Protein Alignment CG42685 and Pkdrej

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609717.5
• Gene: CG42685 / 34854
• FlyBaseID: FBgn0261571
• Length: 1609
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_035235.2
• Gene: Pkdrej / 18766
• MGIID: 1338786
• Length: 2126
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 1392
• Identity: 258/1392 - (18%)
• Similarity: 474/1392 - (34%)
• Gaps: 402/1392 - (28%)

  Fly   396 VYFSPMGHLEFFASISDACSTVEYDKITWQLCDITENKIIARLKNATGLVVKL----LPYKVHIL 456
            ||||       .||::|   |.::::..          ::.::..:.|..:.:    |||.|::.
Mouse   147 VYFS-------VASVND---TPDWNRPV----------LLPQVAVSKGFSLHIPKYALPYGVYVF 191

  Fly   457 NEPDRRKVFLLRGKAVINGVTTVARCYMKYKPPPIEPLIKGNERRLVDVRKPIIIDGSSSKDRLK 521
            |    ..:.:.|.......||.....|:..:..|::.::.|..|..|.....:|::||.|.|.
Mouse   192 N----FTLSIFRWDLAWPTVTGSDIIYIWVRKRPLKAVLLGAPRVTVKFSDELILNGSMSYDP-- 250

  Fly   522 IRESIKS--KQFLWTCISLDDPFNNYCKKYM-------------------SKSPTLRLPPYALKE 565
             ...|.:  .||.|.|.:  :| ..|...|:                   :....|.:||..|:.
Mouse   251 -EADIPTWGLQFFWYCTT--NP-RYYSGNYVLVINQAVCHPEQDSLNWPWAVGSVLTIPPKTLRG 311

  Fly   566 NAVYDFSLTVISRFDPRNRMT----TTQTIKGVAKTTFTPQILCRRNC--ALGVYAPLDSIHLIS 624
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Mouse   312 NGVYYFRMVV----QKQNRTAFSDKTVHVLQGLQPKA---HISCIENCGPTLGV---SDRFSLFL 366

  Fly   625 KCDDCPGTVKRYEWWLL---------DTESQPTLESSHKYLILHTLEPLVQIRLRVWVK--GQGW 678
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Mouse   367 NCPSC-GRQDLYSWSILSLTGHEVMFDWAGQAITRRNGPYLSIKAFAFRNFLENRVWVSLILKSW 430

  Fly   679 ADAFYTLRR----NNGPQHGSCTIYPFLGVEGFTMFEIDCPGFESPFPPITYRYMV----SYGVV 735
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Mouse   431 SGMTTTLRHPVVINHGPRVGKCKINPASGISMVTKFAVECSDFKDENLPLKYKIIVSELDSIGAI 495

  Fly   736 AS-------NVPYSRIVLTLPA------------AETIMISICDAIDMCVEKRVEVKVLSIDKSM 781
            :|       :|.||......||            ...:.:.:.|::....:..::..|.:  .::
Mouse   496 SSVEENTLGSVVYSGAEPITPAFFLPVGTVTDEYNVRLYVQVYDSLGTFSQVTLQATVTA--PTV 558

  Fly   782 LTGQKEVMNYVPNFFKRGHWNRAYIMGIAAITFIETSIDGDEFY--SYLTGLVAST-----GSQ- 838
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Mouse   559 RDSSKDVLQQLLN------------VTMKPTSLLSTLLQKQDWLQAGYLTYVVISVLNNIKGEQE 611

  Fly   839 -MEQITTLSSHML-----IRLHPVDFRGATVM-----AEMFSHLGD------SF-----SAIVQE 881
             .:....|..|::     ..::..|..|.:||     .:..|.|..      ||     |..:||
Mouse   612 LQDDRARLLEHLVKQSLTFAMNTADEIGQSVMVITKLTQKASDLSQADLEATSFRLRQASQDLQE 676

  Fly   882 HEWLHREGYYSLTAMHMFFMSILGKKTESHSNAMCSLHNPACMNLQIIDLEKPFVIKFDPLILVR 946
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Mouse   677 YQHRHK---------HLQQVEVVG------TGILTSLSN-------LLKLINPYYTLQDPLFVVE 719

  Fly   947 INSWLMSTWFLYRCIYFLGVIATQRHHPYDDALTIHKSGIAYQINVTEVTENTKDIQVKTIDHIH 1011
            ..|                           |.:..:|   ......|.:..:..::.|:.:::.:
Mouse   720 SLS---------------------------DTILANK---VPGSKTTALRTSNFNMYVEKVENWN 754

  Fly  1012 VIKL--STKLLYELQRRLNHSSILLQIISQQNFHNIYWWY-PDPFPSKT-----SVLIVHAYSPV 1068
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Mouse   755 VFKAFRNDSLCPNCLRATLNASTVPRLPAKAPISMMFCEFADDPFPWLTYPENISVDVVG----- 814

  Fly  1069 QFFR------SAKEFQLTNPL--VY--KTNITHFNDASFN------------QYMTNNSIQNSTE 1111
              ||      :.|..::|..:  ||  :.::|   .:|||            ..:|...|....:
Mouse   815 --FRMTGVADNNKVIEITPDIAEVYLVRKDLT---PSSFNLTVGPGIKSDGFSKVTTGGISFEVD 874

  Fly  1112 VHIYSVMLNHKAMLAVRIVNCSE-LMYIKMRLHRWPTLGQIRQHACRITPDMQGKRIWIANSCER 1175
            ......:|.|   :...:....| |:|                ..|::||........:.|....
Mouse   875 SRWTGELLIH---IVTNVTVLFEALVY----------------EGCQLTPTNLMATFLVPNDIPP 920

  Fly  1176 SPAYVAIHKP----GEIRYKTEDKDQLSARGRKKGNRTHDGSETPEVRQKADFIDYDNEDIVEEV 1236
            ...:..:..|    .|.|........|.:..:::.:..::.|   .|.|.:.|:          :
Mouse   921 IVKWSGLFDPTCSVKEARVVCLSSSLLRSIAQRRFSFKYNIS---MVLQASRFV----------L 972

  Fly  1237 LPLNYSILLEIYQCNIWKNRSLDPGWSEDHCTTSFEHSRGSSVQCTCHTLGALSSRIFPISSQLF 1301
            .|.|..:.:.::..:......:...|.:..|... |.:...:|.|.|.. |..|.|.. .|.:|.
Mouse   973 KPTNKLVRIALFMVHCLDMYGIQSDWQQSTCVLG-EKTTWKTVHCVCRN-GRRSRRQL-TSVKLT 1034

  Fly  1302 VEHIPVPIFTFNMILM-------------------IFFALLFLLLVFKFL----LHLNIISAYLK 1343
            ..|:.....|..:|::                   .|.|:||:::::..|    ||.::|..|.:
Mouse  1035 YHHLHTHFVTAKVIVVPNPVDLRLAIISNLTQNPATFLAVLFIMILYAILAFWALHRDVIDLYFR 1099

  Fly  1344 --------NPEFRLQCDASVGKSDQSFVSGSEILLVIVTGGQEFAGTTSNVKFYLKSPHRQQTSY 1400
                    |..|...|                .|:.|.||.:..:||.:||...|.........:
Mouse  1100 DNVVILTDNDPFDTLC----------------YLVTIFTGSRWGSGTRANVFIQLMGTEGTSDVH 1148

  Fly  1401 QITQDPGHP--KLLRNSTIKIMV-----PRGHIYIPTRLALRL--VPNGRYPSWYCRSITVVDLK 1456
            .::    ||  |.|...:|...:     ..|.|:     ::|:  ..:|..||||...|.|.:|.
Mouse  1149 CLS----HPYFKTLYRGSINTFLLTTKNDLGDIH-----SIRVWHDNSGEAPSWYLSRIKVENLF 1204

  Fly  1457 LKVQQLFLVESWIEGGSHIQ-----------FMRSKYFTYGNYSRYPK-YTWCKRFRSRAEQLYF 1509
            .|...||:...|:...:.:.           ..|:.:|......:..| :.|...|..
Mouse  1205 NKRIWLFVCRRWLSVDTTLDATFSVTNPDEPLKRTDFFMIDVRDKLRKNHMWISIFTE------- 1262

  Fly  1510 SWYLINAITGPSQSKVGGIIMNQFERTCVWICKTAITLAFVT---LYFGKHTVSSIQEETRENVD 1571
                              |:...|.|.....|..|:.|:.:.   ::|..:....|:
Mouse  1263 ------------------IVPKPFNRLQRLSCCLAMLLSSLVCNIMFFNLNQKEKIE-------- 1301

  Fly  1572 NSLKVHLV--VMLGFFAFLIGLAIHVL 1596
             |..:|::  :::|..:.:|.:.:.:|
Mouse  1302 -SRHMHIIRSMLIGIESVVITIPVQLL 1327

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG42685	NP_609717.5	REJ	411..>728	CDD:366875	83/362 (23%)
		PLAT	1367..1480	CDD:238061	29/132 (22%)
Pkdrej	NP_035235.2	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	20..71
		REJ	130..598	CDD:366875	107/505 (21%)
		PLAT_polycystin	1115..1230	CDD:238850	30/139 (22%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1379..1431
		Polycystin_dom	1623..1828	CDD:466668
		PKD_channel	1829..2051	CDD:462341