DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and ABCC14

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_191829.1 Gene:ABCC14 / 825444 AraportID:AT3G62700 Length:1539 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:1515 Identity:514/1515 - (33%)
Similarity:815/1515 - (53%) Gaps:178/1515 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   102 SELPLYDLDVWGPIIKFATFLLLFIFI-----------PLN-RKYGVQTTGCQFIFWFLLTVLSI 154
            ::|.|.|...|  :|...|.:::.:.:           ||. |.|.|    ..|:...|.||..|
plant   124 TKLKLVDTLFW--LIHAVTNVVIAVLVLHLKRFASPSHPLTLRIYWV----FNFVVTTLFTVSGI 182

  Fly   155 PRCRTEVRLDAERQKILNSQQPSEQDFSWEEYQFVSFFIFFTFTSIMLIL-------------NC 206
            ..              |.|..|:......::   |:.||.|..|:::|::             |.
plant   183 LH--------------LLSDDPAAASLRADD---VASFISFPLTAVLLLVSIKGSTGVVVTTSNV 230

  Fly   207 FADGMPRQTKYQRGENEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEVMP 271
            .|.........::.||.....||||:|:..:.|.:.:..|||::||....:..|.|:....::..
plant   231 TAPAKSNDVVVEKSENVSLYASASFISKTFWLWMNPLLRKGYKSPLNLDQVPTLSPEHRAEKLAT 295

  Fly   272 IFAHHWNQNVRKNYKNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPPIYKSFGGVFLFG 336
            :|...|               ||.|.::     .||             :...:.:.|.....|.
plant   296 LFESKW---------------PKPQENS-----RNP-------------VRTTLIRCFWKEIAFT 327

  Fly   337 ALMKLFTDTLTFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYFHRMFIVG 401
            |::.:...::.:..|.::...:.|...:.:.|. :|....::|.:....:.....|:......:|
plant   328 AVLAIIRLSVIYVGPVLIQSFVDFTSGKRSSPS-QGYYLVLILLIAKFVEVLSTHQFNFNSQKLG 391

  Fly   402 LRIRTALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYF 466
            :.||:.||.|:|:|.|:::.|.::...||:|||.||||||:..::...|:.||..|||:..|:..
plant   392 MLIRSTLITALYKKGLKLTGSARQNHGVGQIVNYMAVDAQQLSDMMLQLHAIWLMPLQVAAAIVL 456

  Fly   467 LWQQLGPSV------LAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLK 525
            |:..|||||      |.|:.|.|:|    |  ..|...||...|..:|.|:|..||:|:.::|:|
plant   457 LYNTLGPSVVTTVIGLTGIFVFILL----G--TKRNNRYQFSLMMNRDSRMKATNEMLNYMRVIK 515

  Fly   526 LYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSF-LWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSVE 589
            ..|||..|.:::|..|:.|...|....|..||... ||| .|.|:|.:||.|.|....  :|...
plant   516 FQAWEDHFNERILKFREMEFGWLSKFLYSIAGNIIVLWS-TPVLISALTFTTAVFLGV--KLDAG 577

  Fly   590 KVLVSIALFDLMKLPLTILPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSVLHDSSKPHPMSIE-- 652
            .|..:..:|.:::.|:...|...:.:::..:|:.|::.::.|.||...:|.........:::|  
plant   578 TVFTTTTIFKILQEPIRTFPQSMISLSQAMISLGRLDAYMMSRELSEETVERSQGCDGNVAVEIK 642

  Fly   653 NGEFSW---GDEITLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLAYV 714
            :|.|||   .||..:.|||.|||||.|.|:||||||||||::.:.||||.||:|.|...|..|||
plant   643 DGSFSWDDEDDEPAIENINFEVKKGELAAIVGTVGSGKSSLLASVLGEMHKLSGKVRVCGTTAYV 707

  Fly   715 PQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQRI 779
            .|.:||||.||:||||||...:|.:||:|:..|.|..|:.|:..||.|||||:||||||||||||
plant   708 AQTSWIQNGTVQDNILFGLPMNRSKYNEVLKVCCLEKDMQIMEFGDQTEIGERGINLSGGQKQRI 772

  Fly   780 SLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYVI 844
            .||||||.::|:|||||..||||||.|..||::.:  :|.|..|:.:||||.|.||..||.|.|:
plant   773 QLARAVYQESDVYLLDDVFSAVDAHTGSDIFKKCV--RGALKGKTILLVTHQVDFLHNVDRILVM 835

  Fly   845 KMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEGNEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKAI-- 907
            :.|.|.:||.:|:||.:...|.:.:..|     |...||.:.....::.|:||......:::|  
plant   836 RDGMIVQSGKYDELVSSGLDFGELVAAH-----ETSMELVEAGSASATAANVPMASPITQRSISI 895

  Fly   908 ---------KLARTESLSDS--ISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSHDSVASAASLKKKQEVEG 961
                     |:.||.|:...  :..||.:|        .|.::..|  :|:.|... ....|...
plant   896 ESPRQPKSPKVHRTTSMESPRVLRTTSMES--------PRLSELND--ESIKSFLG-SNIPEDGS 949

  Fly   962 KLIETEKSQTGGVEFAVYKHY-IKSVGIFLSVATLVLNFVFQAFQIGSNLWLTQWANDQNVANDT 1025
            :||:.|:.:.|.|.|.|||.| .::.|.:..:..:..:..:||..:.|:.||   |.:.:..|:.
plant   950 RLIKEEEREVGQVSFQVYKLYSTEAYGWWGMILVVFFSVAWQASLMASDYWL---AYETSAKNEV 1011

  Fly  1026 GL-RDMYLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLG-------GFQAAKTIHNELLAVIIRGSVCRFFD 1082
            .. ..:::.||       .::|..::|:|.|.       |.:.|:....::|..::...: .|||
plant  1012 SFDATVFIRVY-------VIIAAVSIVLVCLRAFYVTHLGLKTAQIFFKQILNSLVHAPM-SFFD 1068

  Fly  1083 ITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAV----------IV 1137
            .||.||:|:..|.|.        ..:|.|:.|:..::||:....||  ||:..          |:
plant  1069 TTPSGRILSRASTDQ--------TNVDIFIPFMIGLVATMYTTLLS--IFIVTCQYAWPTVFFII 1123

  Fly  1138 PIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKN 1202
            |:.:|..:.:.:|:|:||:|.||:|::::|:..||||::.|..||||:.....|.:|:..:|:.|
plant  1124 PLGWLNIWYRGYYLASSRELTRLDSITKAPVIHHFSESIAGVMTIRAFKKQPMFRQENVKRVNAN 1188

  Fly  1203 QVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFAVL--GGQTNPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVR 1265
            ....:.:..:|.||..|||::|:.::..::||.|:  .....|..||||:||.|.:...|.|.:.
plant  1189 LRMDFHNNGSNEWLGFRLELIGSWVLCISALFMVMLPSNIIKPENVGLSLSYGLSLNGVLFWAIY 1253

  Fly  1266 MSSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGV 1330
            :|..||..:|||||||::.:...||.||:::.: .|.|||.:|.:..::.:||||....|||:|:
plant  1254 LSCFIENKMVSVERIKQFTDIPAEAKWEIKESR-PPPNWPYKGNIRLEDVKVRYRPNTPLVLKGL 1317

  Fly  1331 SFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPV 1395
            :.:|:||||:|:|||||:|||:|...|||::|.:||:|.|||:||.::|||.||||..||||:||
plant  1318 TIDIKGGEKIGVVGRTGSGKSTLIQVLFRLVEPSGGKIIIDGIDICTLGLHDLRSRFGIIPQEPV 1382

  Fly  1396 LFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARA 1460
            ||.|::|.|:||.|..:|:||||:||...||..|.|....|:..:|:.|||.|||||||:||.|.
plant  1383 LFEGTVRSNIDPTEKYSDEEIWKSLERCQLKDVVASKPEKLDSLVADNGENWSVGQRQLLCLGRV 1447

  Fly  1461 LLRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEF 1525
            :|:::::|.||||||:||.:||.:|||.||.:|.:||:::||||:.|::|.|:|:|:|.|:..|:
plant  1448 MLKRSRILFLDEATASVDSQTDAMIQKIIREDFSDCTIISIAHRIPTVMDCDRVLVIDAGKAKEY 1512

  Fly  1526 ASPTELLDNPKSAFYSMAKD 1545
            .||..||:. :|.|.::.::
plant  1513 DSPVRLLER-QSLFAALVQE 1531

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 514/1515 (34%)
ABCC14NP_191829.1 MRP_assoc_pro 142..1534 CDD:188098 508/1495 (34%)

Return to query results.
Submit another query.