DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and Mrp5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001262747.1 Gene:Mrp5 / 42362 FlyBaseID:FBgn0038740 Length:1408 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1410 Identity:486/1410 - (34%)
Similarity:748/1410 - (53%) Gaps:176/1410 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   208 ADGMPRQTKYQRGENEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEVMPI 272
            ||.:|          |.|...::..|.:.:.:......||.:..|:|.||:....:.....:...
  Fly     6 ADELP----------ENPREKSNIFSSLMFCFAMPTFFKGRKKTLDENDLYRALQEHRSDHLGSK 60

  Fly   273 FAHHWNQNVRKNYKNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPPIYKSFGGVF---L 334
            .:..|.:.|.|..|.|.                                .|.:.|:...||   |
  Fly    61 LSAAWEKEVEKKRKKKK--------------------------------TPSLLKASMNVFGWRL 93

  Fly   335 FGALMKLFTDTLTF--AQPQVL-SLIISFVEA--QDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYF 394
            .|..:.||...:.|  .||..| .|:..:.:|  |:.:.:.|..|||:.:.:.:|.....:..|.
  Fly    94 AGLGLVLFILEIGFRVTQPLFLGGLVAYYADASNQEGDNQTKAYLYALGVILTSACNVLFMHPYM 158

  Fly   395 HRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQ 459
            ..||.:|::.|.|:.:.|||||||:|.:...::|:|::|||::.|..|......::|.:|..|::
  Fly   159 LGMFHIGMKARIAMTSMIYRKALRLSRTALGDTTIGQVVNLISNDVGRLDVSVIHMNYLWLGPVE 223

  Fly   460 IGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVL 524
            ||:..|.:::::|.|...|:|||::.||:...:..:....:::.....||||::|||::|||:|:
  Fly   224 IGIITYLMYREIGISAFFGVAVMLLFIPLQAYLGKKTSVLRLKTALRTDERVRMMNEIISGIQVI 288

  Fly   525 KLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTFAT---YVLTSEANQL 586
            |:||||..|.|.:..:|.||:..:|:..|:. ||  |.|...|:..:..|.:   :||..:.  |
  Fly   289 KMYAWEIPFSKMINYVRTKEMNAIRNVNYIR-GT--LQSFIMFVTRISVFVSLVGFVLLGKL--L 348

  Fly   587 SVEKVLVSIALFDLMKLPLTI-LPMLSVDIAETQVSVNRINKFL---------NSEELD------ 635
            :.||..|..|.:::::..:|: .||.....||..||:.||..|:         .||:||      
  Fly   349 TAEKAFVITAYYNILRNTMTVYFPMGISQFAELLVSIRRIQTFMLHEETKVRDKSEDLDEQKLGK 413

  Fly   636 -----------PNSVLHDSSK-----PHPMSIENGEFSW---GDEITLRNINIEVKKGSLVALVG 681
                       ...||..||:     .|.:.|...:..|   ..:.||.||:::.|...|||::|
  Fly   414 AGLIAEPTVAQTTGVLKPSSRRTSEAEHSIVISKLKAKWDQKNTDNTLDNISLKFKPRQLVAVIG 478

  Fly   682 TVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDA 746
            .|||||||::||.|||:...:|.|...|.|:|..|:.|:...|||.|||||...|:.||..|:..
  Fly   479 PVGSGKSSLIQAVLGELNPDSGSVKVNGTLSYASQEPWLFTGTVRQNILFGLPMDKHRYRTVVKR 543

  Fly   747 CALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFE 811
            |||..|.::|...|.|.:||:|.:||||||.|||||||||..||:|||||||||||.|||:|:|:
  Fly   544 CALERDFELLPYADKTIVGERGASLSGGQKARISLARAVYRKADIYLLDDPLSAVDTHVGRHLFD 608

  Fly   812 EVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEG 876
            :.:  :|.|..:..:||||.:.||.|.|.|.::..|:||..||::.:.|:...||    |.|.:.
  Fly   609 QCM--RGFLREEIVLLVTHQLQFLEQADVIVIMDKGKISAMGTYESMAKSGLDFA----QMLTDP 667

  Fly   877 NEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKAIKLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQ 941
            ::::|          ...|.|:             .:|||                  |:.:|.:
  Fly   668 SKKDE----------GAGDAPD-------------KKSLS------------------RQNSKLR 691

  Fly   942 DSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYI--KSVGIFLSVATLVLNFVFQAF 1004
            |.|.|::|..|..:....|..:...|....|.:...:||.|.  ...|:|:..|...:.  .|..
  Fly   692 DRHGSISSMESAAESLAAESPMQTQEGRVEGRIGMKLYKKYFGANGYGLFIVFAFFCIG--AQVL 754

  Fly  1005 QIGSNLWLTQWANDQNVANDTGLRDMYLG-------------------VYGAFGFGQGVLAYFAV 1050
            ..|.:::|:.|.|....|.    ||.::.                   :|...|....|:.:..|
  Fly   755 ASGGDIFLSYWVNKNGEAE----RDTFMARLRRAFPETRINADTDPVDIYYFTGINVSVIIFSLV 815

  Fly  1051 ---VIVYLGGFQAAKTIHNELLAVIIRGSVCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFM 1112
               :..|| ..:::.|:||.:...:.|.:: .||:..|.||:||.||.|:..|||.||:.|...|
  Fly   816 RSMLFFYL-AMRSSTTLHNTMFQGVTRAAM-HFFNTNPSGRILNRFSKDLGQVDEILPSVMMDVM 878

  Fly  1113 TFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVT 1177
            .....::..:||:.:....::...|.:..::|..:.||::|||.:.|||:|:|||||||.|.::.
  Fly   879 QIFLAIVGIVVVLCIINVWYILATVFLVIVFYLLRVFYLSTSRDVKRLEAVTRSPIYSHLSASLN 943

  Fly  1178 GASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFAVLGGQTN 1242
            |.:||||:......|.|.|...|.:....|..:..:|.....|:.|..:.|...:|...|....|
  Fly   944 GLATIRAFGAQKELIAEFDNYQDMHSSGYYMFLATSRAFGYWLDCVCVVYIAVITLSFFLFSPEN 1008

  Fly  1243 PGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQE 1307
            .|.|||:::.|:.:|..:.|.:|.|:::|..:.:|||:.||.:.:.|..:|.:.:|..||:||::
  Fly  1009 GGDVGLAITQAMGMTGMVQWGMRQSAELENTMTAVERVVEYEDLEPEGDFESKPNKKPPKDWPED 1073

  Fly  1308 GRVEFQNFQVRY--REGLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISI 1370
            |::.|.:..::|  .:..|.|||.::..|:|.||||||||||||||||..|||| :....|.|.|
  Fly  1074 GKIVFDDLSLKYFPDKAADYVLRSLNIAIEGCEKVGIVGRTGAGKSSLINALFR-LSYNEGAILI 1137

  Fly  1371 DGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAG 1435
            |..|...:|||.|||:::||||:||||||::|.|||||:..:|.::|::||...||..|..|.:|
  Fly  1138 DRRDTNDLGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFDEYSDAKLWESLEEVKLKQVVADLPSG 1202

  Fly  1436 LNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLT 1500
            |..:|:|||.|.|||||||||||||:||:.::||:|||||.||.:||.|||.|||.:||:|||||
  Fly  1203 LQSKISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDALIQTTIRNKFKDCTVLT 1267

  Fly  1501 IAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTELL-DNPKSAFYSMAK 1544
            |||||:|::|||||:|:|.|:.:||.||.||| .:.|..|:||.|
  Fly  1268 IAHRLHTVMDSDKVLVMDAGKAVEFGSPFELLTTSEKKVFHSMVK 1312

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 486/1410 (34%)
Mrp5NP_001262747.1 MRP_assoc_pro 79..1315 CDD:188098 469/1295 (36%)

Return to query results.
Submit another query.