DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and Abcc12

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008770597.1 Gene:Abcc12 / 291923 RGDID:735100 Length:1378 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1412 Identity:473/1412 - (33%)
Similarity:726/1412 - (51%) Gaps:185/1412 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   225 PELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEV----MPIFAHHWNQNVRKNY 285
            |...|..||..|:.|...:.::.|::.|....|..|.|.|| |:|    :.|.   |::.:.   
  Rat    45 PVDDAGLLSFATFSWLTPVMIRSYKHTLTVDTLPPLSPYDS-SDVNAKRLQIL---WDEEIE--- 102

  Fly   286 KNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGM----ASIMPPIYKSFGGVFLFGALMKLFTDTL 346
                ||.|: :.|.|.|.:      |..|.:.:    |:|:..|..:.|...|...:::..|:..
  Rat   103 ----RVGPE-RASLGRVVW------KFQRTRVLMDVVANILCIIMAALGPTVLIHQILQHVTNIS 156

  Fly   347 TFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYFHRMFIVGLRIRTALINA 411
            :......:.|.::....:..:         ||.:.||.|..          :...:|::.||...
  Rat   157 SGHIGISICLCLALFATEFTK---------VLFWALAWAIN----------YRTAIRLKVALSTL 202

  Fly   412 IYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQLGPSVL 476
            |::..|  |..|....:.||::|:::.|:....|...:..:..:.|:.:.:...:.:..||.:.|
  Rat   203 IFKNLL--SFKTLTHISAGEVLNVLSSDSYSLFEAALFCPLPATIPILMVVCAVYAFFILGSTAL 265

  Fly   477 AGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQVLDIR 541
            .|:.|.:|.||:...:|.....::...:...|:||:.|||.|:.||::|:||||.||...:.|||
  Rat   266 VGICVYLIFIPIQMFMAKLNSAFRRSAISVTDKRVQTMNEFLTCIKLIKMYAWEKSFMNTIHDIR 330

  Fly   542 DKEIATLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSVEKVLVSIALFDLMKLPLT 606
            .:|...|....|:.:|.|.|......:..:.||..::.....  |:.......||:|::||..:.
  Rat   331 KREKKLLEKAGYVQSGNSALAPIVSTIAIVSTFTCHIFLKRT--LTAPVAFSVIAMFNVMKFSIA 393

  Fly   607 ILPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSVLHDSSKPHP-MSIENGEFSWGDEI-------- 662
            |||.....:||..||:.|:.|.|.::  .|.|.:.....|.. :.:.|...:|..||        
  Rat   394 ILPFSVKAVAEASVSLRRMKKILVAK--SPPSYITQPEDPDTILLLANATLTWEQEINRKRGPLK 456

  Fly   663 ---------------------------------------TLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKS 688
                                                   .|.||:..|:||.::.:.|.||||||
  Rat   457 TQDQRRHVFKKQRAELYSEQSLSDQGVASPERQSGSPKSVLHNISFVVRKGKVLGICGNVGSGKS 521

  Fly   689 SVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADI 753
            |::.|.||:|:...|||...|.||||.|||||.:..||:|||||:.|:.:||...:..|.|:.|:
  Rat   522 SLISALLGQMQLQKGVVAVSGPLAYVSQQAWIFHGNVRENILFGEKYNHQRYQHTVHVCGLQKDL 586

  Fly   754 DILSAGDLTE-------IGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFE 811
            :.|..|||||       |||:|:||||||:||||||||||::..||||||||||||||||||:||
  Rat   587 NSLPYGDLTECHYPHLQIGERGVNLSGGQRQRISLARAVYANRQLYLLDDPLSAVDAHVGKHVFE 651

  Fly   812 EVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEG 876
            |.|  |..|..|:.|||||.:.||...|.:.:::.|||.|.||..:|::.:|.:|..|  |...|
  Rat   652 ECI--KKTLKGKTVVLVTHQLQFLESCDEVILLEDGEICEKGTHKELMEERGRYAKLI--HNLRG 712

  Fly   877 NEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKAIKLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQ 941
            .:.::               ||.:..|      |..|:|.:|.:....|:::..|.. |...|..
  Rat   713 LQFKD---------------PEHIYNV------AMVETLKESQAQRDEDAVLASGDE-RDEGKEP 755

  Fly   942 DSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYIKSVGIFL-SVATLVLNFVFQAFQ 1005
            ::.:.|...|.:.       :||:.|..|.|.|.:..|..|||:.|.:| |...|.|.|:.....
  Rat   756 ETEEFVDIKAPVH-------QLIQIESPQEGIVTWKTYHTYIKASGGYLVSFLVLCLFFLMMGSS 813

  Fly  1006 IGSNLWLTQWANDQN------VANDTG------LRD----MYLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVY 1054
            ..|..||..|.:..:      .:|:|.      |:|    ||..||         :|....|:.:
  Rat   814 AFSTWWLGLWLDSGSQVICAPQSNETACNVNQTLQDTKHHMYQLVY---------IASMMSVLTF 869

  Fly  1055 --LGGF-------QAAKTIHNELLAVIIRGSVCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDS 1110
              :.||       .|:.::||.:...|: .|...|||.||.|||:|.||.|||.:|..||...::
  Rat   870 GIIKGFTFTNTTLMASSSLHNRVFNKIV-SSPMSFFDTTPTGRLMNRFSKDMDELDVRLPFHAEN 933

  Fly  1111 FMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSET 1175
            |:....||:..:|:::.|.|:.|.|:..:|.|::...|.:....::|.::|::||||.:||.:.:
  Rat   934 FLQQFSMVVFILVIMAASFPVVLVVLAGLAILFFILLRIFHRGVQELKQVENISRSPWFSHITSS 998

  Fly  1176 VTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFAVLG-G 1239
            :.|...|.||:..|..|.:..|..|:|.........|.||.|:|::::.|::....:|...|. .
  Rat   999 MQGLGVIHAYDKKDDCISKFKALNDENSSHLLYFNCALRWFALRMDILMNIVTFVVALLVTLSFS 1063

  Fly  1240 QTNPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDK--NKPK 1302
            ..:....|||:||.:|::..|...||..::.:....|.|.::||..|.  .|...:..|  ..||
  Rat  1064 SISASSKGLSLSYIIQLSGLLQVCVRTGTETQAKFTSAELMREYISTC--VPEHTQSFKVGTCPK 1126

  Fly  1303 NWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGR 1367
            :||..|.:.|:::::|||:...|||.|::.|||.|:.||||||||:|||||.:||||::|.|.|.
  Rat  1127 DWPSRGEITFKDYRMRYRDNTPLVLDGLNLNIQSGQTVGIVGRTGSGKSSLGMALFRLVEPASGT 1191

  Fly  1368 ISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSL 1432
            |.||.|||.::||..||::||:||||||||.|::|.||||....||:.:|..||.:.::..:..|
  Rat  1192 IFIDEVDICTVGLEELRTKLTMIPQDPVLFVGTVRYNLDPLGSHTDEMLWHVLERTFMRDTIMKL 1256

  Fly  1433 AAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECT 1497
            ...|..|:.|.|||.|||:|||:|:||||||.:|:::||||||::|.:||.|:|.||:..||.||
  Rat  1257 PEKLQAEVTENGENFSVGERQLLCMARALLRNSKIILLDEATASMDSKTDTLVQSTIKEAFKSCT 1321

  Fly  1498 VLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQ-----IIEFASPTELLDNPKSAF 1539
            ||||||||||:|:.|.|:|::.|:     :|||..|..|.:.|.|||
  Rat  1322 VLTIAHRLNTVLNCDLVLVMENGKVQEVLVIEFDKPEVLAEKPDSAF 1368

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 473/1412 (33%)
Abcc12XP_008770597.1 MRP_assoc_pro 43..1378 CDD:188098 473/1412 (33%)

Return to query results.
Submit another query.