DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG31729 and Atp9b

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_609634.1 Gene:CG31729 / 34736 FlyBaseID:FBgn0051729 Length:1256 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017456363.1 Gene:Atp9b / 291411 RGDID:1563006 Length:1158 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1095 Identity:675/1095 - (61%)
Similarity:826/1095 - (75%) Gaps:68/1095 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   198 LCLCSCWRKWF-----RPRELRARTVNLG--RVNTEKFPPNEIRNQKYNFITFLPLVLFEQFRFF 255
            ||...|  .|.     |.:||:||||.||  ....||.|.|.|:|||||..||:|.||:|||:||
  Rat    95 LCTSCC--DWLINVCQRKKELKARTVWLGCPEKCEEKHPRNSIKNQKYNVFTFIPGVLYEQFKFF 157

  Fly   256 LNLYFLLMALSQFIPDIRIGYPYTYWGPLGFVLMVTICREAVDDLRRHQRDHEVNSQKYKRLSST 320
            ||||||:::.|||:|.::|||.||||.|||||:.|||.|||:|:.||.|||.|:|||.|.:|:  
  Rat   158 LNLYFLVVSCSQFVPALKIGYLYTYWAPLGFVMAVTIAREAIDEFRRFQRDKEMNSQLYSKLT-- 220

  Fly   321 NISGYEMVPSSKLKVGDVIIVEKNERVPADLILLRTSDRSGSVFVRTDQLDGETDWKPRLAVPYT 385
             :.|...|.||.::|||:||||||:|:|:|::.||||:::||.|:||||||||||||.::||..|
  Rat   221 -VRGKVQVKSSDIQVGDLIIVEKNQRIPSDMVFLRTSEKAGSCFIRTDQLDGETDWKLKVAVSCT 284

  Fly   386 QKLSRDSELHSIDASFYVEKPQNDIHSFIATFCMADGSE--DTGLSVENTLWANTVVAAGTATGI 448
            |:|....:|.||.|..|.:|||.|||||..||...|...  ...||:||||||:|:||:||..|:
  Rat   285 QRLPALGDLFSISAYVYAQKPQLDIHSFEGTFTRDDSDPPIHESLSIENTLWASTIVASGTVIGV 349

  Fly   449 VIYTGCETRSVMNNSQPRSKVGLLDMEINGLTKVLFCAVLGLSLVMMMLKGFGGPWYRYMFRFVL 513
            |||||.|||||||.|.|::||||||:|:|.|||.||.|::.||:||:.|:||.|||||.:|||:|
  Rat   350 VIYTGKETRSVMNTSNPKNKVGLLDLELNQLTKALFLALVVLSVVMVTLQGFAGPWYRNLFRFLL 414

  Fly   514 LFSYIIPISLRVNLDMGKAFYSWQMQNDSNIQGTVVRSTTIPEELGRISYVLTDKT--------- 569
            |||||||||||||||||||.|.|.:..|.||.|||||::||||||||:.|:|||||         
  Rat   415 LFSYIIPISLRVNLDMGKAAYGWMIMKDENIPGTVVRTSTIPEELGRLVYLLTDKTVTKAKALYS 479

  Fly   570 --GTLTQNEMVFKKIHLGIVSHDADTFHHIGQMIQKLSGNILQQQQGSLSSSSSGGDSTKPMMFG 632
              .||||||||||::|||.||:..||       :.::..::|.......|.:|....|:.|:...
  Rat   480 PARTLTQNEMVFKRLHLGTVSYGTDT-------MDEIQSHVLNSYLQVHSQTSGHNPSSAPLRRS 537

  Fly   633 N----RMRRPEGWREWEAVRALALCHNVTPVSDDEDNRSVSTASTVTGGNNSPTKSVINIEAPGS 693
            .    ::::....|..|||:|:|||||||||.:        ..:.:||....       .||...
  Rat   538 QSSTPKVKKSVSSRIHEAVKAIALCHNVTPVYE--------ARTGITGETEF-------AEADQD 587

  Fly   694 -TDTEHQYQAASPDEIALVKWTEQVGLTLIARDLNTMTLQVKTPSEDNDILLHYQILQLFPFTSE 757
             :|....|||:||||:|||:|||.|||||::|||.:|  |:||||..   :|.|.|||:||||||
  Rat   588 FSDENRTYQASSPDEVALVRWTESVGLTLVSRDLASM--QLKTPSGQ---VLTYCILQMFPFTSE 647

  Fly   758 SKRMGIIVRESKTGQITFYLKGADVVMSSIVQYNDWLSEESGNMAREGLRTLVVAKKVLTEEQYS 822
            |||||||||:..|.:||||:|||||.||:||||||||.||.|||||||||||||||:.||||||.
  Rat   648 SKRMGIIVRDEATAEITFYMKGADVAMSTIVQYNDWLEEECGNMAREGLRTLVVAKRTLTEEQYQ 712

  Fly   823 DFETRYNAARLSITDRVAKVAAVTESLERELELLCLTGVEDRLQENVRPTLELLRNAGVRVWMLT 887
            |||:||:.|:|||.||..|||||.||||||:||||||||||:||.:||||||:|||||:::||||
  Rat   713 DFESRYSQAKLSIHDRTLKVAAVVESLEREMELLCLTGVEDQLQADVRPTLEMLRNAGIKIWMLT 777

  Fly   888 GDKLETACCIAKSSQLIGRNQGLHVLRSVKTRTDAHQELNSFRRKQGHALVISGESLEVCLQYYR 952
            |||||||.||||||.|:.|.|.:|:.|.|..|.:||.|||:||||...||||||:||||||:||.
  Rat   778 GDKLETATCIAKSSHLVSRTQDIHIFRPVTNRGEAHLELNAFRRKHDCALVISGDSLEVCLRYYE 842

  Fly   953 PEFLELATASPAVVCCRCSPTQKAQVVALIQKHTGKRTCAVGDGGNDVSMIQQADAGVGIEGREG 1017
            .|.:|||...||||||||||||||.:|.|:::||.|||||:|||||||||||.||.|:||||:||
  Rat   843 HELVELACQCPAVVCCRCSPTQKAHIVTLLRQHTRKRTCAIGDGGNDVSMIQAADCGIGIEGKEG 907

  Fly  1018 RQASLAGDFSIPQFSHIAKLLLIHGRRSYKRSAALSQFVIHRGLIITTLQAVFSAVFYLSSVALY 1082
            :|||||.||||.||.||.:||::|||.||||||||.|||:||||||:|:|||||:|||.:||.||
  Rat   908 KQASLAADFSITQFRHIGRLLMVHGRNSYKRSAALGQFVMHRGLIISTMQAVFSSVFYFASVPLY 972

  Fly  1083 QGFLMVGYSTLYTMFPVFSLVLDQDITSETAVTYPELYKDLSKGRSLSYKTFFIWVLISIYQGGV 1147
            ||||||||:|:||||||||||||||:..|.|:.||||||||:||||||:|||.|||||||||||:
  Rat   973 QGFLMVGYATIYTMFPVFSLVLDQDVKPEMAILYPELYKDLTKGRSLSFKTFLIWVLISIYQGGI 1037

  Fly  1148 IMYGALILFVDEFIHIVAISFSALIMTELIMVALTVRTWHRLMVLAELFSLALYLISLAVLHEYF 1212
            :|||||:||..||:|:|||||:|||:|||:|||||:||||.|||:||..||..|:.|||.|:|||
  Rat  1038 LMYGALLLFEAEFVHVVAISFTALILTELLMVALTIRTWHWLMVVAEFLSLGCYVASLAFLNEYF 1102

  Fly  1213 -----------DWEFIWSYDFLWKVSLITLVSCLPLYIIKFLRKKCSPPSYLKLS 1256
                       |..||.:..||||||.||:|||||||::|:|::|.|||||.|||
  Rat  1103 GIGRVSFGAFLDVAFITTVTFLWKVSAITVVSCLPLYVLKYLKRKLSPPSYSKLS 1157

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG31729NP_609634.1 PhoLip_ATPase_N 227..279 CDD:292826 32/51 (63%)
ATPase-Plipid 228..1252 CDD:273734 655/1052 (62%)
E1-E2_ATPase 323..525 CDD:278548 124/203 (61%)
Cation_ATPase <704..783 CDD:289987 53/78 (68%)
HAD_like <975..1019 CDD:304363 31/43 (72%)
PhoLip_ATPase_C 1021..1249 CDD:292829 165/238 (69%)
Atp9bXP_017456363.1 None


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166338589
Domainoid 1 1.000 341 1.000 Domainoid score I1053
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG0210
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H21915
Inparanoid 1 1.050 1308 1.000 Inparanoid score I140
OMA 1 1.010 - - QHG53737
OrthoDB 1 1.010 - - D587717at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0002153
OrthoInspector 1 1.000 - - oto97464
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101160
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR24092
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1437
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1615.770

Return to query results.
Submit another query.