DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Sec71 and agef-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609675.2 Gene:Sec71 / 34785 FlyBaseID:FBgn0028538 Length:1653 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001021798.2 Gene:agef-1 / 173231 WormBaseID:WBGene00012386 Length:1594 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1673 Identity:734/1673 - (43%)
Similarity:1038/1673 - (62%) Gaps:161/1673 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 MFIVRALEKILADKDIRRSHHSQLKKSCDSALEQIK-AELISAGQIAEGNELPCAALPLPKNDAA 74
            ||:...:||||||:||:|..:.||||:|:||||::| ||...|...:.|..||.|        ..
 Worm    15 MFLRSGIEKILADRDIKRKENLQLKKACESALEELKAAEEQDASPSSNGEHLPDA--------GG 71

  Fly    75 SIINAETYFLPFELACKSRSPRIVVTALDCLQKLIAYGHLTGSIQDSANPGHLLIDRIVVTIYGC 139
            :.:.|:.|||||||||.|:||:||:|||||||||||||||||...|.:||...||||||..|...
 Worm    72 TAVEADRYFLPFELACNSKSPKIVITALDCLQKLIAYGHLTGRGADISNPERKLIDRIVEAICAP 136

  Fly   140 FSGPQTDEAVQLQIIKALLTVVTSQHVEIHEFTLLQAVRTCYDIYLSSKNLVNQTTARATLTQML 204
            |.|..|||.|.||:|||:|.||.|.|.|:|..:|:.|||||::|||:||:.:||.||:.||||::
 Worm   137 FLGQGTDETVLLQLIKAVLAVVLSTHCEVHGASLILAVRTCFNIYLTSKSPINQATAKGTLTQVI 201

  Fly   205 NVIFARMENQVYELPPPNSNPTNGSIHSEDCNGSGEESLRDSDEVIASELLAEIISAAYNEAMKD 269
            |.:|..||.             .|:|              ..||.|..|::..::|...:..:.|
 Worm   202 NTVFGNMEK-------------FGNI--------------KDDETIVREVVEVLVSNTISNEVSD 239

  Fly   270 QESVGEPEPTLNGNDYSSHSDHDSVELHSENDAVVTAKFT--HILQKDAFLVFRALCKLSMKPLP 332
            :.|........||:..            .|::|.:..:||  :..||||||||||||.|:.|. .
 Worm   240 ETSEAGGTHRQNGSTM------------GESEAPLDDQFTFMNAYQKDAFLVFRALCILAQKE-E 291

  Fly   333 DGHPDPKSHELRSKVLSLHLLLLILQNAGPVFRSNEMFIMAIKQYLCVALSNNGVSLVPEVFELS 397
            .|..:..|  ||||:|:|.:|||:|||:..:.:|::..|:.||:.||:||:.|.||...:|||.|
 Worm   292 GGASNEMS--LRSKLLALEMLLLVLQNSSSILQSSQPCIIVIKRTLCMALTRNAVSNNIQVFEKS 354

  Fly   398 LSIFVALLSNFKVHLKRQIEVFFKEIFLNILEANSSSFEHKWMVIQALTRICADAQSVVDIYVNY 462
            |:|||.||..||.|||..|||||..:.|.:|::|:.:||.||:|:..:.:|.|:.|||||::|||
 Worm   355 LAIFVELLDKFKTHLKASIEVFFNSVILPMLDSNTCAFEQKWIVLNTIGKILANPQSVVDMFVNY 419

  Fly   463 DCDFSAANLFERLVNDLSKIAQGRQALELGANPMQ---EKSMRIRGLECLVSILKCMVEWSKDLY 524
            |||.::.|||:.:|..:||..  |..:...|.|.|   |::||:.||.||..:|:|:|:|.:   
 Worm   420 DCDMTSPNLFKSIVEVVSKTT--RTTINENAPPAQKEKERAMRLLGLSCLTDLLQCLVDWWQ--- 479

  Fly   525 VNPNMPVPPMQVQSPTSTEQDQADTTIQTMHSGSSHSLNSNQEQLQDLPEALEERKMRKEVMETG 589
                    ..:||..|| :.|.|:               .:::|..:..||.|..|.:|.:||.|
 Worm   480 --------VCEVQKITS-DIDDAE---------------PSEQQHGETFEAFETLKQQKNLMEQG 520

  Fly   590 IELFNRKPQKGVQFLQEKQLLGATCGDIARWLHEDERLDKTVIGNYIGENDDHSKEVMCAYIDAF 654
            |::|:.||:||::||||...:|....::|.::.::|||:||.:|:::|::|:.:..||.||||..
 Worm   521 IQIFSEKPKKGLKFLQEHGFVGTDAVEVAEFMMKEERLNKTQVGDFLGDSDEFNNSVMHAYIDFL 585

  Fly   655 DFRQMEVVAALRFLLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFASRYCECNPKNQLFQSADTVYVLAFSIIMLT 719
            ||..::::||||..||.||||||||||||||.||||||.:|||:..:|.|||..|||||||||||
 Worm   586 DFSSIDILAALRMFLEKFRLPGEAQKIDRLMLKFASRYLDCNPRQGIFASADAAYVLAFSIIMLT 650

  Fly   720 TDLHSPQVKHKMTKEQYIKMNRGISDSKSDLPEEYLSSIYDEISEHEIKMKNNSGMLQQAKPT-G 783
            ||||:..||:||||:.||.|||||::. .::|.|.|.:|:::||::||||:..:..|.:::.| |
 Worm   651 TDLHNKTVKNKMTKQGYINMNRGINEG-GNIPVELLEAIFEDISKNEIKMRAGATALLRSRVTPG 714

  Fly   784 KQAFITEKRRKLLWNMEMEVISLTATNLMQSVSHVKSPFTSAKHLEHVRPMFKMAWTPFLAAFSV 848
            :.|..|:|.|:.:..:|||.:|.||..||:|.|...:.||.|:|..||:||||:.|||.||||||
 Worm   715 QGALATDKERRAMAALEMEALSETARALMESASDADAYFTPAQHQHHVKPMFKICWTPCLAAFSV 779

  Fly   849 GLQDCDDPEIATLCLDGIRCAIRIACIFHMSLERDAYVQALARFTLLNANSPINEMKAKNIDTIK 913
            |:|..||.|..:|||.|.|..:|.||:...:|||:|::|||||||||.|.:.:.||:.|||:.||
 Worm   780 GVQMSDDEEEWSLCLRGFRLGVRAACVLQATLERNAFIQALARFTLLTAKNSLGEMRVKNIEAIK 844

  Fly   914 TLIMVAHTDGNYLGSSWLDIVKCISQLELAQLIGTGVRP----------QFLSGAQTTLKDSLNP 968
            .|:::...||.||..:|:|::||:|.|||.||||||:..          |::..|...:.:....
 Worm   845 LLLLIGDEDGEYLEENWVDVMKCMSSLELVQLIGTGLNSAMSHDTDSSRQYVMKATGGIDEKTLH 909

  Fly   969 SVKEHIGETSSQSVVVAVDRIFTGSMRLDGDAIVDFVKALCQVSVDELQQ-QQPRMFSLQKIVEI 1032
            |:::.:|||||||||||:||||.||.||..:|||.||:|||.||.:||.. ..||||.|.|:||:
 Worm   910 SLQDALGETSSQSVVVAIDRIFNGSARLSAEAIVYFVRALCAVSREELSHPAAPRMFLLGKVVEV 974

  Fly  1033 SYYNMERIRLQWSRIWQVLGEHFNAVGCNSNEEISFFALDSLRQLSMKFMEKGEFSNFRFQKDFL 1097
            ::|||.||||:|||||.|:||||||.||||||.:::|::|:|||||:||:||||..|||||||||
 Worm   975 AFYNMNRIRLEWSRIWNVIGEHFNAAGCNSNEAVAYFSVDALRQLSIKFLEKGELPNFRFQKDFL 1039

  Fly  1098 RPFEHIMKKNASPAIRDMVVRCIAQMVNSQAHNIRSGWKNIFSIFHLAAGDNEEPIVELAFQTTG 1162
            ||||.||.:|.|...||:||||.|.:|.:.:..::|||:|:||::.:||||....|.|.:|.|..
 Worm  1040 RPFEVIMVRNGSAQTRDLVVRCCAHLVEAHSSRLKSGWQNLFSVWTIAAGDPSTEIGEASFLTAQ 1104

  Fly  1163 KIIGDLYKRQFAIMVDSFQDAVKCLSEFA-TARFPDTSMEAIRLVRTCAQCVHEAPQLFAE---- 1222
            |:|...:|..|...:||||:|:|||.||| ....||.:||||||:|.||..|.|......|    
 Worm  1105 KVIEKRFKEDFPAFLDSFQEALKCLQEFACNQNQPDMNMEAIRLIRLCADYVSENSDKIDEAARR 1169

  Fly  1223 ----HAGMENDASVAEEDRVWVRGWFPMLFSLSCVVNRCKLDVRTRALTVLFEIVKTYGESFKPH 1283
                |.|:..|      ..||:|||||:.|.|||::||||||||||:|||:|||:|.:|..|:|.
 Worm  1170 DDHLHKGLTAD------QHVWLRGWFPIFFELSCIINRCKLDVRTRSLTVMFEIMKHHGSDFRPE 1228

  Fly  1284 WWKDLFNVIFRIFDNMKLPEHVTEKSEWMTTTCNHALYAIIDVFTQYFDVLGHLLLEELFAQLHW 1348
            |||||..::|||||..|:.:|.::|.|||:||||||:.::::||||::..|....|..::.|...
 Worm  1229 WWKDLLEIVFRIFDPSKMDDHRSDKREWMSTTCNHAMLSVVEVFTQFYTQLSVYALPMIYRQFGI 1293

  Fly  1349 CVQQSNEQLARSGTNCLENLVISNGFKFNESTWDKTCQCILDIFNATLPQDLLSWRPKAHSSNNI 1413
            .::|.||||||...:|||:|:..||.:|.|..|::|.:.|.::|..|||:.||:|.|.  :||.|
 Worm  1294 FIRQQNEQLARCTISCLESLISQNGERFTEPMWEQTIELIRELFETTLPKSLLTWEPP--NSNGI 1356

  Fly  1414 PQEH--NHFEALH----IRCVVQLELIQTMDNIVFFPATSRKEDAETLAQAAADLTGGRSGSQSQ 1472
            ..|.  |..:.|.    :.||||.||::.:..||.......|.|.:.                  
 Worm  1357 GSEDRTNGSDTLSSEQIVFCVVQNELVEAVSRIVLGDHRESKRDLQI------------------ 1403

  Fly  1473 LLECQREEQGMYGYLRTRQLLTLADCLMQSHRFAKRFNADHDQRSLLWRAGFKGSVKPNLLKQET 1537
                    .|::..:..:.||::.|.|.:||..||:||.::.||.|:|:|...||.||||:.|||
 Worm  1404 --------DGLFTQMSPQLLLSICDALAESHTLAKQFNNNNGQRVLIWKARLLGSTKPNLINQET 1460

  Fly  1538 SSLACVLRIFFKMYGDENRRSDWPGIEQELVQVCKEALGYYLSLQSEAHRDAWTSLLLLIL---- 1598
            .||:.:|.|.|::..|...:|....|...:::|...||..|...:|:..|.|:..::..:|    
 Worm  1461 RSLSAMLAILFRLLYDLRAQSISDKIAIRVLEVVSLALSGYGEAESDTRRTAYGPVICELLRECI 1525

  Fly  1599 ---TRLLKMSDARFATHVSNYYSLLCEMMCFDLKPELRSVLRRVFMRI 1643
               |.|:.:....|...       ||:::.......:|.:|..:|.||
 Worm  1526 ALPTNLIPVLGPEFPLK-------LCDLVETAEDQTMRKLLAELFRRI 1566

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Sec71NP_609675.2 PLN03076 13..1580 CDD:215560 718/1599 (45%)
agef-1NP_001021798.2 PLN03076 18..1476 CDD:215560 711/1571 (45%)

Return to query results.
Submit another query.