DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and ABCC9

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_191575.2 Gene:ABCC9 / 825186 AraportID:AT3G60160 Length:1506 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:1495 Identity:524/1495 - (35%)
Similarity:783/1495 - (52%) Gaps:181/1495 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   139 TGCQFIFWFLLTVLSIPRCRTEVRL-DAERQKILNSQQPSEQDFSW------------------- 183
            |.| ||...|.....:.||.:.|.: .||          ..|.|||                   
plant    95 THC-FILLLLFRDSVVSRCDSSVSVFSAE----------VSQSFSWLFVSVVVVKIRERRLVKFP 148

  Fly   184 ---EEYQFVSFFIFFTF------------------------TSIML------------ILNCFAD 209
               ..:...||.:.|:|                        .|:.|            :|....:
plant   149 WMLRSWWLCSFILSFSFDAHFITAKHEPLEFQDYADLTGLLASLFLLAVSIRGKTGFHLLESSGN 213

  Fly   210 GMP-------RQTKYQRGENEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDS-- 265
            ..|       .|.|.....:..|..:|:...|||:.|.:.:...||:.|||:.|:.|:..:||  
plant   214 TEPLLLGDQTEQNKKDSYSSSSPYGNATLFQRITFSWINPLFSLGYKRPLEKDDVPDIDVKDSAR 278

  Fly   266 -CSEVMPIFAHHWNQNVRKNYKNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPPIYKSF 329
             ||       |.::|.::..         |.:...||..|.|             |::..:::..
plant   279 FCS-------HAFDQKLKTT---------KEKEGPGNAFFYN-------------SVLRYVWRKA 314

  Fly   330 GGVFLFGALMKLFTDTLTFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYF 394
            .    ..|:..:...:..:..|.:::..:.|:..:.::....|.|.|:........:|....|:.
plant   315 A----INAVFAVVNASTAYIGPYLINDFVEFLSEKQSQSLNHGYLLALGFLTAKIVETVTQRQWI 375

  Fly   395 HRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQ 459
            .....:|||:|.|||:.||:|.|.:|:.:::..|.|||:|.|:||.||..:...|:|.||..|:|
plant   376 FGARQLGLRLRAALISHIYQKGLVLSSQSRQSHTSGEIINYMSVDVQRITDFIWYVNNIWMLPIQ 440

  Fly   460 IGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVL 524
            |..|:|.|.:.||...||.|...::::..|..:....:.||...|..||:|:|..:|:|..:|:|
plant   441 IFSAIYILQKHLGLGALAALVTTLMVMACNYPLTRLQRNYQSDIMNAKDDRMKATSEILKNMKIL 505

  Fly   525 KLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSF-LWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSV 588
            ||.||:..|..:|..:|.||...|..:..|.|.|:| ||. ||.|:|:|||.|.:|...  :|:.
plant   506 KLQAWDNQFLNKVKTLRKKEYDCLWKSLRLQAFTTFILWG-APSLISVVTFVTCMLMGV--KLTA 567

  Fly   589 EKVLVSIALFDLMKLPLTILPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSVLHDSSKPH---PMS 650
            ..||.::|.|.:::.|:..||.|...:.:::||.:||..:|...|...::|.: .||.|   .:.
plant   568 GAVLSALATFQMLQSPIFGLPDLLSALVQSKVSADRIASYLQQSETQKDAVEY-CSKDHTELSVE 631

  Fly   651 IENGEFSWGDEI---TLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLA 712
            ||||.|||..|.   ||.:|.::||.|..||:.|.|||||||::.:.|||::||.|.|...||.|
plant   632 IENGAFSWEPESSRPTLDDIELKVKSGMKVAVCGAVGSGKSSLLSSILGEIQKLKGTVRVSGKQA 696

  Fly   713 YVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQ 777
            ||||..||.:.|:|||||||..|:.::|.:.:.||||..|.::.|.||||||||:|||:||||||
plant   697 YVPQSPWILSGTIRDNILFGSMYESEKYERTVKACALIKDFELFSNGDLTEIGERGINMSGGQKQ 761

  Fly   778 RISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIY 842
            ||.:|||||.:||:||||||.||||||.|:.:||:.:  .|||..|:.:.|||.|.|||..|.|.
plant   762 RIQIARAVYQNADIYLLDDPFSAVDAHTGRELFEDCL--MGILKDKTVLYVTHQVEFLPAADLIL 824

  Fly   843 VIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEGNEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKAI 907
            |::.|.:.::|.|::|:|....|...:..|       .|.|:.|.              ::||:.
plant   825 VMQNGRVMQAGKFEELLKQNIGFEVLVGAH-------NEALDSIL--------------SIEKSS 868

  Fly   908 KLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTG 972
            :..:..|..|:.|:  |:||             |...||..:.::..||:  |.||::.|:::.|
plant   869 RNFKEGSKDDTASI--AESL-------------QTHCDSEHNISTENKKK--EAKLVQDEETEKG 916

  Fly   973 GVEFAVYKHYIKSVGIFLSVATLVL-NFVFQAFQIGSNLWLTQWANDQNVAN--DTGLRDMYLGV 1034
            .:...||..|:.:|...|.|..::| ...||..||.||.|:. |.......:  ..|:..:.| |
plant   917 VIGKEVYLAYLTTVKGGLLVPFIILAQSCFQMLQIASNYWMA-WTAPPTAESIPKLGMGRILL-V 979

  Fly  1035 YGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHNELLAVIIRGSVCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDV 1099
            |.....|..:......::|.:||...|:|..:.:|..|.|..: .|||.||.||:||..|.|..|
plant   980 YALLAAGSSLCVLARTILVAIGGLSTAETFFSRMLCSIFRAPM-SFFDSTPTGRILNRASTDQSV 1043

  Fly  1100 VDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVS 1164
            :|.|:...:......|..::.||.|:|........:.:|:|....|.||:|..|:|:|.|:..|.
plant  1044 LDLEMAVKLGWCAFSIIQIVGTIFVMSQVAWQVCVIFIPVAVACVFYQRYYTPTARELSRMSGVE 1108

  Fly  1165 RSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIIL 1229
            |:||..||:|::.||:||||::..||||..:...:|.:....:....|..||:.||.::.:.:..
plant  1109 RAPILHHFAESLAGATTIRAFDQRDRFISSNLVLIDSHSRPWFHVASAMEWLSFRLNLLSHFVFA 1173

  Fly  1230 FASLFAVL--GGQTNPGLVGLSVSYALQVT---QTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGETKQE 1289
            |:.:..|.  .|..||.:.||.|:|.|.:.   .|:.|.:   .:.|..::|||||.:|.:...|
plant  1174 FSLVLLVTLPEGVINPSIAGLGVTYGLSLNVLQATVIWNI---CNAENKMISVERILQYSKIPSE 1235

  Fly  1290 APWELEQDKNKP-KNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSL 1353
            ||  |..|.::| .|||..|.:.|::.||||.|....||:.::....||:|:|:|||||:|||:|
plant  1236 AP--LVIDGHRPLDNWPNVGSIVFRDLQVRYAEHFPAVLKNITCEFPGGKKIGVVGRTGSGKSTL 1298

  Fly  1354 TLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWK 1418
            ..|||||:|.:.|.|.||.|||..:|||.|||||.||||||.||.|::|:||||....||.|||:
plant  1299 IQALFRIVEPSQGTIVIDNVDITKIGLHDLRSRLGIIPQDPALFDGTIRLNLDPLAQYTDHEIWE 1363

  Fly  1419 ALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKVLVLDEATAAVDLETDD 1483
            |::...|...:::....|:..:.|.|||.||||||||||.|.||:|:.:||||||||:||..||.
plant  1364 AIDKCQLGDVIRAKDERLDATVVENGENWSVGQRQLVCLGRVLLKKSNILVLDEATASVDSATDG 1428

  Fly  1484 LIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTELLDNPKSAFYSMAKDANL 1548
            :|||.|..|||:.||:|||||::|:::||.|:||..|:|.||.||.:||....|.|..:.|:.:|
plant  1429 VIQKIINQEFKDRTVVTIAHRIHTVIESDLVLVLSDGRIAEFDSPAKLLQREDSFFSKLIKEYSL 1493

  Fly  1549  1548
            plant  1494  1493

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 523/1493 (35%)
ABCC9NP_191575.2 MRP_assoc_pro 236..1485 CDD:188098 497/1333 (37%)

Return to query results.
Submit another query.