DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and ABCC5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_171908.1 Gene:ABCC5 / 839277 AraportID:AT1G04120 Length:1514 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:1521 Identity:538/1521 - (35%)
Similarity:814/1521 - (53%) Gaps:118/1521 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    62 SLDRNIPWNKLNVSKALVNLGLL-VITALDL-IMALVKKGGDSELPLYDLDVWGPII-----KFA 119
            ||:|.:  |.::|.... ||.|| .:..|.: ::.||..|......:.|   |..:.     ..|
plant    64 SLEREV--NHVSVGFGF-NLSLLCCLYVLGVQVLVLVYDGVKVRREVSD---WFVLCFPASQSLA 122

  Fly   120 TFLLLFIFIPLNRKYGVQTTGCQFIFWFLLTVLSIPRCRTEVRLDAERQKILN-SQQPSEQDFSW 183
            .|:|.|:.:.|..|...:......|:|||  ..||  |...:.:|..|..|.. |:..|....:.
plant   123 WFVLSFLVLHLKYKSSEKLPFLVRIWWFL--AFSI--CLCTMYVDGRRLAIEGWSRCSSHVVANL 183

  Fly   184 EEYQFVSFFIFFTFTSIMLILNCFADGMPRQTKYQRGENEI----------------PELSASFL 232
            .....:.|..|..:..:..|            :..|..:::                |..:|..:
plant   184 AVTPALGFLCFLAWRGVSGI------------QVTRSSSDLQEPLLVEEEAACLKVTPYSTAGLV 236

  Fly   233 SRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEVMPIFAHHWNQNVRKNYKNKARVEPKAQF 297
            |.||..|.|.:...|.:.|||.||:..|.|:|.......:...:|     |..|:          
plant   237 SLITLSWLDPLLSAGSKRPLELKDIPLLAPRDRAKSSYKVLKSNW-----KRCKS---------- 286

  Fly   298 SNGNVTFENPHGEKNGRKKGMA-SIMPPIYKSFGGVFLFGALMKLFTDTLTFAQPQVLSLIISFV 361
                   |||     .:...:| :||...:|......:|..|..|    :::..|.::|..:.::
plant   287 -------ENP-----SKPPSLARAIMKSFWKEAACNAVFAGLNTL----VSYVGPYLISYFVDYL 335

  Fly   362 EAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYFHRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISNSTKKE 426
            ..::..|. :|.:.|.:.|.....:|....|::..:.|:|:.:|:||...:|||.|::|:..|:.
plant   336 GGKEIFPH-EGYVLAGIFFTSKLIETVTTRQWYMGVDILGMHVRSALTAMVYRKGLKLSSIAKQN 399

  Fly   427 STVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGV 491
            .|.|||||.||||.||..:.:.||:.||..|:||.|||..|::.:|.:.:|.|...||.|.|...
plant   400 HTSGEIVNYMAVDVQRIGDYSWYLHDIWMLPMQIVLALAILYKSVGIAAVATLVATIISILVTIP 464

  Fly   492 IASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNA 556
            :|...:.||.:.|..||||::..:|.|..::||||.|||..:..::.::|::|...||...|..|
plant   465 LAKVQEDYQDKLMTAKDERMRKTSECLRNMRVLKLQAWEDRYRVRLEEMREEEYGWLRKALYSQA 529

  Fly   557 GTSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSVEKVLVSIALFDLMKLPLTILPMLSVDIAETQVS 621
            ..:|::..:|..|:.|||||.:..  ..||:...||.::|.|.:::.||...|.|...:|:|:||
plant   530 FVTFIFWSSPIFVAAVTFATSIFL--GTQLTAGGVLSALATFRILQEPLRNFPDLVSMMAQTKVS 592

  Fly   622 VNRINKFLNSEEL--DPNSVLHDSSKPHPMSIENGEFSW---GDEITLRNINIEVKKGSLVALVG 681
            ::||:.||..|||  |...|:........:.|::|.|.|   ....||..|.::|:||..||:.|
plant   593 LDRISGFLQEEELQEDATVVIPRGLSNIAIEIKDGVFCWDPFSSRPTLSGIQMKVEKGMRVAVCG 657

  Fly   682 TVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDA 746
            ||||||||.:...|||:.|::|.|...|...||.|.||||:..:.:|||||...::.:|..||.|
plant   658 TVGSGKSSFISCILGEIPKISGEVRICGTTGYVSQSAWIQSGNIEENILFGSPMEKTKYKNVIQA 722

  Fly   747 CALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFE 811
            |:|:.||::.|.||.|.|||:|||||||||||:.||||:|.|||:||||||.||:|||.|..:|.
plant   723 CSLKKDIELFSHGDQTIIGERGINLSGGQKQRVQLARALYQDADIYLLDDPFSALDAHTGSDLFR 787

  Fly   812 EVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEG 876
            :.|  ...||.|:.|.|||.|.|||..|.|.|:|.|.|.:||.:|.|::   |..||  :.|...
plant   788 DYI--LSALAEKTVVFVTHQVEFLPAADLILVLKEGRIIQSGKYDDLLQ---AGTDF--KALVSA 845

  Fly   877 NEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKAIKLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQ 941
            :.|..|...|....|..:|...:..::  .:...:::...:.|...:.:...||..|..:..|.:
plant   846 HHEAIEAMDIPSPSSEDSDENPIRDSL--VLHNPKSDVFENDIETLAKEVQEGGSASDLKAIKEK 908

  Fly   942 DSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYIKSV--GIFLSVATLVLNFVFQAF 1004
            ..     .|...:|||     |::.|:...|.|...||..|:.:.  |..:.:..|. ...||..
plant   909 KK-----KAKRSRKKQ-----LVQEEERVKGKVSMKVYLSYMGAAYKGALIPLIILA-QAAFQFL 962

  Fly  1005 QIGSNLWLTQWANDQNVANDTGL-RDMYLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHNEL 1068
            ||.||.|:. |||.|...:::.: ..:.|.||.|..||..|..:....:|...|..||:.:...:
plant   963 QIASNWWMA-WANPQTEGDESKVDPTLLLIVYTALAFGSSVFIFVRAALVATFGLAAAQKLFLNM 1026

  Fly  1069 LAVIIRGSVCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVI-SLSTPIF 1132
            |..:.|..: .|||.||.||:||..|.|..|||.::|..:..|.:....:...:.|: :::..:|
plant  1027 LRSVFRAPM-SFFDSTPAGRILNRVSIDQSVVDLDIPFRLGGFASTTIQLCGIVAVMTNVTWQVF 1090

  Fly  1133 LAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDA 1197
            | ::||:|...::.|::|:|:||:|:|:.|:.:|||...|.|::.||:|||.:....|||:.:..
plant  1091 L-LVVPVAVACFWMQKYYMASSRELVRIVSIQKSPIIHLFGESIAGAATIRGFGQEKRFIKRNLY 1154

  Fly  1198 KVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFAVL--GGQTNPGLVGLSVSYALQVTQTL 1260
            .:|......:.|:.|..||.:|:|::..|:..|..:..|.  .|..:|.:.||:|:|.|.:...|
plant  1155 LLDCFVRPFFCSIAAIEWLCLRMELLSTLVFAFCMVLLVSFPHGTIDPSMAGLAVTYGLNLNGRL 1219

  Fly  1261 N-WLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLD 1324
            : |::.... :|..|:|:|||.:|.:...|||..:| |...|.:||..|.:|..:.:|||.|.|.
plant  1220 SRWILSFCK-LENKIISIERIYQYSQIVGEAPAIIE-DFRPPSSWPATGTIELVDVKVRYAENLP 1282

  Fly  1325 LVLRGVSFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTI 1389
            .||.|||....||:|:|||||||:|||:|..||||:||...|:|:||.:||:.:|||.|||||.|
plant  1283 TVLHGVSCVFPGGKKIGIVGRTGSGKSTLIQALFRLIEPTAGKITIDNIDISQIGLHDLRSRLGI 1347

  Fly  1390 IPQDPVLFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQL 1454
            |||||.||.|::|.||||.|..:||:||:||:.|.|...|:.....|:..:.|.|:|.|||||||
plant  1348 IPQDPTLFEGTIRANLDPLEEHSDDKIWEALDKSQLGDVVRGKDLKLDSPVLENGDNWSVGQRQL 1412

  Fly  1455 VCLARALLRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDK 1519
            |.|.||||::.|:||||||||:||..||:||||.|||||::|||.|||||:.|::|||.|:||..
plant  1413 VSLGRALLKQAKILVLDEATASVDTATDNLIQKIIRTEFEDCTVCTIAHRIPTVIDSDLVLVLSD 1477

  Fly  1520 GQIIEFASPTELLDNPKSAFYSMAKD 1545
            |::.||.:|..||::..|.|..:..:
plant  1478 GRVAEFDTPARLLEDKSSMFLKLVTE 1503

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 538/1521 (35%)
ABCC5NP_171908.1 MRP_assoc_pro 229..1493 CDD:188098 499/1322 (38%)

Return to query results.
Submit another query.