DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and Abcc1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_071617.2 Gene:Abcc1 / 24565 RGDID:3112 Length:1532 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1579 Identity:785/1579 - (49%)
Similarity:1058/1579 - (67%) Gaps:87/1579 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 MDRFCGS----TFWNATETWYTNDPDFTPCFEQTALVWTPCAFYWAFVIFDFYYLKASL-DRN-I 67
            :..||.|    ..|:...||:|::||||.||:.|.|.|.||.:.|:  .|..|:|..|. ||. |
  Rat     3 LSSFCSSDGSDPLWDWNVTWHTSNPDFTKCFQNTVLTWVPCFYLWS--CFPLYFLYLSRHDRGYI 65

  Fly    68 PWNKLNVSKALVNLGLLVITALDLIMALVKKGGDSELPLYDLDVWGPIIKFATFLLLFIFIPLNR 132
            ....||.:|..:...|.:|...||..:..::  ...:.|..:.:..|.:...|.||....|...|
  Rat    66 QMTHLNKAKTALGFFLWIICWADLFYSFWER--SQGMLLAPVLLVSPTLLGITMLLATFLIQFER 128

  Fly   133 KYGVQTTGCQFIFWF--LLTVLSIPRCRTEVRLDAERQKILNSQQPSEQDFSWEEYQFVSFFIFF 195
            :.|||::|....||.  ||..|:|           .|.||:::   .::|...:.::..:|:::|
  Rat   129 RKGVQSSGIMLTFWLVALLCALAI-----------LRSKIISA---LKKDAQVDMFRDSAFYLYF 179

  Fly   196 TFTSIMLILNCFADGMPRQTKYQRGENEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDL 260
            |...|.|:|:||:|..|..::..|..|..||.|||||||||:.|...|.::|||.||:..|||.|
  Rat   180 TLVFIQLVLSCFSDSSPLFSETVRDPNPCPESSASFLSRITFWWITGMMVQGYRQPLKSSDLWSL 244

  Fly   261 RPQDSCSEVMPIFAHHWNQNVRKNYKNKARV---------EPKAQFSNGNVTFENPHGE----KN 312
            ..:|:..||:|:..::|.:...|:.|...|:         :||.. |..:|   |...|    |:
  Rat   245 NKEDTSEEVVPVLVNNWKKECVKSRKQPVRIVYAPPKDPTKPKGS-SQLDV---NEEVEALIVKS 305

  Fly   313 GRKKGMASIMPPIYKSFGGVFLFGALMKLFTDTLTFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAV 377
            ..|....|:...:||:||..||...|.|...|.:.||.|::|.|||:||..::| |:|:|.||..
  Rat   306 SHKDRDPSLFKVLYKTFGPYFLMSFLYKALHDLMMFAGPEILELIINFVNDREA-PDWQGYLYTA 369

  Fly   378 LLFVLAAAQTFILGQYFHRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQR 442
            ||||.|..||..|.||||..|:.|:||:||::.|:|||||.|:||.:|.||||||||||:|||||
  Rat   370 LLFVSACLQTLALHQYFHICFVTGMRIKTAVVGAVYRKALVITNSARKSSTVGEIVNLMSVDAQR 434

  Fly   443 FMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYK 507
            ||:|.||:|||||||||:.|||||||..||||||||:||||:::|.|.|:|.:.||||:..||.|
  Rat   435 FMDLATYINMIWSAPLQVTLALYFLWLNLGPSVLAGVAVMILMVPFNAVMAMKTKTYQVAHMKSK 499

  Fly   508 DERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLV 572
            |.|:|||||:|:|||||||||||.:|:.:|::||.:|:..|:.:|||.|..:|.|.|.||||:|.
  Rat   500 DNRIKLMNEILNGIKVLKLYAWELAFQDKVMNIRQEELKVLKKSAYLAAVGTFTWVCTPFLVALS 564

  Fly   573 TFATYVLTSEANQLSVEKVLVSIALFDLMKLPLTILPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPN 637
            |||.:|...|.|.|..:|..||:|||::::.||.||||:...|.:..||:.|:..||:.|||:|:
  Rat   565 TFAVFVTVDEKNILDAKKAFVSLALFNILRFPLNILPMVISSIVQASVSLKRLRIFLSHEELEPD 629

  Fly   638 SV----LHDSSKPHPMSIENGEFSWG-DE-ITLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLG 696
            |:    :.|....:.::::|..|:|. || .||..|...:..|:|||:||.||.||||::.|.|.
  Rat   630 SIERWSIKDGGGMNSITVKNATFTWARDEPPTLNGITFAIPDGALVAVVGQVGCGKSSLLSALLA 694

  Fly   697 EMEKLAGVVNTVGKLAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDL 761
            ||:|:.|.|...|.:|||||||||||.::|:|||||:......|..|::||||..|::||.:|||
  Rat   695 EMDKVEGHVTLKGSVAYVPQQAWIQNDSLRENILFGRPLQEHCYKAVMEACALLPDLEILPSGDL 759

  Fly   762 TEIGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRV 826
            |||||||:|||||||||:|||||||.::|:||||||||||||||||||||:|:||.|:|..|:|:
  Rat   760 TEIGEKGVNLSGGQKQRVSLARAVYCNSDIYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEKVVGPMGLLKNKTRI 824

  Fly   827 LVTHGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEGNEEEEELNQ--IKRQ 889
            |||||:::|||||.|.|:..|:|||.|::.:|:...||||:|:..:   .|.|::..::  .|..
  Rat   825 LVTHGISYLPQVDVIIVMSGGKISEMGSYQELLDRDGAFAEFVRTY---ANTEQDLASEDDSKNG 886

  Fly   890 ISSTADVPELLGTVEKAIKLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSHDSV-----AS 949
            :|.       ||...|.::        :.|.||.|     .|..|:|......||..|     :|
  Rat   887 VSG-------LGKESKPVE--------NGILVTDA-----VGKPLQRHLSNSSSHSVVTNQQHSS 931

  Fly   950 AASLKKK--QEVEGKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYIKSVGIFLSVATLVLNFVFQAFQIGSNLWL 1012
            .|.|:|.  :|...||:|.:|:|||.|:.:||.:|:|::|:.:|..::.|........:.||.||
  Rat   932 TAELQKSGVKEETWKLMEADKAQTGQVKLSVYWNYMKAIGLCISFLSIFLFLCNHVSALASNYWL 996

  Fly  1013 TQWANDQNVANDT-GLRDMYLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHNELLAVIIRGS 1076
            :.|.:|:...|.| ..|:..|.||||.|..|||..:...:.|.:||..|::.:|.:||..::| |
  Rat   997 SLWTDDRPAVNGTQENRNFRLSVYGALGILQGVAVFGYSMAVSIGGIFASRRLHLDLLQNVLR-S 1060

  Fly  1077 VCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAF 1141
            ...||:.||.|.|:|.||.::|.||..:|..:..||..:|.|:..:::|.|:|||...:|.|:..
  Rat  1061 PMSFFERTPSGNLVNRFSKELDTVDSMIPQVIKMFMGSLFSVIGAVIIILLATPIAAVIIPPLGL 1125

  Fly  1142 LYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCK 1206
            :|:|.||||||:||||.|||||||||:||||:||:.|.|.|||:...:|||.:||.|||:||...
  Rat  1126 VYFFVQRFYVASSRQLKRLESVSRSPVYSHFNETLLGVSVIRAFEEQERFIRQSDLKVDENQKAY 1190

  Fly  1207 YPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFAVLGGQT-NPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDI 1270
            |||::||||||:|||.|||.|:|||:||||:...: :.|||||||||:||:|..|||||||||::
  Rat  1191 YPSIVANRWLAVRLECVGNCIVLFAALFAVISRHSLSAGLVGLSVSYSLQITAYLNWLVRMSSEM 1255

  Fly  1271 ETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGVSFNIQ 1335
            |||||:|||:|||.||::||.|:: |:...|..||..|||||:::.:||||.|||||:.::..|:
  Rat  1256 ETNIVAVERLKEYSETEKEASWQI-QETAPPSTWPHSGRVEFRDYCLRYREDLDLVLKHINVTIE 1319

  Fly  1336 GGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGS 1400
            ||||||||||||||||||||.||||.|:|.|.|.|||::||.:|||.||.::|||||||||||||
  Rat  1320 GGEKVGIVGRTGAGKSSLTLGLFRINESAEGEIIIDGINIAKIGLHNLRFKITIIPQDPVLFSGS 1384

  Fly  1401 LRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKT 1465
            ||:|||||...:|:|:|.||||:|||.||.:|...||||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1385 LRMNLDPFSQYSDEEVWMALELAHLKGFVSALPDKLNHECAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKT 1449

  Fly  1466 KVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTE 1530
            |:|||||||||||||||||||.||||:|::.||||||||||||:|..:|||||||:|.|..:|:|
  Rat  1450 KILVLDEATAAVDLETDDLIQSTIRTQFEDSTVLTIAHRLNTIMDYTRVIVLDKGEIRECGAPSE 1514

  Fly  1531 LLDNPKSAFYSMAKDANLV 1549
            ||.. :..||||||||.||
  Rat  1515 LLQQ-RGVFYSMAKDAGLV 1532

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 781/1571 (50%)
Abcc1NP_071617.2 MRP_assoc_pro 7..1531 CDD:188098 782/1572 (50%)

Return to query results.
Submit another query.