Protein Alignment CG42685 and Pkd1l1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609717.5
• Gene: CG42685 / 34854
• FlyBaseID: FBgn0261571
• Length: 1609
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_063129791.1
• Gene: Pkd1l1 / 289796
• RGDID: 1564724
• Length: 2543
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1980
• Identity: 359/1980 - (18%)
• Similarity: 597/1980 - (30%)
• Gaps: 747/1980 - (37%)

  Fly    46 PTSHPWRSAEAGKISFSERTRFTKMLSRKRHKIIRRTIPEEEERRIERLWDPVLNKSY------- 103
            |||:...:...|::||:.|.              .:|.||         ||...|:|.
  Rat    24 PTSNILNTTSEGRLSFTNRE--------------PQTPPE---------WDEATNRSSTSPSSQL 65

  Fly   104 -----------DFSSFEEYNT--TTKTYP-TIPSEKF---------GLEDAARTYKNISEQKPGE 145
                       .||..::.:.  .:...| ::..|.|         ..||:|.|..:.|:..||.
  Rat    66 QWLREAEREDGSFSGRQQVDLQGVSSAAPCSLKKEAFCCNGTRLLCSGEDSANTLLSFSDPPPGI 130

  Fly   146 NSTHLFNDEDYSW-----SSVNTEISYGYENQTYENGIEGSKSQNGNVSFSLADFPLVD-EYP-- 202
            :.|   .:...||     |...|:...|        .:..::.:|.. .|:...||..| :.|
  Rat   131 SQT---RNLSASWYHPESSCPLTQHPLG--------AVLATQPENAG-HFATCCFPETDAKAPPA 183

  Fly   203 ----IYNQSSTCI-------NNSSTE---------------YQNQTVNDYNFAV---PC------ 232
                ::..|.|.:       :|...|               ||.:|...|...|   .|
  Rat   184 LGIRVHAASRTALCLLLDFGDNHGAEMKLSTVTGAATMTGYYQYRTEGVYKLKVVVSDCHGADEE 248

  Fly   233 LAP----------NVNGRTSSVKNQQLLG-------QKGPLKVYL----------FMNRNPVYGE 270
            |.|          :|...:||:.|.:.|.       |:|.:.|:.          ||::..|...
  Rat   249 LGPYYMDIGHGNVSVFMNSSSIHNNESLAFANSLPQQEGTVVVHCFSSVSSYNVSFMSQTRVGSS 313

  Fly   271 E----YSVFTTMPSLGKKNFAVNLTVDTNDYLI---DE---IHSDWKYTKN------LRKLMRKW 319
            :    .:|..||.|:...........|||...:   :|   :...|.:.:|      .|.:.|:.
  Rat   314 QAWSGVTVGYTMQSVSVYTNGTVFAADTNITFVAVTEETVPLEFTWYFGENPPVTTTSRSIRRRL 378

  Fly   320 GIR-------------------------SKRIVYNRCYFHRCTARFYNTKHKYIVAKVS------ 353
            .|.                         .|||:.|         |..:|....:.|.||
  Rat   379 SIPQWYRVMVKATSRMGSVVSEPHLIRVQKRILAN---------RLVSTASALVNANVSFECRLN 434

  Fly   354 --------------SLNDRRKLLAHVV----RFKIKVRKPPNVSCLPALELEF-CKNPEKPVYFS 399
                          |:........||.    .|.::|....|:|.....:..| .:.|.:|....
  Rat   435 FGTDVAYLWNFGDGSIELGSSSSGHVYDREGEFTVEVLAFNNISSATLRKQIFIVQEPCQPPPVK 499

  Fly   400 PMG--------------HLEFFASISDACSTVEYDKITWQLCDITENKI-IARLKNATGLVVKLL 449
            .||              .:.|.|:|  .|:..:....||.........: :....|.....:.|.
  Rat   500 NMGPAKVQIWRSQPLRLGVTFEAAI--ICNISQGLSYTWSFVGAEATAVTLPAAVNTHRQTIMLP 562

  Fly   450 PYKVHILNEPDRRKVFLLRGKAVIN----GVTTVARCYMKYKPPPIEPLIKGNERRLVDVRK-PI 509
            .|.:...|.....|| .::|..|.:    ||...||.       |:..:.:|....|..... .|
  Rat   563 SYTLECGNYTAVAKV-QIKGSMVYSNYCVGVEVRARA-------PVSVISEGTHIFLSKATSTSI 619

  Fly   510 IIDGSSSKDRLKIRESIKSKQFLWTCISLDDP----FNNYCKKYM-SKSPTLRLPPYALKENAVY 569
            |:.||.|.|......:::   :.|||.:...|    |::.....| :::|.:..|...|.| ...
  Rat   620 ILSGSQSYDPDNPGAALR---YHWTCTAASSPIWPCFDDSTSYQMDTQAPAISFPAKWLSE-CCD 680

  Fly   570 DFSLTVISRFDPRNRMTTTQTIKGVAKTTF---TPQILCR---------RNCALGVYAPLDSIHL 622
            .|.:|:......||   ::|.:      ||   .|.:..|         |:.::...   :.:.|
  Rat   681 QFLVTLTVSSSGRN---SSQAL------TFLSTRPDLAFRFIHVSWVNFRDISVNWN---EEVSL 733

  Fly   623 ISKCDDCPGTVK--RYEW--WLLDTESQPTLESSHKYLI-------------------------- 657
            .:.|:|| |.|.  .|.|  :|::...:..:|....|.|
  Rat   734 RAVCEDC-GDVSDLTYSWDLFLVNATEKNAVEGKSCYSILLIGKVHGPVAGSGEPMEDYGSLSPA 797

  Fly   658 ---------------------------------------------------------LHT--LEP 663
                                                                     |||  .:|
  Rat   798 PSSLAEEALMMSDPEGSWPFPSSSTAFDGISANFQEAGSSLSAEESASYGDNLLGPFLHTGRAKP 862

  Fly   664 LVQIRLRVWVK------------------------------GQ---------------GWADAFY 683
            .:.|.   |.|                              |:               |.|..:.
  Rat   863 TLMID---WPKALVSRAVFHGYTTSGIMGPDVTIKPFSLSSGEMYVLQASVASKHVLLGKAQLYL 924

  Fly   684 TLRRNNGPQHGSCTIYPFLGVEGFTMFEIDCPGFESPFPPITYRYMVSYGVVASNVPY----SRI 744
            |:  |..||..||.:.|..|:|..|:|.|.|   .|..|...|.:....|..:|:..|    ::.
  Rat   925 TV--NQAPQDMSCQVRPHRGMEAHTIFSIFC---MSGKPDFHYEFRYRIGNASSHTLYRGQDTQY 984

  Fly   745 VLTLPAAET-----IMIS--ICDA----IDMCVEKRVEVKVL-------------------SIDK 779
            ...|||.::     :::|  :.|.    :..|.   |||.||                   ::..
  Rat   985 YFLLPAGDSSDSYKVIVSTEVTDGQGSKVQPCT---VEVTVLPRYHGNDCHDKDLYNSTLENLST 1046

  Fly   780 SMLTGQ-KEVMNYVPNFFKRGHWNRAYIMGIAAITFIE---TSIDGDEFYSYLTGLVASTGSQM- 839
            ..|.|. .|:.||:           |.|.||.:..::|   ||..|.  :|.:..::..:..::
  Rat  1047 LQLVGSYTEIRNYI-----------AMITGILSRLYVESRNTSSCGQ--WSQIQDVLIFSACKVP 1098

  Fly   840 --EQITTLSS-HMLIRLHPVDFRGATVMAEMFSHLGDSFSA--------IVQEH---EWL----- 885
              :|.|.:.| |:|..|.....:.:.:.||:.......|.|        :|.|.   |::
  Rat  1099 YTDQETMMDSIHILRDLISFPNKLSLMSAELIYKYAQMFLAQGQVSRRLLVDEKLRVEFILLISG 1163

  Fly   886 --------HREGYY-----------------SLTAMHMFFMSI--LGKKTESHSNAMCSLHNPAC 923
                    .|:|||                 ||:..|...:|.  :..:|..|.:...|:.|
  Rat  1164 VWEAAKEDVRDGYYLQKEGMKIVSDMLLACLSLSPKHQIHISTGQMEFQTLVHRSPQSSIQN--- 1225

  Fly   924 MNLQIIDLEKPFVIKFDPLILVRINSWLMSTWFLYRCIYFLGVIATQRHHPYDDALTIHKSGIAY 988
                                                    ||.|..  |.|.|.||  |
  Rat  1226 ----------------------------------------LGFIRV--HLPNDVAL--H------ 1240

  Fly   989 QINVTEVTENTKDIQVKTIDHIHVIKLS--TKLLYELQRRLNHSSILLQIISQQNFHNIYWWYPD 1051
                       ...|.:|....::.:|:  .|..|..::....   |..::|.       |.|
  Rat  1241 -----------SPTQEETQSPCYISQLTFFMKSPYSGEQAPGQ---LGGVMSP-------WLY-- 1282

  Fly  1052 PFPSKTSVLIVHAYSPVQF-FRSAKEFQLTNPLVY-----KTNITHFNDASFNQYMTNNSIQNST 1110
            ...|:..:|.....:||.. |.........||.::     :.|:..|...|.|.       |.|.
  Rat  1283 SCKSRRPILRGRLETPVTIEFGEEDHLHKKNPAMFVLLRDEVNVHQFTGLSENS-------QESL 1340

  Fly  1111 EVHIYSVMLNHKAMLAVRIVNCSELM----YIKMRLHRWPTLGQIRQHACRITPDMQGKRIWIAN 1171
            ::||.......:|...:.:|..||..    ::..:::.|               |.|..::::..
  Rat  1341 QIHIEFSKPVIRAFPIILLVRFSEKATPSDFLMKQVYFW---------------DEQTVQMYVPA 1390

  Fly  1172 SCERSPAYVAIHKPGEIRYKTEDKDQLSARGRKKGNRTHDGSETPEVRQKADFIDYDNEDIVEEV 1236
            :..|..      ..|.:.....|.|      ||..|:...|:
  Rat  1391 APWRGA------NVGYLSLLDADYD------RKPPNKYLAGA----------------------- 1420

  Fly  1237 LPLNYSILLEIYQCNIWKNRSLDPGW-SEDHCT---TSFEHSRGSSVQCTCHTLGALS------S 1291
              :||::..:..||..|....    | ||..|.   ||.|     .|.|:.|.|...|      :
  Rat  1421 --VNYTVHFQWIQCVFWDKTE----WRSEGPCPQPGTSPE-----KVNCSYHRLAPFSVLRRKLN 1474

  Fly  1292 RIFPISS-QLFVEHIPVPIFTFNMILMIFFALLFLLLVFKFLL-HLNIISAYLKNPEFRLQCDAS 1354
            ..|.:|| ..|..|      ..|::..||  .:|.|:::.||: ..:.:..:.|.       |..
  Rat  1475 ATFQVSSVSEFQSH------PHNLLPSIF--SVFFLVLYGFLMSKSSCVDCHKKK-------DPG 1524

  Fly  1355 VGKSDQSFVSGSEILLVIV-TGGQEFAGTTSNVKFYLKSPHRQQTSYQITQD---PGHPKLLRNS 1415
            ....::..:.|.::..|:: ||.:..|..||.|...|..    :..:..|::   |..|...|||
  Rat  1525 CIFLEEEALLGHQLYAVVIDTGFRSPARFTSKVFIVLCG----ENGHSETKELCCPEKPLFGRNS 1585

  Fly  1416 TIKIMVPRGHIYIP-TRLALRLVPNGRYPSWYCRSITVVDLKLKVQQLFLVESWI----EGG--- 1472
            ....::...|...| .::.|....:|..|||:...:.|.:|.......|..:.|:    .||
  Rat  1586 RHTFILSTPHQLGPLQKIRLWHDSSGLSPSWFISHVMVKELCSGQAWFFSAQCWLAVSKRGGQVL 1650

  Fly  1473 ------SH------------IQFMRSKYFTYGNYSRYPKYTWCKRFRSRAEQLYFSWY--LINAI 1517
                  ||            .:::...:..:..||:.|...:....|........|.|  |...:
  Rat  1651 GEFFCLSHGLSFWKLFYSKFTEYLEDFHIWFSLYSQPPSSNYLHTQRLAVSFCLLSVYSCLTALV 1715

  Fly  1518 TGPSQSKVGGIIMNQFERTCVWICKTAITL 1547
            |      |||     .|:..:.:..|||||
  Rat  1716 T------VGG-----HEQRPLGVGPTAITL 1734

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG42685	NP_609717.5	REJ	411..>728	CDD:366875	82/473 (17%)
		PLAT	1367..1480	CDD:238061	29/142 (20%)
Pkd1l1	XP_063129791.1	None