DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and Abcc10

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001101671.1 Gene:Abcc10 / 316231 RGDID:1306696 Length:1494 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1639 Identity:535/1639 - (32%)
Similarity:810/1639 - (49%) Gaps:265/1639 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 RFCGSTFWNATETWYTNDPDFT-PCFEQTALVWTPCAFYWAFVIFDFYYLKASLDRNI--PWN-- 70
            :.||:........|   :.|.| .||.|..|...|.|.   ..:....:|......||  |:|  
  Rat     7 QLCGTDAARPLPLW---EGDTTGHCFTQLVLSVLPHAL---LAVLSACHLGTPRTNNIIQPFNPG 65

  Fly    71 -KLNVSKALVNLGLLVITALDL---IMALVKKGGDSELPL------------YDLDVW------- 112
             :|.::.:.:   |.|...|||   ::..|...|...|.:            :.|.:|       
  Rat    66 WRLRLTASFL---LSVFPLLDLLPVVLPPVSHPGPLWLEVLAGCVTAVAWFTHSLALWALVHSPH 127

  Fly   113 ----GPIIKFATFLLLFIFIPLNRKYGVQTTGCQFIFW------FLLTVLSIPR---CRTEVRLD 164
                ||:.     |.|..|:|....  |.|     :.|      ||..:|..|.   |...::|.
  Rat   128 GHSRGPLA-----LALAAFLPTPAL--VLT-----LLWHCQRGTFLPPLLPGPLGRVCLLILQLA 180

  Fly   165 AERQKILNSQQPSEQDFSWEEYQFVSFFIFFTFTSIMLILNCFADGMPRQTKYQRGENEIPELSA 229
            |.....|....|......|....|:|                     |     :..|.|:.|...
  Rat   181 AVLAYGLGWAAPGGPREPWTHDPFLS---------------------P-----ESQEREVAEDGE 219

  Fly   230 SFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSC--------SEVMPIFAHHWNQNVRKNYK 286
            |:|||.:|.|...:..:|.|..|.:       |||:|        :.:...|..||         
  Rat   220 SWLSRFSYAWLAPLLARGVRGELRQ-------PQDTCRLPRRLHPAYLARAFQAHW--------- 268

  Fly   287 NKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPPIYKSFGGVFLFGALMKLFTDTLTFAQP 351
                                        |:| |.:...:|.:||..::...|:|:....|.|:.|
  Rat   269 ----------------------------KEG-AQLWRALYGAFGCCYIALGLLKMVGTMLGFSGP 304

  Fly   352 QVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYFHRMFIVGLRIRTALINAIYRKA 416
            .:|||::.|:| :..||...|:||.:.|...:.....:..||.:.:..|.|:.|.|:::.:|||.
  Rat   305 LLLSLLVGFLE-EGQEPLSHGLLYVLGLASGSVISAVLQNQYGYEVRKVTLQARVAVLSILYRKT 368

  Fly   417 LRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQLGPSVLAGLAV 481
            |::..|   ....||::||:..|::|.:......:..|..|||:.:.||.|::|:|.:.||||.:
  Rat   369 LKLGPS---RPPTGEVLNLLGTDSERLLNFAGSFHEAWGLPLQLAITLYLLYEQVGVAFLAGLVL 430

  Fly   482 MIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIA 546
            .::|:|||.|||:||.......:::||.|||||.|:||||:|||.:.||.:...:|...|.:|:.
  Rat   431 ALLLVPVNKVIATRIMANNQEMLRHKDARVKLMTELLSGIRVLKFFRWEQALGDRVKACRTQELG 495

  Fly   547 TLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSVEKVLVSIALFDLMKLPLTILPML 611
            .||...||:|...:||:..|.::.:|.|.||||.  .:||:..||..::||..::.|||...|.:
  Rat   496 RLRVIKYLDAACVYLWAALPVVICIVIFITYVLL--GHQLTATKVFTALALVHMLILPLNNFPWV 558

  Fly   612 SVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSVLHDSSKPHP---MSIENGEFSWGDEITLRNI---NIE 670
            ...:.|::||::||.:||:.....|.:.........|   :.:....|||....|.:..   :::
  Rat   559 INGLLESKVSLDRIQRFLDLPSYSPEAYYSPDPPTEPSTVLELHEALFSWDPTGTSQKTFISHLQ 623

  Fly   671 VKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAG--VVNTVGK-LAYVPQQAWIQNATVRDNILFG 732
            ||||.||.:||.||.||||::.|..||:.:|.|  .|:.:.| .....|:.|||.||:|||:|||
  Rat   624 VKKGMLVGIVGKVGCGKSSLLAAITGELHRLCGWVAVSDLSKGFGLATQEPWIQCATIRDNVLFG 688

  Fly   733 QTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDP 797
            :|:|.:.|.:|::||||..|:.||.|||.||:||||:.|||||:.||:||||||.:..|||||||
  Rat   689 KTFDAQLYREVLEACALNDDLSILPAGDQTEVGEKGVTLSGGQRARIALARAVYQEKTLYLLDDP 753

  Fly   798 LSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNK 862
            |:||||.|..|:....|  .|:|...:|:|.||...:|.:.|.:.:::.|.:..:|         
  Rat   754 LAAVDADVANHLLHRCI--LGVLGHTTRLLCTHRTEYLERADLVLLMEAGRLVRAG--------- 807

  Fly   863 GAFADFIIQHLQEGNEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKA-IKLARTESLSDSISVTSADS 926
                                            ...|:|..|:.| ..||..|.::||        
  Rat   808 --------------------------------PPSEILPLVQAAPTALADKEQVTDS-------- 832

  Fly   927 LMGGGGSLRRRTKRQDSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYIKSVGIFLS 991
              |...|:         |:...:...|...|...|:|::.|....|.|...||:.|.:::|..|:
  Rat   833 --GQSPSV---------HNLEKTTEELDVAQNTSGRLVQEESKSEGAVALHVYRAYWRAMGSGLA 886

  Fly   992 VATLVLNFVFQAFQIGSNLWLTQWANDQNV----------------------------------- 1021
            .|.|:...:.||.:.|::.||..|.:....                                   
  Rat   887 TAILISLLLMQATRNGADWWLAHWLSQLKAGRNSSEERPASSSPRSMGFFSPRLLLFSPGNLYIP 951

  Fly  1022 ---ANDTGLRDM--YLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHNELLAVIIRGSVCRFF 1081
               |...|..|:  ||.||........:......|:...|..|||.::|:.||..::...| .|:
  Rat   952 LHKATSNGSSDVHFYLTVYATIAGVNSLCTLLRAVLFAAGALQAAASLHHRLLHRLLMAPV-TFY 1015

  Fly  1082 DITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFA 1146
            |.||.||:||.||.|:..||:.||..::..:.....:|..:.|:....|..|.::.|::|:||..
  Rat  1016 DSTPSGRVLNRFSSDVACVDDSLPFLLNILLANSVGLLGLLAVLGSGLPWLLLLLPPLSFIYYGV 1080

  Fly  1147 QRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVI 1211
            ||.|.|:.|:|.||.|::.||:|||.::|:.|...:||.....||.||:...::.||.|::.|..
  Rat  1081 QRRYRASFRELRRLGSLTLSPLYSHLADTLAGLPVLRAAGATYRFEEENQRLLELNQRCQFASYA 1145

  Fly  1212 ANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFAVL---GGQTNPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETN 1273
            ..:||.|||:::|..::...:..|::   .|..|||||||.:||||.:|..|:.||...:..|..
  Rat  1146 TMQWLDIRLQLMGAAVVSAIAGIALVQHQQGLANPGLVGLVLSYALSLTGLLSGLVSSFTQTEAM 1210

  Fly  1274 IVSVERIKEYG-ETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGVSFNIQGG 1337
            :|||||::||. :..||...:..|..::..:|..:|.||||:..:.||.||...|.||:|.::.|
  Rat  1211 MVSVERLEEYSCDIPQEPHGQPPQSPHQRVSWLTQGSVEFQDVVLVYRPGLPNALDGVTFRVEPG 1275

  Fly  1338 EKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLR 1402
            ||:|||||||:|||||.|.|||::|.:.|::.:||||.:.:.|..|||:|.:|||:|.||||::|
  Rat  1276 EKLGIVGRTGSGKSSLFLVLFRLLEPSAGQVLLDGVDTSQLELAELRSQLAVIPQEPFLFSGTVR 1340

  Fly  1403 INLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKV 1467
            .||||..:..|..:|:|||..|| |.|.....||:.|:.|.|.:||:|||||:|||||||...|:
  Rat  1341 ENLDPQGLHEDRALWQALEQCHL-SEVAMAIGGLDGELGERGRDLSLGQRQLLCLARALLTDAKI 1404

  Fly  1468 LVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTELL 1532
            |.:|||||:||.:||.|:|:||...|...|||||||||||||:||:|:||..|:::|..||:.|.
  Rat  1405 LCIDEATASVDQKTDQLLQQTICRRFANKTVLTIAHRLNTILNSDRVLVLQAGRVVELDSPSALR 1469

  Fly  1533 DNPKSAFYSMAKDA 1546
            :.|.|.|..:.:.:
  Rat  1470 NQPHSLFRQLLQSS 1483

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 534/1636 (33%)
Abcc10NP_001101671.1 MRP_assoc_pro 201..1471 CDD:188098 486/1410 (34%)

Return to query results.
Submit another query.