DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Sec71 and Arfgef1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_609675.2 Gene:Sec71 / 34785 FlyBaseID:FBgn0028538 Length:1653 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001263985.1 Gene:Arfgef1 / 312915 RGDID:1560793 Length:1846 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1846 Identity:1109/1846 - (60%)
Similarity:1319/1846 - (71%) Gaps:221/1846 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     7 KTKEMFIVRALEKILADKDIRRSHHSQLKKSCDSALEQIKAELISA----GQIAEGNELPCAALP 67
            |||.||:.||||||||||:::::|||||:|:|:.|||:||.|....    |:...|:    ..||
  Rat     6 KTKNMFLTRALEKILADKEVKKAHHSQLRKACEVALEEIKVETEKQSPPHGEAKAGS----GTLP 66

  Fly    68 LPKNDAASIINAETYFLPFELACKSRSPRIVVTALDCLQKLIAYGHLTGSIQDSANPGHLLIDRI 132
             |.....:.|.|:.|||||||||:|:.||||.|:||||||||||||||||..||..||..|||||
  Rat    67 -PVKSKTNFIEADKYFLPFELACQSKCPRIVSTSLDCLQKLIAYGHLTGSAPDSTTPGKKLIDRI 130

  Fly   133 VVTIYGCFSGPQTDEAVQLQIIKALLTVVTSQHVEIHEFTLLQAVRTCYDIYLSSKNLVNQTTAR 197
            :.||.|||.||||||.|||||||||||.|||||:||||.|:||||||||:|||:||||:|||||:
  Rat   131 IETICGCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSQHIEIHEGTVLQAVRTCYNIYLASKNLINQTTAK 195

  Fly   198 ATLTQMLNVIFARMENQVYE---------------------------------LPP--------- 220
            |||||||||||||||||..:                                 |||         
  Rat   196 ATLTQMLNVIFARMENQALQEAKQMERERHRQQHHLLQSPVSHHEPESPHLRYLPPQTVDHIAQE 260

  Fly   221 ------PNSN-----------PTNGS--------------------IHSED--CNGSGEESLRDS 246
                  |.::           |.|||                    :..:|  |:|..||..:|.
  Rat   261 QEGDLDPQTHDVDKSLQDDIEPENGSDISSAENEQTEADQATAAETLSKDDVLCDGECEEKPQDI 325

  Fly   247 DEVIASELLAEII---------------SAAYNEAMKDQESV------GEP-----EPTLNGNDY 285
            .:.|..|::..|:               :|...|...|.|:|      |.|     .|:| .:|.
  Rat   326 VQSIVEEMVDIIVGDMGEGTAVSASADGNAGAVEDGSDSENVQANGIPGTPISAAYTPSL-PDDR 389

  Fly   286 SSHSDHDSVELHSENDAVVTAKFTHILQKDAFLVFRALCKLSMKPLPDGHPDPKSHELRSKVLSL 350
            .|.|.:|:.|..:.:.....|||:||||||||||||:|||||||||.||.|||||||||||:|||
  Rat   390 LSVSSNDTQESGNSSGPSPGAKFSHILQKDAFLVFRSLCKLSMKPLSDGPPDPKSHELRSKILSL 454

  Fly   351 HLLLLILQNAGPVFRSNEMFIMAIKQYLCVALSNNGVSLVPEVFELSLSIFVALLSNFKVHLKRQ 415
            .|||.||||||||||:|||||.|||||||||||.||||.||||||||||||:.||||||.|||.|
  Rat   455 QLLLSILQNAGPVFRTNEMFINAIKQYLCVALSKNGVSSVPEVFELSLSIFLTLLSNFKTHLKMQ 519

  Fly   416 IEVFFKEIFLNILEANSSSFEHKWMVIQALTRICADAQSVVDIYVNYDCDFSAANLFERLVNDLS 480
            ||||||||||.|||.::|||:|||||||.|||||||||||||||||||||.:|||:|||||||||
  Rat   520 IEVFFKEIFLYILETSTSSFDHKWMVIQTLTRICADAQSVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLS 584

  Fly   481 KIAQGRQALELGANPMQEKSMRIRGLECLVSILKCMVEWSKDLYVNPNMPVPPMQVQSPTSTEQD 545
            ||||||.:.|||.:.:||.|:|.:||||||||||||||||||.|||||......| :.|:..|..
  Rat   585 KIAQGRGSQELGMSNVQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQ-EKPSEQEIS 648

  Fly   546 Q---ADT-----TIQTMHSGSSHSLNSNQEQLQ--DLPEALEERKMRKEVMETGIELFNRKPQKG 600
            :   .:|     ::.::.|.||..:.|...|:.  |.||..|..|.:||::|.||:|||:||::|
  Rat   649 EIKHPETINRYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRG 713

  Fly   601 VQFLQEKQLLGATCGDIARWLHEDERLDKTVIGNYIGENDDHSKEVMCAYIDAFDFRQMEVVAAL 665
            :|:|||:.:||.|..|||::||::||||.|..|.::|:||..:||||.||:|..||...:.|:||
  Rat   714 IQYLQEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQAGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSAL 778

  Fly   666 RFLLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFASRYCECNPKNQLFQSADTVYVLAFSIIMLTTDLHSPQVKHK 730
            |..|||||||||||||||||||||:||.|||....||.||||.||||:|||||||||||||||:|
  Rat   779 RLFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKNK 843

  Fly   731 MTKEQYIKMNRGISDSKSDLPEEYLSSIYDEISEHEIKMKNNSGMLQQAKPTGKQAFITEKRRKL 795
            |||||||||||||:||| ||||||||:||:||:..:|.||....:....|.| ||...:||:|:|
  Rat   844 MTKEQYIKMNRGINDSK-DLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKST-KQNVASEKQRRL 906

  Fly   796 LWNMEMEVISLTATNLMQSVSHVKSPFTSAKHLEHVRPMFKMAWTPFLAAFSVGLQDCDDPEIAT 860
            |:|:|||.::.||..||::||||::|||||.||||||||||:||||||||||||||||||.::|:
  Rat   907 LYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWTPFLAAFSVGLQDCDDTDVAS 971

  Fly   861 LCLDGIRCAIRIACIFHMSLERDAYVQALARFTLLNANSPINEMKAKNIDTIKTLIMVAHTDGNY 925
            |||:||||||||||||.:.||||||||||||||||..:|.|.|||.||||||||||.||||||||
  Rat   972 LCLEGIRCAIRIACIFSIQLERDAYVQALARFTLLTVSSGITEMKQKNIDTIKTLITVAHTDGNY 1036

  Fly   926 LGSSWLDIVKCISQLELAQLIGTGVRPQFLSGAQTTLKDSLN----------------------- 967
            ||:||.:|:||||||||||||||||:|:::||.....:.||.                       
  Rat  1037 LGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKPRYISGTVRGREGSLTGTKDQAPDEFVGLGLVGGNVDWK 1101

  Fly   968 --PSVKEHIGETSSQSVVVAVDRIFTGSMRLDGDAIVDFVKALCQVSVDE-LQQQQPRMFSLQKI 1029
              .|::|.||||||||||||||||||||.||||:||||||:.||.||:|| |....|||||||||
  Rat  1102 QIASIQESIGETSSQSVVVAVDRIFTGSTRLDGNAIVDFVRWLCAVSMDELLSTTHPRMFSLQKI 1166

  Fly  1030 VEISYYNMERIRLQWSRIWQVLGEHFNAVGCNSNEEISFFALDSLRQLSMKFMEKGEFSNFRFQK 1094
            ||||||||.||||||||||:|:|:|||.||||.||:::.||:||||||||||:||||.:||||||
  Rat  1167 VEISYYNMGRIRLQWSRIWEVIGDHFNKVGCNPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQK 1231

  Fly  1095 DFLRPFEHIMKKNASPAIRDMVVRCIAQMVNSQAHNIRSGWKNIFSIFHLAAGDNEEPIVELAFQ 1159
            |||||||||||:|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||:|||||.|.:|.|||||||
  Rat  1232 DFLRPFEHIMKRNRSPTIRDMVVRCIAQMVNSQAANIRSGWKNIFSVFHLAASDQDESIVELAFQ 1296

  Fly  1160 TTGKIIGDLYKRQFAIMVDSFQDAVKCLSEFA-TARFPDTSMEAIRLVRTCAQCVHEAPQLFAEH 1223
            |:|.|:..::::.|...:|||||||||||||| .|.|||||||||||:|.||:.|.:.||.|.|:
  Rat  1297 TSGHIVTLVFEKHFPATIDSFQDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRHCAKYVSDRPQAFKEY 1361

  Fly  1224 AGMENDASVAEEDRVWVRGWFPMLFSLSCVVNRCKLDVRTRALTVLFEIVKTYGESFKPHWWKDL 1288
            .  .:|.:||.|||||||||||:||.||||:||||||||||.|||:|||:||||.:::.|||:||
  Rat  1362 T--SDDMNVAPEDRVWVRGWFPILFELSCVINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKTYGHTYEKHWWQDL 1424

  Fly  1289 FNVIFRIFDNMKLPEHVTEKSEWMTTTCNHALYAIIDVFTQYFDVLGHLLLEELFAQLHWCVQQS 1353
            |.::|||||||||||..|||:||||||||||||||.||||||.:||..:||:::||||:|||||.
  Rat  1425 FRIVFRIFDNMKLPEQQTEKAEWMTTTCNHALYAICDVFTQYLEVLSDVLLDDIFAQLYWCVQQD 1489

  Fly  1354 NEQLARSGTNCLENLVISNGFKFNESTWDKTCQCILDIFNATLPQDLLSWRP------------- 1405
            ||||||||||||||:||.||.||....|||||.|.||||..|:|..||:|||             
  Rat  1490 NEQLARSGTNCLENVVILNGEKFTLEIWDKTCNCTLDIFKTTIPHALLTWRPTSGEAAPPSPSAM 1554

  Fly  1406 -------------------KAHSSNNIPQ-----------------------EHNHFEALHIRCV 1428
                               :..||:|..|                       |...|.||.|:||
  Rat  1555 SEKQLDAISQKSVDIHDSAQPRSSDNRQQAPLVSVSPASEEVSKGRPTAKFPEQKLFAALLIKCV 1619

  Fly  1429 VQLELIQTMDNIVFFPATSRKEDAETLAQAAADLTGGRSGSQSQLLECQREEQGMYGYLRTRQLL 1493
            ||||||||:||||||||||:|||||.||.|..|.....       :....::||||.:|.::||.
  Rat  1620 VQLELIQTIDNIVFFPATSKKEDAENLAAAQRDAVDFD-------VRVDTQDQGMYRFLTSQQLF 1677

  Fly  1494 TLADCLMQSHRFAKRFNADHDQRSLLWRAGFKGSVKPNLLKQETSSLACVLRIFFKMYGDENRRS 1558
            .|.|||::||||||.||::::||:.||:|||||..||||||||||||||.|||.|:||.||:|.|
  Rat  1678 KLLDCLLESHRFAKAFNSNNEQRTALWKAGFKGKSKPNLLKQETSSLACGLRILFRMYTDESRVS 1742

  Fly  1559 DWPGIEQELVQVCKEALGYYLSLQSEAHRDAWTSLLLLILTRLLKMSDARFATHVSNYYSLLCEM 1623
            .|..::|.|:.||.|||.|:|:|.||:||:|||:||||.||::||:||.||..|.|.||.||||:
  Rat  1743 AWEEVQQRLLNVCSEALSYFLTLTSESHREAWTNLLLLFLTKVLKISDNRFKAHASFYYPLLCEI 1807

  Fly  1624 MCFDLKPELRSVLRRVFMRIGPVFNI 1649
            |.|||.||||:||||.|:|||.||.|
  Rat  1808 MQFDLIPELRAVLRRFFLRIGIVFQI 1833

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Sec71NP_609675.2 PLN03076 13..1580 CDD:215560 1056/1769 (60%)
DCB 30..212 CDD:292830 125/185 (68%)
Sec7_N 312..465 CDD:289549 132/152 (87%)
Sec7 582..767 CDD:279680 125/184 (68%)
DUF1981 1080..1161 CDD:286414 68/80 (85%)
Arfgef1NP_001263985.1 DCB, DCB:DCB domain and DCB:HUS domain interaction. /evidence=ECO:0000250 2..224 144/222 (65%)
PLN03076 15..1763 CDD:215560 1055/1765 (60%)
DCB 29..210 CDD:292830 125/185 (68%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 217..248 0/30 (0%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 264..302 5/37 (14%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 347..410 14/63 (22%)
Sec7_N 416..570 CDD:289549 133/153 (87%)
HUS, DCB:HUS domain interaction. /evidence=ECO:0000250 554..574 17/19 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 631..684 11/53 (21%)
Sec7 695..879 CDD:279680 125/184 (68%)
Nuclear localization signal (NLS). /evidence=ECO:0000250 708..712 2/3 (67%)
DUF1981 1217..1297 CDD:286414 67/79 (85%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1571..1600 4/28 (14%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166342730
Domainoid 1 1.000 613 1.000 Domainoid score I179
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5307
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H4687
Inparanoid 1 1.050 2090 1.000 Inparanoid score I39
OMA 1 1.010 - - QHG54931
OrthoDB 1 1.010 - - D50759at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001583
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45422
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100729
Panther 1 1.100 - - O PTHR10663
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X714
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1615.770

Return to query results.
Submit another query.