Protein Alignment spel1 and msh3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523565.2
• Gene: spel1 / 34842
• FlyBaseID: FBgn0015546
• Length: 917
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_002942407.2
• Gene: msh3 / 100486354
• XenbaseID: XB-GENE-1014070
• Length: 1077
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 943
• Identity: 250/943 - (26%)
• Similarity: 410/943 - (43%)
• Gaps: 200/943 - (21%)

  Fly    44 HTD---------RYTVHGSDDCELVAK----IVYKSTAFIGALLPDDKKETLQFVSMSKGNFELA 95
            |||         :|...| :|.|:.::    ..:....|:.|.:|..:    .||.:.:
 Frog   191 HTDAILCVECGYKYRFFG-EDAEIASRELNIYCHMDHNFMTASIPAHR----LFVHVRR------ 244

  Fly    96 VRELLLVRNYRVEVYVKNSSDWEIEYRG-SPGNLLQFEDILFSNKEVLVGNSIISLLVKLDGGGQ 159
                |:.:.|:|.| ||.:....::..| |..:|...:......|..|:|.. :|.|:.:|...:
 Frog   245 ----LVAKGYKVGV-VKQTETAALKAAGESKSSLFTRQLTALYTKSTLIGED-VSPLINIDDSLE 303

  Fly   160 RRVGVASVEQN------------------DCKFQLL-------EFLDDDFF-----TELEATVVL 194
            ....:|.|..:                  |..|.|:       |.:.|.|.     ||||..::.
 Frog   304 VECIMADVPSSYLLCIFENIDRTKNKKSADAVFGLVAVQPSTGEVMYDRFHDTKSRTELETRILR 368

  Fly   195 LGPKECLLPS---------IEGEYSAVKTLLDRNGVMITMPKKSGDNDLLQDLNRLLRFAKGQQE 250
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 Frog   369 LQPVEILLPSDISDCTERLISSLTSA--SLRDDDRIRIERMDKS-HFEYSQAFQLISEFYGQEQH 430

  Fly   251 DATGLKELQLQLASN-----ALKTAIKYL------DLVNDAGNLGHYEIKQLDLNRFVHLDSAAV 304
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 Frog   431 ISAGSQKLTEILTFDKSVICSLAATIKYLKEFHLEKILYNSSNFTQMSSK----NECLRMNGTTL 491

  Fly   305 AALNIMPKPGTHPSMPSYRWQSVLGVLDHCRTPQGHRLMGQWVKQPLRSRNILNDRHNIVQCLLE 369
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 Frog   492 KNLEILQNQTDLKTKGSLIW-----VLDHTRTCFGRRKIKQWVTQPLVNTREINARLEAVSEVLL 551

  Fly   370 SPDTMETLSLDYLKRIPDILMLTKKLMRRKANLQDLFRIYQVILRTPKILKVLHELDNSTIESVI 434
            |..::.|....:|.::||:......:..:|.:.|:.|.|...:......::.|.....|.::|.:
 Frog   552 SDSSVFTQVRSHLSKLPDLERGVCSIYHKKCSTQEFFLIVSTLCNISNNMEALIPAIKSQVKSPL 616

  Fly   435 -----------CAPFKSFLKDL------TGLK-QMVEQVVDFEAIERGEYLVKASFDSRLMELQQ 481
                       ..|...||..|      ||.| ::.:.:.||..|           .:|.:|:|:
 Frog   617 LQTIFAEIPQMLEPMHKFLNVLNESAARTGNKTELFKDLTDFPKI-----------SARKLEIQE 670

  Fly   482 MMTELYSKMEELQ-----------FKCSQELNLDGKNQVKLESVAKLGHHFRITVKDDSVLRK-- 533
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 Frog   671 MLLKLEAHLGDIRKILKNPAASYTSVYGQEFLIEVKN--SLGSVVPPDW---ITVSSTKAVSRFH 730

  Fly   534 ----NKNYRIVDVIKGGVRFTSDKLEGYADEFASCRT-------RYEEQQLSIVEEIIHVAVGYA 587
                .:|||.::.::       :||      ...|.|       ::.|...|:.:.|
 Frog   731 SPFIVENYRHLNQLR-------EKL------VLDCNTEWLHFLDKFGENYHSVCKSI-------- 774

  Fly   588 APLTLLNNELAQLDCLVSFAIAARSAPTPYVRPKMLEEGARELVLEDVRHPCLE--LQEHVNFIA 650
                   |.||..||:.|.|..|:.  ..|.||.:.:.|: |:::::.|||.::  |:|...|:.
 Frog   775 -------NHLATADCIFSLAEVAKQ--DGYCRPAVHDSGS-EIIIKNGRHPVIDLLLEEQSQFVP 829

  Fly   651 NSVDFKKEECNMFIITGPNMGGKSTYIRSVGTAVLMAHIGAFVPCSLATISMVDSILGRVGASDN 715
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 Frog   830 NSTSLMADKERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEAVTVGIVDGIFTRMGAADN 894

  Fly   716 IIKGLSTFMVEMIETSGIIRTATDKSLVIIDELGRGTSTYEGCGIAWSIAEHLAKETKCFTLFAT 780
            |.||.||||.|:::|:.|::.||.:||||:|||||||||::|..||:|..|::.|.....|||.|
 Frog   895 IYKGRSTFMDELLDTAEILKNATPRSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYSTLEYIIKSVTSLTLFVT 959

  Fly   781 HFHEITKLAETLS-TVKNCHMAAVADADD--------------FTLLYQVRSGVMEKSFGIQVAR 830
            |:..:.:|.:..: .|.|.|||...|.::              .|.|||:..|:..:|:|:.||:
 Frog   960 HYPSLCELEKAYAEQVGNYHMAFFVDEEEDTDSGAESLQQPQHVTFLYQITQGIAARSYGLNVAK 1024

  Fly   831 LANFPEHVVQNAQEVYNEFEDEHVDKQKKEDKA 863
            ||:.|..||..| ...::..:|.|:.::|:.||
 Frog  1025 LADIPHSVVTRA-ACKSKALEELVEMKRKKLKA 1056

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
spel1	NP_523565.2	MutS_I	24..132	CDD:426350	21/101 (21%)
		MutS	174..890	CDD:440019	220/781 (28%)
msh3	XP_002942407.2	MutS	177..1046	CDD:440019	245/931 (26%)