DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and CG11898

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_651679.2 Gene:CG11898 / 43451 FlyBaseID:FBgn0039645 Length:1320 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1383 Identity:461/1383 - (33%)
Similarity:725/1383 - (52%) Gaps:188/1383 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   218 QRGENEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEVMPIFAHHWNQNVR 282
            ||..|  |...|:|.|:..:.|..::.:||.:..|:..||::..|....::|......||.|.::
  Fly     7 QRQPN--PVTKANFFSKWFFIWTREILVKGLQRNLDPSDLYETEPSLESTQVSSFLLGHWEQELK 69

  Fly   283 KNYKNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPPIYKSFGGVFLFGALM-KLFTDTL 346
            ::..|..|:                                 |:|::|..|:..::: .:....:
  Fly    70 RSKPNVLRM---------------------------------IFKAYGWSFVPASIVYSIMAIAV 101

  Fly   347 TFAQPQVLSLIISFV-EAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYFH----RMFIVGLRIRT 406
            ...||.:|..::||. |:.....:....|||:.:.:.    :.|.|.:||    .:|.||.|:|.
  Fly   102 HTTQPLMLGGLVSFFSESTGKITKHSAYLYAMGVVLC----SLISGLFFHPFMKYLFRVGSRVRL 162

  Fly   407 ALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQL 471
            |....:|||.||:|.:.......|..::|||.|...|.|.....:.:|..||:..:.:|.::|.:
  Fly   163 ACAGLVYRKFLRVSVAADNSGVSGYAISLMATDLPTFNESFYCFHELWRGPLEGVVFVYIIYQLI 227

  Fly   472 GPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQ 536
            |...:.||..::..||:....|..|..|:.......|||||||||:::.::::|:||||.||.|.
  Fly   228 GWPAVVGLGTIVAFIPLQAWAARAIARYKRSSADVGDERVKLMNEIIAAMQLIKMYAWEKSFAKL 292

  Fly   537 VLDIRDKEIATLRSTAYLNAG---TSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSVEKVLVSIALF 598
            :..:|.:|:.::|.:.|:.||   |..:...:.|| |||   |||.|.:.  ::.:||.:..:.:
  Fly   293 IGKVRKEEMDSIRGSTYIYAGLQCTGMISKLSLFL-SLV---TYVFTGDI--VTSQKVFIVASYY 351

  Fly   599 DLMKLPLTILPMLSVDI-AETQVSVNRINKFLNSEELDPNSVLHD--SSKPHPMSIENGEF---- 656
            |.:...|.....|:::: .||.|..||:..||...|...:..:|:  .::.:|   |:|.|    
  Fly   352 DHLNDSLLHSWPLAINMWVETFVVANRVKDFLFQHENPADGGVHNFKEAEDNP---EHGNFFGRT 413

  Fly   657 -----------------SWGDEIT------LRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLGEM 698
                             ||..:..      :.:::.:.:....|.:|||||:|||:::|..|||:
  Fly   414 HKPKAEVKSITVHKLSASWDQKKQEKRHRHIEDVSFQAQDQQFVGIVGTVGAGKSTLLQVILGEL 478

  Fly   699 EKLAGVVNTVGKLAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDLTE 763
            :.::|.|...|.|:|.||:.|:...::||||||.:.||.:||.:|:..|.|..|::.|..||.|.
  Fly   479 DIISGSVEVNGVLSYAPQEPWLLRGSLRDNILFTEPYDEQRYLEVLRVCHLDRDVEQLPLGDSTR 543

  Fly   764 IGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRVLV 828
            :||.|.:||||||.|:|||||||..||:|||||||||||:||.|.:.:..:..  .|::|.|:||
  Fly   544 VGEGGASLSGGQKARVSLARAVYRKADIYLLDDPLSAVDSHVSKMLLDRCLNE--FLSKKIRILV 606

  Fly   829 THGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEGNEEEEELNQIKRQISST 893
            ||.|..|..||.:.:::.|.||..|.:|.|.|                      |.:.:..:::.
  Fly   607 THRVQLLRHVDHLVLLEGGRISVQGHYDALKK----------------------LIRFRMSVAND 649

  Fly   894 ADVPELLGTVEKAIKLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSHDSVASAASLKKKQE 958
            .:|.:|        :..||:|:.:...              .|::..|:.|         ..:.|
  Fly   650 VEVAKL--------RAMRTDSVYEEPE--------------PRKSLSQEEH---------MDRHE 683

  Fly   959 VEGKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYIKSVGIFLSVATLVLNFVF-QAFQIGSNLWLTQWAN-DQNV 1021
            :|.:.  .|:.|.|.|:...||.|.|.:|..|.|..::|.||. ::.:...:::|::||. ::..
  Fly   684 IEQQF--KEQQQIGSVKLQTYKEYFKVLGHPLVVVLILLMFVVARSSEATMDIFLSKWATWEETE 746

  Fly  1022 AND---------TGLRDMYL-----------GVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHN 1066
            .|.         |.||.|.|           .|...|||             ::...:.:..||:
  Fly   747 PNQHEPIPEYHRTRLRMMILYTFLILCTLIFYVLRTFGF-------------FMMTLRISLRIHD 798

  Fly  1067 ELLAVIIRGSVCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPI 1131
            :|...:|| :...||.:...||:||.||.|:..:|..||..|...:.|....||.:.|:|.:...
  Fly   799 QLFQGVIR-AFMHFFTLATSGRILNRFSSDVLAIDVNLPQAMMDSIEFAVNALAVLAVVSTANIW 862

  Fly  1132 FLAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIE-ES 1195
            .|.....:..|.|..:..|:..||.|.|:|::||||||||.:.|..|.:||||.| |.:::| :.
  Fly   863 LLIPATVVVALLYGCRCLYIGASRSLKRIETISRSPIYSHTNATFKGLATIRALN-GTKYMERDF 926

  Fly  1196 DAKVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFAVLGGQTNPGL----VGLSVSYALQV 1256
            ....::|....|..|..||..|...:::..|.|| |..|:.|....:.|.    |||:::.::::
  Fly   927 HYYQNENTSALYLHVSINRAFAFWTDLICVLYIL-AVTFSFLLFDKHRGYYSGDVGLAITQSMKL 990

  Fly  1257 TQTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQEGRVEFQNFQVRYRE 1321
            .......:|.:.::|..:.||||:.||.....|..:|.|:..|.||:||..|:::|::.::||..
  Fly   991 VLMCQAGMRQTVELENMMTSVERVMEYVNIPSEPAYETEESVNLPKHWPSGGQLDFRDLRLRYSN 1055

  Fly  1322 GLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSR 1386
            ....:|:|::|.|:|.||:||||.|.|||||:..||||:.. ..|.|||||.:.:.:|||.||.|
  Fly  1056 HGPYILKGLTFTIRGEEKIGIVGHTAAGKSSIVHALFRLAH-INGHISIDGFETSQLGLHDLRRR 1119

  Fly  1387 LTIIPQDPVLFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQ 1451
            ::||||||||||||||.||||||.|||:|:|.|||...||.||.:|..|:|..:.:.|.|.|:||
  Fly  1120 ISIIPQDPVLFSGSLRFNLDPFEEKTDEELWLALEAVKLKEFVSNLKDGINCRLHDCGANFSMGQ 1184

  Fly  1452 RQLVCLARALLRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIV 1516
            ||||||||||||:.|:|::|||||.||.|||:|||:.|.|:|..||||||||||:|::|:|:|:|
  Fly  1185 RQLVCLARALLRQNKILIMDEATANVDPETDNLIQEAIHTKFAHCTVLTIAHRLHTVMDNDRVMV 1249

  Fly  1517 LDKGQIIEFASPTELLDN 1534
            :|.|:::|...|.|||.|
  Fly  1250 VDMGRVVELGHPHELLHN 1267

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 461/1383 (33%)
CG11898NP_651679.2 MRP_assoc_pro 2..1268 CDD:188098 461/1383 (33%)

Return to query results.
Submit another query.