .:.|:| ..|..|||:|.|:||.|.:|:.|.|||:::|..:|.:...:.|:.||:.||
 Worm  1916 ALILRSMTKDGKN-APLAQIPQLLDEIIPKDSLKMYSASEWRKTISNAYARIEHLKSDQAKIEFL 1979

  Fly  2055 KIVYRWPTFGSAFFEVKQTTEPNYPEMLLIAINKHGVSLIHPVTKDILVTHPFTRISNWSSGNTY 2119
            ..:.||||||||||.|.|.::.|.|:.||:|||:.||::.|..||::||.:||..|.||:|||||
 Worm  1980 NYICRWPTFGSAFFPVSQYSDLNLPDRLLLAINQTGVNIYHLDTKNLLVQYPFNVICNWTSGNTY 2044

  Fly  2120 FHMTIGNLVRGS---KLLCETSLGYKMDDLLTSYISLMLTNMNKN 2161
            |:||:||:::|:   |||.:|::||||||||||||||:::|.|.:
 Worm  2045 FNMTVGNMLKGNEGKKLLLDTTVGYKMDDLLTSYISLLISNQNNH 2089

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ckNP_001285949.1 MYSc 64..733 CDD:214580 418/670 (62%)
MYSc_Myo7 77..721 CDD:276832 398/645 (62%)
MyTH4 <1138..1245 CDD:214535 75/109 (69%)
B41 1251..1467 CDD:214604 138/215 (64%)
FERM_B-lobe 1355..1439 CDD:271216 42/83 (51%)
FERM_C1_MyoVII 1461..1559 CDD:270019 62/97 (64%)
SH3 1560..1624 CDD:302595 21/63 (33%)
MyTH4 1701..1849 CDD:214535 87/147 (59%)
B41 1856..2068 CDD:214604 113/214 (53%)
FERM_M 1966..2068 CDD:278785 48/103 (47%)
FERM_C2_MyoVII 2064..2159 CDD:270020 56/97 (58%)
hum-6NP_508420.1 MYSc 57..731 CDD:214580 421/675 (62%)
MYSc_Myo7 76..720 CDD:276832 398/645 (62%)
IQ 757..779 CDD:197470 11/21 (52%)
MyTH4 929..1168 CDD:214535 126/244 (52%)
B41 1174..1388 CDD:214604 138/215 (64%)
FERM_B-lobe 1278..1378 CDD:271216 47/101 (47%)
FERM_C1_MyoVII 1382..1480 CDD:270019 62/97 (64%)
SH3 1481..1544 CDD:302595 21/63 (33%)
MyTH4 1624..1772 CDD:214535 87/147 (59%)
B41 1779..1993 CDD:214604 113/214 (53%)
FERM_B-lobe 1890..1985 CDD:271216 40/95 (42%)
FERM_C2_MyoVII 1989..2087 CDD:270020 56/97 (58%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 842 1.000 Domainoid score I22
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG4229
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 1720 1.000 Inparanoid score I28
Isobase 1 0.950 - 0 Normalized mean entropy S1958
OMA 1 1.010 - - QHG52371
OrthoDB 1 1.010 - - D21221at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001409
OrthoInspector 1 1.000 - - oto18674
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100101
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR13140
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R2580
SonicParanoid 1 1.000 - - X1286
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1514.860

Return to query results.
Submit another query.