DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and ABCC3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_187915.1 Gene:ABCC3 / 820496 AraportID:AT3G13080 Length:1514 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:1460 Identity:500/1460 - (34%)
Similarity:782/1460 - (53%) Gaps:140/1460 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   144 IFWFLLTVLSIPRCRTEVRLDAERQK------------ILNSQQPSEQDFSWEE----------- 185
            :.|.:|:: .:.|||     |.|.:|            ::.|......||...|           
plant   127 VSWGVLSI-CLHRCR-----DCEHKKAPFLLRLWLVFYLVVSCYSLVVDFVMYERRETVPVHLLV 185

  Fly   186 YQFVSFF--IFFTFTSIMLILNCFADGMPRQTKYQRGENEI------------------PELSAS 230
            :..|:|.  :|..:.:::......::|:..:.....|::.:                  |...|.
plant   186 FDIVAFIAAVFLGYVAVLKKDRSNSNGVLEEPLLNGGDSRVGGDDSVELNKTNGSGEATPYSRAG 250

  Fly   231 FLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEVMPIFAHHWNQNVRKNYKNKARVEPKA 295
            .||.:|:.|...:...|.:..|:.:|:..|...||...:.|.|                      
plant   251 ILSLLTFSWMSPLIDIGNKKTLDLEDVPQLHDTDSVVGLAPKF---------------------- 293

  Fly   296 QFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMAS--IMPPIYKSFGGVFLFGALMKLFTDTLTFAQPQVLSLII 358
                 ....|:|.|   |.:.|:.:  ::..:|.:.....|..|.........::..|   :||.
plant   294 -----RSMLESPDG---GERSGVTTFKLIKALYFTAQWEILVTAFFAFIYTVASYVGP---ALID 347

  Fly   359 SFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQ--YFHRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISN 421
            :||:..:...::....|.:::...||.....|.|  :|.|:..||:|:|:||:..||.|.|.:|.
plant   348 TFVQYLNGRRQYNHEGYVLVITFFAAKIVECLSQRHWFFRLQKVGIRMRSALVAMIYEKGLTLSC 412

  Fly   422 STKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILI 486
            .:|:..|.|||:|.|.|||:|....:.|::..|...||:||||:.|::.||.:.:|.|...||::
plant   413 QSKQGRTSGEIINFMTVDAERIGNFSWYMHDPWMVLLQVGLALWILYRNLGLASIAALVATIIVM 477

  Fly   487 PVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRST 551
            .:|.......:.:|.:.|:.||.|:|..:|:|..:::|||..||..|..::.|:|..|...|:..
plant   478 LINFPFGRMQERFQEKLMEAKDSRMKSTSEILRNMRILKLQGWEMKFLSKIFDLRKSEEGWLKKY 542

  Fly   552 AYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSVEKVLVSIALFDLMKLPLTILPMLSVDIA 616
            .|.:|..||::..||.|||:.||...:|.  ...|...|:|.::|.|.:::.|:..||.....|.
plant   543 VYNSAVISFVFWGAPTLVSVSTFGACILL--GIPLESGKILSALATFRILQEPIYNLPDTISMIV 605

  Fly   617 ETQVSVNRINKFLNSEELDPNSV--LHDSSKPHPMSIENGEFSW---GDEITLRNINIEVKKGSL 676
            :|:||::|:..:|..:.|.|:.|  |...|....:.:.|...||   ....||::||.:|..|..
plant   606 QTKVSLDRLASYLCLDNLQPDIVERLPKGSSDVAVEVINSTLSWDVSSSNPTLKDINFKVFPGMK 670

  Fly   677 VALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYN 741
            ||:.|||||||||::.:.|||:.|::|.:...|..|||.|..|||:..:.||||||:..:|:||:
plant   671 VAVCGTVGSGKSSLLSSLLGEVPKVSGSLKVCGTKAYVAQSPWIQSGKIEDNILFGKPMERERYD 735

  Fly   742 KVIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVG 806
            ||::||:|..|::|||.||.|.|||:||||||||||||.:|||:|.|||:||.|||.||||||.|
plant   736 KVLEACSLSKDLEILSFGDQTVIGERGINLSGGQKQRIQIARALYQDADIYLFDDPFSAVDAHTG 800

  Fly   807 KHIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQ 871
            .|:|:||:  .|:|..||.:.|||.|.|||..|.|.|:|.|.||::|.::.::.:...|.:.|..
plant   801 SHLFKEVL--LGLLCSKSVIYVTHQVEFLPAADLILVMKDGRISQAGKYNDILNSGTDFMELIGA 863

  Fly   872 HLQEGNEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKAIKLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRR 936
            |       :|.|..:....:::......||.....:|        |:|:|..         .|..
plant   864 H-------QEALAVVDSVDANSVSEKSALGQENVIVK--------DAIAVDE---------KLES 904

  Fly   937 RTKRQDSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYIK-SVGIFLSVATLVLNFV 1000
            :..:.|..:||          |.:.::|:.|:.:.|.|...||..||. :.|..|....|:...:
plant   905 QDLKNDKLESV----------EPQRQIIQEEEREKGSVALDVYWKYITLAYGGALVPFILLGQVL 959

  Fly  1001 FQAFQIGSNLWLTQWAN--DQNVANDTGLRDMYLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKT 1063
            ||..|||||.|:. ||.  .::|.....|..:.: ||.|..||..:.......::...|::.|..
plant   960 FQLLQIGSNYWMA-WATPVSEDVQAPVKLSTLMI-VYVALAFGSSLCILLRATLLVTAGYKTATE 1022

  Fly  1064 IHNELLAVIIRGSVCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLS 1128
            :.:::...|.| |...|||.||.||:::..|.|...||.|||....|....:..::..|.|:|..
plant  1023 LFHKMHHCIFR-SPMSFFDSTPSGRIMSRASTDQSAVDLELPYQFGSVAITVIQLIGIIGVMSQV 1086

  Fly  1129 TPIFLAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIE 1193
            :.:...|.:|:.....:.||:|:|.:|:|.||..|.::|:..|||||::||:|||:::...||..
plant  1087 SWLVFLVFIPVVAASIWYQRYYIAAARELSRLVGVCKAPLIQHFSETISGATTIRSFSQEFRFRS 1151

  Fly  1194 ESDAKVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLF--AVLGGQTNPGLVGLSVSYALQV 1256
            ::....|.....|:.:..|..||..||:|:.:|..:|:.:|  ::..|..:|.|.||:|:|.|.:
plant  1152 DNMRLSDGYSRPKFYTAGAMEWLCFRLDMLSSLTFVFSLVFLVSIPTGVIDPSLAGLAVTYGLSL 1216

  Fly  1257 TQTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDKNKP-KNWPQEGRVEFQNFQVRYR 1320
            .....||:....::|..|:|||||.:|.....|.|..:|  .|:| ::||..|.||.::.||||.
plant  1217 NTLQAWLIWTLCNLENKIISVERILQYASVPSEPPLVIE--SNRPEQSWPSRGEVEIRDLQVRYA 1279

  Fly  1321 EGLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRS 1385
            ..:.|||||::...:||.:.|||||||:|||:|...||||:|.:.|.|.||||:|.::|||.||.
plant  1280 PHMPLVLRGITCTFKGGLRTGIVGRTGSGKSTLIQTLFRIVEPSAGEIRIDGVNILTIGLHDLRL 1344

  Fly  1386 RLTIIPQDPVLFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVG 1450
            ||:||||||.:|.|::|.||||.|..|||:||:||:...|...|:.....|:..::|.|:|.|:|
plant  1345 RLSIIPQDPTMFEGTMRSNLDPLEEYTDDQIWEALDKCQLGDEVRKKEQKLDSSVSENGDNWSMG 1409

  Fly  1451 QRQLVCLARALLRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVI 1515
            |||||||.|.||:::|:||||||||:||..||:|||||:|..|.:|||:|||||:::::|||.|:
plant  1410 QRQLVCLGRVLLKRSKILVLDEATASVDTATDNLIQKTLREHFSDCTVITIAHRISSVIDSDMVL 1474

  Fly  1516 VLDKGQIIEFASPTELLDNPKSAFYSMAKD 1545
            :|..|.|.|:.:|..||::..|:|..:..:
plant  1475 LLSNGIIEEYDTPVRLLEDKSSSFSKLVAE 1504

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 500/1460 (34%)
ABCC3NP_187915.1 MRP_assoc_pro 115..1499 CDD:188098 499/1453 (34%)

Return to query results.
Submit another query.