DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and ABCC10

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_191473.2 Gene:ABCC10 / 825083 AraportID:AT3G59140 Length:1453 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:1405 Identity:477/1405 - (33%)
Similarity:742/1405 - (52%) Gaps:181/1405 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   199 SIMLILNCF---------------------ADGMPRQTKYQRGENEIPELS-ASFLSRITYQWFD 241
            |::|:|:.:                     ::|...:..:   :|.:.:.: |...|.:::.|.:
plant   161 SVLLLLSAYKGYRFDESGESSLYEPLNAGDSNGFSEKADF---DNRVSQFAKAGLFSTLSFWWLN 222

  Fly   242 KMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEVMPIFAHHWNQNVRKNYKNKARVEPKAQFSNGNVTFEN 306
            .:..:|....|||:|:.:||.::.......:|    .:|:         :|.|            
plant   223 SLIKRGNVKDLEEEDIPELRKEERAETCYSLF----EENL---------IEQK------------ 262

  Fly   307 PHGEKNGRKKGMASIMPPIYK----------SFGGVFLFGALMKLFTDTLTFAQPQVLSLIISFV 361
                   |:.| :|..|.|.|          ...|.|.|   ||:   ....|.|.:|:..|...
plant   263 -------RRLG-SSCQPSILKVTVLCVWRELLTSGFFAF---MKI---VAVSAGPLLLNAFILVA 313

  Fly   362 EAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYFHRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISNSTKKE 426
            |. :|...::|::.|||||.....::....|::.|..|||||:|:.|..||.:|.||::||::..
plant   314 EG-NASFRYEGLVLAVLLFFSKMIESLSQRQWYFRCRIVGLRVRSLLTAAINKKQLRLNNSSRLI 377

  Fly   427 STVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGV 491
            .:..||:|...|||.|..|...:.:.:|:...|:.:||..|:..:|.:..:.|||:|:.:..|..
plant   378 HSGSEIMNYATVDAYRIGEFPYWFHQLWTTSFQLLIALGILFHSVGVATFSALAVIILTVLCNAP 442

  Fly   492 IASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNA 556
            ||.....:|...|..:|||:|..||.|..:|||||||||..|:|.:..:|:.|:.:|::.....|
plant   443 IAKLQNKFQSELMTSQDERLKACNESLVNMKVLKLYAWESHFKKVIEKLRNIELKSLKAVQMRKA 507

  Fly   557 GTSFLWSCAPFLVSLVTFAT-YVLTSEANQLSVEKVLVSIALFDLMKLPLTILP-MLSVDIAETQ 619
            ..:.|:..:|..||..|||| |.|..   .|....|...:|...|::.|:.::| ::.|.| :.:
plant   508 YNAVLFWSSPVFVSAATFATCYFLDI---PLRASNVFTFVATLRLVQDPVRMIPDVIGVTI-QAK 568

  Fly   620 VSVNRINKFLNSEEL---DPNSVLHDSSKPHPMSIENGEFSWGD----EITLRNINIEVKKGSLV 677
            |:.:||..||.:.||   :...........:.:.|::..|||.:    :..|||:::|||.|..|
plant   569 VAFSRIATFLEAPELQGGERRRKQRSEGNQNAIIIKSASFSWEEKGSTKPNLRNVSLEVKFGEKV 633

  Fly   678 ALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNK 742
            |:.|.||||||:::.|.|||...::|.::..|.:|||.|.||||..|:|||||||...|..||.:
plant   634 AVCGEVGSGKSTLLAAILGETPCVSGTIDFYGTIAYVSQTAWIQTGTIRDNILFGGVMDEHRYRE 698

  Fly   743 VIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGK 807
            .|...:|..|:::|..||.|||||:|:||||||||||.||||:|.|||:||||||.||||||...
plant   699 TIQKSSLDKDLELLPDGDQTEIGERGVNLSGGQKQRIQLARALYQDADIYLLDDPFSAVDAHTAS 763

  Fly   808 HIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQH 872
            .:|:|.:  ...||.|:.:||||.|.|||..||:.::..|||:|:.|:.:|:.....|.|.:..|
plant   764 SLFQEYV--MDALAGKAVLLVTHQVDFLPAFDSVLLMSDGEITEADTYQELLARSRDFQDLVNAH 826

  Fly   873 LQEGNEEE--------EELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKAIKLARTESLSDSISVTSADSLMG 929
            .:....|.        :.:.:|.|.|||.:          |.:|.:|.                 
plant   827 RETAGSERVVAVENPTKPVKEINRVISSQS----------KVLKPSRL----------------- 864

  Fly   930 GGGSLRRRTKRQDSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYIKSVGIFLSVAT 994
                                     .|||      |.||..||...:..|.:..|.. ||..:|:
plant   865 -------------------------IKQE------EREKGDTGLRPYIQYMNQNKGY-IFFFIAS 897

  Fly   995 LVLNFVFQAFQIGSNLWLTQWANDQNVANDTGLRDMYLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQ 1059
            |. ...|...||..|.|:.     .||.|........:.||...|....:......|.|.:...:
plant   898 LA-QVTFAVGQILQNSWMA-----ANVDNPQVSTLKLILVYLLIGLCSVLCLMVRSVCVVIMCMK 956

  Fly  1060 AAKTIHNELLAVIIRGSVCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATI-- 1122
            ::.::.::||..:.|..: .|:|.||:||:|:..|.|:.:||.::|      ...||:|.:::  
plant   957 SSASLFSQLLNSLFRAPM-SFYDSTPLGRILSRVSSDLSIVDLDVP------FGLIFVVASSVNT 1014

  Fly  1123 ----VVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIR 1183
                .|:::.|...|.|.||:.:|.:..|::|..|:::|||:...:||.:.:|.:|:|.||.|||
plant  1015 GCSLGVLAIVTWQVLFVSVPMVYLAFRLQKYYFQTAKELMRINGTTRSYVANHLAESVAGAITIR 1079

  Fly  1184 AYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFAVL---GGQTNPGL 1245
            |::..:||.::|...:|.|....:.|..||.||..|||.| :.|:|.::.|.::   .|..:.|.
plant  1080 AFDEEERFFKKSLTLIDTNASPFFHSFAANEWLIQRLETV-SAIVLASTAFCMILLPTGTFSSGF 1143

  Fly  1246 VGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQEGRV 1310
            :|:::||.|.:...|.:.|:....:...|:||||:.:|.....||| |:.::...|.|||..|||
plant  1144 IGMALSYGLSLNMGLVYSVQNQCYLANWIISVERLNQYTHLTPEAP-EVIEETRPPVNWPVTGRV 1207

  Fly  1311 EFQNFQVRYREGLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDI 1375
            |..:.|:|||....|||:|:|...:||.|:|||||||:||::|..||||::|..||:|.:|||||
plant  1208 EISDLQIRYRRESPLVLKGISCTFEGGHKIGIVGRTGSGKTTLISALFRLVEPVGGKIVVDGVDI 1272

  Fly  1376 ASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEI 1440
            :.:|:|.||||..||||||.||:|::|.||||....:|.|||:.|....||..|:....||:..:
plant  1273 SKIGVHDLRSRFGIIPQDPTLFNGTVRFNLDPLCQHSDAEIWEVLGKCQLKEVVQEKENGLDSLV 1337

  Fly  1441 AEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRL 1505
            .|.|.|.|:|||||.||.||:||:::|||||||||::|..||.::|||||.||.:|||:|:|||:
plant  1338 VEDGSNWSMGQRQLFCLGRAVLRRSRVLVLDEATASIDNATDLILQKTIRREFADCTVITVAHRI 1402

  Fly  1506 NTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTELLDNPKSAFYSMAKD 1545
            .|::|...|:.:..|:|:|:..|.:|:.:..|.|..:.|:
plant  1403 PTVMDCTMVLSISDGRIVEYDEPMKLMKDENSLFGKLVKE 1442

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 477/1405 (34%)
ABCC10NP_191473.2 MRP_assoc_pro 194..1437 CDD:188098 471/1365 (35%)

Return to query results.
Submit another query.